Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CJD0

Protein Details
Accession A1CJD0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
196-218ILSRKISKRYFARKPKKSPEEIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
199-227RKISKRYFARKPKKSPEEIAKLKKEAEER
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000717  PCI_dom  
IPR040134  PSMD12/CSN4  
IPR040896  RPN5_C  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0008180  C:COP9 signalosome  
GO:0008541  C:proteasome regulatory particle, lid subcomplex  
GO:0034515  C:proteasome storage granule  
GO:0043161  P:proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
GO:0000338  P:protein deneddylation  
KEGG act:ACLA_034570  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01399  PCI  
PF18098  RPN5_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MSSGGLLKPEKDFSKDADKLIPEAEQLAKTDVQGAIDKLLVLEKQARQASDLATTSRILTTIVTLSKNSGDWNLLNDQVLLLSKKHGQLKQATTRMVQKVMGFLDDTPNTDVKLSVIETLRTVTEGKIFVEVERARVTRILSNIKKSQGDLNAAADILCELQVETFGSMTRREKTEFILEQVGLCIERGDWTQAAILSRKISKRYFARKPKKSPEEIAKLKKEAEEREKTRAPDEAPMEVDDDVTDLKLRYYEQQIILANHDYKYLDVCKNYREVLDTDSVQNNQEQLRAVLARIVYYIVLSPYDNEQSDLLHRIQQDSRLSLVPTEARLVKLFTVPELMRWPMVAEQFGPHLCNTDVFDSQPSQSAEDQAHKRWQDLRKRVIEHNVRVVAKYYTRIQMGRLTELLDLTEEETEKYISELVTSKTIYAKIDRPARLVNFAKPRDADDVLNEWSSDMKSLLGLLERIDHLITKEEMMARILPSRGEKAKAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.44
3 0.44
4 0.44
5 0.43
6 0.39
7 0.38
8 0.34
9 0.24
10 0.24
11 0.25
12 0.19
13 0.19
14 0.21
15 0.2
16 0.19
17 0.22
18 0.2
19 0.19
20 0.2
21 0.19
22 0.17
23 0.17
24 0.17
25 0.13
26 0.15
27 0.13
28 0.13
29 0.19
30 0.19
31 0.27
32 0.3
33 0.3
34 0.3
35 0.32
36 0.31
37 0.3
38 0.29
39 0.23
40 0.22
41 0.22
42 0.21
43 0.19
44 0.17
45 0.12
46 0.11
47 0.11
48 0.14
49 0.16
50 0.17
51 0.17
52 0.18
53 0.19
54 0.2
55 0.19
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.2
60 0.21
61 0.2
62 0.2
63 0.19
64 0.17
65 0.14
66 0.16
67 0.14
68 0.11
69 0.13
70 0.17
71 0.22
72 0.3
73 0.31
74 0.35
75 0.42
76 0.51
77 0.58
78 0.6
79 0.57
80 0.52
81 0.58
82 0.55
83 0.49
84 0.42
85 0.32
86 0.3
87 0.29
88 0.27
89 0.19
90 0.16
91 0.2
92 0.19
93 0.2
94 0.19
95 0.19
96 0.18
97 0.17
98 0.17
99 0.11
100 0.13
101 0.11
102 0.13
103 0.14
104 0.14
105 0.14
106 0.15
107 0.15
108 0.14
109 0.14
110 0.1
111 0.13
112 0.13
113 0.13
114 0.15
115 0.15
116 0.14
117 0.21
118 0.21
119 0.2
120 0.23
121 0.23
122 0.21
123 0.23
124 0.24
125 0.2
126 0.25
127 0.32
128 0.32
129 0.39
130 0.42
131 0.45
132 0.44
133 0.42
134 0.42
135 0.37
136 0.37
137 0.31
138 0.28
139 0.24
140 0.23
141 0.21
142 0.15
143 0.11
144 0.07
145 0.06
146 0.04
147 0.03
148 0.03
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.07
155 0.1
156 0.13
157 0.16
158 0.18
159 0.2
160 0.2
161 0.23
162 0.3
163 0.27
164 0.27
165 0.27
166 0.25
167 0.23
168 0.22
169 0.19
170 0.11
171 0.1
172 0.07
173 0.04
174 0.05
175 0.06
176 0.08
177 0.07
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.12
184 0.12
185 0.17
186 0.19
187 0.23
188 0.23
189 0.28
190 0.36
191 0.45
192 0.53
193 0.6
194 0.69
195 0.73
196 0.82
197 0.86
198 0.85
199 0.8
200 0.76
201 0.74
202 0.73
203 0.72
204 0.7
205 0.63
206 0.56
207 0.52
208 0.49
209 0.43
210 0.39
211 0.4
212 0.41
213 0.4
214 0.46
215 0.48
216 0.46
217 0.43
218 0.4
219 0.33
220 0.29
221 0.28
222 0.22
223 0.19
224 0.19
225 0.19
226 0.16
227 0.14
228 0.09
229 0.07
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.08
238 0.11
239 0.15
240 0.15
241 0.18
242 0.2
243 0.2
244 0.22
245 0.21
246 0.19
247 0.16
248 0.16
249 0.13
250 0.11
251 0.12
252 0.15
253 0.15
254 0.16
255 0.17
256 0.18
257 0.2
258 0.21
259 0.19
260 0.17
261 0.16
262 0.16
263 0.18
264 0.17
265 0.17
266 0.18
267 0.19
268 0.17
269 0.16
270 0.15
271 0.13
272 0.13
273 0.11
274 0.1
275 0.11
276 0.11
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.08
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.13
297 0.15
298 0.14
299 0.15
300 0.15
301 0.17
302 0.18
303 0.23
304 0.24
305 0.22
306 0.23
307 0.21
308 0.21
309 0.18
310 0.19
311 0.15
312 0.13
313 0.15
314 0.14
315 0.14
316 0.14
317 0.15
318 0.14
319 0.15
320 0.14
321 0.12
322 0.16
323 0.14
324 0.16
325 0.18
326 0.18
327 0.15
328 0.15
329 0.16
330 0.14
331 0.15
332 0.13
333 0.11
334 0.11
335 0.14
336 0.14
337 0.14
338 0.11
339 0.13
340 0.12
341 0.13
342 0.14
343 0.15
344 0.15
345 0.15
346 0.17
347 0.16
348 0.17
349 0.2
350 0.19
351 0.19
352 0.19
353 0.2
354 0.2
355 0.27
356 0.3
357 0.29
358 0.36
359 0.34
360 0.36
361 0.41
362 0.48
363 0.5
364 0.56
365 0.61
366 0.62
367 0.66
368 0.69
369 0.71
370 0.72
371 0.66
372 0.65
373 0.63
374 0.55
375 0.51
376 0.48
377 0.41
378 0.33
379 0.32
380 0.28
381 0.26
382 0.28
383 0.28
384 0.28
385 0.32
386 0.33
387 0.32
388 0.29
389 0.26
390 0.23
391 0.22
392 0.2
393 0.14
394 0.12
395 0.1
396 0.11
397 0.09
398 0.09
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.08
405 0.1
406 0.12
407 0.14
408 0.17
409 0.17
410 0.18
411 0.2
412 0.22
413 0.22
414 0.24
415 0.27
416 0.32
417 0.4
418 0.41
419 0.42
420 0.47
421 0.48
422 0.51
423 0.49
424 0.5
425 0.51
426 0.51
427 0.53
428 0.47
429 0.47
430 0.45
431 0.44
432 0.37
433 0.31
434 0.33
435 0.31
436 0.3
437 0.27
438 0.21
439 0.2
440 0.19
441 0.16
442 0.12
443 0.09
444 0.09
445 0.1
446 0.11
447 0.11
448 0.11
449 0.11
450 0.14
451 0.14
452 0.15
453 0.15
454 0.15
455 0.14
456 0.18
457 0.18
458 0.16
459 0.19
460 0.2
461 0.21
462 0.22
463 0.23
464 0.2
465 0.24
466 0.24
467 0.23
468 0.25
469 0.31
470 0.34