Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CDF4

Protein Details
Accession A1CDF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-86QGALYKEKPVKNQRRGQNQNQSQNQKPNAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
225-250PKKKKDRLRASEKGSATTSDKKRKRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039999  LYAR  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG act:ACLA_006380  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
Amino Acid Sequences MVSFSCEACGDVLTKKKLDPHRSQCRGASYTCIDCMVHFQGLSYRAHTSCMSEAQKYQGALYKEKPVKNQRRGQNQNQSQNQKPNANNHHRAPYVEDATDVDVPKANAPPPAPTPPRTEKAAAAKAETSKSVNVFDYLVTADTPNASKVSLGGPKEQMQMVDHAPSVFETSKALARVESDNDEEKKSYDVAYEENGFSYGAGPIEPGVYPSKAPNVSMEFLTPAPKKKKDRLRASEKGSATTSDKKRKRRTDDVDMDVDTPLVEAPSSVVNHPGTPMLNHSGLTGGLSRMLRSPSAETDDDDQPKQGARQRYPDPSSPIKRSRRDDQEGEKDGGLGISMKNKAGRLVSSMFGGSVASGSSVTNDDKASNDARRSKKTARVRSPSGQVATSDSRKSKRKSSAQTGGDRPTQRLKQIEYDQPQRDESGREVVVYGQPNIPSELQRQMASHFLSLVTKGPESSRGFSMNKILKRFHRDITDEFDADRGRDQGRSRADRERRVDDEKELWRTLRVKQNERGEIVLFF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.4
4 0.49
5 0.57
6 0.62
7 0.65
8 0.71
9 0.77
10 0.8
11 0.76
12 0.74
13 0.68
14 0.59
15 0.55
16 0.49
17 0.45
18 0.4
19 0.37
20 0.29
21 0.26
22 0.3
23 0.26
24 0.22
25 0.19
26 0.18
27 0.21
28 0.25
29 0.26
30 0.23
31 0.24
32 0.22
33 0.25
34 0.25
35 0.24
36 0.24
37 0.31
38 0.31
39 0.3
40 0.31
41 0.33
42 0.37
43 0.33
44 0.32
45 0.29
46 0.3
47 0.32
48 0.33
49 0.39
50 0.43
51 0.46
52 0.54
53 0.6
54 0.67
55 0.72
56 0.78
57 0.77
58 0.81
59 0.86
60 0.87
61 0.87
62 0.86
63 0.86
64 0.86
65 0.84
66 0.8
67 0.8
68 0.76
69 0.73
70 0.68
71 0.68
72 0.69
73 0.72
74 0.72
75 0.68
76 0.69
77 0.62
78 0.59
79 0.54
80 0.51
81 0.44
82 0.37
83 0.32
84 0.25
85 0.27
86 0.29
87 0.24
88 0.17
89 0.16
90 0.16
91 0.18
92 0.2
93 0.18
94 0.19
95 0.19
96 0.23
97 0.25
98 0.34
99 0.36
100 0.36
101 0.43
102 0.46
103 0.49
104 0.5
105 0.47
106 0.44
107 0.48
108 0.52
109 0.45
110 0.4
111 0.39
112 0.38
113 0.37
114 0.33
115 0.26
116 0.21
117 0.21
118 0.21
119 0.19
120 0.17
121 0.16
122 0.14
123 0.13
124 0.12
125 0.11
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.13
137 0.17
138 0.18
139 0.2
140 0.23
141 0.25
142 0.28
143 0.27
144 0.24
145 0.2
146 0.21
147 0.18
148 0.17
149 0.15
150 0.13
151 0.12
152 0.11
153 0.14
154 0.11
155 0.1
156 0.09
157 0.1
158 0.13
159 0.14
160 0.14
161 0.11
162 0.13
163 0.15
164 0.16
165 0.17
166 0.17
167 0.21
168 0.23
169 0.24
170 0.22
171 0.21
172 0.2
173 0.18
174 0.16
175 0.12
176 0.11
177 0.11
178 0.13
179 0.15
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.11
184 0.1
185 0.09
186 0.08
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.05
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.15
199 0.14
200 0.15
201 0.16
202 0.17
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.14
207 0.14
208 0.19
209 0.18
210 0.22
211 0.28
212 0.35
213 0.4
214 0.48
215 0.57
216 0.62
217 0.71
218 0.74
219 0.77
220 0.78
221 0.79
222 0.78
223 0.68
224 0.6
225 0.5
226 0.42
227 0.35
228 0.36
229 0.37
230 0.4
231 0.46
232 0.53
233 0.63
234 0.7
235 0.75
236 0.77
237 0.77
238 0.78
239 0.79
240 0.74
241 0.66
242 0.58
243 0.49
244 0.39
245 0.3
246 0.19
247 0.11
248 0.07
249 0.04
250 0.03
251 0.02
252 0.03
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.09
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.09
262 0.09
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.09
272 0.06
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.13
281 0.12
282 0.17
283 0.17
284 0.16
285 0.19
286 0.24
287 0.25
288 0.23
289 0.22
290 0.18
291 0.18
292 0.2
293 0.21
294 0.24
295 0.25
296 0.32
297 0.37
298 0.44
299 0.48
300 0.49
301 0.49
302 0.51
303 0.54
304 0.55
305 0.59
306 0.6
307 0.63
308 0.65
309 0.68
310 0.69
311 0.69
312 0.68
313 0.68
314 0.68
315 0.65
316 0.61
317 0.51
318 0.42
319 0.35
320 0.28
321 0.19
322 0.1
323 0.07
324 0.1
325 0.1
326 0.11
327 0.13
328 0.14
329 0.16
330 0.16
331 0.16
332 0.16
333 0.17
334 0.17
335 0.16
336 0.16
337 0.13
338 0.12
339 0.11
340 0.07
341 0.05
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.05
347 0.07
348 0.08
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.11
353 0.14
354 0.17
355 0.19
356 0.25
357 0.32
358 0.38
359 0.44
360 0.5
361 0.54
362 0.59
363 0.65
364 0.7
365 0.72
366 0.74
367 0.75
368 0.74
369 0.74
370 0.7
371 0.61
372 0.51
373 0.42
374 0.39
375 0.37
376 0.34
377 0.33
378 0.33
379 0.37
380 0.45
381 0.48
382 0.52
383 0.57
384 0.63
385 0.68
386 0.73
387 0.76
388 0.76
389 0.79
390 0.76
391 0.71
392 0.68
393 0.6
394 0.53
395 0.52
396 0.48
397 0.45
398 0.44
399 0.42
400 0.44
401 0.49
402 0.55
403 0.54
404 0.6
405 0.6
406 0.57
407 0.55
408 0.49
409 0.44
410 0.37
411 0.32
412 0.29
413 0.24
414 0.22
415 0.21
416 0.21
417 0.24
418 0.23
419 0.23
420 0.19
421 0.2
422 0.2
423 0.23
424 0.22
425 0.2
426 0.22
427 0.25
428 0.25
429 0.26
430 0.25
431 0.24
432 0.28
433 0.27
434 0.24
435 0.19
436 0.17
437 0.17
438 0.17
439 0.19
440 0.16
441 0.15
442 0.16
443 0.17
444 0.24
445 0.27
446 0.29
447 0.29
448 0.32
449 0.33
450 0.34
451 0.42
452 0.42
453 0.43
454 0.45
455 0.48
456 0.5
457 0.59
458 0.61
459 0.58
460 0.59
461 0.58
462 0.57
463 0.59
464 0.57
465 0.48
466 0.44
467 0.41
468 0.34
469 0.3
470 0.28
471 0.23
472 0.18
473 0.23
474 0.26
475 0.3
476 0.39
477 0.46
478 0.49
479 0.56
480 0.64
481 0.68
482 0.72
483 0.72
484 0.69
485 0.69
486 0.67
487 0.63
488 0.62
489 0.6
490 0.6
491 0.54
492 0.49
493 0.48
494 0.48
495 0.5
496 0.52
497 0.53
498 0.55
499 0.61
500 0.7
501 0.71
502 0.71
503 0.65