FuNGI

A0A316Z3C2

Protein Details

Accession

A0A316Z3C2

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
678-716	EKKARKTAAKESKQARKSEKSARKQAYAKERKTQLKQAG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
141-146	KGKGKG
369-371	RSR
672-710	RNESAEEKKARKTAAKESKQARKSEKSARKQAYAKERKT

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 10.5, mito 8, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKKSIWRAPDAQHFSVVHRSQRDPLLHDGDASRGVLREAPRANLLRGNHASGSATPAPGGGETLSQLEAKLGDELAQERPNVGEAQKYGVYFDDSAYDYMQHLRPIGGTHNARHGGVDEVDDVDVVLLPAPAPNTTKSKGKGKGKGDGSSGGGFELKPAELEKQPVRQALPADVLPPRHLPARDWSRMEDVAPELRGLQPNMDPHLRQVLEALDDDAFLLPAQRRAAAAARAAAAASEAEAAAKAPAAEEKEDEEEEDIDDFFADILADGEAADDEVLPWQAEAPGGEETLFETPAARAARELMTLKESGAGPEALSLEARVALFKAAQSEARAQQPQQPRGAGVAGSRVSSTGSQSIFGEKGPSRRSRHPGAKARLAASYYAPSAAGGATAFSMSSSAMERNAGLSGLDERFEKMEALYEAGSDEDEGSDDEDSSLTRPPPASFDSDDDDDDEGAPPLTREDFDGILDDFLTRHEVYGGRLRTRLGAPESSGAAKLGQLREELGAPLARRREEVDEGEESEESEEEEIMMPRSARDGREKWDVETVLSTRSNLENHPRLIAARSSVAGSTMSHRPTTIASSGIGRPSSLSTNGSEVMPRVRINPRTGLPEITSYIKLAAPRERELPPTGFKEECSSVREVPEEDEDEAYSSGAESDDTIGARRTITRPRNESAEEKKARKTAAKESKQARKSEKSARKQAYAKERKTQLKQAGARVAGGGAADVGRNGVGREGIAVRLA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.55
3	0.51
4	0.53
5	0.5
6	0.46
7	0.44
8	0.45
9	0.45
10	0.52
11	0.52
12	0.46
13	0.5
14	0.49
15	0.44
16	0.43
17	0.38
18	0.33
19	0.3
20	0.27
21	0.2
22	0.14
23	0.15
24	0.17
25	0.19
26	0.24
27	0.25
28	0.27
29	0.33
30	0.36
31	0.37
32	0.38
33	0.38
34	0.39
35	0.4
36	0.41
37	0.34
38	0.32
39	0.32
40	0.27
41	0.32
42	0.25
43	0.22
44	0.18
45	0.18
46	0.18
47	0.16
48	0.16
49	0.09
50	0.08
51	0.09
52	0.1
53	0.11
54	0.1
55	0.1
56	0.1
57	0.1
58	0.1
59	0.1
60	0.09
61	0.09
62	0.11
63	0.13
64	0.17
65	0.19
66	0.18
67	0.18
68	0.18
69	0.19
70	0.19
71	0.18
72	0.17
73	0.15
74	0.2
75	0.22
76	0.22
77	0.21
78	0.2
79	0.22
80	0.18
81	0.18
82	0.16
83	0.15
84	0.16
85	0.16
86	0.15
87	0.13
88	0.18
89	0.19
90	0.18
91	0.17
92	0.16
93	0.17
94	0.18
95	0.2
96	0.24
97	0.26
98	0.26
99	0.34
100	0.35
101	0.34
102	0.33
103	0.3
104	0.25
105	0.22
106	0.21
107	0.14
108	0.13
109	0.13
110	0.12
111	0.11
112	0.08
113	0.07
114	0.06
115	0.05
116	0.04
117	0.04
118	0.05
119	0.06
120	0.08
121	0.09
122	0.13
123	0.18
124	0.21
125	0.28
126	0.32
127	0.41
128	0.49
129	0.56
130	0.62
131	0.62
132	0.68
133	0.67
134	0.65
135	0.59
136	0.52
137	0.46
138	0.38
139	0.33
140	0.24
141	0.2
142	0.15
143	0.14
144	0.12
145	0.09
146	0.08
147	0.09
148	0.12
149	0.13
150	0.2
151	0.23
152	0.28
153	0.31
154	0.34
155	0.34
156	0.33
157	0.33
158	0.3
159	0.29
160	0.23
161	0.22
162	0.21
163	0.22
164	0.21
165	0.21
166	0.2
167	0.22
168	0.22
169	0.22
170	0.3
171	0.37
172	0.41
173	0.42
174	0.43
175	0.42
176	0.42
177	0.41
178	0.33
179	0.26
180	0.23
181	0.21
182	0.19
183	0.15
184	0.17
185	0.19
186	0.17
187	0.17
188	0.16
189	0.18
190	0.22
191	0.24
192	0.22
193	0.21
194	0.28
195	0.26
196	0.23
197	0.22
198	0.19
199	0.18
200	0.18
201	0.17
202	0.09
203	0.09
204	0.09
205	0.08
206	0.07
207	0.05
208	0.07
209	0.07
210	0.1
211	0.11
212	0.11
213	0.11
214	0.13
215	0.16
216	0.16
217	0.16
218	0.15
219	0.15
220	0.14
221	0.14
222	0.12
223	0.09
224	0.06
225	0.05
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.06
236	0.07
237	0.08
238	0.09
239	0.11
240	0.13
241	0.13
242	0.14
243	0.12
244	0.11
245	0.11
246	0.11
247	0.09
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.05
252	0.04
253	0.04
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.05
272	0.05
273	0.06
274	0.06
275	0.07
276	0.07
277	0.06
278	0.07
279	0.08
280	0.08
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.11
285	0.11
286	0.1
287	0.09
288	0.11
289	0.12
290	0.14
291	0.15
292	0.11
293	0.12
294	0.12
295	0.12
296	0.13
297	0.12
298	0.1
299	0.11
300	0.1
301	0.08
302	0.08
303	0.09
304	0.07
305	0.07
306	0.06
307	0.05
308	0.06
309	0.06
310	0.05
311	0.04
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.09
319	0.13
320	0.15
321	0.19
322	0.2
323	0.19
324	0.25
325	0.33
326	0.34
327	0.33
328	0.31
329	0.28
330	0.27
331	0.27
332	0.2
333	0.12
334	0.13
335	0.11
336	0.11
337	0.1
338	0.09
339	0.09
340	0.09
341	0.1
342	0.1
343	0.09
344	0.1
345	0.1
346	0.11
347	0.11
348	0.11
349	0.13
350	0.12
351	0.17
352	0.21
353	0.28
354	0.31
355	0.38
356	0.44
357	0.48
358	0.55
359	0.6
360	0.65
361	0.63
362	0.64
363	0.6
364	0.55
365	0.48
366	0.41
367	0.32
368	0.23
369	0.18
370	0.12
371	0.1
372	0.09
373	0.07
374	0.07
375	0.06
376	0.05
377	0.03
378	0.03
379	0.03
380	0.03
381	0.03
382	0.03
383	0.03
384	0.03
385	0.04
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.07
393	0.06
394	0.05
395	0.05
396	0.07
397	0.07
398	0.08
399	0.07
400	0.08
401	0.08
402	0.09
403	0.09
404	0.06
405	0.08
406	0.08
407	0.09
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.07
412	0.07
413	0.05
414	0.05
415	0.03
416	0.04
417	0.04
418	0.04
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.06
425	0.08
426	0.08
427	0.09
428	0.1
429	0.1
430	0.13
431	0.15
432	0.18
433	0.17
434	0.2
435	0.22
436	0.22
437	0.22
438	0.2
439	0.19
440	0.15
441	0.14
442	0.12
443	0.08
444	0.07
445	0.07
446	0.05
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.07
451	0.08
452	0.09
453	0.09
454	0.1
455	0.1
456	0.09
457	0.09
458	0.08
459	0.06
460	0.06
461	0.09
462	0.08
463	0.07
464	0.09
465	0.1
466	0.12
467	0.2
468	0.22
469	0.21
470	0.22
471	0.23
472	0.24
473	0.24
474	0.26
475	0.22
476	0.2
477	0.19
478	0.2
479	0.21
480	0.19
481	0.18
482	0.14
483	0.11
484	0.11
485	0.14
486	0.13
487	0.13
488	0.13
489	0.13
490	0.14
491	0.14
492	0.13
493	0.1
494	0.11
495	0.11
496	0.14
497	0.17
498	0.16
499	0.17
500	0.19
501	0.22
502	0.24
503	0.26
504	0.26
505	0.25
506	0.26
507	0.26
508	0.23
509	0.19
510	0.15
511	0.13
512	0.09
513	0.08
514	0.06
515	0.05
516	0.06
517	0.07
518	0.07
519	0.08
520	0.08
521	0.08
522	0.12
523	0.14
524	0.15
525	0.23
526	0.25
527	0.29
528	0.38
529	0.4
530	0.37
531	0.41
532	0.39
533	0.32
534	0.32
535	0.28
536	0.22
537	0.22
538	0.2
539	0.17
540	0.19
541	0.19
542	0.19
543	0.28
544	0.29
545	0.3
546	0.31
547	0.29
548	0.28
549	0.29
550	0.27
551	0.2
552	0.16
553	0.15
554	0.15
555	0.14
556	0.14
557	0.12
558	0.11
559	0.13
560	0.17
561	0.18
562	0.18
563	0.18
564	0.18
565	0.19
566	0.22
567	0.2
568	0.15
569	0.14
570	0.18
571	0.19
572	0.22
573	0.2
574	0.16
575	0.16
576	0.17
577	0.19
578	0.18
579	0.18
580	0.16
581	0.18
582	0.19
583	0.19
584	0.17
585	0.16
586	0.17
587	0.18
588	0.17
589	0.2
590	0.27
591	0.32
592	0.35
593	0.4
594	0.39
595	0.43
596	0.44
597	0.42
598	0.36
599	0.34
600	0.32
601	0.3
602	0.28
603	0.21
604	0.21
605	0.2
606	0.2
607	0.21
608	0.26
609	0.27
610	0.29
611	0.33
612	0.34
613	0.36
614	0.39
615	0.39
616	0.38
617	0.38
618	0.39
619	0.35
620	0.34
621	0.35
622	0.35
623	0.33
624	0.32
625	0.31
626	0.29
627	0.31
628	0.32
629	0.28
630	0.26
631	0.28
632	0.26
633	0.23
634	0.22
635	0.2
636	0.2
637	0.19
638	0.16
639	0.11
640	0.09
641	0.08
642	0.07
643	0.07
644	0.05
645	0.07
646	0.09
647	0.09
648	0.11
649	0.12
650	0.12
651	0.13
652	0.17
653	0.2
654	0.29
655	0.37
656	0.45
657	0.5
658	0.53
659	0.59
660	0.6
661	0.64
662	0.62
663	0.64
664	0.63
665	0.62
666	0.65
667	0.62
668	0.62
669	0.61
670	0.58
671	0.59
672	0.61
673	0.66
674	0.68
675	0.73
676	0.79
677	0.78
678	0.8
679	0.78
680	0.76
681	0.75
682	0.77
683	0.79
684	0.79
685	0.83
686	0.81
687	0.81
688	0.78
689	0.79
690	0.8
691	0.8
692	0.76
693	0.75
694	0.77
695	0.78
696	0.8
697	0.8
698	0.78
699	0.77
700	0.77
701	0.75
702	0.74
703	0.65
704	0.58
705	0.49
706	0.4
707	0.3
708	0.23
709	0.15
710	0.08
711	0.07
712	0.06
713	0.06
714	0.06
715	0.06
716	0.07
717	0.07
718	0.08
719	0.08
720	0.08
721	0.11
722	0.12

A0A316Z3C2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer