Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317SHS2

Protein Details
Accession A0A317SHS2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
91-124KDIQRHRREEEQAKRSHKKKRSTGTSHKRKELANBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-120HRREEEQAKRSHKKKRSTGTSHKRK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001214  SET_dom  
IPR046341  SET_dom_sf  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PF00856  SET  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50280  SET  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15550  PHD_MLL5  
Amino Acid Sequences MTENPTIPSTPGPSQPPSLANSTTTPEDAADTSGEIDCICEISDDDGFTICCDKCDTWQHLVCVQLNKDNVPGTYYCPKCSPRTLDVQGAKDIQRHRREEEQAKRSHKKKRSTGTSHKRKELANGTNGITPGKISSSTEKTGVQGPGKLVSPKEMQQPSRKRGHRVSAQPNSNAGVNSSASHHSILTNVPNTNIPLDPPSARNGETESDTDPEKPRYLREGFTDLGSSPNKYTGADVQRFLHSLVMPASDPNMTRLLERCIYLNRQELASLGLPKASSQVLPETSKSNIEHSKRRLLLGADCFQGDLITIYKGEVGFQDSYRKDRANQYSSWGHPKPYVLFHPNLPIYVDARRYGSEARFVRRSCRPNLALQTIVVDHSEMCFGLFANQPLKPGAELTVGWDWNGALESRQFVKEGFDVYRLSSEHLRELAVWIQQLTHKMGDCACLGGKECLVNQIRKMTDGETVTGKTPNGNGSSRKQRRTNASTESAVGSQRPSPDCQSVPLKKEEDEEGRSVSPPVSRSKPRSRDLTPSMLQDVAVEKGEMTGREARKFKDVLSRIEKQQQEEQLPQVAKRRKRNSTVSLTPGASSLHSPGIDMKDWIKVADSSKRNKLSNPRSLYSPPATGTGPNHGFAEYSVTDAGVGRRASESPVSSDERRTRRTASYSPVGQLNQGSDTLKRPSKTVVRPVQAQYEDKAVQTDPVGEEIPWWSPAAVKAPPRPPRLPLRKRLMQSLLRDREEAAATVLEDKKRKIDAASEDPEDTLSPKVPKLFNSGSARGTTISPFPDAKGSLDVPLPTATLTTLDTNSLSSRALITSDMSVTMVDASVIKSRLSPRPPGPALADLFSADSDKPLSTQHIPTQEKQSSEKTQANLPQDKPRVNGYKNPSLQVQLLPGPGIVNGPSTPALQSSLPSAPNSASVQPPLIIYSNCVNPSVSALNSSMVNPSPTRTKKMSLEDYGKRKHRADPVEKSDEKLSVKATNEGPTTATNLSKTPMVPLMQEPTSIAGSIPGTLSVVTAPPPPVINSSKLATEPVRIPSTPKDQRTTSLSSSVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.4
3 0.4
4 0.38
5 0.39
6 0.35
7 0.32
8 0.31
9 0.31
10 0.3
11 0.27
12 0.25
13 0.2
14 0.21
15 0.19
16 0.18
17 0.14
18 0.12
19 0.13
20 0.13
21 0.12
22 0.1
23 0.1
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.07
28 0.07
29 0.1
30 0.12
31 0.11
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.17
37 0.14
38 0.14
39 0.18
40 0.18
41 0.24
42 0.33
43 0.38
44 0.42
45 0.47
46 0.49
47 0.48
48 0.52
49 0.51
50 0.49
51 0.46
52 0.42
53 0.39
54 0.37
55 0.38
56 0.35
57 0.3
58 0.26
59 0.24
60 0.25
61 0.33
62 0.34
63 0.33
64 0.38
65 0.42
66 0.44
67 0.52
68 0.53
69 0.49
70 0.57
71 0.58
72 0.62
73 0.63
74 0.61
75 0.57
76 0.53
77 0.5
78 0.46
79 0.48
80 0.48
81 0.51
82 0.53
83 0.54
84 0.58
85 0.66
86 0.71
87 0.74
88 0.74
89 0.74
90 0.79
91 0.83
92 0.82
93 0.83
94 0.81
95 0.81
96 0.82
97 0.84
98 0.85
99 0.85
100 0.89
101 0.9
102 0.93
103 0.91
104 0.89
105 0.82
106 0.73
107 0.72
108 0.7
109 0.67
110 0.62
111 0.57
112 0.51
113 0.5
114 0.48
115 0.39
116 0.29
117 0.21
118 0.16
119 0.14
120 0.13
121 0.13
122 0.2
123 0.25
124 0.27
125 0.29
126 0.29
127 0.29
128 0.34
129 0.37
130 0.32
131 0.29
132 0.28
133 0.29
134 0.3
135 0.32
136 0.26
137 0.26
138 0.27
139 0.28
140 0.36
141 0.4
142 0.44
143 0.51
144 0.61
145 0.63
146 0.7
147 0.71
148 0.7
149 0.71
150 0.75
151 0.74
152 0.75
153 0.78
154 0.78
155 0.78
156 0.72
157 0.66
158 0.58
159 0.5
160 0.4
161 0.3
162 0.22
163 0.17
164 0.15
165 0.16
166 0.16
167 0.16
168 0.17
169 0.16
170 0.14
171 0.14
172 0.16
173 0.19
174 0.21
175 0.2
176 0.21
177 0.22
178 0.23
179 0.24
180 0.21
181 0.17
182 0.15
183 0.18
184 0.19
185 0.19
186 0.21
187 0.22
188 0.22
189 0.22
190 0.22
191 0.22
192 0.22
193 0.22
194 0.21
195 0.19
196 0.2
197 0.23
198 0.24
199 0.25
200 0.27
201 0.26
202 0.27
203 0.33
204 0.35
205 0.34
206 0.35
207 0.37
208 0.33
209 0.33
210 0.31
211 0.24
212 0.26
213 0.24
214 0.21
215 0.17
216 0.19
217 0.18
218 0.17
219 0.19
220 0.22
221 0.3
222 0.31
223 0.33
224 0.32
225 0.33
226 0.34
227 0.32
228 0.27
229 0.18
230 0.17
231 0.16
232 0.15
233 0.13
234 0.13
235 0.13
236 0.12
237 0.12
238 0.13
239 0.15
240 0.13
241 0.15
242 0.17
243 0.21
244 0.21
245 0.21
246 0.21
247 0.23
248 0.27
249 0.29
250 0.33
251 0.29
252 0.27
253 0.27
254 0.25
255 0.23
256 0.22
257 0.2
258 0.14
259 0.14
260 0.13
261 0.13
262 0.15
263 0.12
264 0.1
265 0.1
266 0.14
267 0.16
268 0.19
269 0.2
270 0.2
271 0.21
272 0.25
273 0.24
274 0.26
275 0.3
276 0.34
277 0.41
278 0.44
279 0.52
280 0.49
281 0.5
282 0.47
283 0.41
284 0.42
285 0.4
286 0.38
287 0.29
288 0.28
289 0.26
290 0.23
291 0.21
292 0.14
293 0.09
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.1
303 0.11
304 0.12
305 0.2
306 0.2
307 0.23
308 0.27
309 0.28
310 0.27
311 0.35
312 0.43
313 0.4
314 0.4
315 0.42
316 0.45
317 0.46
318 0.52
319 0.44
320 0.37
321 0.34
322 0.36
323 0.32
324 0.31
325 0.34
326 0.3
327 0.3
328 0.3
329 0.35
330 0.33
331 0.3
332 0.27
333 0.21
334 0.19
335 0.2
336 0.21
337 0.15
338 0.16
339 0.16
340 0.17
341 0.2
342 0.19
343 0.24
344 0.26
345 0.29
346 0.34
347 0.34
348 0.39
349 0.44
350 0.48
351 0.44
352 0.49
353 0.47
354 0.47
355 0.53
356 0.5
357 0.43
358 0.37
359 0.34
360 0.26
361 0.24
362 0.17
363 0.11
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.05
368 0.05
369 0.04
370 0.04
371 0.07
372 0.09
373 0.1
374 0.13
375 0.13
376 0.14
377 0.15
378 0.15
379 0.12
380 0.11
381 0.11
382 0.1
383 0.09
384 0.12
385 0.14
386 0.14
387 0.14
388 0.13
389 0.12
390 0.1
391 0.11
392 0.07
393 0.05
394 0.05
395 0.07
396 0.09
397 0.1
398 0.1
399 0.1
400 0.12
401 0.12
402 0.14
403 0.13
404 0.14
405 0.14
406 0.14
407 0.16
408 0.14
409 0.15
410 0.16
411 0.16
412 0.15
413 0.15
414 0.15
415 0.13
416 0.14
417 0.14
418 0.12
419 0.11
420 0.1
421 0.1
422 0.11
423 0.13
424 0.13
425 0.12
426 0.11
427 0.12
428 0.12
429 0.14
430 0.12
431 0.11
432 0.1
433 0.09
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.09
438 0.09
439 0.15
440 0.17
441 0.18
442 0.18
443 0.23
444 0.23
445 0.23
446 0.24
447 0.18
448 0.19
449 0.19
450 0.18
451 0.15
452 0.16
453 0.15
454 0.16
455 0.14
456 0.11
457 0.12
458 0.13
459 0.14
460 0.16
461 0.19
462 0.23
463 0.35
464 0.41
465 0.47
466 0.49
467 0.52
468 0.58
469 0.61
470 0.6
471 0.55
472 0.52
473 0.46
474 0.42
475 0.38
476 0.3
477 0.24
478 0.19
479 0.14
480 0.11
481 0.14
482 0.14
483 0.15
484 0.17
485 0.2
486 0.2
487 0.22
488 0.29
489 0.3
490 0.32
491 0.34
492 0.33
493 0.3
494 0.32
495 0.31
496 0.27
497 0.25
498 0.23
499 0.21
500 0.2
501 0.2
502 0.18
503 0.15
504 0.13
505 0.12
506 0.16
507 0.19
508 0.24
509 0.31
510 0.41
511 0.48
512 0.5
513 0.55
514 0.54
515 0.56
516 0.56
517 0.55
518 0.47
519 0.4
520 0.37
521 0.31
522 0.27
523 0.2
524 0.16
525 0.1
526 0.08
527 0.07
528 0.06
529 0.06
530 0.07
531 0.07
532 0.08
533 0.13
534 0.15
535 0.2
536 0.23
537 0.23
538 0.26
539 0.27
540 0.26
541 0.29
542 0.31
543 0.33
544 0.37
545 0.4
546 0.38
547 0.45
548 0.45
549 0.39
550 0.4
551 0.37
552 0.34
553 0.32
554 0.31
555 0.28
556 0.27
557 0.26
558 0.3
559 0.32
560 0.36
561 0.44
562 0.51
563 0.53
564 0.6
565 0.67
566 0.66
567 0.68
568 0.66
569 0.61
570 0.56
571 0.49
572 0.42
573 0.34
574 0.27
575 0.19
576 0.14
577 0.11
578 0.09
579 0.09
580 0.09
581 0.1
582 0.12
583 0.12
584 0.12
585 0.12
586 0.13
587 0.13
588 0.13
589 0.12
590 0.11
591 0.14
592 0.21
593 0.26
594 0.29
595 0.36
596 0.42
597 0.42
598 0.44
599 0.52
600 0.53
601 0.57
602 0.58
603 0.52
604 0.5
605 0.51
606 0.51
607 0.43
608 0.36
609 0.27
610 0.23
611 0.22
612 0.2
613 0.19
614 0.21
615 0.2
616 0.19
617 0.18
618 0.16
619 0.16
620 0.14
621 0.18
622 0.11
623 0.11
624 0.1
625 0.09
626 0.09
627 0.1
628 0.1
629 0.1
630 0.1
631 0.09
632 0.1
633 0.11
634 0.12
635 0.14
636 0.14
637 0.12
638 0.17
639 0.2
640 0.21
641 0.27
642 0.33
643 0.37
644 0.4
645 0.41
646 0.41
647 0.41
648 0.46
649 0.44
650 0.43
651 0.43
652 0.4
653 0.39
654 0.38
655 0.34
656 0.28
657 0.25
658 0.2
659 0.14
660 0.14
661 0.13
662 0.11
663 0.14
664 0.19
665 0.22
666 0.21
667 0.21
668 0.26
669 0.34
670 0.39
671 0.46
672 0.49
673 0.49
674 0.53
675 0.55
676 0.56
677 0.5
678 0.45
679 0.36
680 0.33
681 0.3
682 0.25
683 0.24
684 0.17
685 0.15
686 0.14
687 0.15
688 0.1
689 0.11
690 0.11
691 0.09
692 0.1
693 0.1
694 0.11
695 0.1
696 0.1
697 0.08
698 0.08
699 0.1
700 0.13
701 0.16
702 0.2
703 0.26
704 0.35
705 0.43
706 0.49
707 0.5
708 0.51
709 0.58
710 0.65
711 0.67
712 0.68
713 0.69
714 0.69
715 0.69
716 0.71
717 0.68
718 0.63
719 0.62
720 0.63
721 0.62
722 0.56
723 0.54
724 0.48
725 0.43
726 0.37
727 0.29
728 0.19
729 0.12
730 0.11
731 0.15
732 0.17
733 0.18
734 0.19
735 0.2
736 0.23
737 0.24
738 0.25
739 0.22
740 0.25
741 0.29
742 0.35
743 0.39
744 0.37
745 0.36
746 0.35
747 0.34
748 0.28
749 0.21
750 0.14
751 0.13
752 0.13
753 0.14
754 0.19
755 0.2
756 0.22
757 0.28
758 0.29
759 0.34
760 0.4
761 0.41
762 0.38
763 0.37
764 0.36
765 0.29
766 0.28
767 0.21
768 0.17
769 0.15
770 0.16
771 0.16
772 0.16
773 0.18
774 0.18
775 0.18
776 0.19
777 0.18
778 0.17
779 0.18
780 0.17
781 0.16
782 0.15
783 0.14
784 0.1
785 0.1
786 0.08
787 0.08
788 0.09
789 0.09
790 0.09
791 0.1
792 0.1
793 0.11
794 0.12
795 0.12
796 0.11
797 0.09
798 0.09
799 0.09
800 0.09
801 0.09
802 0.09
803 0.1
804 0.1
805 0.1
806 0.09
807 0.08
808 0.08
809 0.07
810 0.06
811 0.05
812 0.05
813 0.06
814 0.1
815 0.11
816 0.11
817 0.14
818 0.19
819 0.27
820 0.31
821 0.37
822 0.37
823 0.47
824 0.48
825 0.48
826 0.46
827 0.43
828 0.41
829 0.34
830 0.31
831 0.21
832 0.2
833 0.17
834 0.16
835 0.1
836 0.1
837 0.1
838 0.09
839 0.09
840 0.11
841 0.15
842 0.18
843 0.22
844 0.27
845 0.36
846 0.4
847 0.43
848 0.5
849 0.49
850 0.48
851 0.48
852 0.49
853 0.45
854 0.48
855 0.5
856 0.42
857 0.45
858 0.49
859 0.53
860 0.53
861 0.51
862 0.54
863 0.55
864 0.56
865 0.52
866 0.54
867 0.55
868 0.51
869 0.55
870 0.54
871 0.58
872 0.58
873 0.58
874 0.51
875 0.45
876 0.43
877 0.37
878 0.32
879 0.25
880 0.23
881 0.2
882 0.18
883 0.16
884 0.14
885 0.13
886 0.1
887 0.09
888 0.08
889 0.1
890 0.11
891 0.12
892 0.12
893 0.12
894 0.14
895 0.13
896 0.13
897 0.15
898 0.18
899 0.19
900 0.19
901 0.19
902 0.17
903 0.21
904 0.23
905 0.21
906 0.2
907 0.2
908 0.21
909 0.2
910 0.2
911 0.18
912 0.18
913 0.16
914 0.17
915 0.19
916 0.23
917 0.23
918 0.24
919 0.22
920 0.2
921 0.24
922 0.24
923 0.2
924 0.17
925 0.17
926 0.17
927 0.18
928 0.18
929 0.17
930 0.15
931 0.18
932 0.16
933 0.18
934 0.27
935 0.3
936 0.36
937 0.38
938 0.43
939 0.47
940 0.56
941 0.62
942 0.6
943 0.65
944 0.67
945 0.72
946 0.75
947 0.76
948 0.73
949 0.68
950 0.67
951 0.67
952 0.69
953 0.7
954 0.71
955 0.73
956 0.76
957 0.74
958 0.7
959 0.63
960 0.58
961 0.5
962 0.42
963 0.36
964 0.32
965 0.33
966 0.36
967 0.36
968 0.36
969 0.35
970 0.34
971 0.32
972 0.27
973 0.29
974 0.26
975 0.25
976 0.2
977 0.2
978 0.21
979 0.22
980 0.21
981 0.21
982 0.23
983 0.22
984 0.23
985 0.25
986 0.29
987 0.27
988 0.27
989 0.24
990 0.22
991 0.22
992 0.2
993 0.16
994 0.13
995 0.12
996 0.13
997 0.12
998 0.1
999 0.09
1000 0.09
1001 0.1
1002 0.08
1003 0.08
1004 0.09
1005 0.12
1006 0.13
1007 0.14
1008 0.16
1009 0.17
1010 0.23
1011 0.25
1012 0.28
1013 0.28
1014 0.29
1015 0.3
1016 0.29
1017 0.32
1018 0.28
1019 0.29
1020 0.3
1021 0.33
1022 0.35
1023 0.33
1024 0.37
1025 0.4
1026 0.49
1027 0.53
1028 0.56
1029 0.55
1030 0.53
1031 0.59
1032 0.6
1033 0.6
1034 0.53