Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317SHE7

Protein Details
Accession A0A317SHE7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
232-268CEEEMVDRKRKRKKEEEETGGKKKKSVSRATRELQKVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-260RKRKRKKEEEETGGKKKKSVSR
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_mito 9.5, nucl 7, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040456  RNase_H2_suB  
IPR019024  RNase_H2_suB_wHTH  
Gene Ontology GO:0032299  C:ribonuclease H2 complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF09468  RNase_H2-Ydr279  
Amino Acid Sequences MYICTPLDPLFVLLPRLFPAAAADAINRFLPVEDLFEEITTGAEGDWELVAKSQVAERRLAAVCESVDIGDEKAYKPSWEKLMNILDGKCVRMAKGGLPATMEEGFVRKPLTRPELEIRGVKKEDKDREMGGGGNTEAAVGVLPAPPDSQATRPRLSEASQEVTDLLRIRVASEFISNNYLSVSVAEALSDCLQKSHDFTPLDNYLAELVKIRQEAAAVRFHDHQIKRSHECEEEMVDRKRKRKKEEEETGGKKKKSVSRATRELQKVDKTGMPTITAFFGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.19
4 0.17
5 0.14
6 0.15
7 0.14
8 0.15
9 0.15
10 0.14
11 0.14
12 0.15
13 0.16
14 0.13
15 0.11
16 0.09
17 0.11
18 0.1
19 0.12
20 0.12
21 0.14
22 0.14
23 0.14
24 0.14
25 0.11
26 0.11
27 0.08
28 0.07
29 0.05
30 0.05
31 0.04
32 0.05
33 0.05
34 0.05
35 0.05
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.07
40 0.1
41 0.15
42 0.16
43 0.18
44 0.18
45 0.23
46 0.23
47 0.23
48 0.21
49 0.18
50 0.16
51 0.15
52 0.15
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.12
61 0.13
62 0.14
63 0.16
64 0.2
65 0.25
66 0.27
67 0.27
68 0.31
69 0.34
70 0.36
71 0.36
72 0.32
73 0.3
74 0.27
75 0.27
76 0.23
77 0.19
78 0.16
79 0.16
80 0.17
81 0.14
82 0.22
83 0.22
84 0.2
85 0.2
86 0.2
87 0.2
88 0.19
89 0.17
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.11
95 0.09
96 0.11
97 0.16
98 0.21
99 0.21
100 0.25
101 0.29
102 0.33
103 0.35
104 0.37
105 0.33
106 0.33
107 0.34
108 0.32
109 0.31
110 0.34
111 0.37
112 0.36
113 0.37
114 0.32
115 0.32
116 0.31
117 0.27
118 0.19
119 0.14
120 0.11
121 0.09
122 0.08
123 0.06
124 0.05
125 0.04
126 0.03
127 0.02
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.06
135 0.07
136 0.11
137 0.17
138 0.22
139 0.23
140 0.24
141 0.25
142 0.26
143 0.26
144 0.26
145 0.23
146 0.22
147 0.2
148 0.2
149 0.19
150 0.17
151 0.17
152 0.14
153 0.11
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.13
164 0.12
165 0.12
166 0.11
167 0.11
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.09
181 0.1
182 0.13
183 0.13
184 0.19
185 0.19
186 0.2
187 0.26
188 0.26
189 0.27
190 0.23
191 0.22
192 0.17
193 0.16
194 0.16
195 0.11
196 0.1
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.11
202 0.15
203 0.16
204 0.21
205 0.19
206 0.22
207 0.24
208 0.26
209 0.34
210 0.32
211 0.36
212 0.38
213 0.43
214 0.46
215 0.46
216 0.48
217 0.42
218 0.43
219 0.39
220 0.36
221 0.34
222 0.36
223 0.41
224 0.45
225 0.49
226 0.55
227 0.62
228 0.66
229 0.7
230 0.74
231 0.78
232 0.8
233 0.86
234 0.87
235 0.88
236 0.88
237 0.88
238 0.86
239 0.76
240 0.68
241 0.65
242 0.63
243 0.62
244 0.64
245 0.64
246 0.66
247 0.74
248 0.78
249 0.8
250 0.79
251 0.75
252 0.71
253 0.67
254 0.6
255 0.55
256 0.52
257 0.46
258 0.45
259 0.4
260 0.35
261 0.29
262 0.28
263 0.27