Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317SVF3

Protein Details
Accession A0A317SVF3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
564-590ETKARARKIFERSYKRLKEKELKEERVBasic
610-635KKVEAQMPSKVKKRRKLDDDTYEEYMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
621-623KKR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MEASRGPPRVKNKGASTQQISAEQILREAFERQEQGLQAPTQRFADLEELHEFQGRKRKEFEDYVRRNRINMNNWMRYAQWELDQKEYARARSIFERALDVDSRSVVLWLRYIEAEMKTRNINHARNLLDRAVTILPRVDKLWYKYVYMEETLGNIPGTRQVFERWMSWEPDEAAWSAYIKLEKRYDEFARARAIFQRFSQVHPEPRNWIKWARFEEEFGTEDNVREVYASAVETLGEEFMDEKLFIAYARYEAKLKEYERARVIYQYALDRLPRSKSQLLHKSYTTFEKQFGEREGVEDVILSKRRVQYEEQIKENPKNYDVWFDYARLEETLGDKDRVRDVYERAIANIPPTKEKRHWRRYIYLWIFYALWEEMEGKDIDRTREIYNECLKRIPHKQFTFAKIWLLKAHFEVRHFNLSAARKTLGQAIGICPKDKLFKGYISLETRLHEFSRCRTLYEKHIEFNPANAQTWIRFAELEMALEDYDRVRAIFELAVDQELLDMPELLWKAYIDFEEESGEFNRVRGLFERLLEKTDHVKVWISYAHFEVNADEGEDEDSVSEETKARARKIFERSYKRLKEKELKEERVALLNAWKAFEQTHGTPEDQKKVEAQMPSKVKKRRKLDDDTYEEYMEYMFPADEQSNARIINMLQAARAWKQNQAGSGPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.75
3 0.72
4 0.68
5 0.64
6 0.59
7 0.53
8 0.46
9 0.42
10 0.33
11 0.29
12 0.23
13 0.21
14 0.19
15 0.2
16 0.18
17 0.2
18 0.22
19 0.22
20 0.26
21 0.26
22 0.26
23 0.29
24 0.29
25 0.3
26 0.3
27 0.31
28 0.28
29 0.27
30 0.25
31 0.23
32 0.27
33 0.22
34 0.24
35 0.25
36 0.25
37 0.26
38 0.3
39 0.28
40 0.26
41 0.34
42 0.34
43 0.35
44 0.39
45 0.41
46 0.45
47 0.54
48 0.6
49 0.61
50 0.68
51 0.74
52 0.78
53 0.76
54 0.7
55 0.69
56 0.68
57 0.64
58 0.65
59 0.64
60 0.61
61 0.62
62 0.61
63 0.53
64 0.47
65 0.44
66 0.35
67 0.32
68 0.33
69 0.34
70 0.37
71 0.4
72 0.38
73 0.41
74 0.43
75 0.38
76 0.38
77 0.36
78 0.35
79 0.37
80 0.41
81 0.35
82 0.32
83 0.34
84 0.28
85 0.31
86 0.29
87 0.25
88 0.22
89 0.19
90 0.19
91 0.15
92 0.15
93 0.12
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.13
98 0.12
99 0.13
100 0.16
101 0.17
102 0.21
103 0.21
104 0.23
105 0.25
106 0.26
107 0.34
108 0.38
109 0.4
110 0.41
111 0.46
112 0.47
113 0.47
114 0.5
115 0.43
116 0.35
117 0.31
118 0.28
119 0.24
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.17
125 0.18
126 0.19
127 0.22
128 0.26
129 0.33
130 0.31
131 0.31
132 0.33
133 0.35
134 0.34
135 0.3
136 0.27
137 0.19
138 0.19
139 0.18
140 0.17
141 0.14
142 0.11
143 0.1
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.14
148 0.15
149 0.19
150 0.21
151 0.22
152 0.22
153 0.24
154 0.26
155 0.25
156 0.26
157 0.24
158 0.23
159 0.22
160 0.18
161 0.15
162 0.12
163 0.12
164 0.1
165 0.1
166 0.13
167 0.13
168 0.18
169 0.21
170 0.23
171 0.25
172 0.32
173 0.32
174 0.38
175 0.39
176 0.36
177 0.4
178 0.38
179 0.37
180 0.37
181 0.38
182 0.31
183 0.29
184 0.36
185 0.29
186 0.31
187 0.38
188 0.36
189 0.41
190 0.44
191 0.45
192 0.42
193 0.46
194 0.48
195 0.43
196 0.45
197 0.41
198 0.44
199 0.47
200 0.45
201 0.41
202 0.39
203 0.38
204 0.34
205 0.3
206 0.23
207 0.21
208 0.17
209 0.16
210 0.15
211 0.13
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.05
236 0.07
237 0.09
238 0.1
239 0.12
240 0.12
241 0.15
242 0.2
243 0.21
244 0.25
245 0.26
246 0.3
247 0.32
248 0.34
249 0.31
250 0.28
251 0.28
252 0.23
253 0.22
254 0.18
255 0.17
256 0.16
257 0.16
258 0.16
259 0.17
260 0.19
261 0.19
262 0.24
263 0.26
264 0.3
265 0.38
266 0.45
267 0.48
268 0.47
269 0.47
270 0.43
271 0.4
272 0.41
273 0.36
274 0.28
275 0.26
276 0.25
277 0.25
278 0.25
279 0.25
280 0.23
281 0.18
282 0.18
283 0.17
284 0.14
285 0.12
286 0.1
287 0.09
288 0.1
289 0.12
290 0.12
291 0.14
292 0.17
293 0.19
294 0.22
295 0.23
296 0.28
297 0.37
298 0.41
299 0.41
300 0.42
301 0.44
302 0.45
303 0.47
304 0.39
305 0.3
306 0.28
307 0.25
308 0.26
309 0.24
310 0.24
311 0.21
312 0.2
313 0.2
314 0.18
315 0.18
316 0.12
317 0.11
318 0.08
319 0.09
320 0.11
321 0.12
322 0.13
323 0.12
324 0.13
325 0.15
326 0.16
327 0.16
328 0.16
329 0.16
330 0.2
331 0.23
332 0.22
333 0.21
334 0.22
335 0.2
336 0.2
337 0.22
338 0.17
339 0.19
340 0.21
341 0.25
342 0.3
343 0.4
344 0.49
345 0.56
346 0.64
347 0.64
348 0.68
349 0.69
350 0.73
351 0.67
352 0.59
353 0.49
354 0.42
355 0.36
356 0.29
357 0.26
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.08
364 0.08
365 0.07
366 0.1
367 0.11
368 0.12
369 0.13
370 0.15
371 0.14
372 0.19
373 0.2
374 0.23
375 0.29
376 0.31
377 0.31
378 0.31
379 0.31
380 0.33
381 0.4
382 0.44
383 0.45
384 0.44
385 0.51
386 0.54
387 0.58
388 0.57
389 0.49
390 0.45
391 0.37
392 0.37
393 0.32
394 0.28
395 0.24
396 0.22
397 0.27
398 0.23
399 0.23
400 0.27
401 0.27
402 0.3
403 0.29
404 0.28
405 0.28
406 0.3
407 0.3
408 0.27
409 0.25
410 0.21
411 0.21
412 0.25
413 0.2
414 0.17
415 0.16
416 0.17
417 0.23
418 0.23
419 0.23
420 0.18
421 0.19
422 0.22
423 0.22
424 0.23
425 0.18
426 0.19
427 0.23
428 0.26
429 0.32
430 0.31
431 0.33
432 0.3
433 0.28
434 0.29
435 0.26
436 0.24
437 0.21
438 0.2
439 0.21
440 0.29
441 0.29
442 0.29
443 0.31
444 0.34
445 0.39
446 0.47
447 0.45
448 0.38
449 0.4
450 0.43
451 0.38
452 0.38
453 0.35
454 0.27
455 0.26
456 0.24
457 0.23
458 0.19
459 0.21
460 0.2
461 0.14
462 0.12
463 0.11
464 0.16
465 0.16
466 0.16
467 0.13
468 0.12
469 0.12
470 0.12
471 0.12
472 0.06
473 0.07
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.09
482 0.09
483 0.1
484 0.09
485 0.09
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.05
490 0.05
491 0.04
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.09
498 0.1
499 0.1
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.13
504 0.13
505 0.14
506 0.14
507 0.16
508 0.13
509 0.12
510 0.16
511 0.14
512 0.16
513 0.16
514 0.21
515 0.22
516 0.24
517 0.29
518 0.26
519 0.28
520 0.27
521 0.27
522 0.26
523 0.28
524 0.27
525 0.23
526 0.25
527 0.23
528 0.25
529 0.26
530 0.22
531 0.2
532 0.21
533 0.21
534 0.18
535 0.18
536 0.16
537 0.14
538 0.12
539 0.11
540 0.09
541 0.08
542 0.09
543 0.09
544 0.08
545 0.06
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.08
550 0.08
551 0.1
552 0.16
553 0.21
554 0.24
555 0.28
556 0.33
557 0.4
558 0.48
559 0.57
560 0.62
561 0.67
562 0.72
563 0.78
564 0.82
565 0.83
566 0.81
567 0.8
568 0.8
569 0.79
570 0.82
571 0.81
572 0.78
573 0.73
574 0.73
575 0.65
576 0.6
577 0.52
578 0.42
579 0.37
580 0.35
581 0.32
582 0.27
583 0.25
584 0.2
585 0.2
586 0.22
587 0.22
588 0.19
589 0.23
590 0.25
591 0.27
592 0.35
593 0.4
594 0.45
595 0.41
596 0.4
597 0.38
598 0.41
599 0.44
600 0.42
601 0.39
602 0.4
603 0.48
604 0.54
605 0.6
606 0.64
607 0.69
608 0.72
609 0.79
610 0.8
611 0.8
612 0.83
613 0.85
614 0.86
615 0.85
616 0.81
617 0.75
618 0.65
619 0.55
620 0.45
621 0.35
622 0.24
623 0.16
624 0.11
625 0.07
626 0.07
627 0.1
628 0.1
629 0.13
630 0.15
631 0.17
632 0.2
633 0.2
634 0.2
635 0.19
636 0.18
637 0.22
638 0.24
639 0.22
640 0.19
641 0.21
642 0.25
643 0.26
644 0.33
645 0.28
646 0.3
647 0.36
648 0.38
649 0.4