Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317XPJ0

Protein Details
Accession A0A317XPJ0    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-152NTYWKSQPSKSQPKKFEKESKKRKADLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-148PKKFEKESKKRK
186-209SSSRRSRKSARTPPSSSSKRKSRK
355-355R
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR017984  Chromo_dom_subgr  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR008251  Chromo_shadow_dom  
IPR044251  LHP1-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031507  P:heterochromatin formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PF01393  Chromo_shadow  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences MVAGTRARSSSAHVSPRKENGHARSKPATISMDISDDEDDDTKPSDSKSDKDAIEIESDGDEEEVEAGDNDDVEDDEYEVEKIRSHRHTKGKEAWKMEYLVKWKGWPESANTWEPETNFSEGMVNTYWKSQPSKSQPKKFEKESKKRKADLSDEYSDADDNGAEEEKESESEDEVEEVEDDKPVRSSSRRSRKSARTPPSSSSKRKSRKAESESEEEDDDEDEDEDRRRPAKKRSDSDSESEAESTSPKEREQRALKKIKDRFLEHYQTRDDWEDRVLSVNNMMRDPEDSMLRCQLQFDKDAQWTRAMKKLGKDDLARDGPELWVPNKIANVKCPHKIIQFYEKHVKFSAPPKPRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.56
3 0.64
4 0.64
5 0.61
6 0.62
7 0.61
8 0.66
9 0.65
10 0.65
11 0.62
12 0.6
13 0.55
14 0.51
15 0.45
16 0.37
17 0.35
18 0.3
19 0.26
20 0.24
21 0.24
22 0.2
23 0.17
24 0.16
25 0.14
26 0.13
27 0.12
28 0.13
29 0.13
30 0.14
31 0.14
32 0.19
33 0.21
34 0.23
35 0.27
36 0.32
37 0.31
38 0.33
39 0.35
40 0.3
41 0.29
42 0.27
43 0.22
44 0.15
45 0.15
46 0.12
47 0.1
48 0.08
49 0.06
50 0.06
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.09
68 0.11
69 0.13
70 0.2
71 0.28
72 0.34
73 0.42
74 0.51
75 0.57
76 0.62
77 0.7
78 0.73
79 0.71
80 0.7
81 0.65
82 0.58
83 0.55
84 0.49
85 0.43
86 0.38
87 0.35
88 0.31
89 0.3
90 0.29
91 0.28
92 0.29
93 0.25
94 0.26
95 0.29
96 0.33
97 0.34
98 0.33
99 0.32
100 0.31
101 0.3
102 0.28
103 0.24
104 0.2
105 0.17
106 0.16
107 0.16
108 0.14
109 0.16
110 0.13
111 0.12
112 0.1
113 0.13
114 0.14
115 0.14
116 0.18
117 0.17
118 0.25
119 0.35
120 0.46
121 0.54
122 0.62
123 0.69
124 0.76
125 0.81
126 0.81
127 0.81
128 0.81
129 0.82
130 0.84
131 0.85
132 0.83
133 0.81
134 0.77
135 0.73
136 0.69
137 0.65
138 0.61
139 0.53
140 0.45
141 0.42
142 0.37
143 0.3
144 0.23
145 0.15
146 0.08
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.09
172 0.1
173 0.18
174 0.28
175 0.39
176 0.45
177 0.51
178 0.59
179 0.67
180 0.76
181 0.78
182 0.77
183 0.74
184 0.72
185 0.7
186 0.71
187 0.69
188 0.65
189 0.63
190 0.65
191 0.65
192 0.7
193 0.74
194 0.74
195 0.76
196 0.76
197 0.77
198 0.71
199 0.69
200 0.63
201 0.56
202 0.46
203 0.36
204 0.3
205 0.21
206 0.16
207 0.1
208 0.08
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.11
214 0.14
215 0.19
216 0.25
217 0.34
218 0.44
219 0.53
220 0.59
221 0.64
222 0.69
223 0.68
224 0.66
225 0.6
226 0.5
227 0.41
228 0.34
229 0.27
230 0.18
231 0.15
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.15
236 0.23
237 0.25
238 0.34
239 0.44
240 0.51
241 0.57
242 0.66
243 0.69
244 0.72
245 0.75
246 0.74
247 0.71
248 0.66
249 0.63
250 0.62
251 0.67
252 0.59
253 0.58
254 0.53
255 0.47
256 0.46
257 0.43
258 0.35
259 0.26
260 0.26
261 0.22
262 0.19
263 0.22
264 0.19
265 0.15
266 0.19
267 0.21
268 0.2
269 0.2
270 0.2
271 0.17
272 0.18
273 0.2
274 0.17
275 0.18
276 0.18
277 0.21
278 0.26
279 0.27
280 0.25
281 0.25
282 0.28
283 0.26
284 0.27
285 0.27
286 0.27
287 0.33
288 0.37
289 0.37
290 0.39
291 0.41
292 0.42
293 0.46
294 0.46
295 0.43
296 0.45
297 0.53
298 0.52
299 0.54
300 0.54
301 0.51
302 0.55
303 0.55
304 0.49
305 0.41
306 0.35
307 0.29
308 0.29
309 0.29
310 0.2
311 0.21
312 0.21
313 0.23
314 0.27
315 0.33
316 0.32
317 0.36
318 0.45
319 0.46
320 0.51
321 0.53
322 0.54
323 0.55
324 0.59
325 0.58
326 0.59
327 0.59
328 0.62
329 0.68
330 0.63
331 0.6
332 0.55
333 0.51
334 0.47
335 0.49
336 0.52