Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317SSD6

Protein Details
Accession A0A317SSD6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-370GASTPNTRTRGKKRRHRIVNLRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
357-366TRGKKRRHRI
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, mito 2, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027536  Mdm34  
IPR031468  SMP_LBD  
Gene Ontology GO:0032865  C:ERMES complex  
GO:0008289  F:lipid binding  
GO:0006869  P:lipid transport  
GO:0007005  P:mitochondrion organization  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51847  SMP  
CDD cd21673  SMP_Mdm34  
Amino Acid Sequences MAFNFNWTPLTTSNTSSSAFYSHAKSLLSAALNKSQKPPIIVDDIFVEELNLGQSAPELEILEIGDLAEDRFRGIFRMSYDGDAFLTLRTKVQANPLNTYLSTTPSYTSPMPLAASSPLTIPLQITLSQFRLSGFIILVFSKAKGITLVFRNDPLESLKVSSTFDTIPFIKDYLQKEIERQVRGLFQEELPVAVHRLSLRLWNPEYAASLGLDVHDPDPSSPIDGSEDGSGDDANAAFTNPLLSPSDNPDTPSIVFSQKNLAALRALSEAQKTLSMRTPDISDAVFRVWASGGGSSSAGWERNIDAPSTPIGPQAYTFSDTGEAVSPATSISSSRHSLATPPSASVGGGASTPNTRTRGKKRRHRIVNLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.3
3 0.27
4 0.26
5 0.22
6 0.22
7 0.22
8 0.23
9 0.22
10 0.23
11 0.23
12 0.22
13 0.22
14 0.24
15 0.24
16 0.23
17 0.24
18 0.31
19 0.34
20 0.35
21 0.39
22 0.39
23 0.39
24 0.39
25 0.38
26 0.34
27 0.38
28 0.36
29 0.32
30 0.29
31 0.29
32 0.26
33 0.23
34 0.18
35 0.1
36 0.11
37 0.1
38 0.08
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.06
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.06
56 0.05
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.09
61 0.1
62 0.12
63 0.13
64 0.19
65 0.2
66 0.22
67 0.22
68 0.21
69 0.2
70 0.18
71 0.16
72 0.11
73 0.12
74 0.1
75 0.1
76 0.11
77 0.13
78 0.14
79 0.23
80 0.28
81 0.29
82 0.33
83 0.34
84 0.35
85 0.33
86 0.34
87 0.26
88 0.22
89 0.21
90 0.17
91 0.16
92 0.15
93 0.19
94 0.16
95 0.17
96 0.14
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.13
101 0.11
102 0.12
103 0.1
104 0.1
105 0.11
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.14
115 0.14
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.12
120 0.11
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.08
127 0.07
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.11
134 0.15
135 0.18
136 0.17
137 0.19
138 0.2
139 0.19
140 0.19
141 0.17
142 0.14
143 0.12
144 0.12
145 0.11
146 0.11
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.12
156 0.11
157 0.12
158 0.17
159 0.18
160 0.21
161 0.25
162 0.24
163 0.25
164 0.32
165 0.35
166 0.31
167 0.3
168 0.25
169 0.24
170 0.24
171 0.25
172 0.19
173 0.13
174 0.15
175 0.14
176 0.13
177 0.11
178 0.11
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.11
186 0.13
187 0.17
188 0.18
189 0.18
190 0.19
191 0.18
192 0.19
193 0.15
194 0.13
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.08
206 0.07
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.06
219 0.06
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.15
233 0.2
234 0.19
235 0.21
236 0.2
237 0.21
238 0.2
239 0.2
240 0.17
241 0.17
242 0.17
243 0.16
244 0.21
245 0.2
246 0.23
247 0.22
248 0.21
249 0.17
250 0.17
251 0.18
252 0.15
253 0.14
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.15
259 0.14
260 0.15
261 0.2
262 0.22
263 0.22
264 0.23
265 0.24
266 0.22
267 0.22
268 0.2
269 0.15
270 0.14
271 0.13
272 0.13
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.1
284 0.12
285 0.12
286 0.11
287 0.12
288 0.13
289 0.17
290 0.18
291 0.17
292 0.16
293 0.16
294 0.18
295 0.19
296 0.17
297 0.15
298 0.15
299 0.15
300 0.16
301 0.17
302 0.19
303 0.19
304 0.19
305 0.17
306 0.17
307 0.17
308 0.17
309 0.16
310 0.13
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.09
319 0.14
320 0.17
321 0.18
322 0.2
323 0.2
324 0.24
325 0.29
326 0.34
327 0.3
328 0.29
329 0.29
330 0.28
331 0.27
332 0.23
333 0.18
334 0.11
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.11
339 0.14
340 0.18
341 0.22
342 0.27
343 0.37
344 0.48
345 0.56
346 0.65
347 0.74
348 0.8
349 0.87
350 0.92