Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CHV1

Protein Details
Accession A1CHV1    Localization Confidence Low Confidence Score 6.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-296VPDVGKEVKKQLRKLKQQEKGGDWHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 10, cyto 7.5, cyto_nucl 6, nucl 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013921  Mediator_Med20  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG act:ACLA_049280  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08612  Med20  
Amino Acid Sequences MPITGVFFIPSTPNSATAFATVTERLHSAVADEPLAIGRWALEHKLMRDTPSCLPGSTPQRSAQPRYMQFLSLSYYPNHGFIYTSPNPETPGLNGGNNSNATAPPGATQPAHPGTPNSAPAEGSGLVMATVPLPSCGTLFKHFVYACQPFWCHRHTVAVPGGTVYDVGDFRVRIGDVRQTQPAVRPRGTVVEIEWRGPSLVTSISTQYSQSRRGSSLSQTDSSAGDHDSAIDLAMFSSIEDTDVDAEYVATAALIREFWSKLGIDGAREAILVPDVGKEVKKQLRKLKQQEKGGDWSPTNDNGDMVRTDEDPDPDAGTDLARQFMEIFRFNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.22
4 0.2
5 0.21
6 0.16
7 0.18
8 0.17
9 0.15
10 0.15
11 0.15
12 0.15
13 0.14
14 0.13
15 0.12
16 0.15
17 0.16
18 0.14
19 0.13
20 0.13
21 0.13
22 0.14
23 0.12
24 0.08
25 0.06
26 0.08
27 0.1
28 0.11
29 0.16
30 0.18
31 0.21
32 0.28
33 0.3
34 0.32
35 0.33
36 0.36
37 0.34
38 0.37
39 0.35
40 0.28
41 0.29
42 0.33
43 0.39
44 0.39
45 0.39
46 0.36
47 0.43
48 0.49
49 0.53
50 0.53
51 0.54
52 0.53
53 0.56
54 0.54
55 0.47
56 0.42
57 0.38
58 0.33
59 0.26
60 0.24
61 0.18
62 0.21
63 0.2
64 0.21
65 0.2
66 0.16
67 0.15
68 0.14
69 0.22
70 0.21
71 0.25
72 0.25
73 0.25
74 0.27
75 0.27
76 0.27
77 0.19
78 0.21
79 0.19
80 0.18
81 0.18
82 0.17
83 0.19
84 0.18
85 0.17
86 0.13
87 0.11
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.09
92 0.1
93 0.11
94 0.1
95 0.11
96 0.15
97 0.17
98 0.17
99 0.17
100 0.17
101 0.19
102 0.21
103 0.24
104 0.19
105 0.18
106 0.17
107 0.17
108 0.18
109 0.14
110 0.12
111 0.09
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.04
117 0.04
118 0.03
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.09
125 0.11
126 0.14
127 0.14
128 0.18
129 0.18
130 0.18
131 0.23
132 0.23
133 0.21
134 0.21
135 0.22
136 0.2
137 0.22
138 0.23
139 0.2
140 0.18
141 0.23
142 0.21
143 0.25
144 0.26
145 0.24
146 0.22
147 0.19
148 0.19
149 0.13
150 0.12
151 0.07
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.08
162 0.14
163 0.16
164 0.18
165 0.19
166 0.19
167 0.2
168 0.26
169 0.31
170 0.3
171 0.28
172 0.26
173 0.26
174 0.28
175 0.29
176 0.23
177 0.17
178 0.21
179 0.21
180 0.21
181 0.2
182 0.17
183 0.16
184 0.16
185 0.14
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.12
194 0.16
195 0.18
196 0.22
197 0.24
198 0.25
199 0.25
200 0.27
201 0.29
202 0.28
203 0.32
204 0.31
205 0.29
206 0.27
207 0.27
208 0.25
209 0.23
210 0.2
211 0.13
212 0.1
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.16
250 0.16
251 0.14
252 0.15
253 0.16
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.07
261 0.06
262 0.07
263 0.09
264 0.1
265 0.11
266 0.2
267 0.28
268 0.34
269 0.42
270 0.52
271 0.61
272 0.71
273 0.8
274 0.82
275 0.83
276 0.85
277 0.85
278 0.8
279 0.77
280 0.7
281 0.65
282 0.55
283 0.5
284 0.45
285 0.41
286 0.39
287 0.32
288 0.29
289 0.24
290 0.25
291 0.22
292 0.2
293 0.18
294 0.15
295 0.18
296 0.2
297 0.21
298 0.2
299 0.21
300 0.2
301 0.18
302 0.19
303 0.15
304 0.14
305 0.15
306 0.14
307 0.16
308 0.14
309 0.14
310 0.15
311 0.18
312 0.23