Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1C489

Protein Details
Accession A1C489    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
151-178LYEAMKRDARKKERKKKWEPYVRKTIPKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
156-169KRDARKKERKKKWE
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 11.5, cyto 10.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003196  TFIIF_beta  
IPR040450  TFIIF_beta_HTH  
IPR040504  TFIIF_beta_N  
IPR011039  TFIIF_interaction  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005674  C:transcription factor TFIIF complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG act:ACLA_058910  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02270  TFIIF_beta  
PF17683  TFIIF_beta_N  
CDD cd07980  TFIIF_beta  
Amino Acid Sequences MFAQVKQEPDAPTPYIKPDPDNKDAVLEDIDEDIFDDDGDLDFTNAAQNVWLSRIPRTLWEHWASLDDDEEIQIGTMRIEGKPNDIKRVSLRINEREDNHDIPKDYILQRQTIDTGTITSHATQNTYLFTEKDLPGHENRMVVFGEARSALYEAMKRDARKKERKKKWEPYVRKTIPKQTALVGGVNEEFNCLPVENEEFRLLSEKKALEALKPKRETVFIDKVPGKLLRARNALPGDKGAFVQAAKTAKAKTQENKTTRMPQNELLDLIYQCFREYKYWPFKTLKARLQQPEAYLKQTLEMVAHLVKSGDFAMTWELKPEAVESTYANAMSYGNAKEELPPGTDYNFDEGSEEDANASGMVTDNDEMQFETVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.39
3 0.37
4 0.4
5 0.45
6 0.5
7 0.51
8 0.52
9 0.46
10 0.44
11 0.42
12 0.38
13 0.3
14 0.23
15 0.18
16 0.16
17 0.15
18 0.1
19 0.11
20 0.09
21 0.08
22 0.07
23 0.07
24 0.06
25 0.06
26 0.07
27 0.07
28 0.06
29 0.06
30 0.07
31 0.09
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.09
37 0.12
38 0.14
39 0.13
40 0.16
41 0.2
42 0.2
43 0.27
44 0.33
45 0.34
46 0.4
47 0.42
48 0.4
49 0.37
50 0.39
51 0.33
52 0.26
53 0.23
54 0.16
55 0.13
56 0.12
57 0.11
58 0.08
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.06
63 0.07
64 0.08
65 0.09
66 0.13
67 0.14
68 0.2
69 0.28
70 0.3
71 0.37
72 0.36
73 0.38
74 0.39
75 0.47
76 0.44
77 0.42
78 0.48
79 0.47
80 0.53
81 0.56
82 0.54
83 0.51
84 0.52
85 0.49
86 0.44
87 0.4
88 0.34
89 0.31
90 0.3
91 0.29
92 0.26
93 0.28
94 0.27
95 0.26
96 0.25
97 0.25
98 0.25
99 0.2
100 0.19
101 0.14
102 0.13
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.1
107 0.12
108 0.12
109 0.12
110 0.12
111 0.13
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.11
116 0.13
117 0.17
118 0.16
119 0.18
120 0.18
121 0.19
122 0.2
123 0.24
124 0.23
125 0.19
126 0.19
127 0.19
128 0.17
129 0.15
130 0.13
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.1
140 0.1
141 0.14
142 0.17
143 0.19
144 0.26
145 0.35
146 0.44
147 0.53
148 0.63
149 0.7
150 0.77
151 0.87
152 0.9
153 0.91
154 0.92
155 0.92
156 0.91
157 0.88
158 0.88
159 0.83
160 0.8
161 0.73
162 0.72
163 0.67
164 0.59
165 0.52
166 0.42
167 0.4
168 0.34
169 0.3
170 0.21
171 0.15
172 0.13
173 0.12
174 0.11
175 0.08
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.06
182 0.09
183 0.09
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.11
188 0.16
189 0.15
190 0.13
191 0.16
192 0.15
193 0.15
194 0.19
195 0.19
196 0.18
197 0.27
198 0.34
199 0.38
200 0.4
201 0.41
202 0.38
203 0.39
204 0.4
205 0.38
206 0.39
207 0.31
208 0.36
209 0.37
210 0.36
211 0.37
212 0.34
213 0.27
214 0.25
215 0.29
216 0.29
217 0.32
218 0.32
219 0.36
220 0.39
221 0.39
222 0.33
223 0.31
224 0.26
225 0.22
226 0.21
227 0.15
228 0.12
229 0.11
230 0.1
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.14
235 0.15
236 0.17
237 0.22
238 0.28
239 0.31
240 0.4
241 0.49
242 0.5
243 0.55
244 0.57
245 0.62
246 0.62
247 0.62
248 0.55
249 0.51
250 0.52
251 0.47
252 0.43
253 0.33
254 0.29
255 0.23
256 0.21
257 0.17
258 0.13
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.14
263 0.18
264 0.26
265 0.35
266 0.39
267 0.44
268 0.47
269 0.52
270 0.59
271 0.65
272 0.63
273 0.6
274 0.66
275 0.65
276 0.68
277 0.64
278 0.58
279 0.58
280 0.52
281 0.47
282 0.4
283 0.34
284 0.29
285 0.26
286 0.23
287 0.14
288 0.12
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.08
298 0.06
299 0.07
300 0.12
301 0.14
302 0.15
303 0.16
304 0.16
305 0.15
306 0.16
307 0.16
308 0.14
309 0.12
310 0.13
311 0.12
312 0.14
313 0.16
314 0.15
315 0.14
316 0.12
317 0.11
318 0.11
319 0.14
320 0.12
321 0.12
322 0.14
323 0.14
324 0.16
325 0.19
326 0.2
327 0.19
328 0.21
329 0.21
330 0.21
331 0.23
332 0.23
333 0.24
334 0.23
335 0.2
336 0.18
337 0.17
338 0.2
339 0.19
340 0.17
341 0.13
342 0.12
343 0.12
344 0.11
345 0.1
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.08
350 0.09
351 0.1
352 0.11
353 0.11
354 0.12