Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A317SHX4

Protein Details
Accession A0A317SHX4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
445-465VKAGAKKKATPAKGKGKDKGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
446-465KAGAKKKATPAKGKGKDKGS
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003738  SRAP  
IPR036590  SRAP-like  
Gene Ontology GO:0008233  F:peptidase activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0018142  P:protein-DNA covalent cross-linking  
GO:0006508  P:proteolysis  
Pfam View protein in Pfam  
PF02586  SRAP  
Amino Acid Sequences MCGRYAVGDGPGHVRIELERNRLPVRQAPPEEANGDIRRHFNVAPGNYQLVYRAFPGDPGNTPGEAPGDTMSGEPGVVYALEYMKWGLIPSWSTSPPNYPGLLKTINCRSDSLAENKPLWSMKNNKRCIVVALGFYEWLHKGKEKVPHFIKRKDGEMMLFAGLWDCVQYEGSQEKLYTYTIITTEANEQLSFLHERMPAILEPSTTAEVIPWLSPKIKSWNSTLQSLLKPYQGALEVYPVSKDVGKVALDSPSFIIPVDSAENKSNIKNFFVTPKKGIKSEATPKEEEPKGGDDNVEITGSSVKQETSEASHSENSSQKPGASKKPMKSFFVTPNKTLPSSSQKFKKEEKDAPGASLPPHIPFRTETPSSSRSPLPSPSAASASRKRERLEGGDEELARKLARLDRPEEEGDEELARKLEMEERLLSSPLGPRTRSSITNTPASVKAGAKKKATPAKGKGKDKGSQKITSFFGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.25
4 0.31
5 0.34
6 0.35
7 0.4
8 0.44
9 0.46
10 0.48
11 0.47
12 0.48
13 0.5
14 0.5
15 0.51
16 0.52
17 0.53
18 0.5
19 0.44
20 0.44
21 0.38
22 0.38
23 0.34
24 0.33
25 0.31
26 0.33
27 0.31
28 0.29
29 0.33
30 0.33
31 0.35
32 0.35
33 0.36
34 0.32
35 0.32
36 0.29
37 0.23
38 0.21
39 0.18
40 0.18
41 0.16
42 0.18
43 0.21
44 0.22
45 0.22
46 0.25
47 0.26
48 0.22
49 0.23
50 0.21
51 0.19
52 0.16
53 0.15
54 0.12
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.08
60 0.08
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.06
68 0.06
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.09
76 0.1
77 0.13
78 0.18
79 0.2
80 0.22
81 0.23
82 0.27
83 0.28
84 0.3
85 0.28
86 0.25
87 0.24
88 0.27
89 0.31
90 0.27
91 0.29
92 0.35
93 0.38
94 0.37
95 0.37
96 0.34
97 0.34
98 0.37
99 0.37
100 0.35
101 0.34
102 0.34
103 0.34
104 0.34
105 0.3
106 0.28
107 0.29
108 0.33
109 0.39
110 0.48
111 0.53
112 0.53
113 0.55
114 0.54
115 0.5
116 0.46
117 0.39
118 0.31
119 0.27
120 0.24
121 0.22
122 0.21
123 0.2
124 0.15
125 0.13
126 0.13
127 0.13
128 0.15
129 0.2
130 0.29
131 0.3
132 0.39
133 0.45
134 0.54
135 0.59
136 0.63
137 0.67
138 0.61
139 0.61
140 0.55
141 0.48
142 0.39
143 0.33
144 0.29
145 0.2
146 0.17
147 0.13
148 0.1
149 0.08
150 0.07
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.07
157 0.08
158 0.1
159 0.11
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.1
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.12
172 0.13
173 0.13
174 0.12
175 0.12
176 0.1
177 0.12
178 0.12
179 0.1
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.13
184 0.14
185 0.12
186 0.13
187 0.13
188 0.09
189 0.09
190 0.11
191 0.11
192 0.09
193 0.09
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.09
201 0.09
202 0.11
203 0.19
204 0.22
205 0.24
206 0.27
207 0.35
208 0.36
209 0.37
210 0.37
211 0.33
212 0.3
213 0.31
214 0.28
215 0.2
216 0.18
217 0.16
218 0.16
219 0.12
220 0.12
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.06
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.12
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.08
243 0.05
244 0.06
245 0.08
246 0.08
247 0.1
248 0.11
249 0.12
250 0.14
251 0.15
252 0.18
253 0.17
254 0.18
255 0.17
256 0.17
257 0.24
258 0.29
259 0.31
260 0.32
261 0.38
262 0.38
263 0.37
264 0.39
265 0.34
266 0.36
267 0.42
268 0.46
269 0.44
270 0.43
271 0.43
272 0.48
273 0.46
274 0.39
275 0.31
276 0.27
277 0.24
278 0.22
279 0.21
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.12
284 0.08
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.09
294 0.11
295 0.13
296 0.14
297 0.16
298 0.18
299 0.18
300 0.21
301 0.25
302 0.22
303 0.24
304 0.23
305 0.22
306 0.26
307 0.31
308 0.36
309 0.42
310 0.48
311 0.52
312 0.61
313 0.64
314 0.62
315 0.61
316 0.58
317 0.58
318 0.61
319 0.58
320 0.5
321 0.51
322 0.5
323 0.47
324 0.42
325 0.36
326 0.36
327 0.37
328 0.43
329 0.46
330 0.49
331 0.54
332 0.61
333 0.66
334 0.64
335 0.67
336 0.66
337 0.67
338 0.61
339 0.58
340 0.53
341 0.45
342 0.36
343 0.33
344 0.27
345 0.21
346 0.24
347 0.21
348 0.21
349 0.22
350 0.26
351 0.29
352 0.3
353 0.29
354 0.32
355 0.36
356 0.37
357 0.39
358 0.36
359 0.32
360 0.34
361 0.36
362 0.35
363 0.33
364 0.32
365 0.31
366 0.33
367 0.32
368 0.36
369 0.39
370 0.43
371 0.48
372 0.49
373 0.48
374 0.5
375 0.52
376 0.51
377 0.5
378 0.45
379 0.43
380 0.44
381 0.43
382 0.38
383 0.34
384 0.29
385 0.22
386 0.18
387 0.17
388 0.19
389 0.25
390 0.29
391 0.34
392 0.36
393 0.42
394 0.43
395 0.41
396 0.38
397 0.32
398 0.29
399 0.25
400 0.23
401 0.18
402 0.17
403 0.15
404 0.12
405 0.12
406 0.16
407 0.17
408 0.19
409 0.21
410 0.24
411 0.26
412 0.26
413 0.25
414 0.21
415 0.25
416 0.29
417 0.31
418 0.29
419 0.29
420 0.35
421 0.39
422 0.41
423 0.43
424 0.44
425 0.44
426 0.49
427 0.49
428 0.46
429 0.44
430 0.43
431 0.39
432 0.34
433 0.38
434 0.4
435 0.46
436 0.46
437 0.49
438 0.56
439 0.62
440 0.66
441 0.68
442 0.69
443 0.74
444 0.79
445 0.83
446 0.82
447 0.8
448 0.78
449 0.78
450 0.78
451 0.74
452 0.72
453 0.66
454 0.64