Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316Z1Y7

Protein Details
Accession A0A316Z1Y7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
159-191HSPRRPAGTRRSTQRWRPRRARRLEQRHARPRTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
161-191PRRPAGTRRSTQRWRPRRARRLEQRHARPRT
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034772  CPSF6/7  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MPTPTSTRDDDDEKPPYDAFSAAGSSSTAEAPPAARAALAGRPKVTDPSIQNALYIGELDWWVTDDELRQIAEREVGAQVALADITFSEHKVNGKSKGVAWIELGDEDEARRLKGWFDENDFHHKRALVTLSTSAHGNPFRTLPKGASRVSLPLRLCAHSPRRPAGTRRSTQRWRPRRARRLEQRHARPRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.37
3 0.34
4 0.3
5 0.26
6 0.2
7 0.15
8 0.14
9 0.12
10 0.12
11 0.11
12 0.1
13 0.11
14 0.1
15 0.08
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.09
20 0.09
21 0.08
22 0.07
23 0.08
24 0.09
25 0.15
26 0.19
27 0.19
28 0.19
29 0.21
30 0.22
31 0.25
32 0.25
33 0.25
34 0.23
35 0.27
36 0.32
37 0.3
38 0.29
39 0.26
40 0.25
41 0.19
42 0.16
43 0.1
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.05
48 0.06
49 0.06
50 0.05
51 0.06
52 0.05
53 0.07
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.06
66 0.05
67 0.04
68 0.04
69 0.03
70 0.02
71 0.02
72 0.04
73 0.04
74 0.05
75 0.06
76 0.07
77 0.08
78 0.12
79 0.15
80 0.17
81 0.19
82 0.19
83 0.19
84 0.26
85 0.25
86 0.22
87 0.19
88 0.17
89 0.15
90 0.14
91 0.14
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.12
102 0.17
103 0.16
104 0.21
105 0.25
106 0.27
107 0.37
108 0.39
109 0.36
110 0.33
111 0.32
112 0.27
113 0.26
114 0.26
115 0.17
116 0.16
117 0.19
118 0.18
119 0.18
120 0.18
121 0.15
122 0.17
123 0.18
124 0.17
125 0.15
126 0.17
127 0.19
128 0.21
129 0.23
130 0.22
131 0.27
132 0.31
133 0.31
134 0.3
135 0.29
136 0.33
137 0.35
138 0.38
139 0.31
140 0.32
141 0.34
142 0.33
143 0.34
144 0.36
145 0.42
146 0.43
147 0.48
148 0.47
149 0.52
150 0.57
151 0.61
152 0.63
153 0.64
154 0.65
155 0.69
156 0.73
157 0.75
158 0.8
159 0.85
160 0.84
161 0.85
162 0.88
163 0.9
164 0.9
165 0.91
166 0.92
167 0.92
168 0.93
169 0.93
170 0.93
171 0.93