FuNGI

A0A317XHX5

Protein Details

Accession

A0A317XHX5

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
226-246	LPRIAEKKSKKERQRAADQRE	Basic
356-379	QLFPRFKQSKSRSKKQDPDPVQPD	Hydrophilic
537-561	QEQREEQQRKLQREQEKQRADRAKY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
113-122	RGRGRGGARP
227-252	PRIAEKKSKKERQRAADQREKAIRSR

Subcellular Location(s)

mito 13, nucl 11.5, cyto_nucl 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

STRPSRGMPAPRGTASLRGGMPRPGAAPSNASMVPSRASYASPSPSPMPSGSNPTAARMARMQFRPVMPQRRKASESPAPSPAPESSSTGASPLAGPSTSTSAGSYARGGASRGRGRGGARPPRQPVQMTASGPFALGPSSRPTARAKVVPMGPGGANLASSSASSSTDPSSSSSALTKTDPDRSAYRNPDKLQDAEAYSDDEDGGVEIIDLDQVHALDELAPRALPRIAEKKSKKERQRAADQREKAIRSRIKAESETVDGVRVKSESEADQDILMGNGQDGDIHGTMQERGVTVSSGTATPQPEDESKVNTADALDLSESEGEEIMDDLVDDFVFNDLEDASPENRLYLFQFPQLFPRFKQSKSRSKKQDPDPVQPDVAEEGTAATNNTAAAAAKRRSVSFAEGTTGGAGSAGTAGGDDNVKGSAKDESDSESDSSDDQEDVKPTDKKLGSQSRSRPRPEGQIGKLDVYRDGRVFFRFGELVMEVTGGSQSTFLQQVMLLDAQNQTATTLGELHRKFVVTPELDCMLNDISLHEQEQREEQQRKLQREQEKQRADRAKYAAHQSGFTSVGGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.42
3	0.4
4	0.34
5	0.33
6	0.34
7	0.34
8	0.34
9	0.29
10	0.28
11	0.25
12	0.26
13	0.24
14	0.25
15	0.22
16	0.25
17	0.24
18	0.24
19	0.22
20	0.21
21	0.21
22	0.18
23	0.19
24	0.15
25	0.16
26	0.19
27	0.23
28	0.27
29	0.26
30	0.29
31	0.3
32	0.3
33	0.33
34	0.3
35	0.3
36	0.27
37	0.35
38	0.33
39	0.37
40	0.36
41	0.36
42	0.41
43	0.36
44	0.36
45	0.32
46	0.35
47	0.36
48	0.38
49	0.39
50	0.37
51	0.39
52	0.46
53	0.5
54	0.57
55	0.55
56	0.62
57	0.66
58	0.68
59	0.72
60	0.65
61	0.65
62	0.62
63	0.63
64	0.58
65	0.58
66	0.51
67	0.47
68	0.47
69	0.39
70	0.34
71	0.28
72	0.27
73	0.22
74	0.23
75	0.22
76	0.2
77	0.19
78	0.16
79	0.15
80	0.11
81	0.11
82	0.09
83	0.09
84	0.1
85	0.14
86	0.14
87	0.14
88	0.13
89	0.14
90	0.15
91	0.15
92	0.14
93	0.12
94	0.12
95	0.12
96	0.13
97	0.15
98	0.23
99	0.27
100	0.27
101	0.27
102	0.29
103	0.31
104	0.37
105	0.44
106	0.46
107	0.47
108	0.54
109	0.58
110	0.61
111	0.63
112	0.57
113	0.52
114	0.48
115	0.49
116	0.42
117	0.38
118	0.34
119	0.3
120	0.28
121	0.23
122	0.16
123	0.1
124	0.09
125	0.09
126	0.12
127	0.15
128	0.16
129	0.18
130	0.22
131	0.27
132	0.31
133	0.33
134	0.31
135	0.35
136	0.37
137	0.36
138	0.32
139	0.29
140	0.24
141	0.21
142	0.19
143	0.12
144	0.1
145	0.08
146	0.08
147	0.06
148	0.06
149	0.06
150	0.06
151	0.07
152	0.07
153	0.09
154	0.1
155	0.1
156	0.11
157	0.12
158	0.14
159	0.13
160	0.14
161	0.14
162	0.14
163	0.15
164	0.15
165	0.17
166	0.18
167	0.24
168	0.25
169	0.26
170	0.29
171	0.32
172	0.39
173	0.45
174	0.49
175	0.49
176	0.5
177	0.52
178	0.52
179	0.48
180	0.43
181	0.36
182	0.29
183	0.24
184	0.23
185	0.19
186	0.16
187	0.15
188	0.12
189	0.09
190	0.08
191	0.06
192	0.05
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.04
198	0.03
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.05
205	0.06
206	0.06
207	0.07
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.07
212	0.08
213	0.07
214	0.11
215	0.19
216	0.22
217	0.32
218	0.37
219	0.46
220	0.56
221	0.65
222	0.7
223	0.72
224	0.77
225	0.75
226	0.82
227	0.81
228	0.8
229	0.8
230	0.73
231	0.69
232	0.66
233	0.59
234	0.5
235	0.49
236	0.44
237	0.37
238	0.41
239	0.39
240	0.37
241	0.36
242	0.36
243	0.29
244	0.28
245	0.27
246	0.2
247	0.19
248	0.15
249	0.14
250	0.13
251	0.11
252	0.09
253	0.08
254	0.09
255	0.08
256	0.1
257	0.11
258	0.11
259	0.1
260	0.1
261	0.09
262	0.08
263	0.07
264	0.05
265	0.03
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.07
278	0.05
279	0.05
280	0.06
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.06
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.09
291	0.1
292	0.11
293	0.15
294	0.15
295	0.15
296	0.16
297	0.16
298	0.15
299	0.14
300	0.13
301	0.1
302	0.09
303	0.06
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.03
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.05
329	0.06
330	0.06
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.08
335	0.08
336	0.1
337	0.13
338	0.13
339	0.16
340	0.19
341	0.19
342	0.26
343	0.31
344	0.31
345	0.27
346	0.36
347	0.36
348	0.36
349	0.46
350	0.48
351	0.54
352	0.61
353	0.7
354	0.71
355	0.78
356	0.84
357	0.83
358	0.85
359	0.81
360	0.82
361	0.76
362	0.69
363	0.59
364	0.49
365	0.41
366	0.32
367	0.25
368	0.15
369	0.1
370	0.08
371	0.07
372	0.08
373	0.07
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.07
381	0.13
382	0.14
383	0.17
384	0.19
385	0.19
386	0.22
387	0.24
388	0.26
389	0.22
390	0.22
391	0.21
392	0.2
393	0.2
394	0.17
395	0.15
396	0.1
397	0.07
398	0.06
399	0.04
400	0.04
401	0.03
402	0.03
403	0.03
404	0.03
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.05
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.08
413	0.1
414	0.11
415	0.11
416	0.12
417	0.15
418	0.16
419	0.18
420	0.18
421	0.15
422	0.15
423	0.14
424	0.15
425	0.12
426	0.11
427	0.1
428	0.12
429	0.13
430	0.15
431	0.2
432	0.21
433	0.21
434	0.3
435	0.29
436	0.31
437	0.39
438	0.47
439	0.47
440	0.53
441	0.63
442	0.65
443	0.72
444	0.74
445	0.7
446	0.63
447	0.68
448	0.68
449	0.67
450	0.6
451	0.6
452	0.58
453	0.55
454	0.52
455	0.43
456	0.38
457	0.32
458	0.31
459	0.24
460	0.24
461	0.23
462	0.24
463	0.24
464	0.2
465	0.21
466	0.18
467	0.17
468	0.18
469	0.16
470	0.15
471	0.13
472	0.13
473	0.09
474	0.09
475	0.09
476	0.06
477	0.05
478	0.05
479	0.05
480	0.07
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.09
485	0.1
486	0.12
487	0.13
488	0.11
489	0.11
490	0.12
491	0.12
492	0.12
493	0.12
494	0.09
495	0.09
496	0.09
497	0.08
498	0.11
499	0.13
500	0.21
501	0.22
502	0.24
503	0.25
504	0.25
505	0.25
506	0.26
507	0.32
508	0.25
509	0.27
510	0.29
511	0.29
512	0.28
513	0.28
514	0.26
515	0.19
516	0.17
517	0.15
518	0.12
519	0.14
520	0.15
521	0.17
522	0.19
523	0.19
524	0.21
525	0.27
526	0.33
527	0.39
528	0.43
529	0.44
530	0.49
531	0.56
532	0.63
533	0.65
534	0.66
535	0.67
536	0.73
537	0.81
538	0.82
539	0.84
540	0.8
541	0.82
542	0.83
543	0.77
544	0.74
545	0.69
546	0.66
547	0.61
548	0.66
549	0.63
550	0.55
551	0.52
552	0.45
553	0.44
554	0.38

A0A317XHX5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer