Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317SHQ8

Protein Details
Accession A0A317SHQ8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
277-319RRTERERERMAEKKRKRKEDLERRKEEVRKKRRGKVGGTWLEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
276-311RRRTERERERMAEKKRKRKEDLERRKEEVRKKRRGK
Subcellular Location(s) mito 13.5, cyto_mito 10.833, cyto 7, cyto_nucl 6.833, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025066  CCDC174-like  
Pfam View protein in Pfam  
PF13300  DUF4078  
Amino Acid Sequences MSLYGAPRPKSKPDPVPLSQSSIHALATELSLARARPRQSRTGPSQKPLSNRGVAVRAARDEAGRTTSRDIGGDVDEHELARSRKKLIVKARVYERLRKVGGGDGEAEEEDRLVDFDRKWVEEGEPEFHSSASSSSDEPEDEGETVEHTDDLGRTREVSKKTLARVLRREARAKQRARDQQVPPSPAHHHQLASQPPPESISYGPRIQTGAFQTANFSSVPTADMLAAAMPAEKAVVEEVHYDAGGEVRTKGVGFYRFSKDEEDRKREFQELEEERRRTERERERMAEKKRKRKEDLERRKEEVRKKRRGKVGGTWLEGFMGQLEGGRGGNAAEEDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.69
3 0.74
4 0.67
5 0.64
6 0.56
7 0.48
8 0.42
9 0.34
10 0.29
11 0.2
12 0.18
13 0.13
14 0.12
15 0.12
16 0.09
17 0.09
18 0.11
19 0.11
20 0.16
21 0.22
22 0.26
23 0.33
24 0.38
25 0.46
26 0.52
27 0.61
28 0.65
29 0.71
30 0.72
31 0.7
32 0.74
33 0.69
34 0.68
35 0.65
36 0.61
37 0.54
38 0.5
39 0.47
40 0.42
41 0.4
42 0.37
43 0.33
44 0.28
45 0.26
46 0.25
47 0.22
48 0.2
49 0.2
50 0.22
51 0.2
52 0.21
53 0.22
54 0.25
55 0.24
56 0.23
57 0.22
58 0.18
59 0.18
60 0.17
61 0.14
62 0.13
63 0.13
64 0.12
65 0.12
66 0.15
67 0.15
68 0.2
69 0.21
70 0.22
71 0.26
72 0.31
73 0.39
74 0.45
75 0.54
76 0.54
77 0.59
78 0.63
79 0.68
80 0.67
81 0.68
82 0.63
83 0.6
84 0.55
85 0.48
86 0.42
87 0.37
88 0.35
89 0.27
90 0.23
91 0.16
92 0.16
93 0.15
94 0.14
95 0.09
96 0.08
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.08
102 0.08
103 0.12
104 0.14
105 0.15
106 0.16
107 0.17
108 0.16
109 0.18
110 0.2
111 0.19
112 0.18
113 0.19
114 0.18
115 0.17
116 0.16
117 0.12
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.11
143 0.17
144 0.19
145 0.2
146 0.24
147 0.26
148 0.28
149 0.33
150 0.35
151 0.36
152 0.39
153 0.44
154 0.47
155 0.47
156 0.5
157 0.5
158 0.56
159 0.59
160 0.57
161 0.55
162 0.57
163 0.62
164 0.63
165 0.66
166 0.58
167 0.59
168 0.6
169 0.58
170 0.49
171 0.45
172 0.42
173 0.36
174 0.36
175 0.28
176 0.23
177 0.23
178 0.29
179 0.3
180 0.3
181 0.29
182 0.26
183 0.25
184 0.26
185 0.24
186 0.19
187 0.15
188 0.16
189 0.18
190 0.19
191 0.2
192 0.18
193 0.19
194 0.17
195 0.19
196 0.18
197 0.19
198 0.17
199 0.17
200 0.18
201 0.17
202 0.18
203 0.15
204 0.12
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.12
240 0.15
241 0.17
242 0.23
243 0.29
244 0.3
245 0.32
246 0.37
247 0.38
248 0.44
249 0.51
250 0.53
251 0.51
252 0.54
253 0.56
254 0.55
255 0.5
256 0.43
257 0.43
258 0.43
259 0.48
260 0.52
261 0.5
262 0.48
263 0.51
264 0.52
265 0.46
266 0.5
267 0.5
268 0.52
269 0.6
270 0.63
271 0.67
272 0.72
273 0.78
274 0.79
275 0.78
276 0.79
277 0.8
278 0.85
279 0.85
280 0.86
281 0.87
282 0.88
283 0.89
284 0.89
285 0.87
286 0.82
287 0.84
288 0.81
289 0.8
290 0.8
291 0.79
292 0.79
293 0.82
294 0.86
295 0.87
296 0.87
297 0.84
298 0.83
299 0.83
300 0.81
301 0.76
302 0.68
303 0.58
304 0.5
305 0.42
306 0.32
307 0.21
308 0.13
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.09