Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CQ96

Protein Details
Accession A1CQ96    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-71EYQGRKRKEFEDYVRRNRINHydrophilic
619-645IDQIEKQMPRRVKKRRKLDDDRYEEYMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
628-635RRVKKRRK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 9.5, cyto_mito 7.5, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG act:ACLA_025340  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF13428  TPR_14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MESSRGPPRVKNKAPAPIQISAEQLLREAVDRQEPALQAPTQRFADLEELHEYQGRKRKEFEDYVRRNRINMNNWMRYAAWELEQKEFRRARSIFERALDVNPTSPVLWIRYIESEMRNRNINHARNLLDRAVTILPRVDKLWYKYVYMEETLGNIQGTRQVFERWMSWEPEEGAWSAYIKLEKRYSEFDRARAIFQRFTIVHPEPRNWIKWARFEEEYGTSELVREVYGAAIETLGEDFMDEKLFIAYAKFEAKLKEYERARAIYKYALDRLPRSKSMALHKAYTTFEKQFGDREGVEDVILSKRRVQYEEQLKENPRNYDVWVDFARLEETSGDVDRVRDVYERAIAQIPPSQEKRHWRRYIYLWIFYAIWEEMEAKDMDRARQVYTECLRLIPHKKFTFAKIWLLKAQFDIRQMDLSAARKTLGQAIGMCPKDKLFRGYIDLERQLFEFVRCRTLYEKQIEWNPSNSQSWIQFAELERGLDDSERARAIFELGIDQPTLDMPELVWKSYIDFEEYEGEYDRVRQLYERLLEKTDHVKVWINYARFEINVPEGEEEEEAEAEEEEERPISEDAKRRARAVFNRAHRVFKEKEMKEERVELLNAWRAFEHTHGSAEDIDQIEKQMPRRVKKRRKLDDDRYEEYMDYVFPADDQSAANLSKLLQKAHEWKKSQGLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.75
3 0.71
4 0.65
5 0.61
6 0.54
7 0.49
8 0.41
9 0.38
10 0.29
11 0.24
12 0.19
13 0.16
14 0.15
15 0.15
16 0.15
17 0.19
18 0.2
19 0.21
20 0.25
21 0.25
22 0.26
23 0.28
24 0.28
25 0.27
26 0.3
27 0.34
28 0.31
29 0.31
30 0.28
31 0.26
32 0.3
33 0.26
34 0.26
35 0.26
36 0.25
37 0.26
38 0.3
39 0.28
40 0.29
41 0.36
42 0.39
43 0.37
44 0.41
45 0.45
46 0.5
47 0.59
48 0.62
49 0.65
50 0.69
51 0.76
52 0.81
53 0.77
54 0.7
55 0.69
56 0.68
57 0.64
58 0.65
59 0.64
60 0.61
61 0.61
62 0.61
63 0.52
64 0.46
65 0.42
66 0.34
67 0.28
68 0.27
69 0.28
70 0.34
71 0.4
72 0.39
73 0.44
74 0.46
75 0.43
76 0.47
77 0.45
78 0.45
79 0.49
80 0.54
81 0.49
82 0.47
83 0.49
84 0.42
85 0.44
86 0.39
87 0.31
88 0.25
89 0.21
90 0.21
91 0.17
92 0.16
93 0.16
94 0.15
95 0.16
96 0.16
97 0.17
98 0.18
99 0.21
100 0.23
101 0.26
102 0.32
103 0.35
104 0.38
105 0.41
106 0.4
107 0.47
108 0.52
109 0.53
110 0.51
111 0.51
112 0.51
113 0.48
114 0.52
115 0.44
116 0.35
117 0.29
118 0.26
119 0.24
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.22
128 0.26
129 0.33
130 0.31
131 0.32
132 0.33
133 0.35
134 0.34
135 0.3
136 0.27
137 0.19
138 0.19
139 0.18
140 0.16
141 0.13
142 0.1
143 0.09
144 0.13
145 0.13
146 0.12
147 0.13
148 0.14
149 0.15
150 0.17
151 0.19
152 0.18
153 0.21
154 0.23
155 0.22
156 0.24
157 0.24
158 0.23
159 0.22
160 0.18
161 0.15
162 0.12
163 0.12
164 0.1
165 0.1
166 0.13
167 0.13
168 0.18
169 0.21
170 0.23
171 0.26
172 0.32
173 0.35
174 0.42
175 0.44
176 0.42
177 0.47
178 0.46
179 0.46
180 0.46
181 0.44
182 0.36
183 0.33
184 0.36
185 0.28
186 0.29
187 0.33
188 0.29
189 0.34
190 0.34
191 0.35
192 0.35
193 0.38
194 0.39
195 0.35
196 0.39
197 0.36
198 0.41
199 0.44
200 0.43
201 0.4
202 0.39
203 0.39
204 0.35
205 0.33
206 0.27
207 0.22
208 0.17
209 0.16
210 0.15
211 0.12
212 0.09
213 0.07
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.08
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.14
242 0.19
243 0.2
244 0.27
245 0.27
246 0.31
247 0.32
248 0.34
249 0.34
250 0.3
251 0.29
252 0.24
253 0.25
254 0.23
255 0.24
256 0.24
257 0.24
258 0.27
259 0.31
260 0.33
261 0.32
262 0.33
263 0.32
264 0.33
265 0.39
266 0.43
267 0.4
268 0.37
269 0.36
270 0.35
271 0.34
272 0.33
273 0.29
274 0.22
275 0.23
276 0.22
277 0.22
278 0.21
279 0.21
280 0.21
281 0.17
282 0.16
283 0.14
284 0.13
285 0.13
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.12
291 0.14
292 0.18
293 0.19
294 0.22
295 0.23
296 0.28
297 0.37
298 0.41
299 0.41
300 0.43
301 0.43
302 0.46
303 0.47
304 0.4
305 0.31
306 0.28
307 0.25
308 0.26
309 0.24
310 0.22
311 0.19
312 0.19
313 0.17
314 0.16
315 0.16
316 0.1
317 0.1
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.14
339 0.16
340 0.19
341 0.19
342 0.22
343 0.32
344 0.39
345 0.47
346 0.52
347 0.5
348 0.53
349 0.56
350 0.63
351 0.56
352 0.51
353 0.41
354 0.37
355 0.34
356 0.29
357 0.25
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.08
364 0.08
365 0.07
366 0.1
367 0.11
368 0.11
369 0.14
370 0.15
371 0.14
372 0.17
373 0.17
374 0.2
375 0.21
376 0.24
377 0.21
378 0.2
379 0.21
380 0.24
381 0.31
382 0.29
383 0.36
384 0.34
385 0.38
386 0.39
387 0.42
388 0.43
389 0.39
390 0.42
391 0.37
392 0.39
393 0.39
394 0.38
395 0.35
396 0.3
397 0.3
398 0.24
399 0.23
400 0.22
401 0.19
402 0.18
403 0.18
404 0.17
405 0.17
406 0.18
407 0.16
408 0.14
409 0.14
410 0.13
411 0.14
412 0.17
413 0.15
414 0.13
415 0.13
416 0.16
417 0.22
418 0.23
419 0.23
420 0.18
421 0.19
422 0.21
423 0.21
424 0.22
425 0.18
426 0.19
427 0.23
428 0.27
429 0.3
430 0.31
431 0.33
432 0.3
433 0.28
434 0.26
435 0.23
436 0.2
437 0.17
438 0.18
439 0.16
440 0.21
441 0.2
442 0.22
443 0.24
444 0.29
445 0.35
446 0.34
447 0.35
448 0.34
449 0.41
450 0.44
451 0.41
452 0.39
453 0.35
454 0.33
455 0.33
456 0.29
457 0.26
458 0.22
459 0.22
460 0.2
461 0.18
462 0.17
463 0.17
464 0.2
465 0.18
466 0.17
467 0.15
468 0.14
469 0.14
470 0.12
471 0.12
472 0.08
473 0.1
474 0.1
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.11
479 0.11
480 0.1
481 0.1
482 0.1
483 0.11
484 0.11
485 0.1
486 0.09
487 0.09
488 0.1
489 0.07
490 0.06
491 0.05
492 0.13
493 0.14
494 0.14
495 0.15
496 0.14
497 0.15
498 0.18
499 0.19
500 0.13
501 0.13
502 0.14
503 0.17
504 0.18
505 0.18
506 0.16
507 0.16
508 0.14
509 0.16
510 0.17
511 0.13
512 0.14
513 0.14
514 0.15
515 0.21
516 0.26
517 0.28
518 0.28
519 0.29
520 0.3
521 0.31
522 0.35
523 0.33
524 0.29
525 0.27
526 0.31
527 0.29
528 0.37
529 0.4
530 0.34
531 0.31
532 0.33
533 0.32
534 0.26
535 0.27
536 0.2
537 0.17
538 0.18
539 0.18
540 0.16
541 0.16
542 0.17
543 0.16
544 0.14
545 0.11
546 0.09
547 0.08
548 0.08
549 0.07
550 0.06
551 0.07
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.09
557 0.1
558 0.12
559 0.17
560 0.25
561 0.32
562 0.42
563 0.44
564 0.44
565 0.49
566 0.56
567 0.58
568 0.6
569 0.61
570 0.6
571 0.69
572 0.69
573 0.7
574 0.63
575 0.62
576 0.56
577 0.56
578 0.58
579 0.49
580 0.57
581 0.59
582 0.62
583 0.58
584 0.6
585 0.53
586 0.47
587 0.46
588 0.36
589 0.35
590 0.38
591 0.34
592 0.29
593 0.27
594 0.23
595 0.24
596 0.25
597 0.24
598 0.17
599 0.2
600 0.19
601 0.2
602 0.2
603 0.19
604 0.21
605 0.17
606 0.17
607 0.15
608 0.16
609 0.19
610 0.22
611 0.25
612 0.29
613 0.36
614 0.45
615 0.55
616 0.65
617 0.71
618 0.78
619 0.86
620 0.89
621 0.92
622 0.93
623 0.94
624 0.93
625 0.91
626 0.86
627 0.8
628 0.71
629 0.6
630 0.5
631 0.39
632 0.28
633 0.21
634 0.16
635 0.11
636 0.09
637 0.11
638 0.1
639 0.1
640 0.1
641 0.11
642 0.14
643 0.14
644 0.14
645 0.13
646 0.14
647 0.2
648 0.22
649 0.23
650 0.22
651 0.29
652 0.39
653 0.49
654 0.57
655 0.54
656 0.57