Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317SXH8

Protein Details
Accession A0A317SXH8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-73EEPPSKKRKVGDGKNGVKEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
393-397KRARR
Subcellular Location(s) cyto 21, cyto_nucl 14.333, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF08512  Rtt106  
Amino Acid Sequences MSKSAGLSWIDEAFPIPSQRSLNKSVRDIIAKEPKHSTVFRNIGKYILSLRGAEEPPSKKRKVGDGKNGVKEEVKVEDVALGKGSVVITVKEISFSVPARKKFTLLLTNSSMSAVNAATGAVEFGVPWSEIQYVACLPVPDKAARQWNFCVFPKGAEGLGDGSSDALVFTIPDGAPKTATGDGMGAGHDTSTYKSLLIAVFDSLLDKGTKVLGPDEKVFYSAVPQSHRKGEKAFHVKAHVGSKEGYLFFLKSGIMWAFKKPLIYFSFAAIESVSYTSITKRTLNLSIHVAEERGDAEFEFSMIDQEEYAGIDTYIKGNRLNDASMAEARRAKKHNVNGKEEEDGEDTGNLQKALEELEDEEEEDYVPGGDKDDDEDELGSELENVNPDVPRAKRARR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.17
4 0.19
5 0.23
6 0.28
7 0.33
8 0.4
9 0.45
10 0.49
11 0.51
12 0.53
13 0.54
14 0.55
15 0.51
16 0.52
17 0.55
18 0.5
19 0.5
20 0.49
21 0.48
22 0.48
23 0.49
24 0.44
25 0.44
26 0.51
27 0.52
28 0.53
29 0.5
30 0.46
31 0.44
32 0.4
33 0.34
34 0.3
35 0.26
36 0.21
37 0.22
38 0.27
39 0.27
40 0.3
41 0.34
42 0.34
43 0.41
44 0.49
45 0.49
46 0.46
47 0.49
48 0.56
49 0.59
50 0.64
51 0.66
52 0.68
53 0.76
54 0.8
55 0.78
56 0.68
57 0.59
58 0.5
59 0.41
60 0.33
61 0.26
62 0.18
63 0.16
64 0.18
65 0.18
66 0.17
67 0.15
68 0.11
69 0.1
70 0.11
71 0.1
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.12
82 0.13
83 0.22
84 0.27
85 0.31
86 0.36
87 0.37
88 0.38
89 0.38
90 0.43
91 0.42
92 0.38
93 0.4
94 0.37
95 0.37
96 0.36
97 0.34
98 0.27
99 0.18
100 0.16
101 0.11
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.04
107 0.05
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.07
121 0.08
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.11
126 0.13
127 0.13
128 0.14
129 0.18
130 0.26
131 0.28
132 0.32
133 0.32
134 0.35
135 0.38
136 0.38
137 0.38
138 0.29
139 0.28
140 0.26
141 0.23
142 0.18
143 0.14
144 0.13
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.03
154 0.03
155 0.02
156 0.03
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.09
199 0.11
200 0.13
201 0.15
202 0.17
203 0.16
204 0.16
205 0.16
206 0.13
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.16
211 0.2
212 0.21
213 0.29
214 0.31
215 0.3
216 0.3
217 0.31
218 0.37
219 0.42
220 0.42
221 0.38
222 0.39
223 0.39
224 0.39
225 0.41
226 0.32
227 0.25
228 0.23
229 0.21
230 0.21
231 0.19
232 0.17
233 0.13
234 0.12
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.07
239 0.09
240 0.09
241 0.11
242 0.12
243 0.13
244 0.16
245 0.17
246 0.19
247 0.17
248 0.22
249 0.21
250 0.25
251 0.24
252 0.22
253 0.24
254 0.22
255 0.22
256 0.16
257 0.14
258 0.1
259 0.1
260 0.08
261 0.06
262 0.07
263 0.08
264 0.11
265 0.13
266 0.13
267 0.15
268 0.18
269 0.24
270 0.25
271 0.26
272 0.28
273 0.27
274 0.27
275 0.25
276 0.22
277 0.16
278 0.15
279 0.13
280 0.09
281 0.09
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.1
301 0.12
302 0.13
303 0.15
304 0.15
305 0.19
306 0.21
307 0.21
308 0.19
309 0.18
310 0.2
311 0.22
312 0.23
313 0.22
314 0.26
315 0.28
316 0.34
317 0.37
318 0.41
319 0.45
320 0.54
321 0.6
322 0.64
323 0.69
324 0.68
325 0.67
326 0.63
327 0.56
328 0.49
329 0.42
330 0.34
331 0.27
332 0.21
333 0.18
334 0.18
335 0.18
336 0.15
337 0.12
338 0.11
339 0.11
340 0.12
341 0.12
342 0.1
343 0.1
344 0.13
345 0.13
346 0.14
347 0.14
348 0.12
349 0.12
350 0.11
351 0.1
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.08
356 0.09
357 0.09
358 0.12
359 0.14
360 0.14
361 0.15
362 0.15
363 0.14
364 0.14
365 0.13
366 0.1
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.1
372 0.12
373 0.12
374 0.14
375 0.2
376 0.21
377 0.29