Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317T024

Protein Details
Accession A0A317T024    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
270-292EEPSPPPRAPPRPRGIRKRVLYTHydrophilic
1159-1179HPTGTMGKKRQLKRGKTQGADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-288PPPRAPPRPRGIRKR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.5, cyto 9.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018834  DNA/RNA-bd_Est1-type  
IPR045153  Est1/Ebs1-like  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR002716  PIN_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0004540  F:RNA nuclease activity  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF10373  EST1_DNA_bind  
PF13638  PIN_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd09880  PIN_Smg5-6-like  
Amino Acid Sequences MGGAGHGNVQAIDIESRIVENKRRQSRDSSYECTICRMVFNAERGLWNHIIAHHQEKCPQDEAELQRFRTHMKEICQRKGADVPSRPENIQTSHNSNAFIRWSSKDTTSSKDAGGQRLGRKVESGDQISPSAHSRGNVDDIANGTSHINLGHPDVQMADASSQARLINRKRNGPDSAPEGGPPTPTHNTPRESQPKRTRAGGSGRGPNVQKLPRTPLDPDFDRSRFKTEQYGDNEGGPTTRPTASRRLFDPEKDHPGAFKSEEDSSKRLEEPSPPPRAPPRPRGIRKRVLYTPTGKVAVPTPQPFSHNREGGQMMILDNFAEQSQQSTQPPQGRQMRPPPFHGDPTLEVNETRMVRQPETRPISPEQLIAEVKGIYAGLVMVEAKCAEVDAKQAATTFDDGQTQPRLNDEQWQALIALHRTLLHEHHDFFLASQHPSASPALRRLADKYAMPARMWRHGIYSFLELLRHRLPHSLEHMLTFIYLAYSMMALLYETVPAFENTWVECLGDLGRYRMAIEDGDIRDRDVWAGVARFWYSKATDKTPYVGRLFHHLAILSRPNILQQLFYYCKSLAVTQPFFPARESILTLFDPVFSPEHASKNRHVDAGFIQLHGINFTHIDLEKFDDALFDYLDNLDQHIGKTESDWKVSGAYIAVCNITGLSQYGAKESLLRLALREGGNRRIPEEEGMEDAPLSLSFSKRLAYKILSVALQRIGDSNVLPHVHIWLVFLSHVVKSGPAIRLLENEFPWEHLVSMLNSLVGQSDQDRFGCREFPVPEKGRGRPLPEDYTLRGLEWARKYFPNRWFEDAQVDEEERSVEVPSMENVRIERILWLATQVAANGECLVYDDNFKVHPALVARNEEHKKLEAIIAHEQELGGSRMTPTSEDSDIDMTSGENESEDGDYVVVGQSEEVRHLKQRQRQLKAQLKAGGKAADSAEEPKRAVAKGPESLKENFSILVVDTNLLLSQPEVFKLMVSTFNWSIVIPNTVVITELLGLTNSTGSVGDDAKAAMIAIHEALTDKRDVKVVTAKGNNVTSIGFYKEQLEKSGDDEQRKIDDIIIETTKLQGEARRQAVPGDYGDYEAAVLITEDRNMRVKANARGVTAIPTSALKKVLSPPAGSDRSKRKSFGAPAVAPDWPEDEVAFVEPGGEFESALNVHPTGTMGKKRQLKRGKTQGADMP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.1
4 0.14
5 0.19
6 0.26
7 0.35
8 0.45
9 0.55
10 0.6
11 0.63
12 0.68
13 0.73
14 0.74
15 0.73
16 0.69
17 0.66
18 0.65
19 0.62
20 0.57
21 0.5
22 0.4
23 0.34
24 0.3
25 0.29
26 0.29
27 0.32
28 0.32
29 0.31
30 0.34
31 0.35
32 0.39
33 0.34
34 0.29
35 0.28
36 0.24
37 0.28
38 0.29
39 0.35
40 0.35
41 0.37
42 0.42
43 0.44
44 0.47
45 0.46
46 0.42
47 0.36
48 0.38
49 0.44
50 0.48
51 0.49
52 0.46
53 0.46
54 0.46
55 0.46
56 0.41
57 0.41
58 0.36
59 0.39
60 0.47
61 0.53
62 0.61
63 0.65
64 0.61
65 0.59
66 0.6
67 0.59
68 0.58
69 0.57
70 0.54
71 0.55
72 0.58
73 0.54
74 0.51
75 0.48
76 0.41
77 0.41
78 0.41
79 0.4
80 0.42
81 0.44
82 0.42
83 0.39
84 0.39
85 0.35
86 0.32
87 0.29
88 0.27
89 0.29
90 0.31
91 0.33
92 0.38
93 0.37
94 0.4
95 0.42
96 0.41
97 0.38
98 0.41
99 0.42
100 0.4
101 0.44
102 0.44
103 0.44
104 0.49
105 0.5
106 0.43
107 0.4
108 0.38
109 0.38
110 0.39
111 0.38
112 0.33
113 0.33
114 0.34
115 0.33
116 0.32
117 0.28
118 0.24
119 0.21
120 0.19
121 0.19
122 0.21
123 0.25
124 0.24
125 0.22
126 0.21
127 0.21
128 0.21
129 0.19
130 0.16
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.12
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.15
145 0.11
146 0.1
147 0.11
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.16
152 0.23
153 0.3
154 0.38
155 0.43
156 0.52
157 0.56
158 0.61
159 0.64
160 0.6
161 0.58
162 0.54
163 0.52
164 0.44
165 0.39
166 0.35
167 0.3
168 0.27
169 0.23
170 0.24
171 0.23
172 0.26
173 0.32
174 0.35
175 0.37
176 0.39
177 0.49
178 0.53
179 0.55
180 0.63
181 0.67
182 0.69
183 0.69
184 0.72
185 0.65
186 0.61
187 0.64
188 0.63
189 0.59
190 0.6
191 0.58
192 0.57
193 0.55
194 0.51
195 0.5
196 0.45
197 0.43
198 0.39
199 0.45
200 0.43
201 0.45
202 0.46
203 0.45
204 0.47
205 0.46
206 0.47
207 0.47
208 0.46
209 0.48
210 0.46
211 0.47
212 0.41
213 0.4
214 0.44
215 0.4
216 0.46
217 0.46
218 0.51
219 0.45
220 0.44
221 0.42
222 0.33
223 0.3
224 0.23
225 0.18
226 0.14
227 0.16
228 0.17
229 0.19
230 0.3
231 0.34
232 0.36
233 0.37
234 0.43
235 0.45
236 0.47
237 0.51
238 0.48
239 0.52
240 0.51
241 0.49
242 0.41
243 0.4
244 0.38
245 0.33
246 0.27
247 0.21
248 0.23
249 0.28
250 0.31
251 0.3
252 0.29
253 0.31
254 0.3
255 0.29
256 0.27
257 0.29
258 0.34
259 0.41
260 0.47
261 0.44
262 0.47
263 0.54
264 0.62
265 0.63
266 0.64
267 0.65
268 0.68
269 0.78
270 0.84
271 0.85
272 0.84
273 0.82
274 0.8
275 0.77
276 0.71
277 0.67
278 0.62
279 0.57
280 0.51
281 0.47
282 0.39
283 0.33
284 0.3
285 0.3
286 0.3
287 0.28
288 0.29
289 0.29
290 0.32
291 0.35
292 0.4
293 0.42
294 0.39
295 0.37
296 0.37
297 0.36
298 0.33
299 0.3
300 0.23
301 0.16
302 0.13
303 0.12
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.07
311 0.09
312 0.13
313 0.14
314 0.17
315 0.22
316 0.29
317 0.31
318 0.37
319 0.44
320 0.45
321 0.51
322 0.59
323 0.63
324 0.59
325 0.63
326 0.62
327 0.55
328 0.54
329 0.49
330 0.42
331 0.34
332 0.37
333 0.34
334 0.27
335 0.23
336 0.21
337 0.24
338 0.21
339 0.2
340 0.2
341 0.21
342 0.22
343 0.28
344 0.31
345 0.37
346 0.43
347 0.43
348 0.42
349 0.42
350 0.45
351 0.4
352 0.38
353 0.29
354 0.26
355 0.25
356 0.21
357 0.19
358 0.13
359 0.12
360 0.1
361 0.09
362 0.05
363 0.05
364 0.04
365 0.03
366 0.03
367 0.04
368 0.03
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.04
376 0.07
377 0.08
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.11
383 0.12
384 0.11
385 0.11
386 0.13
387 0.13
388 0.16
389 0.19
390 0.18
391 0.16
392 0.18
393 0.2
394 0.17
395 0.25
396 0.24
397 0.23
398 0.22
399 0.23
400 0.21
401 0.19
402 0.2
403 0.13
404 0.11
405 0.09
406 0.09
407 0.1
408 0.11
409 0.11
410 0.15
411 0.16
412 0.17
413 0.17
414 0.18
415 0.17
416 0.15
417 0.18
418 0.15
419 0.14
420 0.13
421 0.13
422 0.12
423 0.14
424 0.15
425 0.13
426 0.13
427 0.16
428 0.19
429 0.21
430 0.22
431 0.23
432 0.25
433 0.25
434 0.23
435 0.24
436 0.26
437 0.26
438 0.25
439 0.27
440 0.26
441 0.29
442 0.31
443 0.27
444 0.24
445 0.23
446 0.25
447 0.23
448 0.22
449 0.18
450 0.16
451 0.18
452 0.15
453 0.18
454 0.19
455 0.18
456 0.17
457 0.19
458 0.2
459 0.22
460 0.26
461 0.27
462 0.24
463 0.24
464 0.23
465 0.19
466 0.18
467 0.14
468 0.09
469 0.05
470 0.04
471 0.04
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.05
484 0.06
485 0.07
486 0.07
487 0.08
488 0.07
489 0.09
490 0.08
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.06
495 0.08
496 0.08
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.08
503 0.06
504 0.07
505 0.11
506 0.12
507 0.14
508 0.14
509 0.14
510 0.13
511 0.13
512 0.13
513 0.08
514 0.08
515 0.06
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.1
523 0.1
524 0.16
525 0.19
526 0.21
527 0.25
528 0.25
529 0.28
530 0.29
531 0.31
532 0.26
533 0.25
534 0.22
535 0.25
536 0.27
537 0.24
538 0.22
539 0.18
540 0.17
541 0.18
542 0.2
543 0.14
544 0.12
545 0.11
546 0.11
547 0.13
548 0.13
549 0.11
550 0.09
551 0.14
552 0.16
553 0.16
554 0.18
555 0.15
556 0.16
557 0.16
558 0.17
559 0.15
560 0.18
561 0.19
562 0.18
563 0.22
564 0.22
565 0.22
566 0.21
567 0.18
568 0.13
569 0.13
570 0.13
571 0.1
572 0.11
573 0.11
574 0.11
575 0.1
576 0.1
577 0.09
578 0.09
579 0.09
580 0.07
581 0.09
582 0.11
583 0.16
584 0.19
585 0.22
586 0.24
587 0.31
588 0.32
589 0.31
590 0.28
591 0.25
592 0.23
593 0.27
594 0.24
595 0.17
596 0.16
597 0.15
598 0.15
599 0.14
600 0.13
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.07
605 0.06
606 0.07
607 0.06
608 0.09
609 0.09
610 0.09
611 0.08
612 0.07
613 0.08
614 0.08
615 0.07
616 0.05
617 0.05
618 0.05
619 0.06
620 0.06
621 0.06
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.08
626 0.09
627 0.08
628 0.09
629 0.16
630 0.17
631 0.17
632 0.18
633 0.16
634 0.16
635 0.16
636 0.15
637 0.08
638 0.08
639 0.07
640 0.07
641 0.07
642 0.06
643 0.06
644 0.05
645 0.05
646 0.04
647 0.04
648 0.04
649 0.06
650 0.06
651 0.07
652 0.08
653 0.08
654 0.09
655 0.08
656 0.11
657 0.11
658 0.11
659 0.11
660 0.11
661 0.15
662 0.15
663 0.19
664 0.18
665 0.22
666 0.27
667 0.26
668 0.27
669 0.24
670 0.24
671 0.22
672 0.21
673 0.16
674 0.14
675 0.14
676 0.12
677 0.1
678 0.1
679 0.08
680 0.06
681 0.07
682 0.05
683 0.05
684 0.07
685 0.07
686 0.09
687 0.1
688 0.12
689 0.14
690 0.14
691 0.17
692 0.18
693 0.19
694 0.18
695 0.17
696 0.18
697 0.17
698 0.15
699 0.13
700 0.12
701 0.11
702 0.1
703 0.1
704 0.09
705 0.1
706 0.1
707 0.1
708 0.09
709 0.09
710 0.09
711 0.09
712 0.09
713 0.06
714 0.06
715 0.06
716 0.07
717 0.07
718 0.07
719 0.07
720 0.07
721 0.07
722 0.07
723 0.11
724 0.12
725 0.13
726 0.14
727 0.14
728 0.17
729 0.2
730 0.21
731 0.17
732 0.18
733 0.17
734 0.16
735 0.17
736 0.15
737 0.12
738 0.1
739 0.11
740 0.09
741 0.1
742 0.09
743 0.07
744 0.07
745 0.07
746 0.06
747 0.05
748 0.05
749 0.06
750 0.08
751 0.09
752 0.1
753 0.12
754 0.13
755 0.14
756 0.16
757 0.16
758 0.2
759 0.21
760 0.24
761 0.31
762 0.33
763 0.4
764 0.42
765 0.44
766 0.47
767 0.47
768 0.48
769 0.45
770 0.47
771 0.44
772 0.42
773 0.43
774 0.36
775 0.38
776 0.33
777 0.28
778 0.25
779 0.21
780 0.24
781 0.26
782 0.27
783 0.26
784 0.3
785 0.35
786 0.4
787 0.47
788 0.48
789 0.47
790 0.49
791 0.48
792 0.45
793 0.46
794 0.4
795 0.34
796 0.28
797 0.25
798 0.2
799 0.18
800 0.17
801 0.11
802 0.1
803 0.08
804 0.07
805 0.06
806 0.07
807 0.08
808 0.11
809 0.12
810 0.12
811 0.12
812 0.14
813 0.14
814 0.13
815 0.13
816 0.1
817 0.11
818 0.09
819 0.1
820 0.08
821 0.09
822 0.08
823 0.08
824 0.08
825 0.07
826 0.07
827 0.07
828 0.06
829 0.05
830 0.06
831 0.07
832 0.07
833 0.08
834 0.09
835 0.09
836 0.1
837 0.11
838 0.1
839 0.09
840 0.11
841 0.11
842 0.16
843 0.19
844 0.23
845 0.24
846 0.32
847 0.35
848 0.34
849 0.35
850 0.31
851 0.28
852 0.25
853 0.27
854 0.2
855 0.22
856 0.26
857 0.25
858 0.25
859 0.24
860 0.22
861 0.19
862 0.19
863 0.15
864 0.09
865 0.08
866 0.08
867 0.09
868 0.09
869 0.1
870 0.1
871 0.13
872 0.14
873 0.14
874 0.15
875 0.16
876 0.15
877 0.15
878 0.13
879 0.09
880 0.09
881 0.09
882 0.07
883 0.06
884 0.06
885 0.07
886 0.07
887 0.07
888 0.06
889 0.06
890 0.06
891 0.06
892 0.06
893 0.05
894 0.05
895 0.05
896 0.06
897 0.07
898 0.11
899 0.12
900 0.13
901 0.19
902 0.28
903 0.35
904 0.41
905 0.51
906 0.57
907 0.63
908 0.69
909 0.74
910 0.75
911 0.73
912 0.72
913 0.69
914 0.62
915 0.57
916 0.52
917 0.43
918 0.34
919 0.31
920 0.25
921 0.19
922 0.17
923 0.2
924 0.21
925 0.21
926 0.21
927 0.21
928 0.23
929 0.22
930 0.25
931 0.25
932 0.27
933 0.31
934 0.36
935 0.37
936 0.38
937 0.4
938 0.38
939 0.34
940 0.3
941 0.23
942 0.19
943 0.16
944 0.12
945 0.12
946 0.11
947 0.09
948 0.08
949 0.08
950 0.08
951 0.07
952 0.07
953 0.05
954 0.08
955 0.08
956 0.09
957 0.1
958 0.1
959 0.1
960 0.12
961 0.13
962 0.14
963 0.14
964 0.19
965 0.18
966 0.19
967 0.19
968 0.18
969 0.18
970 0.16
971 0.17
972 0.12
973 0.12
974 0.11
975 0.11
976 0.11
977 0.1
978 0.08
979 0.07
980 0.07
981 0.06
982 0.06
983 0.06
984 0.06
985 0.06
986 0.05
987 0.05
988 0.05
989 0.05
990 0.07
991 0.08
992 0.08
993 0.08
994 0.09
995 0.08
996 0.08
997 0.07
998 0.06
999 0.05
1000 0.06
1001 0.05
1002 0.06
1003 0.06
1004 0.07
1005 0.08
1006 0.09
1007 0.12
1008 0.13
1009 0.13
1010 0.17
1011 0.17
1012 0.2
1013 0.28
1014 0.3
1015 0.36
1016 0.39
1017 0.41
1018 0.42
1019 0.44
1020 0.4
1021 0.32
1022 0.28
1023 0.22
1024 0.19
1025 0.21
1026 0.17
1027 0.16
1028 0.21
1029 0.25
1030 0.26
1031 0.28
1032 0.28
1033 0.25
1034 0.28
1035 0.37
1036 0.38
1037 0.37
1038 0.37
1039 0.37
1040 0.38
1041 0.4
1042 0.36
1043 0.28
1044 0.26
1045 0.24
1046 0.27
1047 0.26
1048 0.23
1049 0.21
1050 0.22
1051 0.21
1052 0.18
1053 0.18
1054 0.17
1055 0.23
1056 0.3
1057 0.34
1058 0.36
1059 0.35
1060 0.36
1061 0.37
1062 0.35
1063 0.29
1064 0.25
1065 0.21
1066 0.2
1067 0.19
1068 0.17
1069 0.15
1070 0.12
1071 0.1
1072 0.06
1073 0.06
1074 0.06
1075 0.07
1076 0.09
1077 0.1
1078 0.13
1079 0.18
1080 0.19
1081 0.21
1082 0.26
1083 0.32
1084 0.38
1085 0.47
1086 0.48
1087 0.44
1088 0.46
1089 0.45
1090 0.43
1091 0.37
1092 0.29
1093 0.2
1094 0.2
1095 0.2
1096 0.2
1097 0.22
1098 0.17
1099 0.2
1100 0.27
1101 0.34
1102 0.35
1103 0.34
1104 0.37
1105 0.43
1106 0.5
1107 0.49
1108 0.5
1109 0.52
1110 0.58
1111 0.61
1112 0.59
1113 0.54
1114 0.57
1115 0.63
1116 0.64
1117 0.63
1118 0.56
1119 0.56
1120 0.56
1121 0.52
1122 0.43
1123 0.37
1124 0.29
1125 0.2
1126 0.19
1127 0.14
1128 0.12
1129 0.12
1130 0.13
1131 0.12
1132 0.1
1133 0.1
1134 0.09
1135 0.1
1136 0.11
1137 0.1
1138 0.08
1139 0.08
1140 0.11
1141 0.11
1142 0.12
1143 0.14
1144 0.11
1145 0.12
1146 0.12
1147 0.13
1148 0.15
1149 0.21
1150 0.29
1151 0.33
1152 0.42
1153 0.51
1154 0.57
1155 0.67
1156 0.72
1157 0.75
1158 0.77
1159 0.83
1160 0.84
1161 0.79