FuNGI

A0A317SW60

Protein Details

Accession

A0A317SW60

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
52-71	SQRRNSAHKPWQTSNQQQKY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, mito 8.5, cyto_nucl 8.333, cyto_mito 6.833, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045117 ATXN2-like IPR009604 LsmAD_domain IPR025852 SM_dom_ATX
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF06741 LsmAD PF14438 SM-ATX

Amino Acid Sequences

MATTATAPSAVTNGASSNAAGGRPQLKGSITGGSGGGGNSNRRPTQSPIDGSQRRNSAHKPWQTSNQQQKYNGTGNPVSASPTPSQSAAMKSRGANASSGGESDTHDKHMHDRTLYLLMNLVGRQVTITLRNGARFAGTLTGADTRSHDLGATMKWVRQVRTPLGDNSDERVEEGEYVGGGLEKAMVFEPKDLVDIFAEKIPLGEDETQSQSANQNGAPAGNFPTDADISGNLAPRERELRRWQPDEKTAELSLEESNQGSGQSWNQFEVNERLFGVTSDFNPDIYTTKVDRSHPLYQQREAIAEKIAREIESQGVGPNMNPHLAEERGVSWGDDSGKDEEDKYGAVQRTPVQAILPQIQQSNNRYKPPALRAPTALPTVPGAPHDPAIISSQLLRPETLQQNQQQQQQPSQPPQAPRPPLPQITLNQQPPNKGSEDVSAKPKEKKSLPDTTAPKRGLPASSPVDPAANSSDAPLPQEVTETFKRFVNSEKERYKKKKADLVQKDRASKLEELRKFSQNFVLKTEVPQDLVPILAKDKSKQAEIVEKAKKSVAKITSAPPTAAVQPPQTTRVPPPNSFAAKNPEEFQLTRQQLLQGFPPTQSRLSRGQQTQQSPLSTRLHQIAVDRRAGHQVSVRSPVPIPEHPHSVPTGPAVAANIPTAPKSTSPSSAAHLRNLSAKAPEFKPNPNAVSFTPTLGGPSTNATPSPTTSAHAHSSRAPSPSAFFGNKKVKTSQEKPLIADRFNPFKRMKIAAPAAQTPTDGPGKKIRGNSNDYIERAFVTPPTWPTTEQNKDKKWEQMFTKPEFSIATSIHSPQPPHVMPQPHHPQIPSHIPHINPPPHIAHQTHPHMPQHMGIPPPHYEPEQHIRQIPPSVMPSPSLHNATVAPYQQSPVAHPSQIGPMYPSHQQAQFTLPSGPGGAAYGYYSGGFRGAAGAGPMMVQGPQPIPYPAGQFIQHPHMYSPQQPHAYLQGAPPPPPPNSQGYPSPGRGAPMMMHQGSQQGTPAGPQMMQYTLQPGQAAPMYAGQGQQQIGMIRGQPHPHHQGGPPLSFYHGPPHFPPGGRGNGFGHPQQHQGGQHVPPPPPPQSQSQQAPPEGEDTK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.11
3	0.1
4	0.12
5	0.13
6	0.12
7	0.12
8	0.16
9	0.18
10	0.19
11	0.21
12	0.21
13	0.21
14	0.23
15	0.25
16	0.25
17	0.21
18	0.21
19	0.2
20	0.18
21	0.17
22	0.14
23	0.16
24	0.15
25	0.19
26	0.23
27	0.3
28	0.31
29	0.34
30	0.38
31	0.41
32	0.48
33	0.52
34	0.52
35	0.51
36	0.6
37	0.64
38	0.64
39	0.65
40	0.62
41	0.57
42	0.58
43	0.57
44	0.56
45	0.59
46	0.63
47	0.64
48	0.64
49	0.71
50	0.74
51	0.79
52	0.8
53	0.79
54	0.78
55	0.74
56	0.72
57	0.69
58	0.66
59	0.57
60	0.53
61	0.45
62	0.4
63	0.37
64	0.33
65	0.3
66	0.25
67	0.27
68	0.22
69	0.24
70	0.25
71	0.23
72	0.25
73	0.24
74	0.29
75	0.31
76	0.32
77	0.33
78	0.32
79	0.38
80	0.4
81	0.38
82	0.32
83	0.29
84	0.29
85	0.25
86	0.25
87	0.18
88	0.15
89	0.15
90	0.2
91	0.19
92	0.19
93	0.21
94	0.21
95	0.27
96	0.34
97	0.37
98	0.33
99	0.33
100	0.32
101	0.37
102	0.36
103	0.3
104	0.24
105	0.2
106	0.21
107	0.2
108	0.18
109	0.12
110	0.11
111	0.11
112	0.1
113	0.12
114	0.14
115	0.16
116	0.21
117	0.24
118	0.25
119	0.26
120	0.25
121	0.23
122	0.19
123	0.18
124	0.15
125	0.13
126	0.11
127	0.13
128	0.16
129	0.16
130	0.16
131	0.17
132	0.18
133	0.18
134	0.18
135	0.16
136	0.14
137	0.15
138	0.15
139	0.2
140	0.18
141	0.18
142	0.25
143	0.29
144	0.3
145	0.34
146	0.4
147	0.4
148	0.45
149	0.48
150	0.45
151	0.46
152	0.48
153	0.44
154	0.4
155	0.37
156	0.3
157	0.26
158	0.24
159	0.19
160	0.15
161	0.15
162	0.11
163	0.08
164	0.08
165	0.07
166	0.06
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.06
172	0.07
173	0.09
174	0.09
175	0.11
176	0.12
177	0.11
178	0.13
179	0.12
180	0.12
181	0.12
182	0.13
183	0.13
184	0.13
185	0.13
186	0.11
187	0.11
188	0.11
189	0.1
190	0.12
191	0.13
192	0.13
193	0.16
194	0.2
195	0.21
196	0.2
197	0.21
198	0.2
199	0.19
200	0.2
201	0.17
202	0.15
203	0.15
204	0.15
205	0.15
206	0.13
207	0.14
208	0.13
209	0.13
210	0.11
211	0.14
212	0.13
213	0.13
214	0.13
215	0.1
216	0.12
217	0.14
218	0.17
219	0.14
220	0.15
221	0.15
222	0.17
223	0.24
224	0.23
225	0.29
226	0.36
227	0.46
228	0.53
229	0.59
230	0.63
231	0.62
232	0.68
233	0.66
234	0.59
235	0.53
236	0.45
237	0.39
238	0.33
239	0.28
240	0.21
241	0.17
242	0.14
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.1
247	0.09
248	0.1
249	0.12
250	0.15
251	0.16
252	0.17
253	0.17
254	0.18
255	0.2
256	0.25
257	0.23
258	0.19
259	0.19
260	0.18
261	0.17
262	0.17
263	0.17
264	0.12
265	0.11
266	0.16
267	0.16
268	0.15
269	0.15
270	0.16
271	0.15
272	0.15
273	0.18
274	0.14
275	0.19
276	0.23
277	0.25
278	0.29
279	0.35
280	0.4
281	0.44
282	0.52
283	0.51
284	0.5
285	0.52
286	0.48
287	0.44
288	0.37
289	0.32
290	0.26
291	0.23
292	0.21
293	0.19
294	0.19
295	0.16
296	0.16
297	0.16
298	0.14
299	0.13
300	0.13
301	0.11
302	0.11
303	0.11
304	0.1
305	0.12
306	0.12
307	0.11
308	0.11
309	0.11
310	0.14
311	0.14
312	0.15
313	0.12
314	0.12
315	0.13
316	0.13
317	0.12
318	0.09
319	0.11
320	0.11
321	0.11
322	0.13
323	0.13
324	0.14
325	0.14
326	0.15
327	0.13
328	0.12
329	0.12
330	0.11
331	0.15
332	0.15
333	0.15
334	0.17
335	0.19
336	0.22
337	0.23
338	0.22
339	0.16
340	0.17
341	0.19
342	0.21
343	0.2
344	0.17
345	0.18
346	0.2
347	0.25
348	0.28
349	0.35
350	0.36
351	0.38
352	0.39
353	0.4
354	0.44
355	0.47
356	0.51
357	0.45
358	0.43
359	0.43
360	0.44
361	0.44
362	0.4
363	0.32
364	0.23
365	0.19
366	0.18
367	0.16
368	0.13
369	0.13
370	0.11
371	0.12
372	0.11
373	0.11
374	0.1
375	0.12
376	0.11
377	0.09
378	0.1
379	0.12
380	0.14
381	0.15
382	0.14
383	0.13
384	0.2
385	0.25
386	0.26
387	0.29
388	0.31
389	0.4
390	0.44
391	0.5
392	0.49
393	0.46
394	0.48
395	0.5
396	0.5
397	0.46
398	0.48
399	0.45
400	0.43
401	0.47
402	0.51
403	0.48
404	0.47
405	0.48
406	0.47
407	0.45
408	0.44
409	0.41
410	0.35
411	0.37
412	0.4
413	0.38
414	0.39
415	0.38
416	0.37
417	0.35
418	0.35
419	0.3
420	0.24
421	0.21
422	0.21
423	0.24
424	0.25
425	0.3
426	0.32
427	0.34
428	0.39
429	0.4
430	0.41
431	0.4
432	0.45
433	0.45
434	0.5
435	0.5
436	0.53
437	0.57
438	0.56
439	0.61
440	0.54
441	0.48
442	0.4
443	0.39
444	0.31
445	0.26
446	0.26
447	0.22
448	0.23
449	0.23
450	0.22
451	0.21
452	0.19
453	0.19
454	0.15
455	0.12
456	0.1
457	0.1
458	0.12
459	0.11
460	0.12
461	0.11
462	0.09
463	0.09
464	0.1
465	0.09
466	0.13
467	0.16
468	0.18
469	0.19
470	0.2
471	0.21
472	0.2
473	0.25
474	0.29
475	0.32
476	0.38
477	0.45
478	0.49
479	0.58
480	0.65
481	0.7
482	0.67
483	0.67
484	0.67
485	0.67
486	0.72
487	0.73
488	0.75
489	0.75
490	0.73
491	0.7
492	0.62
493	0.56
494	0.48
495	0.4
496	0.37
497	0.37
498	0.35
499	0.38
500	0.41
501	0.45
502	0.43
503	0.41
504	0.42
505	0.38
506	0.35
507	0.32
508	0.32
509	0.26
510	0.26
511	0.29
512	0.22
513	0.18
514	0.17
515	0.15
516	0.11
517	0.11
518	0.1
519	0.06
520	0.07
521	0.08
522	0.09
523	0.1
524	0.14
525	0.15
526	0.16
527	0.18
528	0.18
529	0.23
530	0.26
531	0.33
532	0.34
533	0.33
534	0.33
535	0.33
536	0.32
537	0.26
538	0.29
539	0.22
540	0.21
541	0.23
542	0.26
543	0.29
544	0.29
545	0.28
546	0.22
547	0.21
548	0.2
549	0.19
550	0.17
551	0.13
552	0.14
553	0.16
554	0.18
555	0.18
556	0.17
557	0.2
558	0.27
559	0.31
560	0.3
561	0.32
562	0.34
563	0.36
564	0.36
565	0.35
566	0.32
567	0.29
568	0.29
569	0.28
570	0.23
571	0.23
572	0.22
573	0.22
574	0.24
575	0.24
576	0.23
577	0.22
578	0.22
579	0.22
580	0.23
581	0.23
582	0.16
583	0.16
584	0.16
585	0.18
586	0.18
587	0.19
588	0.19
589	0.2
590	0.23
591	0.26
592	0.32
593	0.33
594	0.37
595	0.41
596	0.42
597	0.44
598	0.4
599	0.38
600	0.33
601	0.36
602	0.32
603	0.27
604	0.26
605	0.23
606	0.21
607	0.21
608	0.23
609	0.25
610	0.25
611	0.27
612	0.26
613	0.25
614	0.29
615	0.28
616	0.25
617	0.21
618	0.21
619	0.2
620	0.24
621	0.24
622	0.2
623	0.2
624	0.22
625	0.23
626	0.24
627	0.27
628	0.25
629	0.3
630	0.29
631	0.3
632	0.28
633	0.24
634	0.21
635	0.16
636	0.15
637	0.09
638	0.09
639	0.08
640	0.08
641	0.08
642	0.07
643	0.07
644	0.06
645	0.07
646	0.08
647	0.08
648	0.09
649	0.12
650	0.14
651	0.16
652	0.19
653	0.2
654	0.22
655	0.29
656	0.3
657	0.29
658	0.28
659	0.26
660	0.27
661	0.27
662	0.25
663	0.19
664	0.2
665	0.21
666	0.23
667	0.3
668	0.28
669	0.31
670	0.35
671	0.37
672	0.37
673	0.34
674	0.34
675	0.27
676	0.3
677	0.26
678	0.21
679	0.18
680	0.15
681	0.15
682	0.13
683	0.12
684	0.07
685	0.09
686	0.1
687	0.1
688	0.1
689	0.11
690	0.11
691	0.12
692	0.16
693	0.14
694	0.15
695	0.17
696	0.2
697	0.23
698	0.24
699	0.25
700	0.24
701	0.28
702	0.29
703	0.29
704	0.26
705	0.21
706	0.22
707	0.23
708	0.24
709	0.22
710	0.2
711	0.27
712	0.35
713	0.37
714	0.39
715	0.39
716	0.42
717	0.49
718	0.53
719	0.54
720	0.54
721	0.54
722	0.54
723	0.59
724	0.55
725	0.47
726	0.47
727	0.42
728	0.42
729	0.4
730	0.44
731	0.36
732	0.37
733	0.41
734	0.38
735	0.36
736	0.34
737	0.38
738	0.36
739	0.39
740	0.37
741	0.35
742	0.31
743	0.3
744	0.22
745	0.2
746	0.22
747	0.2
748	0.2
749	0.25
750	0.29
751	0.33
752	0.4
753	0.44
754	0.45
755	0.51
756	0.52
757	0.52
758	0.52
759	0.48
760	0.43
761	0.36
762	0.3
763	0.24
764	0.21
765	0.14
766	0.11
767	0.12
768	0.14
769	0.18
770	0.18
771	0.19
772	0.23
773	0.33
774	0.41
775	0.48
776	0.54
777	0.55
778	0.59
779	0.61
780	0.64
781	0.59
782	0.57
783	0.53
784	0.54
785	0.56
786	0.55
787	0.57
788	0.48
789	0.45
790	0.38
791	0.34
792	0.28
793	0.21
794	0.2
795	0.17
796	0.19
797	0.22
798	0.24
799	0.23
800	0.21
801	0.29
802	0.25
803	0.28
804	0.32
805	0.34
806	0.34
807	0.43
808	0.5
809	0.47
810	0.48
811	0.45
812	0.41
813	0.4
814	0.48
815	0.41
816	0.36
817	0.36
818	0.34
819	0.4
820	0.47
821	0.45
822	0.37
823	0.38
824	0.38
825	0.38
826	0.42
827	0.38
828	0.33
829	0.37
830	0.42
831	0.45
832	0.45
833	0.44
834	0.42
835	0.41
836	0.38
837	0.33
838	0.31
839	0.28
840	0.25
841	0.26
842	0.25
843	0.27
844	0.27
845	0.25
846	0.22
847	0.26
848	0.33
849	0.36
850	0.36
851	0.37
852	0.37
853	0.39
854	0.41
855	0.36
856	0.31
857	0.28
858	0.28
859	0.24
860	0.25
861	0.24
862	0.25
863	0.28
864	0.28
865	0.24
866	0.22
867	0.22
868	0.23
869	0.25
870	0.22
871	0.2
872	0.18
873	0.19
874	0.2
875	0.2
876	0.19
877	0.21
878	0.23
879	0.21
880	0.21
881	0.21
882	0.25
883	0.25
884	0.23
885	0.19
886	0.18
887	0.2
888	0.24
889	0.25
890	0.23
891	0.24
892	0.25
893	0.25
894	0.28
895	0.27
896	0.25
897	0.24
898	0.2
899	0.18
900	0.17
901	0.15
902	0.11
903	0.09
904	0.08
905	0.06
906	0.07
907	0.07
908	0.07
909	0.07
910	0.07
911	0.07
912	0.07
913	0.07
914	0.06
915	0.07
916	0.07
917	0.07
918	0.07
919	0.07
920	0.06
921	0.06
922	0.06
923	0.05
924	0.05
925	0.05
926	0.07
927	0.08
928	0.1
929	0.12
930	0.13
931	0.14
932	0.16
933	0.19
934	0.19
935	0.21
936	0.2
937	0.21
938	0.24
939	0.3
940	0.3
941	0.28
942	0.27
943	0.31
944	0.33
945	0.37
946	0.41
947	0.41
948	0.43
949	0.43
950	0.43
951	0.42
952	0.41
953	0.36
954	0.31
955	0.31
956	0.29
957	0.31
958	0.34
959	0.33
960	0.33
961	0.35
962	0.36
963	0.35
964	0.37
965	0.4
966	0.4
967	0.43
968	0.46
969	0.45
970	0.46
971	0.4
972	0.37
973	0.34
974	0.29
975	0.24
976	0.23
977	0.28
978	0.24
979	0.24
980	0.23
981	0.27
982	0.26
983	0.25
984	0.21
985	0.15
986	0.14
987	0.15
988	0.17
989	0.14
990	0.13
991	0.14
992	0.15
993	0.16
994	0.16
995	0.16
996	0.19
997	0.19
998	0.2
999	0.19
1000	0.17
1001	0.18
1002	0.19
1003	0.19
1004	0.14
1005	0.15
1006	0.15
1007	0.16
1008	0.17
1009	0.16
1010	0.18
1011	0.17
1012	0.17
1013	0.17
1014	0.16
1015	0.16
1016	0.17
1017	0.18
1018	0.19
1019	0.23
1020	0.29
1021	0.3
1022	0.37
1023	0.43
1024	0.44
1025	0.46
1026	0.44
1027	0.5
1028	0.49
1029	0.49
1030	0.44
1031	0.37
1032	0.37
1033	0.35
1034	0.33
1035	0.33
1036	0.31
1037	0.32
1038	0.32
1039	0.38
1040	0.39
1041	0.39
1042	0.42
1043	0.39
1044	0.46
1045	0.43
1046	0.44
1047	0.4
1048	0.4
1049	0.43
1050	0.41
1051	0.4
1052	0.33
1053	0.36
1054	0.36
1055	0.38
1056	0.34
1057	0.36
1058	0.38
1059	0.37
1060	0.39
1061	0.41
1062	0.4
1063	0.42
1064	0.46
1065	0.46
1066	0.47
1067	0.47
1068	0.5
1069	0.51
1070	0.59
1071	0.59
1072	0.62
1073	0.64
1074	0.6
1075	0.59
1076	0.53

A0A317SW60

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer