Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CH35

Protein Details
Accession A1CH35    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
77-104AWVERSPKDRRTGRSKNQKRNPASTRFGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-93RRTGRSKN
540-547HGKRKKGW
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 8, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG act:ACLA_046560  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MAVSPRNNHVTRVQRRNLMNLRRLVSATRPLSFNSPAEYHGVGRGGTQRAFNSGVVQQVKDDEREENHTGDHTDNQAWVERSPKDRRTGRSKNQKRNPASTRFGNPSRNSFHDDTEWSMAPEPAICDETILDQSWDPPAASENCHARPHSEVQSDTSASNPDSALTEISTDLQTRLDMAQHGHGTKKRSTKYENFPKIEDTELHAVERVMEALADSSKNTQYIFRLYRDLPSPGVAYLSERYRGSLLRKFANPPNRRWVDARRYLAIVEDMIAAKLSLSPGLWTSAIHLAGRATGTVKKWDLIRAIGVWQQMEHVGGIKSDHVVFTTLFDISIKAGQFTVADRLLQEMAKRGIVFGRAGKVAMIYYYGLLHDVNGIHRAFDDLISSGEIVDTAVLNCLIISFIRAGEVKTAEQLYQRMMQSQATARHVKAPEYEYDDDPNHQPVLASEFMLYRNKSRELNRVFQKAMHLKKSLPAHHRALQDSVTMSPDTRTFHIFLSYHAYQSGNLNAFKTIMEDMEKSFTMPPRGMIYLLLFEGFARHGKRKKGWTAGKLRLAWRAYLRVLYESRTRLTGDFSFQSPQLTWENPLGGTPVSVPEKSDSSPDRSTTQQPKHDLYTPLPSTMSEARSTSDNNEQGKDKDAELQIEHDPNNAEEILEFDDNVDLEIDNLFLNPTVDEQSATNDMENELRHRIDNGVFLGRRMIIIIIRAFGTVCGPEEVMEAWLSMERIWRPQKRKAVDVQAVREELAKYIQDLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.67
3 0.74
4 0.76
5 0.75
6 0.72
7 0.69
8 0.65
9 0.6
10 0.58
11 0.51
12 0.47
13 0.47
14 0.43
15 0.39
16 0.37
17 0.36
18 0.4
19 0.41
20 0.36
21 0.32
22 0.29
23 0.28
24 0.3
25 0.29
26 0.25
27 0.24
28 0.24
29 0.19
30 0.2
31 0.25
32 0.25
33 0.25
34 0.28
35 0.25
36 0.28
37 0.31
38 0.28
39 0.26
40 0.23
41 0.29
42 0.28
43 0.28
44 0.25
45 0.27
46 0.29
47 0.27
48 0.27
49 0.24
50 0.25
51 0.32
52 0.34
53 0.3
54 0.28
55 0.28
56 0.28
57 0.26
58 0.26
59 0.22
60 0.21
61 0.21
62 0.21
63 0.25
64 0.24
65 0.23
66 0.26
67 0.27
68 0.34
69 0.42
70 0.47
71 0.52
72 0.58
73 0.65
74 0.7
75 0.76
76 0.79
77 0.81
78 0.86
79 0.87
80 0.9
81 0.92
82 0.89
83 0.88
84 0.86
85 0.83
86 0.79
87 0.75
88 0.72
89 0.7
90 0.69
91 0.67
92 0.63
93 0.61
94 0.6
95 0.57
96 0.57
97 0.51
98 0.48
99 0.43
100 0.42
101 0.39
102 0.37
103 0.34
104 0.28
105 0.27
106 0.24
107 0.2
108 0.18
109 0.15
110 0.12
111 0.13
112 0.12
113 0.11
114 0.11
115 0.13
116 0.14
117 0.14
118 0.12
119 0.11
120 0.12
121 0.14
122 0.14
123 0.12
124 0.1
125 0.14
126 0.15
127 0.17
128 0.21
129 0.26
130 0.3
131 0.33
132 0.33
133 0.31
134 0.33
135 0.37
136 0.4
137 0.37
138 0.34
139 0.34
140 0.38
141 0.38
142 0.33
143 0.28
144 0.22
145 0.18
146 0.19
147 0.15
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.11
152 0.09
153 0.1
154 0.09
155 0.1
156 0.11
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.12
166 0.16
167 0.19
168 0.2
169 0.24
170 0.27
171 0.3
172 0.35
173 0.42
174 0.42
175 0.46
176 0.53
177 0.57
178 0.64
179 0.71
180 0.75
181 0.69
182 0.66
183 0.62
184 0.56
185 0.49
186 0.39
187 0.32
188 0.28
189 0.25
190 0.24
191 0.21
192 0.19
193 0.17
194 0.16
195 0.12
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.07
201 0.06
202 0.07
203 0.09
204 0.1
205 0.11
206 0.12
207 0.13
208 0.14
209 0.21
210 0.24
211 0.24
212 0.28
213 0.28
214 0.31
215 0.32
216 0.32
217 0.25
218 0.23
219 0.22
220 0.17
221 0.17
222 0.13
223 0.13
224 0.14
225 0.15
226 0.16
227 0.15
228 0.16
229 0.17
230 0.2
231 0.23
232 0.25
233 0.28
234 0.3
235 0.32
236 0.36
237 0.42
238 0.5
239 0.49
240 0.49
241 0.55
242 0.53
243 0.53
244 0.52
245 0.54
246 0.54
247 0.58
248 0.56
249 0.47
250 0.45
251 0.43
252 0.39
253 0.3
254 0.21
255 0.12
256 0.1
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.05
262 0.06
263 0.05
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.09
272 0.11
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.08
280 0.07
281 0.09
282 0.1
283 0.14
284 0.15
285 0.16
286 0.17
287 0.2
288 0.2
289 0.18
290 0.18
291 0.15
292 0.16
293 0.17
294 0.16
295 0.13
296 0.11
297 0.11
298 0.1
299 0.1
300 0.08
301 0.07
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.09
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.11
327 0.08
328 0.09
329 0.08
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.1
339 0.1
340 0.11
341 0.12
342 0.1
343 0.11
344 0.1
345 0.11
346 0.1
347 0.09
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.09
362 0.09
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.05
374 0.05
375 0.04
376 0.04
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.08
394 0.09
395 0.08
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.11
400 0.12
401 0.12
402 0.15
403 0.15
404 0.15
405 0.15
406 0.15
407 0.15
408 0.19
409 0.21
410 0.21
411 0.23
412 0.22
413 0.28
414 0.28
415 0.27
416 0.26
417 0.24
418 0.22
419 0.27
420 0.29
421 0.24
422 0.26
423 0.26
424 0.24
425 0.24
426 0.23
427 0.16
428 0.14
429 0.12
430 0.09
431 0.13
432 0.12
433 0.11
434 0.1
435 0.1
436 0.12
437 0.16
438 0.17
439 0.15
440 0.18
441 0.2
442 0.25
443 0.28
444 0.35
445 0.37
446 0.45
447 0.49
448 0.51
449 0.49
450 0.45
451 0.49
452 0.48
453 0.48
454 0.44
455 0.39
456 0.35
457 0.39
458 0.45
459 0.45
460 0.42
461 0.43
462 0.43
463 0.48
464 0.51
465 0.47
466 0.42
467 0.35
468 0.31
469 0.26
470 0.21
471 0.17
472 0.13
473 0.12
474 0.11
475 0.12
476 0.13
477 0.13
478 0.15
479 0.15
480 0.15
481 0.19
482 0.18
483 0.18
484 0.23
485 0.23
486 0.21
487 0.2
488 0.2
489 0.16
490 0.18
491 0.21
492 0.16
493 0.16
494 0.16
495 0.16
496 0.16
497 0.15
498 0.15
499 0.11
500 0.09
501 0.1
502 0.1
503 0.11
504 0.13
505 0.13
506 0.13
507 0.15
508 0.17
509 0.18
510 0.18
511 0.18
512 0.19
513 0.2
514 0.19
515 0.17
516 0.15
517 0.13
518 0.13
519 0.12
520 0.08
521 0.07
522 0.08
523 0.08
524 0.11
525 0.13
526 0.2
527 0.25
528 0.32
529 0.39
530 0.47
531 0.55
532 0.61
533 0.66
534 0.69
535 0.74
536 0.75
537 0.76
538 0.71
539 0.65
540 0.62
541 0.55
542 0.49
543 0.42
544 0.38
545 0.31
546 0.3
547 0.28
548 0.26
549 0.26
550 0.26
551 0.28
552 0.27
553 0.27
554 0.26
555 0.26
556 0.22
557 0.26
558 0.24
559 0.23
560 0.22
561 0.23
562 0.23
563 0.22
564 0.23
565 0.19
566 0.2
567 0.19
568 0.18
569 0.19
570 0.19
571 0.19
572 0.18
573 0.18
574 0.16
575 0.12
576 0.11
577 0.1
578 0.13
579 0.14
580 0.15
581 0.16
582 0.16
583 0.19
584 0.19
585 0.25
586 0.24
587 0.28
588 0.31
589 0.32
590 0.33
591 0.35
592 0.43
593 0.47
594 0.52
595 0.53
596 0.55
597 0.56
598 0.58
599 0.6
600 0.55
601 0.48
602 0.5
603 0.44
604 0.4
605 0.36
606 0.32
607 0.3
608 0.31
609 0.3
610 0.22
611 0.21
612 0.21
613 0.23
614 0.24
615 0.24
616 0.28
617 0.31
618 0.32
619 0.34
620 0.36
621 0.35
622 0.39
623 0.37
624 0.29
625 0.3
626 0.3
627 0.3
628 0.27
629 0.3
630 0.28
631 0.3
632 0.29
633 0.24
634 0.23
635 0.21
636 0.22
637 0.19
638 0.15
639 0.1
640 0.12
641 0.14
642 0.13
643 0.13
644 0.11
645 0.12
646 0.11
647 0.12
648 0.11
649 0.06
650 0.06
651 0.07
652 0.07
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.08
660 0.11
661 0.11
662 0.12
663 0.12
664 0.16
665 0.18
666 0.19
667 0.18
668 0.15
669 0.16
670 0.18
671 0.19
672 0.19
673 0.2
674 0.21
675 0.21
676 0.22
677 0.24
678 0.23
679 0.26
680 0.26
681 0.3
682 0.29
683 0.28
684 0.29
685 0.26
686 0.24
687 0.21
688 0.19
689 0.12
690 0.15
691 0.16
692 0.15
693 0.15
694 0.15
695 0.14
696 0.13
697 0.14
698 0.11
699 0.12
700 0.12
701 0.11
702 0.12
703 0.13
704 0.13
705 0.13
706 0.12
707 0.1
708 0.09
709 0.1
710 0.1
711 0.1
712 0.15
713 0.15
714 0.24
715 0.34
716 0.43
717 0.49
718 0.58
719 0.67
720 0.69
721 0.75
722 0.75
723 0.76
724 0.75
725 0.76
726 0.74
727 0.7
728 0.65
729 0.57
730 0.51
731 0.41
732 0.33
733 0.29
734 0.22