Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316ZHR0

Protein Details
Accession A0A316ZHR0    Localization Confidence Low Confidence Score 6.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MFAPPAKKARRQRYTRGADDDEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 9.5, cyto_nucl 8.5, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MFAPPAKKARRQRYTRGADDDESAAGPSSKRAKAATVVIGEEEELDYGNQTLPVGRLPPDFDGIPTDGETYLAVVRQQAKSHPAVLTAATNPYAVVEVAPVPVVAANGSRTALPPQEWREQYVTRFKAMREALAAPPAGPISNPRTGRLPRKGRADEWYKFVHGCAPDRPIEIDGDEWSAPQMPAAGRSRDDAEPQDTSATEREPSAPLLKRLTTTHILAALTVLPYWFTLPFAGPAPAPVFNPLYARWLFALLAMLDGRLTSDEISTLRVLARACIASLALSRAKRSAKARLAKRTLTDDEWLVGEEGAWSVIAAVAGVWGQWDMWDDAARELGAVTQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.85
3 0.83
4 0.77
5 0.68
6 0.63
7 0.53
8 0.43
9 0.34
10 0.27
11 0.19
12 0.15
13 0.13
14 0.16
15 0.22
16 0.23
17 0.25
18 0.25
19 0.28
20 0.31
21 0.36
22 0.36
23 0.31
24 0.3
25 0.28
26 0.27
27 0.24
28 0.2
29 0.15
30 0.09
31 0.07
32 0.06
33 0.06
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.1
41 0.11
42 0.13
43 0.14
44 0.16
45 0.18
46 0.2
47 0.19
48 0.18
49 0.2
50 0.19
51 0.18
52 0.16
53 0.16
54 0.13
55 0.13
56 0.12
57 0.1
58 0.09
59 0.08
60 0.08
61 0.1
62 0.15
63 0.17
64 0.19
65 0.21
66 0.25
67 0.26
68 0.29
69 0.26
70 0.23
71 0.21
72 0.21
73 0.2
74 0.17
75 0.16
76 0.13
77 0.13
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.08
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.1
99 0.11
100 0.13
101 0.17
102 0.22
103 0.3
104 0.3
105 0.32
106 0.35
107 0.36
108 0.38
109 0.42
110 0.39
111 0.34
112 0.35
113 0.32
114 0.35
115 0.33
116 0.3
117 0.23
118 0.24
119 0.22
120 0.22
121 0.22
122 0.14
123 0.14
124 0.13
125 0.1
126 0.07
127 0.1
128 0.12
129 0.19
130 0.19
131 0.2
132 0.26
133 0.3
134 0.39
135 0.46
136 0.5
137 0.49
138 0.57
139 0.59
140 0.56
141 0.58
142 0.57
143 0.49
144 0.45
145 0.41
146 0.33
147 0.3
148 0.28
149 0.25
150 0.18
151 0.18
152 0.17
153 0.18
154 0.18
155 0.18
156 0.19
157 0.16
158 0.14
159 0.12
160 0.11
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.06
169 0.07
170 0.06
171 0.11
172 0.14
173 0.15
174 0.14
175 0.16
176 0.19
177 0.19
178 0.21
179 0.18
180 0.18
181 0.17
182 0.17
183 0.17
184 0.13
185 0.14
186 0.13
187 0.12
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.11
192 0.12
193 0.17
194 0.18
195 0.2
196 0.22
197 0.23
198 0.23
199 0.23
200 0.27
201 0.24
202 0.23
203 0.21
204 0.21
205 0.2
206 0.18
207 0.17
208 0.12
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.09
223 0.11
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.14
228 0.14
229 0.14
230 0.16
231 0.14
232 0.17
233 0.16
234 0.17
235 0.15
236 0.15
237 0.14
238 0.13
239 0.14
240 0.09
241 0.1
242 0.09
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.14
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.11
267 0.14
268 0.16
269 0.17
270 0.18
271 0.23
272 0.26
273 0.31
274 0.35
275 0.42
276 0.46
277 0.55
278 0.63
279 0.68
280 0.72
281 0.71
282 0.7
283 0.67
284 0.63
285 0.56
286 0.5
287 0.4
288 0.35
289 0.3
290 0.27
291 0.2
292 0.15
293 0.12
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.06
298 0.05
299 0.04
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.05
311 0.08
312 0.08
313 0.1
314 0.13
315 0.14
316 0.14
317 0.16
318 0.15
319 0.13