Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317SXM1

Protein Details
Accession A0A317SXM1    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-56DGHERFSSGFQRKRRRAGRDTKERAALGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-47RKRRRAGR
273-279GKGKGKG
364-375GKKKKEKRKAGS
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR022783  GCFC_dom  
IPR022159  STIP/TFIP11_N  
IPR045211  TFP11/STIP/Ntr1  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000390  P:spliceosomal complex disassembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF07842  GCFC  
PF12457  TIP_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MGKRKMENWEDSSGSDSSEDEIEFPDPTDGHERFSSGFQRKRRRAGRDTKERAALGVFGSDSEDEGTRGSKGSGSKGLRNKGMGFVKSGQAAGEDDEDGEGDEDEYTGAVRMVQEMGGEIEEDDRMAGGLGSGSNANARFAGLGSWGNKGNEEESDARPRLGLGRGPLSKFAVVGLGAGSQNDSGISTPRSLDAHVGLGFKASAISGIGYTESPQPEPPVAQQYSTPLGRGFVSSFAAASMGMPSLDSELPVSQSENIVLRPTSFTPEQPSRGKGKGKGRANDASQPKANPESFAARMMAKMGYVEGQGLGKKGEGILTPIEVKLRPQGVGVGAIREKTDQARKEAKRAAALKGEVISDSEDEGKKKKEKRKAGSGSMGSTPSGTPLRTRRERTKFRTAEEISAAAKGLDVPSALKNIIDFTGKKRKLLTSTSGIMSKDPSVEDESLKIARMARKDLESFAGEWTSLQDRKAYINREERRLNLEMDEGIKEIHRLEGMVDMVKGLRSLTLNIANPKASIEAIVTQLEVLQLEYQNEIEDYDLAGVAVAALHPLFKRELSSWSPLTDPFLFFEIFRRLRRILHVRSKEDLEAGYAKDGFIERSKSTTHYESVMFSLWLPKVRSAINNDWDVHKPASVLELLDVWTSVLPPFIHANILDQLVLPKLRAAVADWNPRMSKGKNARLPPHLWVFQWLPHLGPHMDDLLRDVRRGFGIVLDTWDVSKGTVEGLEAWKEVFGPGQLEDLLVRHLLPRLALRLRDDFDVNPGDQILEPLEDVFKWIPFFRISTFTQLVEAEFFPKWLSVLYQWLTAEPVFTEVQEWYMFWQDVFPRELRSDPAIRSGFKKGLDMMNHALDLGQDAPTKLVPPPVQPVRLTKPEAVAPKPTPVKASNTSMPVGSTFRDAVEDWCVDHNLLLIPLRKAHEATGRPLFKITASAIGSGGIEVYFQGDVVWAQDRKDRGLWDPLGLEELLGRIEGSTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.24
3 0.19
4 0.15
5 0.15
6 0.14
7 0.11
8 0.13
9 0.13
10 0.13
11 0.13
12 0.14
13 0.12
14 0.16
15 0.23
16 0.22
17 0.25
18 0.25
19 0.26
20 0.25
21 0.31
22 0.37
23 0.38
24 0.45
25 0.51
26 0.61
27 0.68
28 0.77
29 0.81
30 0.82
31 0.83
32 0.87
33 0.88
34 0.88
35 0.88
36 0.85
37 0.82
38 0.73
39 0.63
40 0.53
41 0.44
42 0.33
43 0.26
44 0.19
45 0.12
46 0.14
47 0.13
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.1
52 0.11
53 0.12
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.13
58 0.15
59 0.2
60 0.28
61 0.32
62 0.4
63 0.47
64 0.53
65 0.54
66 0.56
67 0.52
68 0.52
69 0.54
70 0.47
71 0.44
72 0.4
73 0.39
74 0.36
75 0.34
76 0.26
77 0.2
78 0.2
79 0.16
80 0.15
81 0.12
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.08
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.1
129 0.09
130 0.12
131 0.13
132 0.16
133 0.19
134 0.19
135 0.2
136 0.21
137 0.2
138 0.17
139 0.21
140 0.22
141 0.23
142 0.31
143 0.31
144 0.29
145 0.28
146 0.28
147 0.26
148 0.26
149 0.25
150 0.2
151 0.28
152 0.32
153 0.33
154 0.35
155 0.34
156 0.31
157 0.28
158 0.24
159 0.17
160 0.13
161 0.11
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.12
176 0.14
177 0.15
178 0.15
179 0.16
180 0.14
181 0.16
182 0.17
183 0.17
184 0.15
185 0.15
186 0.14
187 0.12
188 0.1
189 0.07
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.08
198 0.12
199 0.13
200 0.14
201 0.15
202 0.17
203 0.17
204 0.19
205 0.21
206 0.25
207 0.24
208 0.24
209 0.23
210 0.25
211 0.29
212 0.28
213 0.26
214 0.17
215 0.18
216 0.18
217 0.18
218 0.15
219 0.12
220 0.13
221 0.12
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.11
248 0.14
249 0.14
250 0.18
251 0.18
252 0.19
253 0.25
254 0.3
255 0.34
256 0.35
257 0.39
258 0.39
259 0.44
260 0.48
261 0.48
262 0.52
263 0.56
264 0.6
265 0.61
266 0.63
267 0.63
268 0.61
269 0.62
270 0.57
271 0.53
272 0.48
273 0.43
274 0.4
275 0.39
276 0.36
277 0.29
278 0.26
279 0.26
280 0.24
281 0.25
282 0.23
283 0.18
284 0.18
285 0.18
286 0.15
287 0.1
288 0.09
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.07
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.11
307 0.11
308 0.13
309 0.11
310 0.12
311 0.15
312 0.15
313 0.14
314 0.14
315 0.15
316 0.14
317 0.18
318 0.17
319 0.15
320 0.15
321 0.15
322 0.15
323 0.14
324 0.14
325 0.15
326 0.22
327 0.22
328 0.28
329 0.38
330 0.39
331 0.46
332 0.51
333 0.48
334 0.48
335 0.49
336 0.45
337 0.4
338 0.39
339 0.32
340 0.28
341 0.26
342 0.18
343 0.16
344 0.13
345 0.09
346 0.09
347 0.11
348 0.11
349 0.13
350 0.16
351 0.2
352 0.27
353 0.35
354 0.43
355 0.49
356 0.58
357 0.65
358 0.73
359 0.76
360 0.76
361 0.75
362 0.69
363 0.61
364 0.53
365 0.45
366 0.34
367 0.27
368 0.2
369 0.15
370 0.14
371 0.12
372 0.14
373 0.2
374 0.29
375 0.35
376 0.42
377 0.49
378 0.58
379 0.68
380 0.72
381 0.76
382 0.71
383 0.66
384 0.7
385 0.61
386 0.54
387 0.45
388 0.39
389 0.28
390 0.25
391 0.22
392 0.12
393 0.1
394 0.07
395 0.06
396 0.05
397 0.04
398 0.05
399 0.06
400 0.08
401 0.08
402 0.07
403 0.07
404 0.08
405 0.09
406 0.1
407 0.1
408 0.15
409 0.26
410 0.27
411 0.28
412 0.3
413 0.32
414 0.34
415 0.37
416 0.36
417 0.3
418 0.32
419 0.32
420 0.32
421 0.29
422 0.25
423 0.22
424 0.17
425 0.13
426 0.11
427 0.11
428 0.11
429 0.12
430 0.12
431 0.12
432 0.13
433 0.12
434 0.13
435 0.12
436 0.12
437 0.14
438 0.15
439 0.17
440 0.18
441 0.2
442 0.2
443 0.2
444 0.2
445 0.18
446 0.17
447 0.14
448 0.13
449 0.1
450 0.09
451 0.1
452 0.11
453 0.11
454 0.1
455 0.11
456 0.12
457 0.16
458 0.2
459 0.23
460 0.26
461 0.35
462 0.38
463 0.43
464 0.44
465 0.41
466 0.42
467 0.4
468 0.34
469 0.24
470 0.22
471 0.16
472 0.16
473 0.15
474 0.1
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.06
479 0.06
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.06
484 0.07
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.04
492 0.05
493 0.05
494 0.06
495 0.08
496 0.12
497 0.14
498 0.16
499 0.17
500 0.16
501 0.16
502 0.15
503 0.14
504 0.09
505 0.08
506 0.07
507 0.07
508 0.08
509 0.08
510 0.07
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.06
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.05
525 0.05
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.03
531 0.03
532 0.03
533 0.02
534 0.02
535 0.02
536 0.02
537 0.03
538 0.03
539 0.05
540 0.06
541 0.06
542 0.08
543 0.09
544 0.14
545 0.17
546 0.21
547 0.21
548 0.22
549 0.22
550 0.21
551 0.23
552 0.19
553 0.17
554 0.13
555 0.14
556 0.13
557 0.12
558 0.16
559 0.2
560 0.22
561 0.23
562 0.26
563 0.25
564 0.27
565 0.34
566 0.39
567 0.41
568 0.47
569 0.53
570 0.53
571 0.55
572 0.55
573 0.48
574 0.4
575 0.31
576 0.23
577 0.18
578 0.14
579 0.13
580 0.11
581 0.1
582 0.1
583 0.1
584 0.09
585 0.1
586 0.13
587 0.12
588 0.14
589 0.16
590 0.18
591 0.21
592 0.23
593 0.21
594 0.2
595 0.2
596 0.19
597 0.2
598 0.18
599 0.14
600 0.11
601 0.14
602 0.13
603 0.17
604 0.17
605 0.16
606 0.18
607 0.19
608 0.23
609 0.26
610 0.31
611 0.32
612 0.34
613 0.34
614 0.35
615 0.35
616 0.35
617 0.28
618 0.22
619 0.18
620 0.14
621 0.15
622 0.13
623 0.1
624 0.07
625 0.07
626 0.08
627 0.07
628 0.07
629 0.06
630 0.05
631 0.06
632 0.05
633 0.07
634 0.06
635 0.08
636 0.09
637 0.09
638 0.1
639 0.1
640 0.12
641 0.12
642 0.13
643 0.11
644 0.1
645 0.1
646 0.11
647 0.11
648 0.08
649 0.07
650 0.07
651 0.08
652 0.08
653 0.09
654 0.16
655 0.22
656 0.31
657 0.31
658 0.34
659 0.34
660 0.35
661 0.38
662 0.3
663 0.34
664 0.35
665 0.44
666 0.47
667 0.54
668 0.59
669 0.61
670 0.62
671 0.57
672 0.54
673 0.46
674 0.4
675 0.37
676 0.32
677 0.29
678 0.3
679 0.26
680 0.2
681 0.19
682 0.22
683 0.17
684 0.17
685 0.15
686 0.14
687 0.13
688 0.13
689 0.15
690 0.18
691 0.19
692 0.19
693 0.18
694 0.16
695 0.17
696 0.18
697 0.15
698 0.1
699 0.12
700 0.12
701 0.13
702 0.13
703 0.13
704 0.12
705 0.12
706 0.11
707 0.08
708 0.08
709 0.06
710 0.06
711 0.06
712 0.06
713 0.08
714 0.1
715 0.11
716 0.11
717 0.11
718 0.1
719 0.1
720 0.1
721 0.08
722 0.07
723 0.07
724 0.07
725 0.09
726 0.09
727 0.09
728 0.09
729 0.09
730 0.09
731 0.08
732 0.07
733 0.07
734 0.09
735 0.09
736 0.1
737 0.12
738 0.17
739 0.21
740 0.23
741 0.26
742 0.29
743 0.3
744 0.31
745 0.31
746 0.25
747 0.26
748 0.27
749 0.23
750 0.19
751 0.17
752 0.15
753 0.13
754 0.14
755 0.1
756 0.08
757 0.07
758 0.08
759 0.08
760 0.07
761 0.1
762 0.1
763 0.1
764 0.11
765 0.12
766 0.14
767 0.15
768 0.16
769 0.16
770 0.2
771 0.21
772 0.26
773 0.28
774 0.26
775 0.26
776 0.25
777 0.23
778 0.2
779 0.19
780 0.15
781 0.13
782 0.13
783 0.12
784 0.11
785 0.11
786 0.09
787 0.11
788 0.09
789 0.16
790 0.17
791 0.2
792 0.2
793 0.2
794 0.21
795 0.19
796 0.18
797 0.12
798 0.13
799 0.1
800 0.1
801 0.11
802 0.1
803 0.12
804 0.11
805 0.11
806 0.1
807 0.14
808 0.14
809 0.12
810 0.16
811 0.17
812 0.2
813 0.23
814 0.22
815 0.22
816 0.24
817 0.25
818 0.25
819 0.29
820 0.3
821 0.28
822 0.36
823 0.35
824 0.35
825 0.38
826 0.4
827 0.38
828 0.34
829 0.35
830 0.3
831 0.34
832 0.35
833 0.36
834 0.34
835 0.32
836 0.31
837 0.29
838 0.25
839 0.18
840 0.17
841 0.13
842 0.11
843 0.1
844 0.1
845 0.12
846 0.12
847 0.14
848 0.13
849 0.2
850 0.19
851 0.22
852 0.31
853 0.36
854 0.41
855 0.42
856 0.48
857 0.48
858 0.54
859 0.54
860 0.47
861 0.45
862 0.46
863 0.5
864 0.46
865 0.46
866 0.41
867 0.46
868 0.48
869 0.46
870 0.45
871 0.42
872 0.46
873 0.44
874 0.49
875 0.46
876 0.44
877 0.44
878 0.39
879 0.37
880 0.31
881 0.27
882 0.21
883 0.19
884 0.16
885 0.15
886 0.17
887 0.17
888 0.17
889 0.2
890 0.2
891 0.18
892 0.2
893 0.21
894 0.18
895 0.18
896 0.17
897 0.13
898 0.14
899 0.17
900 0.18
901 0.19
902 0.23
903 0.26
904 0.26
905 0.26
906 0.29
907 0.34
908 0.34
909 0.39
910 0.45
911 0.45
912 0.43
913 0.44
914 0.4
915 0.32
916 0.32
917 0.27
918 0.24
919 0.23
920 0.23
921 0.21
922 0.21
923 0.21
924 0.16
925 0.15
926 0.07
927 0.06
928 0.05
929 0.07
930 0.06
931 0.06
932 0.06
933 0.06
934 0.06
935 0.08
936 0.15
937 0.15
938 0.17
939 0.22
940 0.24
941 0.28
942 0.32
943 0.33
944 0.31
945 0.39
946 0.39
947 0.38
948 0.37
949 0.33
950 0.32
951 0.28
952 0.23
953 0.14
954 0.13
955 0.1
956 0.09
957 0.08