Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317XSV6

Protein Details
Accession A0A317XSV6    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21TGEPHRKRRRYSGGASLQNSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 9.5, mito 9, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MTGEPHRKRRRYSGGASLQNSDENFGVQSLPVAELPADFDGVPLDGEQYLAVVRREAASGPNVFHAKHNPYATAAGSAVSTQLSDRASTLESGTSIEAELQLPSKVWQQQFLAQYRNMRESLSNAPLERVGCQPDRLPKPSNAVGWYIWIHGKAPPDDQQRGCRNQRSSEAWKIKEPSGAQVLRLSTDQILGILEAFPFWLGHRIEVPDTLSQEYEQDSSASGRSVCQQPVLQPLHSRWLFALLAHLDSRLLSEQISVLRTLARACIAAVALSRIRRKALQSRKGSKSASTISSTDSNESENEVEQALESTGSNTRRLKDETTRLEAGAWMVLTIVAGIWGQSDLWDDALSDLRRVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.8
3 0.76
4 0.68
5 0.59
6 0.53
7 0.46
8 0.37
9 0.27
10 0.19
11 0.16
12 0.14
13 0.13
14 0.09
15 0.1
16 0.09
17 0.1
18 0.09
19 0.1
20 0.09
21 0.09
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.09
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.07
31 0.07
32 0.06
33 0.07
34 0.06
35 0.06
36 0.07
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.1
41 0.1
42 0.11
43 0.12
44 0.14
45 0.16
46 0.17
47 0.18
48 0.22
49 0.23
50 0.23
51 0.25
52 0.3
53 0.3
54 0.35
55 0.35
56 0.31
57 0.31
58 0.33
59 0.3
60 0.25
61 0.2
62 0.14
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.08
67 0.07
68 0.05
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.12
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.09
91 0.13
92 0.18
93 0.18
94 0.22
95 0.23
96 0.28
97 0.34
98 0.37
99 0.36
100 0.33
101 0.38
102 0.37
103 0.38
104 0.33
105 0.27
106 0.24
107 0.24
108 0.27
109 0.26
110 0.25
111 0.22
112 0.22
113 0.23
114 0.23
115 0.2
116 0.17
117 0.17
118 0.16
119 0.17
120 0.2
121 0.27
122 0.32
123 0.34
124 0.36
125 0.34
126 0.39
127 0.41
128 0.4
129 0.33
130 0.3
131 0.26
132 0.24
133 0.22
134 0.18
135 0.15
136 0.13
137 0.12
138 0.12
139 0.15
140 0.14
141 0.16
142 0.21
143 0.26
144 0.31
145 0.32
146 0.39
147 0.42
148 0.49
149 0.51
150 0.51
151 0.48
152 0.47
153 0.5
154 0.48
155 0.48
156 0.51
157 0.53
158 0.48
159 0.48
160 0.48
161 0.44
162 0.4
163 0.34
164 0.27
165 0.27
166 0.25
167 0.22
168 0.21
169 0.2
170 0.18
171 0.17
172 0.15
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.04
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.11
191 0.13
192 0.13
193 0.14
194 0.16
195 0.12
196 0.13
197 0.13
198 0.12
199 0.11
200 0.11
201 0.12
202 0.1
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.11
212 0.15
213 0.15
214 0.16
215 0.17
216 0.18
217 0.27
218 0.28
219 0.26
220 0.25
221 0.26
222 0.32
223 0.31
224 0.3
225 0.21
226 0.23
227 0.21
228 0.19
229 0.22
230 0.13
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.11
235 0.1
236 0.12
237 0.09
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.1
243 0.11
244 0.1
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.1
258 0.12
259 0.16
260 0.2
261 0.2
262 0.23
263 0.25
264 0.31
265 0.39
266 0.47
267 0.52
268 0.6
269 0.68
270 0.73
271 0.76
272 0.71
273 0.63
274 0.59
275 0.54
276 0.48
277 0.42
278 0.36
279 0.33
280 0.36
281 0.35
282 0.3
283 0.26
284 0.23
285 0.2
286 0.21
287 0.19
288 0.14
289 0.14
290 0.12
291 0.11
292 0.1
293 0.11
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.09
298 0.14
299 0.16
300 0.22
301 0.24
302 0.26
303 0.31
304 0.35
305 0.4
306 0.44
307 0.52
308 0.54
309 0.58
310 0.57
311 0.52
312 0.49
313 0.43
314 0.34
315 0.26
316 0.18
317 0.11
318 0.09
319 0.08
320 0.07
321 0.06
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.19
337 0.19