Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317XUW8

Protein Details
Accession A0A317XUW8    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
120-140AEKATKAKSKSRSRKSKSAGAHydrophilic
175-195ANGPSKSAKRRQKKKAAAAAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
122-149KATKAKSKSRSRKSKSAGASGAAPRRAR
179-191SKSAKRRQKKKAA
216-232AAKAPRAKREPKGLPKG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTDINQSAVDPVANTTGAGYQEAPASQAPGNPTAEDLSKVFAGNLAFATTEEELKNIFSEAGTVTNAQIITRGTRSLGYGFVTFSSESEAQKAISTLNKREIAGREISVESAKPQAVADAEKATKAKSKSRSRKSKSAGASGAAPRRARADEGEEGGAETGPDTEAEKADGENAANGPSKSAKRRQKKKAAAAAAAANGETTAASTTETNGTTTKAAKAPRAKREPKGLPKGEPSKTLVFVANLSFATTDETLKAAFTDYSVKSAHVVKRRVGNRSKGFGFVDFDSEAEQKRAIDSAQNKEIDGRQVTLSVAIQDDRANKDDAPAAAAADAPATEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.12
4 0.12
5 0.13
6 0.13
7 0.12
8 0.13
9 0.14
10 0.15
11 0.12
12 0.14
13 0.14
14 0.16
15 0.18
16 0.2
17 0.21
18 0.2
19 0.21
20 0.2
21 0.2
22 0.2
23 0.17
24 0.16
25 0.15
26 0.15
27 0.14
28 0.14
29 0.13
30 0.12
31 0.12
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.13
36 0.11
37 0.13
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.13
43 0.1
44 0.09
45 0.07
46 0.08
47 0.08
48 0.09
49 0.1
50 0.1
51 0.09
52 0.11
53 0.12
54 0.1
55 0.11
56 0.11
57 0.13
58 0.13
59 0.14
60 0.12
61 0.13
62 0.15
63 0.14
64 0.15
65 0.14
66 0.13
67 0.13
68 0.13
69 0.14
70 0.12
71 0.11
72 0.15
73 0.14
74 0.14
75 0.16
76 0.16
77 0.14
78 0.15
79 0.15
80 0.12
81 0.16
82 0.19
83 0.21
84 0.28
85 0.3
86 0.3
87 0.34
88 0.35
89 0.33
90 0.31
91 0.28
92 0.23
93 0.21
94 0.22
95 0.18
96 0.15
97 0.13
98 0.13
99 0.12
100 0.1
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.13
107 0.13
108 0.14
109 0.15
110 0.14
111 0.18
112 0.2
113 0.26
114 0.32
115 0.43
116 0.53
117 0.63
118 0.73
119 0.76
120 0.83
121 0.81
122 0.79
123 0.72
124 0.68
125 0.59
126 0.49
127 0.46
128 0.4
129 0.39
130 0.35
131 0.3
132 0.24
133 0.25
134 0.25
135 0.21
136 0.18
137 0.19
138 0.17
139 0.19
140 0.19
141 0.16
142 0.15
143 0.14
144 0.12
145 0.07
146 0.05
147 0.03
148 0.03
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.11
166 0.15
167 0.19
168 0.28
169 0.37
170 0.46
171 0.56
172 0.66
173 0.74
174 0.8
175 0.84
176 0.84
177 0.79
178 0.7
179 0.62
180 0.53
181 0.43
182 0.33
183 0.24
184 0.14
185 0.09
186 0.08
187 0.05
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.04
192 0.04
193 0.06
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.14
202 0.16
203 0.18
204 0.23
205 0.32
206 0.39
207 0.48
208 0.57
209 0.61
210 0.63
211 0.71
212 0.74
213 0.75
214 0.77
215 0.71
216 0.65
217 0.67
218 0.7
219 0.63
220 0.56
221 0.5
222 0.43
223 0.4
224 0.38
225 0.3
226 0.23
227 0.21
228 0.19
229 0.16
230 0.12
231 0.11
232 0.1
233 0.09
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.13
246 0.13
247 0.16
248 0.17
249 0.17
250 0.18
251 0.24
252 0.3
253 0.32
254 0.36
255 0.37
256 0.45
257 0.5
258 0.58
259 0.59
260 0.62
261 0.62
262 0.65
263 0.63
264 0.58
265 0.54
266 0.47
267 0.43
268 0.34
269 0.3
270 0.23
271 0.21
272 0.2
273 0.2
274 0.19
275 0.17
276 0.17
277 0.13
278 0.14
279 0.15
280 0.13
281 0.19
282 0.24
283 0.31
284 0.37
285 0.38
286 0.37
287 0.39
288 0.41
289 0.4
290 0.35
291 0.3
292 0.23
293 0.24
294 0.24
295 0.22
296 0.2
297 0.15
298 0.14
299 0.13
300 0.13
301 0.15
302 0.2
303 0.22
304 0.24
305 0.25
306 0.23
307 0.26
308 0.29
309 0.26
310 0.24
311 0.2
312 0.18
313 0.16
314 0.16
315 0.14
316 0.09