Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317XTR0

Protein Details
Accession A0A317XTR0    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-140LPAATPKPKKQSKPKTESGEPKPKKQKKRKDAGSEAPEDBasic
143-163NSAPTKSKKTSKKSADKAKDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-134PKPKKQSKPKTESGEPKPKKQKKRKDAG
146-161PTKSKKTSKKSADKAK
177-236AGKGRESGKGKGKGKGKKQAKKDEATDTSPDKETGKSKQSEKRKAGGAAGSKGAKGAKAS
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.5, cyto 10, nucl 9, mito 3, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MTSSGEGVIPASFFDVPFDLAGPSSISYDSTQSFGNGQMPYYMPPDAQLPQQGSLLPALPMVESDNNYAQNHMSAQMPMAAFDPNSATMQASTDQTASSSALPAATPKPKKQSKPKTESGEPKPKKQKKRKDAGSEAPEDTANSAPTKSKKTSKKSADKAKDDVKEEDKGQDIGMEAGKGRESGKGKGKGKGKKQAKKDEATDTSPDKETGKSKQSEKRKAGGAAGSKGAKGAKASSAAARSVSRMSSVGRDKTTPGLARMESQRPQDGDPEEEEAPPPRAAGDEEQDDENEEAEADDGVEELGKDHFSTQEAIYAAQQRNMGLLSMVMDDDQLDRHMASRRGALNKTSVRKLVNHVLSQSVSQHVAMVVSGVAKIFVGEIVEKARQIQTSRGDQGPLKPTHLREAHRQYYMQRERPGHYPPGTNTGFAGQGKRRRMF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.12
4 0.12
5 0.13
6 0.11
7 0.1
8 0.11
9 0.1
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.11
14 0.12
15 0.15
16 0.15
17 0.15
18 0.15
19 0.15
20 0.16
21 0.16
22 0.2
23 0.18
24 0.17
25 0.18
26 0.19
27 0.2
28 0.21
29 0.2
30 0.15
31 0.15
32 0.18
33 0.18
34 0.2
35 0.23
36 0.23
37 0.23
38 0.24
39 0.24
40 0.21
41 0.21
42 0.19
43 0.14
44 0.11
45 0.1
46 0.09
47 0.09
48 0.11
49 0.12
50 0.13
51 0.16
52 0.19
53 0.22
54 0.23
55 0.23
56 0.21
57 0.19
58 0.19
59 0.17
60 0.15
61 0.11
62 0.12
63 0.15
64 0.14
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.11
69 0.11
70 0.13
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.1
76 0.12
77 0.13
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.11
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.11
91 0.15
92 0.23
93 0.27
94 0.32
95 0.42
96 0.49
97 0.59
98 0.68
99 0.74
100 0.76
101 0.8
102 0.84
103 0.82
104 0.83
105 0.84
106 0.82
107 0.82
108 0.75
109 0.76
110 0.79
111 0.79
112 0.82
113 0.83
114 0.84
115 0.83
116 0.91
117 0.91
118 0.9
119 0.9
120 0.89
121 0.85
122 0.78
123 0.68
124 0.58
125 0.48
126 0.37
127 0.3
128 0.21
129 0.15
130 0.11
131 0.11
132 0.14
133 0.18
134 0.23
135 0.27
136 0.34
137 0.43
138 0.5
139 0.6
140 0.66
141 0.73
142 0.77
143 0.83
144 0.84
145 0.79
146 0.77
147 0.75
148 0.69
149 0.62
150 0.57
151 0.5
152 0.43
153 0.39
154 0.35
155 0.29
156 0.24
157 0.2
158 0.16
159 0.13
160 0.11
161 0.1
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.12
169 0.13
170 0.19
171 0.27
172 0.36
173 0.39
174 0.44
175 0.52
176 0.54
177 0.6
178 0.65
179 0.67
180 0.65
181 0.72
182 0.76
183 0.75
184 0.73
185 0.68
186 0.66
187 0.6
188 0.56
189 0.5
190 0.41
191 0.36
192 0.32
193 0.28
194 0.21
195 0.2
196 0.19
197 0.21
198 0.26
199 0.28
200 0.34
201 0.4
202 0.5
203 0.57
204 0.58
205 0.58
206 0.55
207 0.52
208 0.47
209 0.44
210 0.37
211 0.29
212 0.27
213 0.23
214 0.19
215 0.18
216 0.17
217 0.13
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.1
222 0.11
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.14
227 0.13
228 0.13
229 0.12
230 0.12
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.15
235 0.19
236 0.21
237 0.22
238 0.22
239 0.23
240 0.24
241 0.28
242 0.23
243 0.2
244 0.2
245 0.19
246 0.22
247 0.25
248 0.28
249 0.28
250 0.29
251 0.3
252 0.28
253 0.29
254 0.3
255 0.27
256 0.24
257 0.22
258 0.23
259 0.2
260 0.19
261 0.19
262 0.16
263 0.17
264 0.15
265 0.14
266 0.1
267 0.1
268 0.11
269 0.13
270 0.14
271 0.13
272 0.15
273 0.16
274 0.15
275 0.16
276 0.15
277 0.13
278 0.09
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.07
295 0.08
296 0.1
297 0.1
298 0.13
299 0.13
300 0.14
301 0.16
302 0.23
303 0.22
304 0.23
305 0.23
306 0.19
307 0.2
308 0.19
309 0.17
310 0.09
311 0.09
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.05
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.1
324 0.16
325 0.18
326 0.2
327 0.25
328 0.3
329 0.36
330 0.38
331 0.37
332 0.4
333 0.45
334 0.49
335 0.48
336 0.46
337 0.42
338 0.43
339 0.47
340 0.48
341 0.47
342 0.43
343 0.4
344 0.39
345 0.38
346 0.36
347 0.31
348 0.24
349 0.18
350 0.16
351 0.15
352 0.12
353 0.11
354 0.1
355 0.09
356 0.07
357 0.06
358 0.06
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.11
369 0.13
370 0.13
371 0.15
372 0.18
373 0.2
374 0.22
375 0.28
376 0.31
377 0.37
378 0.43
379 0.42
380 0.42
381 0.42
382 0.47
383 0.49
384 0.45
385 0.43
386 0.43
387 0.43
388 0.49
389 0.54
390 0.5
391 0.52
392 0.6
393 0.61
394 0.6
395 0.6
396 0.55
397 0.6
398 0.66
399 0.63
400 0.61
401 0.59
402 0.59
403 0.62
404 0.64
405 0.61
406 0.56
407 0.55
408 0.5
409 0.54
410 0.51
411 0.46
412 0.4
413 0.34
414 0.34
415 0.29
416 0.34
417 0.33
418 0.4