Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A317XZE4

Protein Details
Accession A0A317XZE4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
262-287QIKKRAEWERWSREKRKKIDEDQEKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
264-279KKRAEWERWSREKRKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 10.499, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045146  SF3A1  
IPR022030  SF3A1_dom  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12230  PRP21_like_P  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50128  SURP  
PS50053  UBIQUITIN_2  
Amino Acid Sequences MAPALNLPAPTHGADNTLAPTANAAASSSNAADTGASQTPKFSSGGIIYPPPELRRTIDKAAELIAKKDPAFETSIKQAEANNPKFAFLKDDDAYHAYYVSRRDAVRRGETLTDTPAPDAVSATPGVNDQQGNTLPQEQAPEEPEPFEFSADLPNITAVDLDILKLTALFTARKGRSFATSLLARESKSFQFEFLRPSHSLYGYFNRLVEQYQNIISPSPQLLEKVKIGAYGTANPPASTVSSSRDVTGPGKGGARPVLLEQIKKRAEWERWSREKRKKIDEDQEKERAAFNEIDWQDFVVVGTVELTETDQHVDLPPPRSLREMESMTLAQKRMASMIMESEAGNVDEEEVEELEMPGSSSKPNQLQSATESTEQQRPPVPAPPPGIKIRKDYVPRGLAGRNKPAAPATTKCPVCGEQVPIDEMAEHVRFELLNPQYREQRQQLETKKAQQAALQAGADPSYYLKQLASSRTDIFGDEEDEQARLAREAEERRLAKEKEKIIWDGHAKSRGTARELYAKNLELEAEMKRLNQKPQTVLPEYGPSIPGQAKPDSAAEARDGRHGTPGGLAGSSLPAKPVSSAVASGEAERAASPALAAGVKRAAEEPEPAGQPPLQRRQADSTTALATASVSETVPSPSTSTPSSSSQSIRITIQIDSSTPDLSGKSFNYTAPLDSTISALRDFVHTDILAGSIAASKLKIKVAGKPATLRQTLAASNLADGDSVVVNVAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.19
3 0.18
4 0.17
5 0.16
6 0.14
7 0.15
8 0.13
9 0.13
10 0.11
11 0.1
12 0.08
13 0.1
14 0.12
15 0.11
16 0.1
17 0.1
18 0.1
19 0.09
20 0.09
21 0.13
22 0.16
23 0.18
24 0.17
25 0.19
26 0.2
27 0.22
28 0.22
29 0.17
30 0.16
31 0.17
32 0.2
33 0.22
34 0.24
35 0.23
36 0.26
37 0.29
38 0.28
39 0.28
40 0.27
41 0.28
42 0.33
43 0.39
44 0.42
45 0.43
46 0.42
47 0.41
48 0.42
49 0.45
50 0.37
51 0.33
52 0.31
53 0.3
54 0.29
55 0.32
56 0.29
57 0.24
58 0.28
59 0.27
60 0.27
61 0.31
62 0.34
63 0.31
64 0.31
65 0.31
66 0.36
67 0.44
68 0.44
69 0.44
70 0.41
71 0.42
72 0.43
73 0.41
74 0.37
75 0.29
76 0.33
77 0.26
78 0.27
79 0.29
80 0.29
81 0.3
82 0.24
83 0.22
84 0.16
85 0.18
86 0.19
87 0.2
88 0.22
89 0.22
90 0.27
91 0.33
92 0.39
93 0.43
94 0.43
95 0.42
96 0.41
97 0.43
98 0.4
99 0.38
100 0.34
101 0.29
102 0.26
103 0.24
104 0.21
105 0.18
106 0.17
107 0.12
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.13
115 0.13
116 0.11
117 0.15
118 0.16
119 0.17
120 0.18
121 0.2
122 0.18
123 0.19
124 0.21
125 0.18
126 0.19
127 0.2
128 0.21
129 0.19
130 0.2
131 0.19
132 0.2
133 0.2
134 0.18
135 0.15
136 0.12
137 0.17
138 0.16
139 0.16
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.11
144 0.11
145 0.06
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.08
156 0.08
157 0.11
158 0.21
159 0.22
160 0.25
161 0.27
162 0.26
163 0.29
164 0.31
165 0.3
166 0.26
167 0.28
168 0.26
169 0.3
170 0.3
171 0.26
172 0.25
173 0.28
174 0.24
175 0.25
176 0.24
177 0.21
178 0.25
179 0.26
180 0.3
181 0.28
182 0.31
183 0.27
184 0.3
185 0.31
186 0.27
187 0.27
188 0.25
189 0.29
190 0.28
191 0.28
192 0.25
193 0.23
194 0.22
195 0.22
196 0.2
197 0.17
198 0.15
199 0.15
200 0.16
201 0.15
202 0.15
203 0.14
204 0.14
205 0.12
206 0.11
207 0.1
208 0.12
209 0.14
210 0.16
211 0.17
212 0.17
213 0.16
214 0.16
215 0.16
216 0.17
217 0.16
218 0.17
219 0.18
220 0.21
221 0.21
222 0.2
223 0.19
224 0.17
225 0.17
226 0.14
227 0.14
228 0.13
229 0.17
230 0.18
231 0.18
232 0.18
233 0.19
234 0.19
235 0.2
236 0.17
237 0.14
238 0.16
239 0.15
240 0.16
241 0.16
242 0.15
243 0.13
244 0.12
245 0.19
246 0.18
247 0.22
248 0.22
249 0.29
250 0.3
251 0.3
252 0.32
253 0.31
254 0.35
255 0.4
256 0.48
257 0.5
258 0.59
259 0.68
260 0.75
261 0.78
262 0.82
263 0.8
264 0.8
265 0.79
266 0.78
267 0.8
268 0.8
269 0.77
270 0.75
271 0.74
272 0.64
273 0.56
274 0.49
275 0.39
276 0.31
277 0.25
278 0.18
279 0.21
280 0.2
281 0.21
282 0.19
283 0.18
284 0.15
285 0.14
286 0.14
287 0.05
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.09
302 0.12
303 0.15
304 0.17
305 0.18
306 0.19
307 0.2
308 0.21
309 0.21
310 0.23
311 0.22
312 0.2
313 0.2
314 0.2
315 0.2
316 0.21
317 0.18
318 0.14
319 0.13
320 0.12
321 0.11
322 0.11
323 0.09
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.03
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.05
348 0.05
349 0.08
350 0.12
351 0.14
352 0.15
353 0.16
354 0.16
355 0.19
356 0.22
357 0.21
358 0.18
359 0.18
360 0.19
361 0.24
362 0.23
363 0.22
364 0.21
365 0.21
366 0.22
367 0.26
368 0.25
369 0.24
370 0.28
371 0.29
372 0.3
373 0.35
374 0.39
375 0.35
376 0.37
377 0.35
378 0.38
379 0.39
380 0.39
381 0.39
382 0.36
383 0.35
384 0.34
385 0.35
386 0.35
387 0.34
388 0.37
389 0.32
390 0.3
391 0.3
392 0.28
393 0.26
394 0.24
395 0.22
396 0.21
397 0.26
398 0.26
399 0.26
400 0.27
401 0.26
402 0.26
403 0.26
404 0.25
405 0.2
406 0.21
407 0.21
408 0.19
409 0.18
410 0.14
411 0.12
412 0.11
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.15
420 0.15
421 0.21
422 0.23
423 0.26
424 0.32
425 0.34
426 0.39
427 0.36
428 0.39
429 0.36
430 0.43
431 0.47
432 0.5
433 0.52
434 0.54
435 0.55
436 0.51
437 0.48
438 0.41
439 0.39
440 0.32
441 0.31
442 0.23
443 0.18
444 0.16
445 0.15
446 0.13
447 0.09
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.07
452 0.07
453 0.1
454 0.13
455 0.17
456 0.19
457 0.21
458 0.22
459 0.23
460 0.23
461 0.2
462 0.19
463 0.16
464 0.15
465 0.13
466 0.12
467 0.12
468 0.11
469 0.11
470 0.1
471 0.1
472 0.08
473 0.07
474 0.08
475 0.13
476 0.16
477 0.2
478 0.27
479 0.28
480 0.31
481 0.38
482 0.37
483 0.38
484 0.42
485 0.42
486 0.4
487 0.43
488 0.42
489 0.36
490 0.4
491 0.4
492 0.37
493 0.37
494 0.38
495 0.35
496 0.34
497 0.38
498 0.34
499 0.33
500 0.31
501 0.29
502 0.32
503 0.33
504 0.36
505 0.33
506 0.32
507 0.29
508 0.26
509 0.24
510 0.15
511 0.16
512 0.13
513 0.13
514 0.12
515 0.13
516 0.2
517 0.24
518 0.3
519 0.34
520 0.37
521 0.39
522 0.45
523 0.51
524 0.47
525 0.45
526 0.4
527 0.39
528 0.36
529 0.32
530 0.26
531 0.19
532 0.18
533 0.18
534 0.2
535 0.19
536 0.19
537 0.18
538 0.19
539 0.2
540 0.2
541 0.19
542 0.17
543 0.17
544 0.19
545 0.2
546 0.23
547 0.24
548 0.21
549 0.25
550 0.24
551 0.21
552 0.19
553 0.2
554 0.15
555 0.13
556 0.13
557 0.09
558 0.11
559 0.11
560 0.1
561 0.1
562 0.09
563 0.1
564 0.1
565 0.11
566 0.11
567 0.11
568 0.11
569 0.11
570 0.14
571 0.14
572 0.14
573 0.14
574 0.12
575 0.11
576 0.11
577 0.1
578 0.07
579 0.06
580 0.06
581 0.05
582 0.06
583 0.07
584 0.07
585 0.08
586 0.1
587 0.11
588 0.11
589 0.12
590 0.13
591 0.14
592 0.16
593 0.18
594 0.2
595 0.21
596 0.21
597 0.22
598 0.21
599 0.26
600 0.31
601 0.38
602 0.41
603 0.41
604 0.45
605 0.51
606 0.53
607 0.52
608 0.46
609 0.4
610 0.33
611 0.32
612 0.27
613 0.2
614 0.16
615 0.12
616 0.11
617 0.08
618 0.07
619 0.07
620 0.08
621 0.1
622 0.11
623 0.12
624 0.13
625 0.13
626 0.17
627 0.18
628 0.2
629 0.22
630 0.25
631 0.27
632 0.29
633 0.3
634 0.32
635 0.34
636 0.33
637 0.31
638 0.3
639 0.28
640 0.25
641 0.26
642 0.21
643 0.19
644 0.19
645 0.19
646 0.16
647 0.15
648 0.15
649 0.13
650 0.13
651 0.17
652 0.16
653 0.2
654 0.21
655 0.21
656 0.24
657 0.25
658 0.25
659 0.24
660 0.25
661 0.2
662 0.2
663 0.21
664 0.19
665 0.19
666 0.18
667 0.15
668 0.13
669 0.14
670 0.15
671 0.14
672 0.16
673 0.14
674 0.15
675 0.15
676 0.14
677 0.12
678 0.1
679 0.1
680 0.08
681 0.09
682 0.09
683 0.09
684 0.11
685 0.14
686 0.17
687 0.23
688 0.23
689 0.31
690 0.4
691 0.46
692 0.48
693 0.52
694 0.56
695 0.58
696 0.58
697 0.51
698 0.44
699 0.41
700 0.38
701 0.34
702 0.3
703 0.22
704 0.21
705 0.21
706 0.19
707 0.14
708 0.13
709 0.12
710 0.08
711 0.08