Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317XM42

Protein Details
Accession A0A317XM42    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-72DLDELEKKRNRRARKASAAASEHydrophilic
218-238RSSFNKGRASQRKKRGPKITGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-65KKRNRRARK
216-235ARRSSFNKGRASQRKKRGPK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR003169  GYF  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50829  GYF  
Amino Acid Sequences MSNHGKRKDPGASGSQPTPSSTATSSKRVRIDDRHNASEVDDLDHFGGDLDLDELEKKRNRRARKASAAASELDAAETSDEDGADGGTYRRKADKSRQADFGDDDHDMFDLDDDDDDTKDVFASKPQAGSRFSQAPVGLDEIGEGQEFGSKKRSALDEDDDAVGLGNSDGDEMDPELELEDSDKEGENSDDAIDLNAQAERTPPTSPGGTPLPKDARRSSFNKGRASQRKKRGPKITGFNMKDEMRTGRFDDEGNYHENSRDPDAQHDAWLTGVYSKSKIRQAKAAHDRRLREAREREAIAQDQDGDEDDVKLKLINYMMRHETVQQTLQRLGKAAAQARKQQTDTKADKATTAPALQAVQDVEAVTHLSSVLMSRFGLLTVYETTYLSLLEDVHRSGLVRRTYDPAARFDSDSASSKTAADSEVAAPSALTNASKRTDTRTDAGPTDLWEYKWAPSYLAAAARASGSPVAPEVEIFGPFSQPDLRSWAQGGYFGDRCDRILLRKAGSKDGWQTYPQAFDAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.53
3 0.46
4 0.43
5 0.4
6 0.32
7 0.29
8 0.26
9 0.31
10 0.31
11 0.39
12 0.43
13 0.47
14 0.52
15 0.54
16 0.6
17 0.61
18 0.67
19 0.68
20 0.71
21 0.68
22 0.64
23 0.59
24 0.52
25 0.47
26 0.38
27 0.3
28 0.23
29 0.19
30 0.18
31 0.17
32 0.16
33 0.11
34 0.1
35 0.07
36 0.06
37 0.06
38 0.05
39 0.06
40 0.08
41 0.09
42 0.17
43 0.23
44 0.26
45 0.36
46 0.45
47 0.54
48 0.63
49 0.73
50 0.76
51 0.81
52 0.86
53 0.83
54 0.8
55 0.72
56 0.62
57 0.53
58 0.43
59 0.32
60 0.24
61 0.17
62 0.11
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.06
73 0.07
74 0.11
75 0.13
76 0.15
77 0.21
78 0.24
79 0.31
80 0.42
81 0.51
82 0.54
83 0.59
84 0.64
85 0.61
86 0.6
87 0.55
88 0.46
89 0.39
90 0.31
91 0.26
92 0.18
93 0.16
94 0.13
95 0.11
96 0.09
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.07
109 0.1
110 0.15
111 0.16
112 0.2
113 0.22
114 0.26
115 0.28
116 0.3
117 0.33
118 0.32
119 0.31
120 0.3
121 0.28
122 0.25
123 0.24
124 0.23
125 0.17
126 0.13
127 0.12
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.07
132 0.05
133 0.08
134 0.08
135 0.1
136 0.15
137 0.15
138 0.16
139 0.2
140 0.22
141 0.23
142 0.28
143 0.31
144 0.28
145 0.29
146 0.29
147 0.25
148 0.22
149 0.18
150 0.13
151 0.08
152 0.05
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.07
187 0.08
188 0.09
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.14
193 0.13
194 0.16
195 0.2
196 0.21
197 0.21
198 0.26
199 0.31
200 0.33
201 0.37
202 0.38
203 0.38
204 0.41
205 0.45
206 0.47
207 0.48
208 0.52
209 0.54
210 0.54
211 0.59
212 0.64
213 0.7
214 0.71
215 0.73
216 0.76
217 0.78
218 0.83
219 0.83
220 0.78
221 0.76
222 0.75
223 0.74
224 0.74
225 0.67
226 0.59
227 0.54
228 0.48
229 0.41
230 0.34
231 0.28
232 0.19
233 0.19
234 0.19
235 0.16
236 0.16
237 0.16
238 0.16
239 0.15
240 0.15
241 0.16
242 0.15
243 0.14
244 0.14
245 0.15
246 0.14
247 0.16
248 0.18
249 0.15
250 0.17
251 0.22
252 0.21
253 0.21
254 0.2
255 0.16
256 0.13
257 0.12
258 0.1
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.09
263 0.1
264 0.14
265 0.21
266 0.25
267 0.25
268 0.32
269 0.34
270 0.43
271 0.52
272 0.57
273 0.59
274 0.6
275 0.6
276 0.6
277 0.64
278 0.56
279 0.54
280 0.51
281 0.47
282 0.47
283 0.47
284 0.42
285 0.37
286 0.36
287 0.28
288 0.23
289 0.18
290 0.13
291 0.11
292 0.1
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.12
304 0.13
305 0.17
306 0.19
307 0.19
308 0.2
309 0.2
310 0.21
311 0.2
312 0.22
313 0.2
314 0.21
315 0.24
316 0.25
317 0.24
318 0.22
319 0.21
320 0.19
321 0.21
322 0.25
323 0.26
324 0.29
325 0.36
326 0.39
327 0.42
328 0.42
329 0.43
330 0.43
331 0.47
332 0.47
333 0.45
334 0.45
335 0.41
336 0.41
337 0.36
338 0.34
339 0.26
340 0.23
341 0.17
342 0.14
343 0.14
344 0.13
345 0.13
346 0.1
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.06
351 0.06
352 0.07
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.04
357 0.04
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.08
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.13
385 0.19
386 0.21
387 0.23
388 0.24
389 0.29
390 0.32
391 0.37
392 0.36
393 0.34
394 0.35
395 0.35
396 0.34
397 0.3
398 0.29
399 0.27
400 0.28
401 0.27
402 0.23
403 0.21
404 0.21
405 0.2
406 0.18
407 0.16
408 0.12
409 0.11
410 0.11
411 0.12
412 0.12
413 0.11
414 0.1
415 0.09
416 0.1
417 0.09
418 0.08
419 0.08
420 0.12
421 0.14
422 0.17
423 0.18
424 0.25
425 0.3
426 0.34
427 0.36
428 0.39
429 0.41
430 0.4
431 0.41
432 0.35
433 0.3
434 0.31
435 0.3
436 0.24
437 0.23
438 0.23
439 0.23
440 0.29
441 0.27
442 0.22
443 0.22
444 0.24
445 0.23
446 0.25
447 0.24
448 0.18
449 0.18
450 0.18
451 0.17
452 0.15
453 0.13
454 0.1
455 0.09
456 0.1
457 0.11
458 0.1
459 0.1
460 0.12
461 0.12
462 0.12
463 0.14
464 0.13
465 0.13
466 0.13
467 0.15
468 0.16
469 0.16
470 0.17
471 0.23
472 0.24
473 0.25
474 0.26
475 0.27
476 0.23
477 0.26
478 0.27
479 0.26
480 0.27
481 0.26
482 0.29
483 0.27
484 0.27
485 0.29
486 0.29
487 0.28
488 0.35
489 0.4
490 0.41
491 0.47
492 0.49
493 0.52
494 0.52
495 0.52
496 0.52
497 0.53
498 0.51
499 0.46
500 0.48
501 0.43
502 0.44