Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316ZIB8

Protein Details
Accession A0A316ZIB8    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-40AAPAEAKPKARKGRKSAAAAEEHydrophilic
352-373LEASLRGKRSRKRDEDPDAEVNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-34PAEAKPKARKGRKS
71-83AAKPKKGKGRKSA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPRKTRAAVAAAKEEPEAAAPAEAKPKARKGRKSAAAAEEAEAAPAAAKQDVKATAAAAEESPVVEEPPAAAKPKKGKGRKSAAAEAAPAAAEADAKPTAAAAEAAPAAAEEAPAAAEPAEDVASANSGAQAESSASAVAADEEQDEAPAAQAESSAAGASAEPSEKLSMAERMAKMKELRKKMNDSTHANRRAVAAEVGRARSSARKDASNSRKLQKAAETLDERDMLERGEDPERARNWGYSIEQNEKWEDKLAATDVRRDKGDIDPNSAAERAYRRKVQGLKPDLASYSASRSGSSSSSSSMALVRSNAGTSSQIVRRADLDVNDGKLSYGGHKPDEAAVDRVISNLNLEASLRGKRSRKRDEDPDAEVNYINDRNKHFNAKVKRFYDDSTREIRENLERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.27
3 0.22
4 0.18
5 0.11
6 0.12
7 0.12
8 0.14
9 0.21
10 0.23
11 0.27
12 0.32
13 0.41
14 0.5
15 0.59
16 0.66
17 0.69
18 0.77
19 0.81
20 0.82
21 0.8
22 0.76
23 0.72
24 0.63
25 0.55
26 0.47
27 0.38
28 0.3
29 0.22
30 0.16
31 0.1
32 0.1
33 0.09
34 0.08
35 0.09
36 0.09
37 0.14
38 0.16
39 0.17
40 0.17
41 0.16
42 0.15
43 0.16
44 0.16
45 0.11
46 0.11
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.11
56 0.13
57 0.16
58 0.17
59 0.23
60 0.32
61 0.41
62 0.5
63 0.55
64 0.62
65 0.68
66 0.77
67 0.79
68 0.78
69 0.77
70 0.72
71 0.65
72 0.56
73 0.46
74 0.37
75 0.28
76 0.21
77 0.13
78 0.08
79 0.07
80 0.05
81 0.08
82 0.07
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.08
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.03
99 0.03
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.03
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.1
158 0.15
159 0.15
160 0.18
161 0.18
162 0.21
163 0.23
164 0.28
165 0.34
166 0.37
167 0.43
168 0.45
169 0.52
170 0.55
171 0.59
172 0.6
173 0.59
174 0.59
175 0.62
176 0.62
177 0.56
178 0.5
179 0.43
180 0.37
181 0.31
182 0.25
183 0.16
184 0.14
185 0.15
186 0.15
187 0.14
188 0.13
189 0.13
190 0.15
191 0.18
192 0.2
193 0.2
194 0.22
195 0.25
196 0.36
197 0.44
198 0.48
199 0.5
200 0.47
201 0.51
202 0.49
203 0.48
204 0.41
205 0.38
206 0.32
207 0.33
208 0.31
209 0.28
210 0.29
211 0.27
212 0.23
213 0.19
214 0.17
215 0.11
216 0.09
217 0.08
218 0.09
219 0.1
220 0.12
221 0.13
222 0.19
223 0.19
224 0.22
225 0.22
226 0.2
227 0.2
228 0.21
229 0.22
230 0.2
231 0.24
232 0.26
233 0.27
234 0.28
235 0.29
236 0.27
237 0.25
238 0.23
239 0.19
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.17
244 0.16
245 0.23
246 0.25
247 0.26
248 0.27
249 0.26
250 0.26
251 0.27
252 0.36
253 0.3
254 0.33
255 0.32
256 0.32
257 0.33
258 0.31
259 0.24
260 0.18
261 0.23
262 0.23
263 0.27
264 0.31
265 0.31
266 0.38
267 0.46
268 0.51
269 0.55
270 0.56
271 0.54
272 0.52
273 0.51
274 0.44
275 0.38
276 0.32
277 0.23
278 0.2
279 0.2
280 0.19
281 0.18
282 0.18
283 0.18
284 0.18
285 0.19
286 0.16
287 0.14
288 0.15
289 0.15
290 0.15
291 0.14
292 0.14
293 0.13
294 0.12
295 0.12
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.12
302 0.17
303 0.19
304 0.24
305 0.24
306 0.25
307 0.25
308 0.27
309 0.28
310 0.23
311 0.26
312 0.23
313 0.25
314 0.24
315 0.23
316 0.19
317 0.17
318 0.17
319 0.15
320 0.17
321 0.18
322 0.2
323 0.2
324 0.21
325 0.23
326 0.27
327 0.26
328 0.23
329 0.21
330 0.21
331 0.2
332 0.2
333 0.18
334 0.14
335 0.12
336 0.11
337 0.1
338 0.09
339 0.09
340 0.11
341 0.12
342 0.17
343 0.2
344 0.26
345 0.34
346 0.41
347 0.51
348 0.61
349 0.67
350 0.71
351 0.79
352 0.81
353 0.8
354 0.8
355 0.77
356 0.68
357 0.6
358 0.51
359 0.41
360 0.36
361 0.34
362 0.3
363 0.28
364 0.3
365 0.37
366 0.41
367 0.49
368 0.5
369 0.54
370 0.62
371 0.68
372 0.73
373 0.69
374 0.69
375 0.63
376 0.62
377 0.63
378 0.58
379 0.53
380 0.52
381 0.53
382 0.49
383 0.47
384 0.48
385 0.45
386 0.43
387 0.39