Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317XQM0

Protein Details
Accession A0A317XQM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
295-316EPKSPAKSTPKKSKSPAAKKAAHydrophilic
318-337SPSPKAPSPRRTRSAAKRIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
297-335KSPAKSTPKKSKSPAAKKAAASPSPKAPSPRRTRSAAKR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 12.666, cyto_nucl 11.333, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:0005840  C:ribosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MPSKVKTPVEKVPVATPSENQKGIAATNVDSAQALKAFKALAAHISSRKASGDSEASSSALPLDGPQGNLRDPSNAVYVQVTVNSLSPVKKVKPVRINLPNALHEPGSTSVCLLVKDPQREYKDLLVAEKIKSIARVVGVTKLKGKFKPYDARKALVQDHDLFLADQRIVPLVPALCGKIFFDAKKNPITVNVQKKGAGLREELESAIKCTTFLQNQGSCSTIKIGYIASHSPKQLTENLMAALPAIVSRLDGGWTNVHNIDVKTGNSAALPIWNQKLGVKTHLLPKPAEEQSEEPKSPAKSTPKKSKSPAAKKAAASPSPKAPSPRRTRSAAKRIAQDDATASPAKSTPTKKKTTSSVSRSSKLVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.45
3 0.4
4 0.41
5 0.44
6 0.43
7 0.37
8 0.34
9 0.3
10 0.29
11 0.29
12 0.23
13 0.17
14 0.2
15 0.19
16 0.18
17 0.17
18 0.17
19 0.14
20 0.15
21 0.15
22 0.11
23 0.12
24 0.12
25 0.13
26 0.14
27 0.13
28 0.15
29 0.18
30 0.22
31 0.24
32 0.27
33 0.27
34 0.27
35 0.27
36 0.24
37 0.21
38 0.22
39 0.22
40 0.2
41 0.22
42 0.22
43 0.21
44 0.2
45 0.19
46 0.15
47 0.11
48 0.09
49 0.06
50 0.11
51 0.11
52 0.13
53 0.15
54 0.17
55 0.18
56 0.21
57 0.21
58 0.18
59 0.18
60 0.19
61 0.2
62 0.18
63 0.18
64 0.16
65 0.16
66 0.14
67 0.14
68 0.12
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.14
75 0.18
76 0.2
77 0.27
78 0.32
79 0.4
80 0.47
81 0.52
82 0.59
83 0.63
84 0.67
85 0.65
86 0.64
87 0.57
88 0.51
89 0.47
90 0.37
91 0.27
92 0.24
93 0.2
94 0.17
95 0.14
96 0.12
97 0.12
98 0.13
99 0.13
100 0.12
101 0.17
102 0.21
103 0.25
104 0.28
105 0.34
106 0.37
107 0.39
108 0.41
109 0.38
110 0.36
111 0.33
112 0.31
113 0.28
114 0.26
115 0.25
116 0.23
117 0.2
118 0.16
119 0.16
120 0.16
121 0.13
122 0.11
123 0.12
124 0.12
125 0.18
126 0.19
127 0.19
128 0.24
129 0.27
130 0.31
131 0.31
132 0.35
133 0.33
134 0.38
135 0.47
136 0.48
137 0.55
138 0.53
139 0.52
140 0.5
141 0.49
142 0.46
143 0.38
144 0.35
145 0.26
146 0.24
147 0.22
148 0.2
149 0.16
150 0.13
151 0.11
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.09
167 0.1
168 0.1
169 0.15
170 0.18
171 0.2
172 0.23
173 0.24
174 0.21
175 0.23
176 0.29
177 0.31
178 0.37
179 0.37
180 0.36
181 0.36
182 0.36
183 0.35
184 0.32
185 0.26
186 0.17
187 0.15
188 0.16
189 0.15
190 0.15
191 0.14
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.09
198 0.12
199 0.12
200 0.14
201 0.19
202 0.2
203 0.22
204 0.22
205 0.22
206 0.19
207 0.19
208 0.18
209 0.12
210 0.1
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.11
215 0.14
216 0.15
217 0.17
218 0.18
219 0.18
220 0.18
221 0.2
222 0.21
223 0.21
224 0.19
225 0.17
226 0.18
227 0.17
228 0.16
229 0.13
230 0.1
231 0.07
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.06
240 0.07
241 0.09
242 0.1
243 0.13
244 0.13
245 0.14
246 0.15
247 0.15
248 0.16
249 0.16
250 0.15
251 0.15
252 0.15
253 0.15
254 0.12
255 0.13
256 0.1
257 0.11
258 0.12
259 0.13
260 0.15
261 0.15
262 0.16
263 0.17
264 0.22
265 0.2
266 0.23
267 0.23
268 0.24
269 0.32
270 0.36
271 0.36
272 0.32
273 0.33
274 0.37
275 0.36
276 0.35
277 0.29
278 0.29
279 0.35
280 0.42
281 0.39
282 0.32
283 0.35
284 0.35
285 0.35
286 0.38
287 0.42
288 0.44
289 0.53
290 0.64
291 0.67
292 0.74
293 0.77
294 0.79
295 0.8
296 0.81
297 0.82
298 0.79
299 0.78
300 0.71
301 0.75
302 0.73
303 0.68
304 0.62
305 0.56
306 0.56
307 0.53
308 0.54
309 0.53
310 0.53
311 0.57
312 0.63
313 0.69
314 0.66
315 0.69
316 0.75
317 0.78
318 0.81
319 0.8
320 0.76
321 0.75
322 0.72
323 0.7
324 0.61
325 0.52
326 0.44
327 0.35
328 0.33
329 0.26
330 0.23
331 0.19
332 0.2
333 0.22
334 0.26
335 0.34
336 0.41
337 0.48
338 0.57
339 0.61
340 0.67
341 0.72
342 0.75
343 0.77
344 0.75
345 0.76
346 0.76
347 0.74