FuNGI

A0A316YYX5

Protein Details

Accession

A0A316YYX5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
980-1001	IYELGKKKLLRKCENKNFPTAI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

extr 9, cyto 7, mito 4, E.R. 3, mito_nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MHLYNLALVAPSNITAACVGQFSGTRTQEIAVCRAGARIELLRPDTTAGRAASICEQQAFGTVRSMANFRLTGGSKDYLILGSDSGRIVILEFDTKLLQFTVVHSETFGRSGSRRIVPGQYLAVDPKGRAVLIGAIEKAKLVYILNRDAAANLTISSPLEAHRPNAIIHAITGVDVGYENPVFAALEVGYEESDRDPTGAAFDAAEKLLTYYELDLGLNHVVRRWTSPVDPRSSHLIPVPGGYNQTSERWEGPSGVLVCAEDYITYKHSVGEEHRIPIPRRHNPVENDAERRGTIITGSVCHRMKSGFFFLVQNEDGDLFKITIEHDGEDMRSLKIKYFDTVPIASSLCILRAGLLFVASESGPSFIYSFQKLGDDDDLPEYSSTHYPDFGVGDRAPEVPTFTPRPLENLVQTDELPALDPILDAKVLNPLGTDSPQIFTACGRGPRSSFKMLQHGLEVQEAISSDLPGVPNAVWTTKLQSDDQYDAYIILSFVNGTLVLSIGETIEEVGDSGFLTSAPTLAVQQLGADALLQVHPHGIRHVMADKRVTEWTTPAAQDGSPTQIVAAATNSRQVVLALAPTNELVYFELDMDGQLNEYQERKSMGSRVLTLSIADVPEGRQRTPYLAVGCEDQTVRIISLDPDSTLASISIQALTAPANSICIAEMEDTVIDRNHATLFVNIGLTNGVLLRTVLDPISGQLTDTRTRFLGAKPVRLVRVRLQGTQTAVLALSSRPWLSYTHQSRTHFTPLIFEALDHAWTFSAEMCPQGLIGIVGGSLRIFTIPTLGTKLKSDSISLSYTPRRFVNHPERSNLFYIAESDHRTLSPWAQQQRLGQLGRELKPSQRGVLDLPASEFGPVRAEAGQWSSCLRVVDVKDMSTAFRLELDNNEAAFCVALVPFASGGAANGAGHGAEPYLVVGSAVEAHVSPRAVRQAYLSVYKLTDEGRGLELLQKTEVDELPTVLRPFQGRLLAGVGKALRIYELGKKKLLRKCENKNFPTAIVSLQTQGTRIIVGDQAESLIYVTYKAAANRLIIFADDVVARWTTATAMLDYDTVASGDKFGNVFVSRLDSAVSTAVDEDSSGLSILHEKPFLQGAPHKTDLVAHFHIGDIVTSMTRTSLVPGGREVLLYTGLNGTVGALVPFVAKEDVETLSTLEMHMRQEATSSIVGRDHLAFRGYYAPVKAVVDGDLCETFGQLPVTKQRAIGEELDRTPAEVNKKLEQLRTTSAF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.09
3	0.09
4	0.09
5	0.09
6	0.09
7	0.1
8	0.12
9	0.15
10	0.23
11	0.24
12	0.24
13	0.25
14	0.26
15	0.28
16	0.29
17	0.29
18	0.23
19	0.23
20	0.21
21	0.22
22	0.21
23	0.18
24	0.18
25	0.18
26	0.2
27	0.24
28	0.27
29	0.26
30	0.27
31	0.29
32	0.27
33	0.25
34	0.26
35	0.21
36	0.21
37	0.2
38	0.22
39	0.24
40	0.26
41	0.25
42	0.21
43	0.22
44	0.19
45	0.25
46	0.25
47	0.21
48	0.21
49	0.22
50	0.22
51	0.23
52	0.25
53	0.2
54	0.22
55	0.21
56	0.19
57	0.24
58	0.25
59	0.25
60	0.28
61	0.28
62	0.24
63	0.25
64	0.24
65	0.18
66	0.18
67	0.16
68	0.11
69	0.11
70	0.12
71	0.12
72	0.11
73	0.1
74	0.09
75	0.09
76	0.09
77	0.1
78	0.11
79	0.11
80	0.12
81	0.13
82	0.13
83	0.14
84	0.13
85	0.12
86	0.1
87	0.12
88	0.19
89	0.19
90	0.19
91	0.19
92	0.21
93	0.21
94	0.22
95	0.21
96	0.15
97	0.15
98	0.2
99	0.26
100	0.29
101	0.31
102	0.33
103	0.38
104	0.37
105	0.39
106	0.37
107	0.32
108	0.29
109	0.29
110	0.29
111	0.25
112	0.22
113	0.22
114	0.21
115	0.19
116	0.17
117	0.16
118	0.15
119	0.16
120	0.19
121	0.17
122	0.16
123	0.16
124	0.16
125	0.15
126	0.12
127	0.1
128	0.09
129	0.13
130	0.17
131	0.22
132	0.23
133	0.24
134	0.24
135	0.23
136	0.24
137	0.19
138	0.15
139	0.11
140	0.1
141	0.1
142	0.1
143	0.1
144	0.09
145	0.09
146	0.15
147	0.16
148	0.17
149	0.2
150	0.21
151	0.21
152	0.24
153	0.24
154	0.18
155	0.17
156	0.17
157	0.13
158	0.11
159	0.11
160	0.08
161	0.06
162	0.06
163	0.06
164	0.07
165	0.07
166	0.07
167	0.07
168	0.07
169	0.07
170	0.07
171	0.08
172	0.05
173	0.05
174	0.06
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.08
179	0.07
180	0.09
181	0.08
182	0.08
183	0.08
184	0.08
185	0.1
186	0.1
187	0.1
188	0.09
189	0.1
190	0.11
191	0.1
192	0.1
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.08
197	0.08
198	0.07
199	0.08
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.1
204	0.12
205	0.13
206	0.12
207	0.13
208	0.14
209	0.15
210	0.19
211	0.21
212	0.22
213	0.26
214	0.35
215	0.4
216	0.45
217	0.46
218	0.46
219	0.5
220	0.47
221	0.43
222	0.37
223	0.33
224	0.26
225	0.26
226	0.25
227	0.19
228	0.2
229	0.18
230	0.18
231	0.17
232	0.18
233	0.18
234	0.19
235	0.2
236	0.2
237	0.21
238	0.2
239	0.18
240	0.22
241	0.21
242	0.19
243	0.18
244	0.15
245	0.14
246	0.13
247	0.12
248	0.07
249	0.07
250	0.08
251	0.1
252	0.12
253	0.12
254	0.13
255	0.14
256	0.16
257	0.19
258	0.26
259	0.27
260	0.28
261	0.32
262	0.37
263	0.39
264	0.44
265	0.51
266	0.5
267	0.55
268	0.58
269	0.62
270	0.59
271	0.65
272	0.67
273	0.62
274	0.59
275	0.53
276	0.49
277	0.41
278	0.37
279	0.29
280	0.2
281	0.15
282	0.13
283	0.12
284	0.12
285	0.15
286	0.22
287	0.22
288	0.22
289	0.23
290	0.21
291	0.22
292	0.25
293	0.27
294	0.21
295	0.22
296	0.23
297	0.23
298	0.26
299	0.25
300	0.19
301	0.15
302	0.14
303	0.13
304	0.12
305	0.12
306	0.08
307	0.07
308	0.08
309	0.07
310	0.1
311	0.11
312	0.11
313	0.11
314	0.11
315	0.12
316	0.14
317	0.15
318	0.12
319	0.15
320	0.15
321	0.17
322	0.2
323	0.21
324	0.2
325	0.22
326	0.24
327	0.24
328	0.25
329	0.23
330	0.2
331	0.2
332	0.18
333	0.16
334	0.13
335	0.1
336	0.09
337	0.08
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.07
342	0.07
343	0.06
344	0.05
345	0.07
346	0.06
347	0.06
348	0.05
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.11
355	0.12
356	0.12
357	0.12
358	0.14
359	0.14
360	0.15
361	0.16
362	0.14
363	0.14
364	0.16
365	0.15
366	0.14
367	0.14
368	0.12
369	0.12
370	0.13
371	0.14
372	0.12
373	0.13
374	0.12
375	0.13
376	0.14
377	0.13
378	0.15
379	0.13
380	0.13
381	0.14
382	0.14
383	0.14
384	0.13
385	0.14
386	0.11
387	0.16
388	0.18
389	0.18
390	0.2
391	0.19
392	0.24
393	0.24
394	0.26
395	0.24
396	0.24
397	0.25
398	0.23
399	0.23
400	0.2
401	0.17
402	0.14
403	0.12
404	0.09
405	0.07
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.1
414	0.1
415	0.1
416	0.09
417	0.1
418	0.11
419	0.12
420	0.13
421	0.09
422	0.1
423	0.11
424	0.11
425	0.1
426	0.09
427	0.12
428	0.13
429	0.17
430	0.18
431	0.19
432	0.2
433	0.26
434	0.31
435	0.33
436	0.34
437	0.33
438	0.39
439	0.39
440	0.38
441	0.34
442	0.3
443	0.26
444	0.22
445	0.19
446	0.11
447	0.1
448	0.09
449	0.09
450	0.07
451	0.06
452	0.06
453	0.07
454	0.07
455	0.06
456	0.07
457	0.06
458	0.07
459	0.08
460	0.08
461	0.08
462	0.08
463	0.12
464	0.14
465	0.16
466	0.15
467	0.17
468	0.2
469	0.21
470	0.21
471	0.18
472	0.16
473	0.14
474	0.13
475	0.11
476	0.08
477	0.06
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.03
484	0.03
485	0.03
486	0.03
487	0.03
488	0.03
489	0.03
490	0.03
491	0.03
492	0.03
493	0.03
494	0.03
495	0.03
496	0.03
497	0.03
498	0.03
499	0.03
500	0.03
501	0.03
502	0.03
503	0.03
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.04
508	0.05
509	0.05
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.03
516	0.03
517	0.03
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.05
522	0.05
523	0.06
524	0.06
525	0.07
526	0.07
527	0.09
528	0.14
529	0.14
530	0.16
531	0.18
532	0.18
533	0.19
534	0.2
535	0.2
536	0.15
537	0.15
538	0.15
539	0.15
540	0.15
541	0.13
542	0.12
543	0.11
544	0.12
545	0.11
546	0.11
547	0.09
548	0.09
549	0.08
550	0.09
551	0.09
552	0.09
553	0.09
554	0.07
555	0.07
556	0.1
557	0.1
558	0.09
559	0.09
560	0.08
561	0.08
562	0.07
563	0.08
564	0.07
565	0.07
566	0.07
567	0.07
568	0.07
569	0.06
570	0.06
571	0.05
572	0.05
573	0.05
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.04
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.07
585	0.07
586	0.07
587	0.09
588	0.1
589	0.1
590	0.13
591	0.15
592	0.15
593	0.17
594	0.17
595	0.16
596	0.16
597	0.14
598	0.12
599	0.1
600	0.09
601	0.07
602	0.06
603	0.06
604	0.1
605	0.11
606	0.1
607	0.11
608	0.12
609	0.14
610	0.16
611	0.17
612	0.15
613	0.14
614	0.15
615	0.15
616	0.15
617	0.13
618	0.11
619	0.09
620	0.08
621	0.08
622	0.07
623	0.06
624	0.06
625	0.06
626	0.07
627	0.07
628	0.07
629	0.07
630	0.07
631	0.07
632	0.07
633	0.06
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.05
638	0.04
639	0.04
640	0.04
641	0.05
642	0.04
643	0.05
644	0.04
645	0.05
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.06
651	0.05
652	0.06
653	0.05
654	0.05
655	0.05
656	0.05
657	0.05
658	0.05
659	0.05
660	0.05
661	0.05
662	0.06
663	0.06
664	0.06
665	0.07
666	0.07
667	0.08
668	0.07
669	0.07
670	0.06
671	0.06
672	0.05
673	0.04
674	0.04
675	0.03
676	0.03
677	0.04
678	0.05
679	0.05
680	0.05
681	0.05
682	0.05
683	0.06
684	0.07
685	0.06
686	0.06
687	0.08
688	0.11
689	0.14
690	0.14
691	0.15
692	0.13
693	0.15
694	0.16
695	0.15
696	0.22
697	0.21
698	0.26
699	0.28
700	0.3
701	0.33
702	0.33
703	0.36
704	0.31
705	0.38
706	0.35
707	0.35
708	0.34
709	0.33
710	0.32
711	0.3
712	0.25
713	0.16
714	0.13
715	0.11
716	0.09
717	0.07
718	0.06
719	0.07
720	0.07
721	0.06
722	0.08
723	0.1
724	0.13
725	0.23
726	0.28
727	0.33
728	0.4
729	0.42
730	0.44
731	0.47
732	0.49
733	0.41
734	0.35
735	0.32
736	0.26
737	0.27
738	0.23
739	0.18
740	0.15
741	0.13
742	0.13
743	0.1
744	0.09
745	0.07
746	0.07
747	0.07
748	0.06
749	0.07
750	0.06
751	0.07
752	0.07
753	0.07
754	0.07
755	0.06
756	0.06
757	0.04
758	0.04
759	0.03
760	0.03
761	0.03
762	0.03
763	0.03
764	0.03
765	0.03
766	0.03
767	0.03
768	0.03
769	0.05
770	0.06
771	0.07
772	0.11
773	0.12
774	0.13
775	0.14
776	0.16
777	0.18
778	0.18
779	0.18
780	0.16
781	0.18
782	0.19
783	0.19
784	0.22
785	0.25
786	0.26
787	0.27
788	0.27
789	0.28
790	0.28
791	0.36
792	0.43
793	0.47
794	0.49
795	0.52
796	0.53
797	0.52
798	0.52
799	0.43
800	0.33
801	0.23
802	0.21
803	0.18
804	0.18
805	0.17
806	0.16
807	0.16
808	0.15
809	0.16
810	0.16
811	0.17
812	0.21
813	0.25
814	0.28
815	0.3
816	0.33
817	0.33
818	0.36
819	0.4
820	0.34
821	0.28
822	0.29
823	0.34
824	0.33
825	0.36
826	0.32
827	0.29
828	0.36
829	0.36
830	0.33
831	0.27
832	0.26
833	0.23
834	0.27
835	0.25
836	0.18
837	0.18
838	0.17
839	0.16
840	0.15
841	0.13
842	0.08
843	0.09
844	0.09
845	0.09
846	0.09
847	0.09
848	0.09
849	0.12
850	0.13
851	0.11
852	0.12
853	0.12
854	0.13
855	0.13
856	0.13
857	0.14
858	0.15
859	0.21
860	0.21
861	0.21
862	0.2
863	0.21
864	0.21
865	0.17
866	0.16
867	0.1
868	0.11
869	0.12
870	0.11
871	0.13
872	0.17
873	0.17
874	0.16
875	0.16
876	0.14
877	0.13
878	0.12
879	0.1
880	0.06
881	0.04
882	0.04
883	0.04
884	0.05
885	0.05
886	0.05
887	0.05
888	0.04
889	0.04
890	0.05
891	0.05
892	0.04
893	0.04
894	0.04
895	0.04
896	0.04
897	0.04
898	0.04
899	0.03
900	0.03
901	0.04
902	0.04
903	0.04
904	0.04
905	0.03
906	0.04
907	0.04
908	0.04
909	0.05
910	0.04
911	0.05
912	0.07
913	0.08
914	0.08
915	0.1
916	0.16
917	0.16
918	0.17
919	0.18
920	0.21
921	0.24
922	0.28
923	0.26
924	0.22
925	0.22
926	0.22
927	0.21
928	0.17
929	0.17
930	0.13
931	0.14
932	0.14
933	0.14
934	0.14
935	0.18
936	0.18
937	0.17
938	0.17
939	0.15
940	0.14
941	0.17
942	0.17
943	0.14
944	0.13
945	0.13
946	0.15
947	0.18
948	0.17
949	0.15
950	0.17
951	0.15
952	0.17
953	0.2
954	0.21
955	0.18
956	0.18
957	0.22
958	0.21
959	0.19
960	0.2
961	0.17
962	0.14
963	0.14
964	0.12
965	0.09
966	0.09
967	0.12
968	0.17
969	0.26
970	0.28
971	0.34
972	0.39
973	0.47
974	0.51
975	0.59
976	0.61
977	0.63
978	0.71
979	0.77
980	0.83
981	0.78
982	0.8
983	0.72
984	0.63
985	0.55
986	0.45
987	0.35
988	0.27
989	0.25
990	0.19
991	0.19
992	0.17
993	0.15
994	0.15
995	0.13
996	0.11
997	0.11
998	0.1
999	0.1
1000	0.11
1001	0.11
1002	0.1
1003	0.1
1004	0.09
1005	0.09
1006	0.08
1007	0.06
1008	0.05
1009	0.06
1010	0.06
1011	0.07
1012	0.1
1013	0.1
1014	0.13
1015	0.14
1016	0.16
1017	0.17
1018	0.18
1019	0.16
1020	0.15
1021	0.15
1022	0.12
1023	0.11
1024	0.09
1025	0.08
1026	0.09
1027	0.09
1028	0.08
1029	0.08
1030	0.08
1031	0.07
1032	0.09
1033	0.1
1034	0.09
1035	0.09
1036	0.1
1037	0.1
1038	0.1
1039	0.1
1040	0.08
1041	0.07
1042	0.07
1043	0.07
1044	0.08
1045	0.08
1046	0.1
1047	0.09
1048	0.09
1049	0.13
1050	0.13
1051	0.13
1052	0.12
1053	0.17
1054	0.15
1055	0.15
1056	0.16
1057	0.12
1058	0.13
1059	0.14
1060	0.13
1061	0.09
1062	0.09
1063	0.09
1064	0.09
1065	0.08
1066	0.08
1067	0.07
1068	0.07
1069	0.07
1070	0.06
1071	0.06
1072	0.11
1073	0.14
1074	0.15
1075	0.16
1076	0.16
1077	0.17
1078	0.2
1079	0.21
1080	0.21
1081	0.25
1082	0.29
1083	0.35
1084	0.38
1085	0.37
1086	0.34
1087	0.38
1088	0.36
1089	0.37
1090	0.32
1091	0.26
1092	0.24
1093	0.23
1094	0.24
1095	0.2
1096	0.17
1097	0.1
1098	0.09
1099	0.08
1100	0.08
1101	0.08
1102	0.07
1103	0.08
1104	0.09
1105	0.1
1106	0.14
1107	0.15
1108	0.17
1109	0.18
1110	0.21
1111	0.2
1112	0.2
1113	0.18
1114	0.14
1115	0.15
1116	0.14
1117	0.13
1118	0.11
1119	0.11
1120	0.11
1121	0.1
1122	0.09
1123	0.07
1124	0.07
1125	0.06
1126	0.05
1127	0.06
1128	0.06
1129	0.06
1130	0.07
1131	0.07
1132	0.07
1133	0.08
1134	0.1
1135	0.11
1136	0.12
1137	0.13
1138	0.11
1139	0.12
1140	0.12
1141	0.12
1142	0.12
1143	0.13
1144	0.14
1145	0.16
1146	0.16
1147	0.15
1148	0.17
1149	0.17
1150	0.18
1151	0.18
1152	0.18
1153	0.17
1154	0.17
1155	0.18
1156	0.19
1157	0.22
1158	0.2
1159	0.19
1160	0.2
1161	0.18
1162	0.18
1163	0.23
1164	0.23
1165	0.23
1166	0.22
1167	0.22
1168	0.22
1169	0.23
1170	0.22
1171	0.18
1172	0.18
1173	0.15
1174	0.15
1175	0.16
1176	0.14
1177	0.14
1178	0.13
1179	0.13
1180	0.12
1181	0.13
1182	0.15
1183	0.13
1184	0.17
1185	0.26
1186	0.3
1187	0.31
1188	0.32
1189	0.33
1190	0.35
1191	0.37
1192	0.38
1193	0.35
1194	0.37
1195	0.37
1196	0.4
1197	0.36
1198	0.33
1199	0.32
1200	0.31
1201	0.33
1202	0.33
1203	0.36
1204	0.38
1205	0.46
1206	0.49
1207	0.53
1208	0.52
1209	0.51

A0A316YYX5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer