FuNGI

A0A317XS74

Protein Details

Accession

A0A317XS74

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
85-113	ATQFVPPLKLNRKNPPRHKLPRPSAGDPI	Hydrophilic
164-187	GSSARPSKAKLFKKKVREIHKAAD	Hydrophilic
774-793	LVQHFRKRLKSEPQIKDQLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
99-102	PPRH
167-189	ARPSKAKLFKKKVREIHKAADGA
567-578	ERKEREAAKNKA

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MPPVKAEPGIKAESAATSHGPSNGRGRQTNGNVRGGVKKEQERRDLPPPPPTTYRDIPLLSTNCGPWLTHLMKFAHHARVDPNDATQFVPPLKLNRKNPPRHKLPRPSAGDPITDKYNRPMIGKDGQPLLWPAAGDDLERIEEVIKKEIAPKGPGADQSLIAPGSSARPSKAKLFKKKVREIHKAADGARKTMKEEHFPWVLEDFETSNEWESIRTPIPTGARALQDHIDELKKKRENGDDATVGHISSSSDVKIEESASLVKSEAGLKAEASTAASASSTSHAPWIGKLDGDSSSDASSLHVLFVFDERDAGGFKVVPVSRMYKFLQKPKHSTMTNDEVEQEYQKYQKNKEMDRWAHRNRPISASSAVSRREDDAALRSWPEANQLTLPTGMPFGAGRRRNLMAVHGGELLRGDDDDDAAAGGSGRRRKREESPGAGYDEMDYEEEFADDEETHDPEADAVDDEEAKELEERLKREMARANNVGDNEEGAGDESADEEDDQVLTGSGKQMMKIMRALAKREGNEAYERDDDARNPYATDESEDEDEEESYVANPEKAIQLAREERERKEREAAKNKAKPDTANASGSNTPTGRHEKKPVALAGSQAGSAPSLVQAAVASQSQQQSQRPGAGHVSLAQRATSPTRGASKIGSKQVSRSSSPSLASGVSPGRAESPPADGVAGVKRRADSHTGGSSSSAPGSGGVAAGLGARPDAKRVKTASGASRAGSPGGSPPGSKPASRAGSPGAPRMPANAVEAEIIQLIRDGKIANTSELVQHFRKRLKSEPQIKDQLSAAVRKVAIMDKATNRLKLKDGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.22
3	0.18
4	0.17
5	0.19
6	0.22
7	0.23
8	0.25
9	0.32
10	0.36
11	0.41
12	0.41
13	0.45
14	0.49
15	0.57
16	0.64
17	0.61
18	0.6
19	0.56
20	0.56
21	0.58
22	0.53
23	0.51
24	0.49
25	0.52
26	0.56
27	0.62
28	0.69
29	0.66
30	0.69
31	0.72
32	0.72
33	0.67
34	0.68
35	0.64
36	0.62
37	0.62
38	0.6
39	0.58
40	0.54
41	0.52
42	0.48
43	0.45
44	0.4
45	0.43
46	0.41
47	0.37
48	0.34
49	0.31
50	0.28
51	0.27
52	0.25
53	0.19
54	0.25
55	0.25
56	0.26
57	0.31
58	0.3
59	0.31
60	0.37
61	0.39
62	0.39
63	0.37
64	0.36
65	0.35
66	0.4
67	0.44
68	0.4
69	0.38
70	0.32
71	0.32
72	0.32
73	0.28
74	0.25
75	0.2
76	0.23
77	0.21
78	0.28
79	0.37
80	0.45
81	0.51
82	0.59
83	0.69
84	0.76
85	0.85
86	0.85
87	0.87
88	0.88
89	0.91
90	0.91
91	0.89
92	0.89
93	0.86
94	0.8
95	0.78
96	0.7
97	0.64
98	0.56
99	0.51
100	0.48
101	0.42
102	0.39
103	0.35
104	0.39
105	0.36
106	0.35
107	0.34
108	0.32
109	0.37
110	0.39
111	0.38
112	0.35
113	0.33
114	0.32
115	0.31
116	0.27
117	0.21
118	0.18
119	0.14
120	0.14
121	0.14
122	0.13
123	0.12
124	0.11
125	0.11
126	0.11
127	0.11
128	0.09
129	0.12
130	0.14
131	0.17
132	0.17
133	0.17
134	0.23
135	0.27
136	0.3
137	0.29
138	0.29
139	0.28
140	0.3
141	0.32
142	0.31
143	0.27
144	0.24
145	0.22
146	0.23
147	0.19
148	0.15
149	0.13
150	0.1
151	0.12
152	0.15
153	0.15
154	0.15
155	0.18
156	0.21
157	0.3
158	0.4
159	0.47
160	0.54
161	0.64
162	0.7
163	0.77
164	0.84
165	0.84
166	0.84
167	0.84
168	0.8
169	0.77
170	0.75
171	0.68
172	0.62
173	0.61
174	0.52
175	0.46
176	0.44
177	0.37
178	0.34
179	0.38
180	0.38
181	0.37
182	0.39
183	0.41
184	0.4
185	0.39
186	0.38
187	0.31
188	0.28
189	0.21
190	0.19
191	0.14
192	0.12
193	0.13
194	0.11
195	0.12
196	0.11
197	0.11
198	0.11
199	0.11
200	0.14
201	0.14
202	0.14
203	0.14
204	0.17
205	0.19
206	0.2
207	0.21
208	0.21
209	0.22
210	0.22
211	0.24
212	0.22
213	0.21
214	0.21
215	0.21
216	0.22
217	0.23
218	0.26
219	0.33
220	0.35
221	0.37
222	0.41
223	0.46
224	0.47
225	0.49
226	0.51
227	0.45
228	0.41
229	0.42
230	0.36
231	0.28
232	0.22
233	0.17
234	0.11
235	0.09
236	0.1
237	0.07
238	0.07
239	0.07
240	0.08
241	0.09
242	0.09
243	0.08
244	0.08
245	0.09
246	0.09
247	0.1
248	0.09
249	0.08
250	0.09
251	0.1
252	0.1
253	0.1
254	0.1
255	0.1
256	0.1
257	0.1
258	0.1
259	0.09
260	0.07
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.05
265	0.05
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.08
270	0.09
271	0.09
272	0.1
273	0.13
274	0.12
275	0.12
276	0.12
277	0.12
278	0.12
279	0.14
280	0.13
281	0.11
282	0.1
283	0.1
284	0.1
285	0.09
286	0.09
287	0.08
288	0.07
289	0.07
290	0.06
291	0.07
292	0.08
293	0.08
294	0.07
295	0.07
296	0.06
297	0.06
298	0.07
299	0.07
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.11
304	0.11
305	0.12
306	0.13
307	0.17
308	0.18
309	0.22
310	0.23
311	0.26
312	0.31
313	0.38
314	0.46
315	0.48
316	0.54
317	0.56
318	0.62
319	0.54
320	0.53
321	0.51
322	0.49
323	0.45
324	0.38
325	0.33
326	0.26
327	0.26
328	0.24
329	0.18
330	0.12
331	0.14
332	0.18
333	0.22
334	0.23
335	0.29
336	0.34
337	0.37
338	0.43
339	0.5
340	0.53
341	0.56
342	0.64
343	0.64
344	0.65
345	0.66
346	0.65
347	0.57
348	0.54
349	0.47
350	0.41
351	0.36
352	0.3
353	0.27
354	0.25
355	0.25
356	0.22
357	0.21
358	0.19
359	0.18
360	0.16
361	0.15
362	0.14
363	0.14
364	0.13
365	0.13
366	0.12
367	0.11
368	0.11
369	0.14
370	0.12
371	0.11
372	0.11
373	0.11
374	0.12
375	0.12
376	0.11
377	0.08
378	0.08
379	0.07
380	0.06
381	0.05
382	0.07
383	0.14
384	0.16
385	0.17
386	0.2
387	0.21
388	0.22
389	0.22
390	0.21
391	0.18
392	0.16
393	0.17
394	0.15
395	0.14
396	0.13
397	0.13
398	0.11
399	0.07
400	0.06
401	0.05
402	0.03
403	0.04
404	0.04
405	0.03
406	0.03
407	0.03
408	0.03
409	0.03
410	0.03
411	0.06
412	0.13
413	0.15
414	0.2
415	0.23
416	0.27
417	0.34
418	0.44
419	0.49
420	0.5
421	0.53
422	0.51
423	0.5
424	0.46
425	0.38
426	0.28
427	0.21
428	0.14
429	0.09
430	0.07
431	0.06
432	0.06
433	0.05
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.06
439	0.06
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.06
445	0.06
446	0.05
447	0.05
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.1
458	0.13
459	0.14
460	0.17
461	0.21
462	0.21
463	0.25
464	0.3
465	0.29
466	0.33
467	0.34
468	0.33
469	0.31
470	0.31
471	0.29
472	0.23
473	0.18
474	0.12
475	0.1
476	0.08
477	0.06
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.04
488	0.04
489	0.04
490	0.04
491	0.04
492	0.04
493	0.05
494	0.09
495	0.09
496	0.1
497	0.13
498	0.14
499	0.16
500	0.17
501	0.19
502	0.21
503	0.23
504	0.25
505	0.28
506	0.31
507	0.3
508	0.32
509	0.31
510	0.27
511	0.28
512	0.26
513	0.24
514	0.21
515	0.21
516	0.2
517	0.2
518	0.19
519	0.2
520	0.23
521	0.19
522	0.18
523	0.18
524	0.18
525	0.17
526	0.18
527	0.15
528	0.13
529	0.14
530	0.14
531	0.14
532	0.13
533	0.12
534	0.1
535	0.09
536	0.07
537	0.06
538	0.08
539	0.07
540	0.07
541	0.07
542	0.08
543	0.09
544	0.09
545	0.1
546	0.09
547	0.14
548	0.19
549	0.22
550	0.29
551	0.31
552	0.34
553	0.44
554	0.47
555	0.44
556	0.48
557	0.54
558	0.56
559	0.63
560	0.68
561	0.69
562	0.71
563	0.72
564	0.69
565	0.63
566	0.54
567	0.5
568	0.48
569	0.41
570	0.39
571	0.36
572	0.34
573	0.33
574	0.33
575	0.3
576	0.22
577	0.19
578	0.2
579	0.29
580	0.3
581	0.34
582	0.41
583	0.43
584	0.46
585	0.51
586	0.49
587	0.43
588	0.39
589	0.35
590	0.3
591	0.25
592	0.21
593	0.16
594	0.14
595	0.1
596	0.09
597	0.08
598	0.05
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.05
603	0.05
604	0.06
605	0.06
606	0.07
607	0.1
608	0.11
609	0.14
610	0.19
611	0.21
612	0.25
613	0.27
614	0.31
615	0.29
616	0.3
617	0.29
618	0.26
619	0.24
620	0.24
621	0.25
622	0.22
623	0.22
624	0.19
625	0.17
626	0.19
627	0.22
628	0.2
629	0.18
630	0.19
631	0.24
632	0.26
633	0.26
634	0.28
635	0.33
636	0.37
637	0.43
638	0.45
639	0.4
640	0.44
641	0.5
642	0.51
643	0.46
644	0.43
645	0.41
646	0.39
647	0.39
648	0.36
649	0.29
650	0.25
651	0.22
652	0.21
653	0.17
654	0.15
655	0.14
656	0.14
657	0.16
658	0.15
659	0.17
660	0.15
661	0.18
662	0.17
663	0.17
664	0.17
665	0.13
666	0.15
667	0.21
668	0.24
669	0.21
670	0.22
671	0.22
672	0.24
673	0.28
674	0.31
675	0.27
676	0.29
677	0.34
678	0.33
679	0.33
680	0.33
681	0.3
682	0.27
683	0.23
684	0.17
685	0.11
686	0.1
687	0.1
688	0.09
689	0.07
690	0.06
691	0.05
692	0.05
693	0.05
694	0.05
695	0.05
696	0.05
697	0.07
698	0.07
699	0.13
700	0.2
701	0.22
702	0.27
703	0.31
704	0.35
705	0.39
706	0.45
707	0.47
708	0.49
709	0.49
710	0.43
711	0.44
712	0.39
713	0.34
714	0.28
715	0.21
716	0.17
717	0.21
718	0.21
719	0.18
720	0.2
721	0.28
722	0.3
723	0.3
724	0.28
725	0.32
726	0.37
727	0.37
728	0.37
729	0.34
730	0.39
731	0.41
732	0.45
733	0.39
734	0.35
735	0.35
736	0.35
737	0.33
738	0.27
739	0.28
740	0.22
741	0.2
742	0.19
743	0.19
744	0.16
745	0.14
746	0.12
747	0.09
748	0.1
749	0.1
750	0.1
751	0.11
752	0.11
753	0.1
754	0.17
755	0.19
756	0.19
757	0.2
758	0.2
759	0.24
760	0.27
761	0.32
762	0.3
763	0.35
764	0.41
765	0.46
766	0.52
767	0.53
768	0.59
769	0.64
770	0.7
771	0.74
772	0.76
773	0.79
774	0.81
775	0.77
776	0.71
777	0.61
778	0.57
779	0.5
780	0.45
781	0.37
782	0.33
783	0.31
784	0.29
785	0.3
786	0.27
787	0.28
788	0.27
789	0.33
790	0.32
791	0.42
792	0.46
793	0.51
794	0.5
795	0.49

A0A317XS74

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer