Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H9CNX7

Protein Details
Accession H9CNX7    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MLNIIKSKLKNTYKKKSLNSSNVTIRHydrophilic
67-98FNSYNWKLEKKLRKEKLRRRLRKFSTNRIFISHydrophilic
123-144YLLKLKKRYTRLFKRVKFVKKLHydrophilic
250-288TQPLVLKLRKKRKLLRYLKALVRKAKIKKIKLNERSKYFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-89EKKLRKEKLRRRLRK
256-281KLRKKRKLLRYLKALVRKAKIKKIKL
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 12, cyto_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007980  Ribosomal_VAR1  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05316  VAR1  
Amino Acid Sequences MLNIIKSKLKNTYKKKSLNSSNVTIRNKDFVPAVRDWKNSIYVYNKNALSLIPVASRLVMKLIKGYFNSYNWKLEKKLRKEKLRRRLRKFSTNRIFISDGEFKHTNDKVNITLYVYNRQRLNYLLKLKKRYTRLFKRVKFVKKLQLIRNIGLNILNKQQEKSKILTNVLPNYSSKVYSIQNSYYKRFIKKSFSRLKYYMYYKQLLYINKAKFENSYLQGLINLIRKIYKKNVEFNIINLKYFYFNSDIFTQPLVLKLRKKRKLLRYLKALVRKAKIKKIKLNERSKYFFDLDNLFTVNNLDTTNNLLNNLMEQNKTSSEYLKKIVLNDIKYKRVSGVRIEAAGRLTRRYTASRSQHKVRYSGNLVNAYSSIKGYPSSVIRGNYKPNLQYTKLNSKSRIGSFGVKGWVSGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.86
3 0.87
4 0.87
5 0.87
6 0.84
7 0.81
8 0.8
9 0.79
10 0.76
11 0.69
12 0.61
13 0.56
14 0.49
15 0.43
16 0.38
17 0.35
18 0.36
19 0.37
20 0.42
21 0.44
22 0.45
23 0.46
24 0.45
25 0.46
26 0.4
27 0.4
28 0.39
29 0.39
30 0.42
31 0.45
32 0.42
33 0.37
34 0.36
35 0.31
36 0.27
37 0.22
38 0.2
39 0.14
40 0.14
41 0.14
42 0.15
43 0.15
44 0.12
45 0.15
46 0.14
47 0.13
48 0.18
49 0.21
50 0.24
51 0.24
52 0.3
53 0.29
54 0.32
55 0.4
56 0.37
57 0.42
58 0.41
59 0.44
60 0.43
61 0.49
62 0.56
63 0.58
64 0.66
65 0.69
66 0.77
67 0.84
68 0.9
69 0.91
70 0.92
71 0.92
72 0.91
73 0.92
74 0.9
75 0.9
76 0.87
77 0.88
78 0.87
79 0.83
80 0.75
81 0.69
82 0.62
83 0.51
84 0.5
85 0.44
86 0.34
87 0.34
88 0.34
89 0.29
90 0.35
91 0.36
92 0.34
93 0.3
94 0.32
95 0.27
96 0.28
97 0.28
98 0.23
99 0.26
100 0.23
101 0.3
102 0.31
103 0.33
104 0.32
105 0.32
106 0.31
107 0.3
108 0.35
109 0.33
110 0.41
111 0.44
112 0.5
113 0.57
114 0.61
115 0.64
116 0.67
117 0.68
118 0.69
119 0.72
120 0.76
121 0.79
122 0.79
123 0.82
124 0.82
125 0.82
126 0.8
127 0.76
128 0.74
129 0.72
130 0.75
131 0.72
132 0.73
133 0.67
134 0.6
135 0.57
136 0.47
137 0.39
138 0.34
139 0.29
140 0.21
141 0.22
142 0.25
143 0.21
144 0.22
145 0.26
146 0.28
147 0.3
148 0.3
149 0.31
150 0.31
151 0.32
152 0.35
153 0.35
154 0.34
155 0.32
156 0.31
157 0.26
158 0.26
159 0.24
160 0.2
161 0.16
162 0.15
163 0.16
164 0.17
165 0.2
166 0.21
167 0.27
168 0.3
169 0.32
170 0.35
171 0.38
172 0.39
173 0.41
174 0.42
175 0.45
176 0.49
177 0.57
178 0.6
179 0.61
180 0.64
181 0.6
182 0.6
183 0.56
184 0.54
185 0.51
186 0.45
187 0.42
188 0.35
189 0.38
190 0.38
191 0.33
192 0.33
193 0.33
194 0.3
195 0.31
196 0.32
197 0.28
198 0.24
199 0.26
200 0.26
201 0.2
202 0.21
203 0.17
204 0.17
205 0.16
206 0.16
207 0.16
208 0.15
209 0.13
210 0.12
211 0.14
212 0.16
213 0.19
214 0.25
215 0.31
216 0.31
217 0.38
218 0.41
219 0.45
220 0.44
221 0.43
222 0.46
223 0.39
224 0.35
225 0.28
226 0.25
227 0.2
228 0.2
229 0.2
230 0.12
231 0.12
232 0.14
233 0.16
234 0.17
235 0.16
236 0.17
237 0.16
238 0.13
239 0.17
240 0.18
241 0.2
242 0.26
243 0.34
244 0.45
245 0.51
246 0.6
247 0.65
248 0.71
249 0.79
250 0.82
251 0.82
252 0.8
253 0.8
254 0.79
255 0.78
256 0.74
257 0.69
258 0.64
259 0.64
260 0.61
261 0.62
262 0.64
263 0.64
264 0.67
265 0.71
266 0.76
267 0.78
268 0.83
269 0.81
270 0.8
271 0.76
272 0.7
273 0.65
274 0.56
275 0.48
276 0.4
277 0.35
278 0.3
279 0.26
280 0.24
281 0.18
282 0.16
283 0.15
284 0.12
285 0.1
286 0.09
287 0.07
288 0.07
289 0.12
290 0.15
291 0.14
292 0.14
293 0.14
294 0.13
295 0.15
296 0.18
297 0.15
298 0.13
299 0.14
300 0.16
301 0.17
302 0.2
303 0.19
304 0.21
305 0.24
306 0.27
307 0.29
308 0.32
309 0.32
310 0.31
311 0.38
312 0.39
313 0.39
314 0.45
315 0.48
316 0.49
317 0.48
318 0.47
319 0.43
320 0.42
321 0.41
322 0.38
323 0.4
324 0.36
325 0.38
326 0.38
327 0.35
328 0.32
329 0.33
330 0.28
331 0.24
332 0.22
333 0.23
334 0.26
335 0.29
336 0.33
337 0.38
338 0.47
339 0.55
340 0.62
341 0.67
342 0.7
343 0.7
344 0.7
345 0.64
346 0.62
347 0.59
348 0.57
349 0.55
350 0.53
351 0.49
352 0.44
353 0.41
354 0.33
355 0.27
356 0.22
357 0.16
358 0.12
359 0.13
360 0.13
361 0.17
362 0.18
363 0.22
364 0.26
365 0.3
366 0.35
367 0.39
368 0.46
369 0.48
370 0.51
371 0.51
372 0.54
373 0.57
374 0.55
375 0.58
376 0.58
377 0.63
378 0.66
379 0.69
380 0.64
381 0.63
382 0.68
383 0.63
384 0.6
385 0.53
386 0.51
387 0.47
388 0.48
389 0.47
390 0.39