Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317XM55

Protein Details
Accession A0A317XM55    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
217-237AATKTQKLRSRPQKEGKQILEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-58RRGGARNGAPRA
64-97APADGEKRDNRRRGGEGRGRGAPRGRGRGGRGRP
251-280GGRGGRGGSRGAPRGERGASRGRGGRGGRG
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 9.832, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSVANKNPFALLSDDGEPAPVAAAPAKAAQAPAAQAARSIPGAANSRRGGARNGAPRAEQGADAPADGEKRDNRRRGGEGRGRGAPRGRGRGGRGRPFDRHSQTDRVDSQKQVAQGWGGEDGKKELESEEKAEADAKAEGAENGTAAAAAAATDRAAEVEKVPEEEEDKTMTLDQYLAAKAGKKLNIESKAPRAVASDDSAYSKLTKLESKEEEYFAATKTQKLRSRPQKEGKQILEIEQTFNQPAVQQRGGRGGRGGSRGAPRGERGASRGRGGRGGRGSGAQVNLADNAAFPKLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.2
4 0.17
5 0.14
6 0.12
7 0.09
8 0.07
9 0.07
10 0.08
11 0.09
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.12
17 0.12
18 0.12
19 0.16
20 0.16
21 0.15
22 0.15
23 0.16
24 0.16
25 0.15
26 0.15
27 0.11
28 0.14
29 0.21
30 0.22
31 0.29
32 0.27
33 0.3
34 0.32
35 0.33
36 0.31
37 0.3
38 0.36
39 0.38
40 0.41
41 0.4
42 0.38
43 0.37
44 0.38
45 0.33
46 0.26
47 0.18
48 0.17
49 0.16
50 0.15
51 0.14
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.14
56 0.17
57 0.26
58 0.35
59 0.41
60 0.44
61 0.49
62 0.55
63 0.56
64 0.61
65 0.61
66 0.58
67 0.56
68 0.59
69 0.55
70 0.51
71 0.5
72 0.47
73 0.45
74 0.45
75 0.44
76 0.41
77 0.45
78 0.52
79 0.57
80 0.57
81 0.58
82 0.56
83 0.58
84 0.58
85 0.62
86 0.58
87 0.56
88 0.52
89 0.52
90 0.49
91 0.5
92 0.49
93 0.46
94 0.43
95 0.38
96 0.36
97 0.31
98 0.3
99 0.25
100 0.22
101 0.16
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.12
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.1
112 0.08
113 0.11
114 0.11
115 0.13
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.14
120 0.13
121 0.11
122 0.1
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.02
136 0.02
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.02
141 0.02
142 0.03
143 0.03
144 0.04
145 0.04
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.09
167 0.12
168 0.16
169 0.18
170 0.17
171 0.2
172 0.27
173 0.3
174 0.33
175 0.34
176 0.35
177 0.37
178 0.36
179 0.34
180 0.28
181 0.26
182 0.24
183 0.22
184 0.18
185 0.14
186 0.16
187 0.16
188 0.15
189 0.14
190 0.13
191 0.12
192 0.13
193 0.16
194 0.17
195 0.24
196 0.27
197 0.33
198 0.34
199 0.34
200 0.32
201 0.3
202 0.29
203 0.22
204 0.25
205 0.19
206 0.21
207 0.26
208 0.34
209 0.38
210 0.43
211 0.53
212 0.57
213 0.65
214 0.71
215 0.76
216 0.77
217 0.81
218 0.84
219 0.76
220 0.73
221 0.65
222 0.58
223 0.56
224 0.47
225 0.41
226 0.33
227 0.32
228 0.25
229 0.24
230 0.21
231 0.15
232 0.2
233 0.24
234 0.26
235 0.26
236 0.28
237 0.37
238 0.38
239 0.37
240 0.33
241 0.3
242 0.3
243 0.32
244 0.32
245 0.27
246 0.32
247 0.36
248 0.37
249 0.37
250 0.34
251 0.36
252 0.38
253 0.35
254 0.34
255 0.38
256 0.38
257 0.4
258 0.43
259 0.4
260 0.44
261 0.44
262 0.47
263 0.42
264 0.42
265 0.38
266 0.35
267 0.36
268 0.32
269 0.31
270 0.25
271 0.21
272 0.2
273 0.19
274 0.18
275 0.14
276 0.11
277 0.12