FuNGI

A0A317SL41

Protein Details

Accession

A0A317SL41

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
25-50	EANSNPLVQRQKRPRAPVANRQKPAA	Hydrophilic
121-140	PTQFTRPVRLHRRDPRAPLQ	Hydrophilic
188-209	GGAQKQKQKVFHKKTQQVFKSN	Hydrophilic
549-570	PESGTESRKKPKKNTAANNTTT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
35-48	QKRPRAPVANRQKP
392-409	RKKLEEVRRKHGKKVKKA
444-474	RKEEEKKKEEERKKAEAAAEKEKADRRRSKT
534-561	SDKKPQLKRAGTSPHPESGTESRKKPKK

Subcellular Location(s)

nucl 14, mito 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MASPAPSSAPTTGSPVPRMVARRREANSNPLVQRQKRPRAPVANRQKPAAAPPPPPTAAAPAKTAPSTAPSGSGTGSAIATDDEGEWHEYKLTTTKASLLKGLRHHVMRMQSKREIDPTDPTQFTRPVRLHRRDPRAPLQGAKEEAAANQLAAANKAAEAGEKAKDEAEQAKKDAEKQANLDKIAPFGGAQKQKQKVFHKKTQQVFKSNDAEKKLRYEEFFPWFIEDFDNKNTWQGQLESSLSNGVFAMFVLEEGAFRMVPIEKWYKFQEKNRFPTMTSEEAELEMKKNARPPRWLMKRTEEKESKQRELEEFARANKTLFTRKGDRLKGEADNDDLDFEDDQFADDEEAPIMEGEEQENKEIEKRIKKEQLSANFFDARDERDWEKEELERKKLEEVRRKHGKKVKKALMNREGNFTYESDSDANPYETTGDEDSEDEEETARKEEEKKKEEERKKAEAAAEKEKADRRRSKTPPAGTPASTTAPSSTAPSTAAATTTLQPKSKVTGGVVGAPHSGTTNKKDKHPAGTPLPPSDKKPQLKRAGTSPHPESGTESRKKPKKNTAANNTTTGKPTTLPILGGADKKNIVKLKVASESLSQIASSTPSPSPPPPGVGAGNKKRKADATAGARSSDERSGETSDGPGSKKQRIKITTSGRSLSPAVAVVAASRQGTPGASRVGSPAATAGTGNTNAPAARGTPGPPDFITDAEIRTVLSSNPEGVTLKFIADKFKNRVRNEEVKKGLVSSLRRLSVSTDKRTYKLKEGVSA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.31
3	0.31
4	0.33
5	0.4
6	0.42
7	0.47
8	0.48
9	0.54
10	0.56
11	0.64
12	0.63
13	0.65
14	0.63
15	0.62
16	0.61
17	0.61
18	0.67
19	0.64
20	0.7
21	0.72
22	0.76
23	0.75
24	0.79
25	0.81
26	0.82
27	0.85
28	0.85
29	0.86
30	0.85
31	0.8
32	0.74
33	0.68
34	0.58
35	0.57
36	0.56
37	0.51
38	0.46
39	0.49
40	0.53
41	0.51
42	0.51
43	0.44
44	0.43
45	0.42
46	0.38
47	0.37
48	0.32
49	0.34
50	0.32
51	0.31
52	0.25
53	0.22
54	0.24
55	0.2
56	0.21
57	0.19
58	0.2
59	0.19
60	0.19
61	0.16
62	0.13
63	0.12
64	0.1
65	0.09
66	0.08
67	0.08
68	0.07
69	0.07
70	0.07
71	0.08
72	0.12
73	0.12
74	0.13
75	0.14
76	0.14
77	0.15
78	0.2
79	0.2
80	0.19
81	0.19
82	0.25
83	0.28
84	0.29
85	0.34
86	0.33
87	0.36
88	0.4
89	0.45
90	0.44
91	0.42
92	0.42
93	0.41
94	0.47
95	0.51
96	0.53
97	0.54
98	0.54
99	0.56
100	0.58
101	0.59
102	0.53
103	0.47
104	0.46
105	0.46
106	0.47
107	0.44
108	0.43
109	0.41
110	0.43
111	0.41
112	0.43
113	0.41
114	0.44
115	0.54
116	0.6
117	0.66
118	0.7
119	0.78
120	0.77
121	0.8
122	0.79
123	0.78
124	0.73
125	0.68
126	0.63
127	0.59
128	0.54
129	0.46
130	0.39
131	0.3
132	0.27
133	0.24
134	0.18
135	0.12
136	0.11
137	0.12
138	0.11
139	0.11
140	0.12
141	0.09
142	0.09
143	0.1
144	0.09
145	0.07
146	0.09
147	0.11
148	0.13
149	0.14
150	0.14
151	0.14
152	0.15
153	0.16
154	0.23
155	0.27
156	0.27
157	0.28
158	0.32
159	0.33
160	0.36
161	0.42
162	0.39
163	0.35
164	0.37
165	0.44
166	0.44
167	0.44
168	0.43
169	0.35
170	0.31
171	0.28
172	0.24
173	0.16
174	0.15
175	0.21
176	0.25
177	0.29
178	0.36
179	0.43
180	0.47
181	0.56
182	0.62
183	0.66
184	0.68
185	0.74
186	0.76
187	0.78
188	0.82
189	0.84
190	0.81
191	0.78
192	0.72
193	0.7
194	0.67
195	0.64
196	0.61
197	0.56
198	0.52
199	0.46
200	0.48
201	0.45
202	0.4
203	0.37
204	0.36
205	0.36
206	0.38
207	0.38
208	0.33
209	0.31
210	0.28
211	0.26
212	0.25
213	0.21
214	0.18
215	0.19
216	0.2
217	0.18
218	0.2
219	0.2
220	0.18
221	0.18
222	0.17
223	0.15
224	0.16
225	0.18
226	0.15
227	0.15
228	0.16
229	0.13
230	0.12
231	0.11
232	0.08
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.04
237	0.04
238	0.05
239	0.05
240	0.04
241	0.05
242	0.06
243	0.05
244	0.05
245	0.06
246	0.06
247	0.07
248	0.11
249	0.17
250	0.18
251	0.21
252	0.26
253	0.34
254	0.39
255	0.47
256	0.54
257	0.57
258	0.63
259	0.66
260	0.63
261	0.55
262	0.55
263	0.52
264	0.45
265	0.37
266	0.32
267	0.26
268	0.25
269	0.25
270	0.19
271	0.15
272	0.13
273	0.14
274	0.14
275	0.2
276	0.25
277	0.29
278	0.33
279	0.38
280	0.47
281	0.56
282	0.59
283	0.58
284	0.62
285	0.68
286	0.65
287	0.69
288	0.64
289	0.59
290	0.63
291	0.65
292	0.59
293	0.51
294	0.51
295	0.43
296	0.43
297	0.4
298	0.36
299	0.32
300	0.3
301	0.3
302	0.27
303	0.26
304	0.23
305	0.24
306	0.24
307	0.25
308	0.28
309	0.31
310	0.38
311	0.46
312	0.48
313	0.47
314	0.43
315	0.44
316	0.42
317	0.39
318	0.33
319	0.26
320	0.23
321	0.2
322	0.18
323	0.14
324	0.11
325	0.08
326	0.07
327	0.07
328	0.05
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.07
344	0.08
345	0.08
346	0.09
347	0.09
348	0.11
349	0.15
350	0.19
351	0.23
352	0.27
353	0.34
354	0.41
355	0.42
356	0.47
357	0.5
358	0.54
359	0.52
360	0.51
361	0.46
362	0.41
363	0.4
364	0.34
365	0.28
366	0.22
367	0.17
368	0.18
369	0.17
370	0.17
371	0.19
372	0.19
373	0.2
374	0.2
375	0.26
376	0.27
377	0.29
378	0.28
379	0.26
380	0.32
381	0.36
382	0.41
383	0.43
384	0.45
385	0.51
386	0.61
387	0.62
388	0.64
389	0.66
390	0.66
391	0.67
392	0.73
393	0.71
394	0.69
395	0.73
396	0.74
397	0.77
398	0.76
399	0.67
400	0.61
401	0.53
402	0.46
403	0.4
404	0.31
405	0.23
406	0.15
407	0.16
408	0.12
409	0.11
410	0.12
411	0.12
412	0.12
413	0.1
414	0.09
415	0.08
416	0.07
417	0.1
418	0.09
419	0.08
420	0.08
421	0.08
422	0.09
423	0.09
424	0.09
425	0.07
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.08
430	0.08
431	0.09
432	0.16
433	0.24
434	0.33
435	0.37
436	0.42
437	0.5
438	0.6
439	0.67
440	0.7
441	0.69
442	0.66
443	0.64
444	0.62
445	0.56
446	0.53
447	0.5
448	0.47
449	0.43
450	0.37
451	0.39
452	0.41
453	0.43
454	0.45
455	0.49
456	0.48
457	0.55
458	0.6
459	0.67
460	0.7
461	0.7
462	0.68
463	0.66
464	0.62
465	0.53
466	0.49
467	0.42
468	0.35
469	0.29
470	0.23
471	0.17
472	0.15
473	0.14
474	0.14
475	0.12
476	0.11
477	0.11
478	0.11
479	0.12
480	0.1
481	0.1
482	0.09
483	0.1
484	0.11
485	0.17
486	0.19
487	0.19
488	0.2
489	0.2
490	0.22
491	0.23
492	0.23
493	0.18
494	0.2
495	0.19
496	0.22
497	0.22
498	0.19
499	0.17
500	0.16
501	0.15
502	0.11
503	0.12
504	0.11
505	0.16
506	0.25
507	0.27
508	0.33
509	0.42
510	0.44
511	0.5
512	0.53
513	0.54
514	0.52
515	0.57
516	0.55
517	0.52
518	0.55
519	0.5
520	0.49
521	0.5
522	0.53
523	0.53
524	0.59
525	0.63
526	0.66
527	0.7
528	0.67
529	0.67
530	0.67
531	0.64
532	0.62
533	0.55
534	0.5
535	0.45
536	0.43
537	0.4
538	0.39
539	0.43
540	0.42
541	0.44
542	0.49
543	0.56
544	0.63
545	0.67
546	0.69
547	0.71
548	0.76
549	0.81
550	0.82
551	0.84
552	0.8
553	0.77
554	0.7
555	0.61
556	0.53
557	0.43
558	0.33
559	0.25
560	0.22
561	0.19
562	0.17
563	0.15
564	0.14
565	0.16
566	0.18
567	0.21
568	0.21
569	0.19
570	0.21
571	0.21
572	0.26
573	0.26
574	0.25
575	0.27
576	0.28
577	0.32
578	0.34
579	0.35
580	0.31
581	0.29
582	0.3
583	0.25
584	0.23
585	0.17
586	0.12
587	0.12
588	0.12
589	0.11
590	0.12
591	0.11
592	0.13
593	0.17
594	0.19
595	0.24
596	0.24
597	0.26
598	0.24
599	0.27
600	0.28
601	0.32
602	0.41
603	0.45
604	0.54
605	0.56
606	0.55
607	0.54
608	0.53
609	0.5
610	0.46
611	0.45
612	0.43
613	0.47
614	0.47
615	0.45
616	0.43
617	0.4
618	0.37
619	0.31
620	0.24
621	0.17
622	0.19
623	0.21
624	0.22
625	0.21
626	0.19
627	0.19
628	0.21
629	0.22
630	0.26
631	0.27
632	0.35
633	0.39
634	0.44
635	0.5
636	0.52
637	0.56
638	0.6
639	0.66
640	0.66
641	0.66
642	0.63
643	0.54
644	0.52
645	0.47
646	0.38
647	0.28
648	0.2
649	0.15
650	0.13
651	0.12
652	0.09
653	0.09
654	0.1
655	0.1
656	0.09
657	0.09
658	0.1
659	0.11
660	0.12
661	0.14
662	0.16
663	0.15
664	0.16
665	0.17
666	0.19
667	0.18
668	0.17
669	0.15
670	0.11
671	0.11
672	0.11
673	0.1
674	0.11
675	0.12
676	0.12
677	0.12
678	0.12
679	0.12
680	0.12
681	0.12
682	0.1
683	0.11
684	0.13
685	0.14
686	0.21
687	0.22
688	0.25
689	0.25
690	0.28
691	0.27
692	0.25
693	0.27
694	0.21
695	0.2
696	0.18
697	0.18
698	0.14
699	0.14
700	0.14
701	0.11
702	0.14
703	0.15
704	0.16
705	0.16
706	0.17
707	0.18
708	0.17
709	0.21
710	0.17
711	0.17
712	0.19
713	0.2
714	0.27
715	0.32
716	0.39
717	0.43
718	0.51
719	0.59
720	0.58
721	0.66
722	0.66
723	0.71
724	0.71
725	0.74
726	0.7
727	0.65
728	0.63
729	0.55
730	0.51
731	0.47
732	0.43
733	0.41
734	0.43
735	0.42
736	0.42
737	0.41
738	0.43
739	0.47
740	0.51
741	0.51
742	0.53
743	0.54
744	0.57
745	0.65
746	0.65
747	0.64
748	0.63

A0A317SL41

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer