Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317SQF5

Protein Details
Accession A0A317SQF5    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
611-642AVRTPVPKMPRPPRPPKPPRSRKGRIADPTKSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
588-588K
590-592IKK
616-635VPKMPRPPRPPKPPRSRKGR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037651  Swc3  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0000812  C:Swr1 complex  
GO:0140849  F:ATP-dependent H2AZ histone chaperone activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MGEKRKRTVAVRESHPSKHHSATPAAAETPTPEEQTSTPEVPTSFTRDGPLPVIPHRQPDGLLLSDHKSVAESKVMAESLIRSQRKWVDGDIFEKFWIKPLKSRKLDPAELEKNPSKDCMTRLGSCTMSSMPHKFDIKLFGVLEPSGISENTASRPSFTPHRGQSTGAGVQTPSAYQVPQQGVIRTPDPAWAQSSPAPVTPVPHQKPTSNPACISSQPSTLSQPSHQGPQLQQGNPPQQSPHRVVAPPATLRPDPVIQALAIRAASDPDLKALMRIVASGKATTEQLKIFQGHIDALTPVTSSQLIHNHTARPSTQTPGPSSTAGSGHTAQVPHQQTHPGHQQRHHHQQQLQHTQQPQPQHQSQHHPQQHLHQQQYHQHQPHPQSHSNPPQFTHHPPQPTPNRTPAPHPVQTNPKSRPFPQPPKQEITSVVFEFVDPYSQGDRFHFPKHAILEYLKGGTMVRASFILVRKPVDDLDEYYQPMTIVLESVTPKPLDILQRVVASPEITRKHMEEIMASKKRAEDTFLVFRLRREPGETVPDKPEMHEKVEVTSRVLRERRARRESSTPARDPKSLADTSQAAPSRPRVKTIKKAIPREPTAQPSIPSPSTSAVRTPVPKMPRPPRPPKPPRSRKGRIADPTKSCHICQTSKTSLWRKADIEGENVTVCNACGIKWKTNAQKAAQAATQGITGQPLPTDGAGPSSDTVRPTTQQPEAGVPQMQYNQHAAGSTANDLNDLNGQQVHANACQVAASSAPVPCSQQCPQHVASASGPQPSLPQQGGNPQLPSLMEGLQPASSSGDNGPQSLPPVNDTLPGPVSVVTDGPPLLQQAIPEKPMDQNSSMVQGAPGGLGDIV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.69
3 0.65
4 0.61
5 0.57
6 0.56
7 0.5
8 0.49
9 0.47
10 0.47
11 0.44
12 0.39
13 0.34
14 0.28
15 0.26
16 0.27
17 0.25
18 0.22
19 0.2
20 0.21
21 0.21
22 0.26
23 0.3
24 0.26
25 0.24
26 0.25
27 0.25
28 0.25
29 0.28
30 0.3
31 0.26
32 0.26
33 0.28
34 0.28
35 0.3
36 0.3
37 0.3
38 0.26
39 0.29
40 0.37
41 0.36
42 0.4
43 0.41
44 0.4
45 0.36
46 0.37
47 0.36
48 0.28
49 0.28
50 0.25
51 0.25
52 0.25
53 0.25
54 0.21
55 0.18
56 0.18
57 0.18
58 0.2
59 0.17
60 0.17
61 0.2
62 0.2
63 0.19
64 0.18
65 0.17
66 0.21
67 0.29
68 0.3
69 0.27
70 0.34
71 0.4
72 0.43
73 0.43
74 0.4
75 0.38
76 0.41
77 0.45
78 0.42
79 0.37
80 0.35
81 0.35
82 0.3
83 0.3
84 0.34
85 0.31
86 0.35
87 0.44
88 0.54
89 0.58
90 0.63
91 0.66
92 0.67
93 0.71
94 0.69
95 0.69
96 0.66
97 0.62
98 0.64
99 0.59
100 0.54
101 0.49
102 0.46
103 0.39
104 0.35
105 0.34
106 0.36
107 0.36
108 0.37
109 0.39
110 0.41
111 0.38
112 0.35
113 0.35
114 0.27
115 0.26
116 0.26
117 0.26
118 0.25
119 0.3
120 0.32
121 0.31
122 0.32
123 0.35
124 0.33
125 0.34
126 0.31
127 0.26
128 0.26
129 0.24
130 0.22
131 0.15
132 0.14
133 0.11
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.13
139 0.16
140 0.15
141 0.17
142 0.19
143 0.22
144 0.29
145 0.32
146 0.38
147 0.4
148 0.47
149 0.46
150 0.46
151 0.45
152 0.43
153 0.42
154 0.34
155 0.29
156 0.21
157 0.2
158 0.19
159 0.16
160 0.13
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.17
165 0.18
166 0.22
167 0.23
168 0.23
169 0.25
170 0.28
171 0.27
172 0.23
173 0.21
174 0.22
175 0.22
176 0.22
177 0.22
178 0.2
179 0.22
180 0.23
181 0.26
182 0.22
183 0.22
184 0.23
185 0.2
186 0.22
187 0.26
188 0.34
189 0.33
190 0.4
191 0.41
192 0.41
193 0.47
194 0.52
195 0.52
196 0.46
197 0.43
198 0.39
199 0.39
200 0.39
201 0.39
202 0.33
203 0.29
204 0.26
205 0.27
206 0.28
207 0.27
208 0.27
209 0.23
210 0.27
211 0.26
212 0.29
213 0.29
214 0.29
215 0.28
216 0.35
217 0.41
218 0.36
219 0.38
220 0.4
221 0.47
222 0.44
223 0.44
224 0.38
225 0.35
226 0.4
227 0.41
228 0.38
229 0.35
230 0.34
231 0.35
232 0.36
233 0.36
234 0.33
235 0.3
236 0.31
237 0.26
238 0.26
239 0.27
240 0.24
241 0.2
242 0.19
243 0.17
244 0.12
245 0.13
246 0.12
247 0.11
248 0.09
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.1
257 0.09
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.13
271 0.14
272 0.12
273 0.14
274 0.16
275 0.17
276 0.16
277 0.16
278 0.15
279 0.13
280 0.13
281 0.11
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.09
291 0.14
292 0.16
293 0.19
294 0.21
295 0.23
296 0.24
297 0.26
298 0.24
299 0.24
300 0.24
301 0.24
302 0.25
303 0.25
304 0.27
305 0.28
306 0.3
307 0.24
308 0.23
309 0.21
310 0.19
311 0.17
312 0.17
313 0.14
314 0.13
315 0.14
316 0.14
317 0.13
318 0.2
319 0.22
320 0.2
321 0.2
322 0.25
323 0.24
324 0.29
325 0.39
326 0.38
327 0.4
328 0.44
329 0.52
330 0.54
331 0.65
332 0.65
333 0.62
334 0.57
335 0.6
336 0.65
337 0.66
338 0.61
339 0.55
340 0.51
341 0.49
342 0.49
343 0.48
344 0.42
345 0.39
346 0.4
347 0.41
348 0.43
349 0.47
350 0.51
351 0.55
352 0.56
353 0.52
354 0.49
355 0.5
356 0.56
357 0.54
358 0.51
359 0.44
360 0.43
361 0.47
362 0.54
363 0.54
364 0.47
365 0.43
366 0.45
367 0.47
368 0.51
369 0.51
370 0.48
371 0.44
372 0.5
373 0.57
374 0.57
375 0.52
376 0.46
377 0.44
378 0.44
379 0.45
380 0.45
381 0.39
382 0.38
383 0.38
384 0.45
385 0.49
386 0.51
387 0.49
388 0.49
389 0.49
390 0.45
391 0.49
392 0.48
393 0.46
394 0.45
395 0.43
396 0.4
397 0.45
398 0.5
399 0.54
400 0.5
401 0.5
402 0.5
403 0.51
404 0.57
405 0.57
406 0.61
407 0.62
408 0.68
409 0.66
410 0.67
411 0.65
412 0.57
413 0.49
414 0.43
415 0.37
416 0.27
417 0.22
418 0.17
419 0.15
420 0.15
421 0.12
422 0.09
423 0.06
424 0.07
425 0.08
426 0.09
427 0.1
428 0.11
429 0.14
430 0.16
431 0.18
432 0.19
433 0.18
434 0.21
435 0.23
436 0.22
437 0.2
438 0.18
439 0.18
440 0.16
441 0.16
442 0.12
443 0.1
444 0.09
445 0.08
446 0.09
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.09
452 0.11
453 0.13
454 0.13
455 0.14
456 0.14
457 0.15
458 0.15
459 0.14
460 0.13
461 0.13
462 0.15
463 0.17
464 0.17
465 0.16
466 0.15
467 0.13
468 0.12
469 0.1
470 0.06
471 0.04
472 0.04
473 0.06
474 0.08
475 0.08
476 0.1
477 0.1
478 0.1
479 0.1
480 0.13
481 0.14
482 0.15
483 0.17
484 0.17
485 0.19
486 0.19
487 0.19
488 0.16
489 0.13
490 0.12
491 0.16
492 0.16
493 0.17
494 0.18
495 0.18
496 0.21
497 0.22
498 0.21
499 0.17
500 0.2
501 0.28
502 0.31
503 0.3
504 0.28
505 0.28
506 0.3
507 0.28
508 0.27
509 0.2
510 0.21
511 0.27
512 0.29
513 0.3
514 0.29
515 0.29
516 0.31
517 0.3
518 0.25
519 0.22
520 0.23
521 0.22
522 0.31
523 0.32
524 0.3
525 0.31
526 0.33
527 0.3
528 0.28
529 0.33
530 0.26
531 0.28
532 0.28
533 0.25
534 0.25
535 0.29
536 0.29
537 0.24
538 0.25
539 0.24
540 0.28
541 0.3
542 0.33
543 0.38
544 0.47
545 0.54
546 0.58
547 0.6
548 0.58
549 0.64
550 0.67
551 0.68
552 0.67
553 0.63
554 0.62
555 0.62
556 0.58
557 0.51
558 0.46
559 0.42
560 0.34
561 0.29
562 0.25
563 0.24
564 0.24
565 0.28
566 0.26
567 0.21
568 0.22
569 0.28
570 0.33
571 0.31
572 0.36
573 0.38
574 0.45
575 0.54
576 0.63
577 0.66
578 0.66
579 0.73
580 0.75
581 0.76
582 0.73
583 0.69
584 0.63
585 0.59
586 0.55
587 0.49
588 0.42
589 0.35
590 0.36
591 0.31
592 0.27
593 0.23
594 0.21
595 0.21
596 0.22
597 0.21
598 0.18
599 0.21
600 0.24
601 0.26
602 0.29
603 0.34
604 0.38
605 0.46
606 0.53
607 0.59
608 0.66
609 0.73
610 0.77
611 0.82
612 0.88
613 0.89
614 0.91
615 0.91
616 0.9
617 0.9
618 0.89
619 0.87
620 0.85
621 0.84
622 0.82
623 0.8
624 0.8
625 0.74
626 0.71
627 0.68
628 0.62
629 0.53
630 0.5
631 0.46
632 0.42
633 0.4
634 0.43
635 0.43
636 0.45
637 0.53
638 0.54
639 0.57
640 0.58
641 0.58
642 0.51
643 0.49
644 0.5
645 0.43
646 0.39
647 0.33
648 0.3
649 0.25
650 0.23
651 0.2
652 0.13
653 0.11
654 0.1
655 0.08
656 0.07
657 0.16
658 0.2
659 0.26
660 0.31
661 0.39
662 0.46
663 0.54
664 0.59
665 0.53
666 0.55
667 0.51
668 0.49
669 0.42
670 0.35
671 0.28
672 0.22
673 0.2
674 0.14
675 0.12
676 0.1
677 0.09
678 0.08
679 0.08
680 0.08
681 0.08
682 0.08
683 0.09
684 0.08
685 0.1
686 0.1
687 0.11
688 0.11
689 0.12
690 0.14
691 0.14
692 0.17
693 0.17
694 0.19
695 0.22
696 0.27
697 0.28
698 0.3
699 0.3
700 0.32
701 0.32
702 0.33
703 0.31
704 0.26
705 0.26
706 0.27
707 0.27
708 0.24
709 0.23
710 0.22
711 0.2
712 0.2
713 0.17
714 0.15
715 0.15
716 0.16
717 0.15
718 0.14
719 0.14
720 0.14
721 0.14
722 0.15
723 0.13
724 0.12
725 0.11
726 0.12
727 0.11
728 0.14
729 0.15
730 0.13
731 0.14
732 0.13
733 0.12
734 0.12
735 0.11
736 0.1
737 0.08
738 0.08
739 0.09
740 0.1
741 0.12
742 0.13
743 0.16
744 0.17
745 0.23
746 0.25
747 0.31
748 0.33
749 0.38
750 0.39
751 0.42
752 0.42
753 0.39
754 0.37
755 0.37
756 0.36
757 0.33
758 0.31
759 0.25
760 0.26
761 0.27
762 0.3
763 0.23
764 0.23
765 0.22
766 0.3
767 0.37
768 0.37
769 0.35
770 0.3
771 0.3
772 0.28
773 0.27
774 0.21
775 0.16
776 0.13
777 0.13
778 0.14
779 0.13
780 0.13
781 0.12
782 0.13
783 0.11
784 0.12
785 0.13
786 0.18
787 0.19
788 0.2
789 0.21
790 0.19
791 0.23
792 0.25
793 0.24
794 0.19
795 0.23
796 0.22
797 0.24
798 0.23
799 0.24
800 0.22
801 0.21
802 0.2
803 0.17
804 0.17
805 0.15
806 0.15
807 0.12
808 0.13
809 0.12
810 0.12
811 0.12
812 0.12
813 0.13
814 0.13
815 0.14
816 0.19
817 0.23
818 0.24
819 0.24
820 0.25
821 0.28
822 0.34
823 0.37
824 0.32
825 0.31
826 0.31
827 0.34
828 0.33
829 0.28
830 0.22
831 0.18
832 0.16
833 0.13
834 0.11