Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317T0H9

Protein Details
Accession A0A317T0H9    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-48LGQKDAPESKKKKPKSQDDAEDDTLKHydrophilic
578-598AQVVARRKEKEEKARERSKLVHydrophilic
659-682RAAKAARIIARKRQVRRRAGKGGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-35KKKK
142-143KG
152-155KKRA
502-512AERRRKAQGKG
583-682RRKEKEEKARERSKLVAEGKAKSLESTKEKKKQFSEDKASAMVRRGGKGFSGGKRKREEKATDVREDPNKNAKKDERAAKAARIIARKRQVRRRAGKGGA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12676  RRM3_Nop4p  
Amino Acid Sequences MDKHAKINNEDNRSNDDSEVEGLGQKDAPESKKKKPKSQDDAEDDTLKRRTVFVRSLPYTVTTESLSIHFSFIAPLKHATVVADPVTKKSRGFGFVTFLSAEDAQKAVKRFNGASFEGRKLKVEIAEKRHREAALSEGEVKKGRTVDREDIKKRAPRLIVRNLPWSVKKPEDLVKIFQSYGKVRGVIIPRKGNKPSGPMSGFAFVTMKGYKNAENAIEKTNGMEIDGRTVAVDWAVEKNEWERREGVEDMDIGEDGEEREDAAKLYSEEEEKSLTVFIRNLPFSTDDETLHEHFESNFGPVRYARIVMDHATERPRGTGFVCFFNQEDCDRCLAGAPRQQLRATKAKSLLQNEGDDPSGRYTIGGRILQLARAVNKTEAAKLQEAGLARRDKAQGDKRRLFLLQEGTIPASSVAFQRLSNSERLLREASLKQRKTLLQSNPMLHLSLTRLSIRNLPRSVTAKGLKQLAREAAVGFAADVKAGKRKQLSKEELMRGGDEDREAERRRKAQGKGIVRQAKVVEEKAGTGRSRGYGFIEYSSHRWALMGLRWLNGHEVAAPPPAIGEKKKRLIVEFAIENAQVVARRKEKEEKARERSKLVAEGKAKSLESTKEKKKQFSEDKASAMVRRGGKGFSGGKRKREEKATDVREDPNKNAKKDERAAKAARIIARKRQVRRRAGKGGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.44
3 0.37
4 0.3
5 0.28
6 0.26
7 0.19
8 0.17
9 0.15
10 0.16
11 0.16
12 0.14
13 0.16
14 0.21
15 0.25
16 0.34
17 0.39
18 0.49
19 0.58
20 0.67
21 0.74
22 0.79
23 0.85
24 0.84
25 0.89
26 0.89
27 0.87
28 0.86
29 0.8
30 0.76
31 0.65
32 0.6
33 0.53
34 0.44
35 0.36
36 0.32
37 0.31
38 0.32
39 0.38
40 0.4
41 0.48
42 0.49
43 0.5
44 0.48
45 0.47
46 0.42
47 0.36
48 0.3
49 0.21
50 0.18
51 0.18
52 0.18
53 0.18
54 0.15
55 0.15
56 0.13
57 0.12
58 0.14
59 0.16
60 0.18
61 0.17
62 0.18
63 0.19
64 0.2
65 0.2
66 0.19
67 0.17
68 0.18
69 0.19
70 0.22
71 0.21
72 0.25
73 0.3
74 0.3
75 0.29
76 0.3
77 0.33
78 0.32
79 0.35
80 0.32
81 0.32
82 0.32
83 0.34
84 0.29
85 0.24
86 0.22
87 0.2
88 0.18
89 0.13
90 0.13
91 0.12
92 0.16
93 0.17
94 0.17
95 0.19
96 0.22
97 0.23
98 0.28
99 0.33
100 0.32
101 0.38
102 0.4
103 0.44
104 0.45
105 0.44
106 0.41
107 0.37
108 0.37
109 0.35
110 0.39
111 0.41
112 0.44
113 0.54
114 0.55
115 0.56
116 0.58
117 0.52
118 0.45
119 0.38
120 0.34
121 0.29
122 0.28
123 0.31
124 0.27
125 0.3
126 0.3
127 0.29
128 0.27
129 0.26
130 0.26
131 0.27
132 0.32
133 0.39
134 0.46
135 0.56
136 0.57
137 0.6
138 0.65
139 0.64
140 0.61
141 0.59
142 0.57
143 0.55
144 0.59
145 0.63
146 0.64
147 0.62
148 0.66
149 0.61
150 0.59
151 0.54
152 0.51
153 0.46
154 0.41
155 0.39
156 0.36
157 0.41
158 0.45
159 0.44
160 0.43
161 0.41
162 0.4
163 0.39
164 0.37
165 0.34
166 0.28
167 0.29
168 0.26
169 0.22
170 0.2
171 0.26
172 0.32
173 0.34
174 0.39
175 0.43
176 0.46
177 0.52
178 0.55
179 0.55
180 0.5
181 0.49
182 0.46
183 0.46
184 0.42
185 0.37
186 0.36
187 0.33
188 0.3
189 0.24
190 0.21
191 0.13
192 0.14
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.15
197 0.16
198 0.17
199 0.19
200 0.19
201 0.22
202 0.22
203 0.24
204 0.23
205 0.21
206 0.2
207 0.2
208 0.16
209 0.13
210 0.14
211 0.11
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.1
216 0.11
217 0.1
218 0.07
219 0.07
220 0.05
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.12
226 0.18
227 0.18
228 0.19
229 0.19
230 0.19
231 0.24
232 0.24
233 0.21
234 0.16
235 0.16
236 0.14
237 0.13
238 0.12
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.08
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.11
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.11
265 0.14
266 0.15
267 0.15
268 0.15
269 0.17
270 0.17
271 0.2
272 0.19
273 0.15
274 0.16
275 0.19
276 0.19
277 0.18
278 0.17
279 0.13
280 0.12
281 0.13
282 0.11
283 0.1
284 0.12
285 0.11
286 0.12
287 0.11
288 0.14
289 0.13
290 0.14
291 0.12
292 0.11
293 0.12
294 0.12
295 0.14
296 0.12
297 0.14
298 0.15
299 0.16
300 0.15
301 0.14
302 0.14
303 0.13
304 0.13
305 0.16
306 0.15
307 0.18
308 0.18
309 0.18
310 0.18
311 0.18
312 0.18
313 0.14
314 0.15
315 0.12
316 0.13
317 0.12
318 0.12
319 0.13
320 0.13
321 0.16
322 0.18
323 0.2
324 0.22
325 0.24
326 0.25
327 0.26
328 0.29
329 0.34
330 0.32
331 0.32
332 0.32
333 0.35
334 0.38
335 0.38
336 0.38
337 0.32
338 0.31
339 0.27
340 0.25
341 0.22
342 0.17
343 0.15
344 0.12
345 0.1
346 0.09
347 0.08
348 0.08
349 0.1
350 0.13
351 0.13
352 0.11
353 0.15
354 0.15
355 0.16
356 0.16
357 0.15
358 0.13
359 0.14
360 0.15
361 0.11
362 0.14
363 0.14
364 0.14
365 0.15
366 0.16
367 0.16
368 0.15
369 0.15
370 0.14
371 0.14
372 0.14
373 0.17
374 0.16
375 0.16
376 0.19
377 0.2
378 0.19
379 0.27
380 0.35
381 0.39
382 0.47
383 0.52
384 0.5
385 0.51
386 0.5
387 0.43
388 0.37
389 0.33
390 0.25
391 0.21
392 0.2
393 0.19
394 0.18
395 0.17
396 0.13
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.1
404 0.13
405 0.15
406 0.17
407 0.18
408 0.21
409 0.2
410 0.23
411 0.23
412 0.2
413 0.23
414 0.26
415 0.34
416 0.39
417 0.39
418 0.38
419 0.41
420 0.43
421 0.44
422 0.48
423 0.44
424 0.43
425 0.47
426 0.48
427 0.46
428 0.44
429 0.38
430 0.3
431 0.25
432 0.18
433 0.15
434 0.15
435 0.14
436 0.15
437 0.16
438 0.23
439 0.26
440 0.32
441 0.31
442 0.3
443 0.33
444 0.35
445 0.36
446 0.36
447 0.34
448 0.31
449 0.33
450 0.38
451 0.35
452 0.33
453 0.35
454 0.3
455 0.28
456 0.25
457 0.22
458 0.16
459 0.14
460 0.12
461 0.09
462 0.08
463 0.06
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.13
468 0.14
469 0.19
470 0.24
471 0.31
472 0.4
473 0.49
474 0.55
475 0.57
476 0.65
477 0.66
478 0.64
479 0.58
480 0.5
481 0.41
482 0.35
483 0.28
484 0.19
485 0.16
486 0.13
487 0.19
488 0.22
489 0.26
490 0.31
491 0.34
492 0.42
493 0.48
494 0.5
495 0.52
496 0.58
497 0.61
498 0.62
499 0.68
500 0.68
501 0.6
502 0.6
503 0.52
504 0.48
505 0.42
506 0.37
507 0.29
508 0.22
509 0.24
510 0.23
511 0.27
512 0.22
513 0.2
514 0.2
515 0.19
516 0.2
517 0.2
518 0.2
519 0.19
520 0.19
521 0.2
522 0.21
523 0.21
524 0.23
525 0.25
526 0.22
527 0.19
528 0.18
529 0.17
530 0.18
531 0.2
532 0.25
533 0.23
534 0.24
535 0.25
536 0.25
537 0.26
538 0.23
539 0.19
540 0.12
541 0.12
542 0.12
543 0.14
544 0.13
545 0.11
546 0.11
547 0.13
548 0.15
549 0.19
550 0.27
551 0.34
552 0.41
553 0.46
554 0.48
555 0.48
556 0.5
557 0.49
558 0.47
559 0.4
560 0.34
561 0.32
562 0.29
563 0.26
564 0.21
565 0.18
566 0.15
567 0.17
568 0.21
569 0.25
570 0.28
571 0.34
572 0.43
573 0.52
574 0.59
575 0.67
576 0.71
577 0.75
578 0.82
579 0.81
580 0.75
581 0.71
582 0.65
583 0.64
584 0.57
585 0.55
586 0.5
587 0.49
588 0.49
589 0.47
590 0.43
591 0.35
592 0.35
593 0.34
594 0.38
595 0.45
596 0.51
597 0.56
598 0.62
599 0.69
600 0.72
601 0.75
602 0.77
603 0.78
604 0.78
605 0.74
606 0.7
607 0.67
608 0.63
609 0.55
610 0.48
611 0.44
612 0.37
613 0.35
614 0.34
615 0.3
616 0.29
617 0.33
618 0.36
619 0.38
620 0.46
621 0.49
622 0.56
623 0.64
624 0.69
625 0.69
626 0.71
627 0.69
628 0.67
629 0.72
630 0.71
631 0.69
632 0.67
633 0.67
634 0.66
635 0.63
636 0.61
637 0.61
638 0.61
639 0.57
640 0.63
641 0.62
642 0.64
643 0.69
644 0.71
645 0.69
646 0.7
647 0.72
648 0.68
649 0.67
650 0.64
651 0.61
652 0.61
653 0.58
654 0.59
655 0.65
656 0.68
657 0.72
658 0.77
659 0.81
660 0.82
661 0.87
662 0.86