Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317SIX2

Protein Details
Accession A0A317SIX2    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
277-297IARLARKKLSHFPPRRRKGSVBasic
431-450RGDGRVVRERLPRPRRERSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
282-294RKKLSHFPPRRRK
442-446PRPRR
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 10.5, cyto 8, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MQRDPPVPYDNPSSKVLNAATTATTNGGLSGGSVGNGWGLQWSALQGLANSALGSDVGATTSDSPATQPHRSAVAAVRRRRRPADAMTATGAGGGGGRRSQSSGSWLGGISILEADSPRDAGGGSGSGGARSQNSIKNRKFSNKRSTSPDPTDDPTLLSTTGDESDALAYVHHVKPTDTLEGVVIMYNIHASALYRANGMWPGDSVQRRKILLLPVEDCGVKGKPVDLLNLDLACDRWTDLPPPKKELTPQEKAAAEERGYQHESFVMMDDIGQVEIARLARKKLSHFPPRRRKGSVSTGTATGFGTPPPDDETSVFRGMTPGVGALGGSEGGARVGLRAEESVAKALIELAQGAGAGLESVGGVIEGFVRKWTTKAQDFATHDLIELTQRLGFEIEEEDRGGSGRRNGSGSGGIGERAAGYKRMGCSTARGDGRVVRERLPRPRRERSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.4
3 0.37
4 0.3
5 0.26
6 0.24
7 0.22
8 0.2
9 0.21
10 0.16
11 0.16
12 0.13
13 0.12
14 0.1
15 0.08
16 0.07
17 0.09
18 0.08
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.06
29 0.07
30 0.07
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.05
43 0.04
44 0.04
45 0.05
46 0.06
47 0.07
48 0.08
49 0.09
50 0.08
51 0.09
52 0.15
53 0.2
54 0.23
55 0.23
56 0.25
57 0.27
58 0.27
59 0.29
60 0.31
61 0.35
62 0.4
63 0.47
64 0.55
65 0.59
66 0.66
67 0.68
68 0.67
69 0.63
70 0.62
71 0.65
72 0.59
73 0.55
74 0.5
75 0.46
76 0.39
77 0.32
78 0.24
79 0.13
80 0.1
81 0.07
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.16
90 0.18
91 0.17
92 0.18
93 0.17
94 0.16
95 0.16
96 0.15
97 0.1
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.06
110 0.05
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.1
119 0.13
120 0.17
121 0.25
122 0.35
123 0.38
124 0.45
125 0.5
126 0.58
127 0.64
128 0.68
129 0.71
130 0.7
131 0.71
132 0.73
133 0.76
134 0.74
135 0.7
136 0.65
137 0.58
138 0.52
139 0.5
140 0.41
141 0.34
142 0.26
143 0.21
144 0.17
145 0.13
146 0.1
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.06
155 0.05
156 0.06
157 0.1
158 0.11
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.14
163 0.17
164 0.18
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.09
171 0.07
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.06
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.12
186 0.11
187 0.09
188 0.07
189 0.08
190 0.14
191 0.18
192 0.19
193 0.21
194 0.25
195 0.25
196 0.25
197 0.27
198 0.26
199 0.26
200 0.27
201 0.24
202 0.22
203 0.22
204 0.21
205 0.18
206 0.15
207 0.12
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.1
212 0.11
213 0.12
214 0.11
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.07
223 0.06
224 0.07
225 0.08
226 0.12
227 0.19
228 0.27
229 0.29
230 0.34
231 0.35
232 0.35
233 0.39
234 0.44
235 0.45
236 0.42
237 0.43
238 0.42
239 0.41
240 0.41
241 0.39
242 0.31
243 0.24
244 0.23
245 0.22
246 0.22
247 0.24
248 0.22
249 0.2
250 0.18
251 0.18
252 0.13
253 0.13
254 0.09
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.03
263 0.05
264 0.06
265 0.08
266 0.09
267 0.11
268 0.14
269 0.16
270 0.21
271 0.29
272 0.38
273 0.46
274 0.55
275 0.65
276 0.73
277 0.8
278 0.82
279 0.78
280 0.73
281 0.69
282 0.7
283 0.67
284 0.61
285 0.53
286 0.49
287 0.44
288 0.4
289 0.33
290 0.23
291 0.15
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.1
296 0.13
297 0.13
298 0.14
299 0.15
300 0.19
301 0.21
302 0.22
303 0.21
304 0.17
305 0.17
306 0.16
307 0.15
308 0.11
309 0.07
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.07
328 0.09
329 0.1
330 0.12
331 0.11
332 0.11
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.08
337 0.07
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.02
348 0.02
349 0.02
350 0.02
351 0.02
352 0.02
353 0.05
354 0.06
355 0.06
356 0.08
357 0.1
358 0.11
359 0.13
360 0.2
361 0.26
362 0.31
363 0.35
364 0.38
365 0.45
366 0.48
367 0.52
368 0.49
369 0.41
370 0.36
371 0.32
372 0.28
373 0.21
374 0.18
375 0.13
376 0.11
377 0.1
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.1
382 0.13
383 0.14
384 0.14
385 0.14
386 0.14
387 0.13
388 0.14
389 0.14
390 0.14
391 0.19
392 0.21
393 0.23
394 0.25
395 0.26
396 0.28
397 0.29
398 0.26
399 0.23
400 0.19
401 0.17
402 0.15
403 0.15
404 0.12
405 0.12
406 0.13
407 0.12
408 0.13
409 0.18
410 0.21
411 0.24
412 0.25
413 0.24
414 0.29
415 0.32
416 0.39
417 0.37
418 0.36
419 0.35
420 0.38
421 0.45
422 0.48
423 0.45
424 0.43
425 0.5
426 0.56
427 0.65
428 0.7
429 0.72
430 0.73