Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317SHP0

Protein Details
Accession A0A317SHP0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-132LTPPPRPKRVNRRNAKALKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-136PPPRPKRVNRRNAKALKEGVWR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025124  DUF4050  
Pfam View protein in Pfam  
PF13259  DUF4050  
Amino Acid Sequences MPSLPKKSVRIAPDTTLSKTERSEALRSVRTILDSVSTDWIFTPPPPISSQHSKFALQRSGSLGSWRPNAANSPPATPRMSDSDSEDAGSDSSLDLDLDLEDGIGTSSYRRALTPPPRPKRVNRRNAKALKEGVWRRREDDSDIDAPNIVKRESENGQYPFESPDDVPTPEKLRERVKREMEAEMAWNDGLRLFVARRDAWTGAVGDEVPVRESRFKDNPLTSMVTPQVYPQIYRKVVVEGATPPVP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.48
3 0.46
4 0.42
5 0.38
6 0.35
7 0.34
8 0.31
9 0.32
10 0.33
11 0.34
12 0.4
13 0.42
14 0.41
15 0.41
16 0.37
17 0.33
18 0.3
19 0.25
20 0.21
21 0.17
22 0.18
23 0.2
24 0.19
25 0.17
26 0.17
27 0.18
28 0.15
29 0.14
30 0.18
31 0.14
32 0.16
33 0.18
34 0.21
35 0.27
36 0.35
37 0.39
38 0.4
39 0.43
40 0.43
41 0.45
42 0.48
43 0.48
44 0.39
45 0.37
46 0.34
47 0.35
48 0.32
49 0.32
50 0.29
51 0.26
52 0.28
53 0.26
54 0.23
55 0.21
56 0.24
57 0.22
58 0.25
59 0.22
60 0.24
61 0.25
62 0.27
63 0.27
64 0.25
65 0.25
66 0.24
67 0.25
68 0.22
69 0.25
70 0.25
71 0.24
72 0.24
73 0.21
74 0.16
75 0.13
76 0.12
77 0.08
78 0.05
79 0.05
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.04
95 0.06
96 0.07
97 0.07
98 0.09
99 0.17
100 0.27
101 0.37
102 0.47
103 0.53
104 0.6
105 0.64
106 0.7
107 0.74
108 0.75
109 0.75
110 0.74
111 0.75
112 0.77
113 0.8
114 0.76
115 0.7
116 0.62
117 0.55
118 0.55
119 0.53
120 0.51
121 0.5
122 0.46
123 0.44
124 0.45
125 0.42
126 0.37
127 0.34
128 0.32
129 0.29
130 0.29
131 0.26
132 0.23
133 0.22
134 0.2
135 0.17
136 0.12
137 0.08
138 0.09
139 0.13
140 0.15
141 0.18
142 0.23
143 0.24
144 0.26
145 0.26
146 0.27
147 0.24
148 0.22
149 0.2
150 0.13
151 0.15
152 0.16
153 0.17
154 0.17
155 0.18
156 0.21
157 0.24
158 0.27
159 0.28
160 0.35
161 0.42
162 0.47
163 0.54
164 0.57
165 0.58
166 0.58
167 0.56
168 0.48
169 0.41
170 0.37
171 0.28
172 0.23
173 0.17
174 0.14
175 0.11
176 0.09
177 0.08
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.14
183 0.15
184 0.16
185 0.2
186 0.21
187 0.2
188 0.21
189 0.19
190 0.15
191 0.15
192 0.13
193 0.1
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.11
198 0.13
199 0.17
200 0.19
201 0.27
202 0.32
203 0.36
204 0.42
205 0.44
206 0.44
207 0.44
208 0.46
209 0.39
210 0.38
211 0.36
212 0.29
213 0.26
214 0.25
215 0.28
216 0.24
217 0.26
218 0.27
219 0.34
220 0.34
221 0.35
222 0.35
223 0.32
224 0.33
225 0.32
226 0.29
227 0.22