Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317XJA3

Protein Details
Accession A0A317XJA3    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-27DSSTSTILKRPRGRPRKNAPAPGADVHydrophilic
149-170TEAGPTPRKRGRPRKDANASVDHydrophilic
226-253RQEGRSKGKRRRKGWPTPRERLRKWRKLBasic
390-414LTRTKSSISKLRKDRKAIKNSDSGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-19KRPRGRPRKN
90-92GRP
155-163PRKRGRPRK
228-252EGRSKGKRRRKGWPTPRERLRKWRK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MDSSTSTILKRPRGRPRKNAPAPGADVSLASTIATTATPRPRGRSRKDATNTSSSIASAATTPRPRGGPRKNADTSTNSIPSTSTGRPRGRPRKSADVSLASTAAPVTPRPRGRPRKDVSVSFDDSVTVAIPRSKGRPRTNADTSVTSTEAGPTPRKRGRPRKDANASVDNSTAAASAVRGQAAEDSDVSLIDGASDAESDASEDDAAQSADEDEGGLSSDGESGRQEGRSKGKRRRKGWPTPRERLRKWRKLSLEERECVTSEGGLIWRTAIPLLNSMPKNVRSMVADSLARALNRIDGKLEAGLVPPLPRVPTASGARRELASSMLSWRLEEEGSLLRAENADLTANIMNPTDLGMNAEIAELEQMLLPEAEQIIELNKTLQHQSDELTRTKSSISKLRKDRKAIKNSDSGAYPGDLEAHKLVSIITTKPELDLHLAPALRMYNS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.85
3 0.89
4 0.91
5 0.91
6 0.91
7 0.86
8 0.82
9 0.78
10 0.7
11 0.61
12 0.49
13 0.39
14 0.31
15 0.25
16 0.17
17 0.12
18 0.09
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.14
24 0.22
25 0.3
26 0.33
27 0.41
28 0.51
29 0.61
30 0.67
31 0.71
32 0.7
33 0.73
34 0.78
35 0.79
36 0.76
37 0.73
38 0.67
39 0.57
40 0.51
41 0.4
42 0.33
43 0.24
44 0.18
45 0.12
46 0.13
47 0.19
48 0.22
49 0.24
50 0.27
51 0.31
52 0.36
53 0.45
54 0.52
55 0.55
56 0.57
57 0.65
58 0.66
59 0.66
60 0.66
61 0.6
62 0.56
63 0.52
64 0.49
65 0.39
66 0.35
67 0.32
68 0.29
69 0.3
70 0.29
71 0.3
72 0.35
73 0.41
74 0.48
75 0.59
76 0.68
77 0.71
78 0.75
79 0.74
80 0.77
81 0.75
82 0.73
83 0.68
84 0.63
85 0.57
86 0.49
87 0.43
88 0.31
89 0.27
90 0.2
91 0.15
92 0.1
93 0.1
94 0.12
95 0.2
96 0.24
97 0.32
98 0.43
99 0.53
100 0.6
101 0.69
102 0.71
103 0.74
104 0.75
105 0.73
106 0.7
107 0.66
108 0.62
109 0.52
110 0.46
111 0.36
112 0.3
113 0.24
114 0.17
115 0.1
116 0.07
117 0.08
118 0.1
119 0.12
120 0.18
121 0.25
122 0.34
123 0.41
124 0.49
125 0.54
126 0.61
127 0.65
128 0.64
129 0.61
130 0.54
131 0.49
132 0.43
133 0.36
134 0.28
135 0.22
136 0.18
137 0.17
138 0.17
139 0.21
140 0.21
141 0.29
142 0.34
143 0.43
144 0.52
145 0.61
146 0.68
147 0.73
148 0.78
149 0.81
150 0.84
151 0.82
152 0.78
153 0.75
154 0.66
155 0.57
156 0.49
157 0.38
158 0.29
159 0.22
160 0.16
161 0.08
162 0.06
163 0.05
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.09
214 0.1
215 0.13
216 0.22
217 0.31
218 0.39
219 0.48
220 0.57
221 0.65
222 0.68
223 0.76
224 0.77
225 0.79
226 0.82
227 0.82
228 0.82
229 0.83
230 0.87
231 0.86
232 0.8
233 0.8
234 0.8
235 0.79
236 0.76
237 0.74
238 0.7
239 0.7
240 0.73
241 0.73
242 0.69
243 0.61
244 0.57
245 0.5
246 0.44
247 0.36
248 0.28
249 0.17
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.07
261 0.09
262 0.1
263 0.16
264 0.16
265 0.18
266 0.21
267 0.22
268 0.24
269 0.22
270 0.22
271 0.17
272 0.2
273 0.2
274 0.19
275 0.18
276 0.16
277 0.18
278 0.18
279 0.15
280 0.14
281 0.12
282 0.14
283 0.15
284 0.15
285 0.13
286 0.12
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.09
291 0.08
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.11
300 0.12
301 0.18
302 0.23
303 0.3
304 0.33
305 0.35
306 0.36
307 0.34
308 0.32
309 0.26
310 0.22
311 0.16
312 0.12
313 0.13
314 0.16
315 0.15
316 0.14
317 0.15
318 0.14
319 0.13
320 0.12
321 0.12
322 0.11
323 0.12
324 0.13
325 0.12
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.1
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.09
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.1
338 0.09
339 0.08
340 0.09
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.07
349 0.06
350 0.07
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.05
362 0.06
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.1
368 0.12
369 0.15
370 0.17
371 0.18
372 0.18
373 0.2
374 0.27
375 0.3
376 0.31
377 0.33
378 0.31
379 0.29
380 0.31
381 0.33
382 0.31
383 0.36
384 0.42
385 0.48
386 0.58
387 0.68
388 0.74
389 0.8
390 0.85
391 0.86
392 0.88
393 0.86
394 0.82
395 0.81
396 0.75
397 0.69
398 0.6
399 0.5
400 0.41
401 0.33
402 0.27
403 0.18
404 0.19
405 0.15
406 0.17
407 0.16
408 0.15
409 0.15
410 0.14
411 0.14
412 0.13
413 0.16
414 0.14
415 0.17
416 0.19
417 0.19
418 0.21
419 0.22
420 0.21
421 0.23
422 0.23
423 0.23
424 0.25
425 0.25
426 0.23
427 0.25