Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317SY19

Protein Details
Accession A0A317SY19    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
384-407AVREREKMRRERRQEEERQQRMKNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
222-237PKFKHKKIPRGPPSPP
340-372QKAREAAHARSRGRSRSRSSDGSRESRSRSRSR
390-395KMRRER
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MTSLAAGLSKVLPAPKYSAEEDVTAGRKPTARVLGGGDPDQQGLILKKTGPPPYGRRSAWRPRSADDFGDGGAFPEVPMAQYPLDMGRKGLGTSKALSLQVDNEGKVKYDAISRQGHNDKRIVHASFKDLIPLRQRADVGEISLERPSEEDVAATTEKTRQALAKLVSGAVAAQKPKNVKGTNRKEAQYVRYTPSNQLGDTTKRSDKIIKIVERQQDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAADQEAWTIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEALFTADRHAREEIKQRALMQQKLAEKEKSQKEEHLRMLAQKAREAAHARSRGRSRSRSSDGSRESRSRSRSRSSSEDSRSDDEAVREREKMRRERRQEEERQQRMKNMGSERKMQMLAREQGRDIGEKIALGLAKPTQSQETMWDSRLFNQSSAFGAGSGFNEDQPYDKPLFAAQEAANSIYRPKVSVDDDDEDAARSEMDRIKRSSRFEVLGKAQQGFKGAADAEARDGPVQFEKDTADPFGVEAFVKAAGEKAGAKHGLQERDSSPGGSKRPRASYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.23
3 0.28
4 0.29
5 0.32
6 0.3
7 0.3
8 0.3
9 0.32
10 0.3
11 0.27
12 0.25
13 0.23
14 0.25
15 0.25
16 0.31
17 0.32
18 0.31
19 0.31
20 0.35
21 0.38
22 0.39
23 0.39
24 0.35
25 0.28
26 0.27
27 0.25
28 0.2
29 0.17
30 0.16
31 0.17
32 0.16
33 0.16
34 0.21
35 0.28
36 0.35
37 0.36
38 0.41
39 0.47
40 0.53
41 0.61
42 0.58
43 0.6
44 0.63
45 0.7
46 0.73
47 0.73
48 0.69
49 0.64
50 0.69
51 0.65
52 0.57
53 0.49
54 0.39
55 0.31
56 0.28
57 0.24
58 0.17
59 0.14
60 0.11
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.08
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.14
71 0.17
72 0.17
73 0.17
74 0.17
75 0.18
76 0.18
77 0.23
78 0.21
79 0.21
80 0.22
81 0.24
82 0.26
83 0.26
84 0.26
85 0.21
86 0.19
87 0.24
88 0.24
89 0.22
90 0.21
91 0.21
92 0.21
93 0.21
94 0.2
95 0.14
96 0.18
97 0.2
98 0.25
99 0.31
100 0.31
101 0.39
102 0.47
103 0.51
104 0.49
105 0.51
106 0.46
107 0.45
108 0.5
109 0.44
110 0.4
111 0.37
112 0.38
113 0.37
114 0.35
115 0.36
116 0.31
117 0.33
118 0.35
119 0.38
120 0.35
121 0.34
122 0.35
123 0.29
124 0.32
125 0.28
126 0.22
127 0.2
128 0.19
129 0.16
130 0.17
131 0.16
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.13
144 0.15
145 0.15
146 0.16
147 0.15
148 0.16
149 0.22
150 0.23
151 0.23
152 0.22
153 0.21
154 0.2
155 0.18
156 0.16
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.16
162 0.19
163 0.22
164 0.3
165 0.31
166 0.38
167 0.47
168 0.56
169 0.62
170 0.66
171 0.64
172 0.61
173 0.62
174 0.59
175 0.56
176 0.5
177 0.44
178 0.44
179 0.44
180 0.41
181 0.44
182 0.39
183 0.31
184 0.29
185 0.29
186 0.28
187 0.3
188 0.32
189 0.28
190 0.28
191 0.3
192 0.33
193 0.31
194 0.35
195 0.4
196 0.4
197 0.43
198 0.49
199 0.53
200 0.5
201 0.5
202 0.43
203 0.38
204 0.35
205 0.38
206 0.37
207 0.32
208 0.31
209 0.41
210 0.46
211 0.44
212 0.52
213 0.53
214 0.59
215 0.67
216 0.77
217 0.75
218 0.77
219 0.79
220 0.78
221 0.76
222 0.72
223 0.65
224 0.56
225 0.52
226 0.49
227 0.49
228 0.49
229 0.5
230 0.47
231 0.48
232 0.5
233 0.44
234 0.4
235 0.39
236 0.39
237 0.35
238 0.32
239 0.28
240 0.26
241 0.26
242 0.25
243 0.22
244 0.13
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.16
249 0.19
250 0.25
251 0.32
252 0.37
253 0.43
254 0.42
255 0.45
256 0.4
257 0.39
258 0.37
259 0.4
260 0.38
261 0.38
262 0.39
263 0.35
264 0.33
265 0.32
266 0.28
267 0.19
268 0.17
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.11
274 0.12
275 0.12
276 0.15
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.13
282 0.11
283 0.11
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.11
296 0.12
297 0.16
298 0.25
299 0.29
300 0.31
301 0.32
302 0.32
303 0.37
304 0.41
305 0.39
306 0.32
307 0.32
308 0.31
309 0.34
310 0.37
311 0.31
312 0.28
313 0.35
314 0.39
315 0.4
316 0.37
317 0.4
318 0.44
319 0.49
320 0.5
321 0.45
322 0.39
323 0.37
324 0.4
325 0.37
326 0.3
327 0.25
328 0.24
329 0.21
330 0.24
331 0.25
332 0.23
333 0.28
334 0.35
335 0.34
336 0.39
337 0.42
338 0.46
339 0.51
340 0.54
341 0.52
342 0.53
343 0.58
344 0.59
345 0.59
346 0.6
347 0.59
348 0.58
349 0.57
350 0.52
351 0.52
352 0.5
353 0.53
354 0.51
355 0.51
356 0.53
357 0.53
358 0.55
359 0.57
360 0.58
361 0.6
362 0.58
363 0.58
364 0.54
365 0.52
366 0.48
367 0.42
368 0.37
369 0.3
370 0.31
371 0.3
372 0.28
373 0.27
374 0.28
375 0.31
376 0.38
377 0.46
378 0.5
379 0.56
380 0.63
381 0.69
382 0.75
383 0.8
384 0.82
385 0.82
386 0.83
387 0.82
388 0.81
389 0.75
390 0.7
391 0.64
392 0.58
393 0.54
394 0.52
395 0.51
396 0.47
397 0.52
398 0.49
399 0.48
400 0.47
401 0.41
402 0.37
403 0.36
404 0.39
405 0.37
406 0.37
407 0.33
408 0.35
409 0.35
410 0.32
411 0.25
412 0.21
413 0.17
414 0.15
415 0.15
416 0.13
417 0.12
418 0.1
419 0.1
420 0.1
421 0.11
422 0.12
423 0.13
424 0.13
425 0.14
426 0.15
427 0.18
428 0.24
429 0.25
430 0.27
431 0.29
432 0.28
433 0.32
434 0.39
435 0.35
436 0.28
437 0.27
438 0.26
439 0.23
440 0.24
441 0.19
442 0.12
443 0.11
444 0.12
445 0.11
446 0.14
447 0.12
448 0.11
449 0.12
450 0.12
451 0.13
452 0.14
453 0.18
454 0.16
455 0.16
456 0.16
457 0.17
458 0.19
459 0.18
460 0.21
461 0.16
462 0.18
463 0.19
464 0.21
465 0.2
466 0.17
467 0.18
468 0.17
469 0.17
470 0.14
471 0.15
472 0.18
473 0.21
474 0.26
475 0.3
476 0.31
477 0.32
478 0.32
479 0.3
480 0.26
481 0.24
482 0.18
483 0.13
484 0.09
485 0.12
486 0.16
487 0.22
488 0.27
489 0.3
490 0.38
491 0.44
492 0.5
493 0.53
494 0.53
495 0.52
496 0.49
497 0.53
498 0.51
499 0.53
500 0.5
501 0.45
502 0.42
503 0.38
504 0.37
505 0.3
506 0.24
507 0.2
508 0.18
509 0.18
510 0.18
511 0.17
512 0.18
513 0.18
514 0.19
515 0.16
516 0.16
517 0.16
518 0.19
519 0.21
520 0.18
521 0.18
522 0.2
523 0.21
524 0.23
525 0.22
526 0.18
527 0.16
528 0.16
529 0.15
530 0.14
531 0.11
532 0.1
533 0.09
534 0.09
535 0.09
536 0.08
537 0.09
538 0.08
539 0.1
540 0.12
541 0.13
542 0.19
543 0.21
544 0.21
545 0.28
546 0.34
547 0.4
548 0.39
549 0.42
550 0.37
551 0.41
552 0.42
553 0.35
554 0.34
555 0.34
556 0.41
557 0.44
558 0.51
559 0.53