Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317SHP6

Protein Details
Accession A0A317SHP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
245-274QVTRDRIAKEKEEKRLRKKPWEQLPSRPLVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-129PKRATAREIRRRGRLTKRE
252-263AKEKEEKRLRKK
Subcellular Location(s) mito 23.5, cyto_mito 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001063  Ribosomal_L22  
IPR036394  Ribosomal_L22/L17_sf  
IPR005727  Ribosomal_L22_bac/chlpt-type  
Gene Ontology GO:0015934  C:large ribosomal subunit  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00237  Ribosomal_L22  
CDD cd00336  Ribosomal_L22  
Amino Acid Sequences MSAITATRWLLRPKVTHLPPSTVTSQSRGASWFTWRKKAPSKPALTSISELLKQSPKTKAAAGTYNSQRGGLAGSSIFGDGSTEVAATESDMGAFSTVHIRDPNRGHWAWPKRATAREIRRRGRLTKREMLLRTEKEHLAKSHMFKTSVKKLAPIARQIQGKKIEDAIIQMRFSAKKAARDVLGHLYAARNESVVRRRMDPQQTYIEQAWVGRGTYGLDRNHRARGRIDMLRLPYTSITVVLKEQVTRDRIAKEKEEKRLRKKPWEQLPSRPLVGQTQYYRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.51
3 0.56
4 0.55
5 0.56
6 0.54
7 0.55
8 0.52
9 0.47
10 0.44
11 0.38
12 0.4
13 0.34
14 0.33
15 0.29
16 0.28
17 0.24
18 0.31
19 0.37
20 0.37
21 0.46
22 0.48
23 0.54
24 0.61
25 0.69
26 0.71
27 0.71
28 0.73
29 0.7
30 0.74
31 0.7
32 0.63
33 0.56
34 0.48
35 0.42
36 0.36
37 0.32
38 0.28
39 0.29
40 0.29
41 0.31
42 0.34
43 0.33
44 0.33
45 0.36
46 0.37
47 0.35
48 0.39
49 0.37
50 0.39
51 0.41
52 0.44
53 0.41
54 0.36
55 0.32
56 0.25
57 0.24
58 0.16
59 0.12
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.05
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.04
71 0.04
72 0.05
73 0.05
74 0.04
75 0.05
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.05
82 0.05
83 0.09
84 0.09
85 0.11
86 0.13
87 0.14
88 0.2
89 0.23
90 0.26
91 0.29
92 0.29
93 0.3
94 0.37
95 0.44
96 0.46
97 0.48
98 0.5
99 0.47
100 0.51
101 0.52
102 0.53
103 0.55
104 0.58
105 0.62
106 0.62
107 0.66
108 0.66
109 0.71
110 0.72
111 0.7
112 0.67
113 0.65
114 0.63
115 0.62
116 0.59
117 0.56
118 0.53
119 0.47
120 0.42
121 0.37
122 0.36
123 0.3
124 0.31
125 0.27
126 0.25
127 0.26
128 0.25
129 0.27
130 0.28
131 0.28
132 0.28
133 0.34
134 0.37
135 0.39
136 0.36
137 0.33
138 0.35
139 0.4
140 0.41
141 0.4
142 0.35
143 0.35
144 0.4
145 0.39
146 0.41
147 0.4
148 0.38
149 0.34
150 0.31
151 0.27
152 0.23
153 0.24
154 0.22
155 0.18
156 0.16
157 0.15
158 0.16
159 0.15
160 0.16
161 0.21
162 0.19
163 0.23
164 0.26
165 0.29
166 0.29
167 0.29
168 0.31
169 0.29
170 0.27
171 0.21
172 0.19
173 0.18
174 0.16
175 0.17
176 0.13
177 0.08
178 0.08
179 0.14
180 0.2
181 0.24
182 0.26
183 0.28
184 0.31
185 0.4
186 0.48
187 0.46
188 0.44
189 0.46
190 0.45
191 0.46
192 0.43
193 0.36
194 0.27
195 0.24
196 0.21
197 0.14
198 0.13
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.13
203 0.18
204 0.21
205 0.25
206 0.31
207 0.34
208 0.43
209 0.44
210 0.43
211 0.39
212 0.43
213 0.45
214 0.44
215 0.45
216 0.42
217 0.44
218 0.44
219 0.42
220 0.36
221 0.29
222 0.26
223 0.22
224 0.19
225 0.15
226 0.13
227 0.14
228 0.15
229 0.16
230 0.16
231 0.19
232 0.23
233 0.25
234 0.27
235 0.3
236 0.32
237 0.38
238 0.42
239 0.48
240 0.52
241 0.57
242 0.65
243 0.72
244 0.77
245 0.8
246 0.85
247 0.86
248 0.87
249 0.89
250 0.88
251 0.88
252 0.89
253 0.84
254 0.85
255 0.84
256 0.79
257 0.71
258 0.62
259 0.53
260 0.49
261 0.47
262 0.44