Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316ZEF3

Protein Details
Accession A0A316ZEF3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1184-1207LPFQNVRRLRNPWRDNRQVKVSRDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
635-639RKRRE
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50882  YTH  
CDD cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MADSRAPEPGTPSPGDSRSGGGGQSAARGPPPNGYAPVEQHAAYPSGPATYGWGSDRGPPAQTQRAWQQQQQHQAPSSQPAPPGANPPHTYAGQPYHLVEVRSVPYSAPGVPLAAPSVPYYAPYPDSSVPTTSARGQQRMDQERMMMQQQQQQQPQPHPQSQQYPPQQLPREQQQQQAQPRMTHQQQPHPNQIYRSQSQHSHPGAPPSRQASYDAAGAYPVTYFPYGSPGVAVETQPSTPRSSQGSISNVHSPASSMGGSSAPTEWSGYYPAYSAAPHGYAPYFPPSSPAPTYAIVAPPHMQQQPYAQHGQAPQAYAAAGAPATHAWAPAYYVAQPGPPPPAGALMQAAPSGQQMPARGGFSGPGRGAPAPRGHQQYGPHMPTARPAPAIPGGVSGMAQRPRPDLGRSQPSASRSRTASSGGNSATGAPAPLNNPLPPRPPAAPQGEGSATTQQTVPSGSVAAVPGSPHSSQSHPRGVYRPLYHPQQGPRSEHVLWVGNVPSDATVEELWNVFAQLPPDDAEPEHAKAGAAAEEGPDDAGGDTGSVSARTDDESDHGVLSIFVISRSNCAFVNYASPRHLERAVKFFHDKPVRPEDTRCPKMVCRVRKKEDESQAGVQGQRGRGIHVALVKEHERKRREAARAQKADSGGSSGSAGHATRQPSDARSKGSVSSQSPRRSGSDETARASPSTPSVEPAAPKPVASPASMLSLSLSPTATTGSSGDRPPLAHDSSGSISIASTSSSLLRHPVFRERFFILKSLRAEDLDRSVQTGLWATQPHNEAVLDQAYRNSETVFLVFSANQSGCFYGYARMTSLIRTQTTPSSSTQAKRDSNGSNGSNGTPKSPKSIVQSPSPAQSPSSPAGYSSQKRPSVTVTKPSTIDEGDESSSTSTRSTSRSLTPEQALEHLAKHGATTSYMLSPAERDRDPMASPQPMTPLDEDRQFPSATTSPDDREVFAATWPPSERQCQEADQEQQHRNTLSPRLLRAATAAEMGAPPGTPTRSNSSLSSRSSLAPIVSGASEISDQELASARPPSPSSSPRRPSVAHADADGIKRLDMAHPVGTPTGVVMSASLGPNDSVSVSHAQRADQISLRAVIHNLRLEERESQRKAAELEAHLNGLSVVSGDGSSGVYEPSRKPSSEPRTQGSGETDNTTASVDTPRAASSDSWGQPFRIEWLETRPLPFQNVRRLRNPWRDNRQVKVSRDGTELEPSVGRQLLEEWSKIGTDEANAAARAPRQNSDDTDDGEEDAPPPRRRGSRQSGGARS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.37
3 0.33
4 0.3
5 0.28
6 0.28
7 0.24
8 0.19
9 0.19
10 0.16
11 0.19
12 0.19
13 0.16
14 0.18
15 0.21
16 0.21
17 0.25
18 0.28
19 0.28
20 0.3
21 0.33
22 0.34
23 0.35
24 0.38
25 0.35
26 0.31
27 0.29
28 0.27
29 0.25
30 0.21
31 0.18
32 0.15
33 0.13
34 0.13
35 0.12
36 0.14
37 0.14
38 0.16
39 0.17
40 0.19
41 0.19
42 0.25
43 0.3
44 0.28
45 0.29
46 0.3
47 0.36
48 0.41
49 0.42
50 0.42
51 0.46
52 0.54
53 0.58
54 0.59
55 0.62
56 0.6
57 0.69
58 0.7
59 0.67
60 0.59
61 0.57
62 0.55
63 0.51
64 0.48
65 0.4
66 0.36
67 0.34
68 0.35
69 0.34
70 0.4
71 0.39
72 0.43
73 0.42
74 0.45
75 0.46
76 0.42
77 0.41
78 0.38
79 0.38
80 0.34
81 0.33
82 0.29
83 0.31
84 0.33
85 0.32
86 0.28
87 0.27
88 0.26
89 0.26
90 0.25
91 0.19
92 0.19
93 0.2
94 0.2
95 0.17
96 0.15
97 0.14
98 0.14
99 0.15
100 0.14
101 0.12
102 0.13
103 0.12
104 0.14
105 0.12
106 0.14
107 0.15
108 0.16
109 0.18
110 0.19
111 0.23
112 0.23
113 0.27
114 0.27
115 0.27
116 0.28
117 0.27
118 0.29
119 0.28
120 0.33
121 0.35
122 0.38
123 0.38
124 0.41
125 0.49
126 0.53
127 0.53
128 0.47
129 0.42
130 0.41
131 0.43
132 0.4
133 0.35
134 0.31
135 0.34
136 0.41
137 0.47
138 0.49
139 0.53
140 0.56
141 0.58
142 0.65
143 0.66
144 0.64
145 0.61
146 0.62
147 0.64
148 0.63
149 0.66
150 0.65
151 0.64
152 0.62
153 0.66
154 0.66
155 0.64
156 0.64
157 0.64
158 0.65
159 0.61
160 0.65
161 0.64
162 0.67
163 0.7
164 0.72
165 0.65
166 0.58
167 0.59
168 0.6
169 0.57
170 0.56
171 0.53
172 0.54
173 0.6
174 0.65
175 0.71
176 0.69
177 0.67
178 0.63
179 0.64
180 0.62
181 0.57
182 0.55
183 0.49
184 0.48
185 0.49
186 0.55
187 0.51
188 0.49
189 0.47
190 0.52
191 0.53
192 0.5
193 0.51
194 0.46
195 0.45
196 0.39
197 0.4
198 0.33
199 0.3
200 0.3
201 0.24
202 0.19
203 0.17
204 0.16
205 0.13
206 0.1
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.11
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.12
221 0.13
222 0.14
223 0.16
224 0.17
225 0.19
226 0.19
227 0.22
228 0.25
229 0.26
230 0.28
231 0.31
232 0.33
233 0.32
234 0.35
235 0.37
236 0.32
237 0.3
238 0.27
239 0.22
240 0.19
241 0.18
242 0.15
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.09
253 0.1
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.12
266 0.12
267 0.11
268 0.13
269 0.17
270 0.17
271 0.16
272 0.19
273 0.2
274 0.24
275 0.25
276 0.25
277 0.23
278 0.22
279 0.24
280 0.23
281 0.25
282 0.2
283 0.2
284 0.19
285 0.18
286 0.22
287 0.23
288 0.22
289 0.19
290 0.25
291 0.29
292 0.32
293 0.33
294 0.28
295 0.29
296 0.3
297 0.35
298 0.29
299 0.25
300 0.2
301 0.18
302 0.18
303 0.14
304 0.13
305 0.08
306 0.06
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.1
318 0.09
319 0.1
320 0.1
321 0.11
322 0.12
323 0.12
324 0.15
325 0.14
326 0.14
327 0.13
328 0.15
329 0.14
330 0.15
331 0.14
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.1
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.09
341 0.09
342 0.12
343 0.14
344 0.15
345 0.14
346 0.13
347 0.15
348 0.14
349 0.17
350 0.15
351 0.13
352 0.15
353 0.16
354 0.16
355 0.18
356 0.22
357 0.22
358 0.28
359 0.33
360 0.33
361 0.36
362 0.38
363 0.43
364 0.46
365 0.44
366 0.4
367 0.36
368 0.35
369 0.35
370 0.35
371 0.28
372 0.21
373 0.19
374 0.2
375 0.21
376 0.22
377 0.18
378 0.15
379 0.14
380 0.12
381 0.13
382 0.1
383 0.12
384 0.14
385 0.16
386 0.16
387 0.17
388 0.2
389 0.22
390 0.24
391 0.26
392 0.31
393 0.38
394 0.39
395 0.4
396 0.41
397 0.43
398 0.46
399 0.42
400 0.38
401 0.31
402 0.31
403 0.29
404 0.29
405 0.28
406 0.23
407 0.24
408 0.21
409 0.2
410 0.18
411 0.17
412 0.14
413 0.11
414 0.1
415 0.06
416 0.07
417 0.07
418 0.1
419 0.12
420 0.13
421 0.16
422 0.19
423 0.22
424 0.23
425 0.26
426 0.24
427 0.26
428 0.31
429 0.32
430 0.32
431 0.29
432 0.3
433 0.27
434 0.26
435 0.24
436 0.22
437 0.17
438 0.15
439 0.15
440 0.12
441 0.12
442 0.12
443 0.11
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.06
452 0.07
453 0.09
454 0.09
455 0.1
456 0.12
457 0.15
458 0.21
459 0.26
460 0.32
461 0.31
462 0.33
463 0.35
464 0.37
465 0.41
466 0.39
467 0.39
468 0.37
469 0.4
470 0.41
471 0.42
472 0.44
473 0.46
474 0.47
475 0.45
476 0.43
477 0.44
478 0.4
479 0.37
480 0.33
481 0.28
482 0.23
483 0.21
484 0.18
485 0.13
486 0.13
487 0.11
488 0.09
489 0.07
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.07
497 0.06
498 0.06
499 0.05
500 0.06
501 0.07
502 0.06
503 0.07
504 0.07
505 0.08
506 0.08
507 0.08
508 0.11
509 0.13
510 0.13
511 0.13
512 0.12
513 0.11
514 0.11
515 0.11
516 0.08
517 0.06
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.04
524 0.04
525 0.03
526 0.03
527 0.03
528 0.03
529 0.03
530 0.03
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.05
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.08
540 0.09
541 0.1
542 0.09
543 0.09
544 0.08
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.05
549 0.04
550 0.06
551 0.06
552 0.08
553 0.08
554 0.09
555 0.09
556 0.1
557 0.11
558 0.1
559 0.17
560 0.17
561 0.19
562 0.19
563 0.2
564 0.2
565 0.21
566 0.25
567 0.21
568 0.21
569 0.25
570 0.25
571 0.27
572 0.29
573 0.28
574 0.34
575 0.37
576 0.37
577 0.36
578 0.44
579 0.45
580 0.43
581 0.45
582 0.46
583 0.5
584 0.51
585 0.47
586 0.41
587 0.38
588 0.46
589 0.51
590 0.51
591 0.51
592 0.58
593 0.62
594 0.68
595 0.72
596 0.71
597 0.72
598 0.67
599 0.6
600 0.52
601 0.48
602 0.42
603 0.36
604 0.29
605 0.24
606 0.18
607 0.18
608 0.16
609 0.15
610 0.14
611 0.14
612 0.14
613 0.14
614 0.14
615 0.11
616 0.14
617 0.15
618 0.21
619 0.25
620 0.31
621 0.31
622 0.33
623 0.4
624 0.45
625 0.49
626 0.5
627 0.55
628 0.58
629 0.6
630 0.59
631 0.55
632 0.47
633 0.41
634 0.34
635 0.25
636 0.14
637 0.1
638 0.09
639 0.06
640 0.06
641 0.07
642 0.06
643 0.06
644 0.09
645 0.1
646 0.11
647 0.13
648 0.14
649 0.15
650 0.21
651 0.22
652 0.22
653 0.22
654 0.23
655 0.22
656 0.23
657 0.25
658 0.23
659 0.28
660 0.33
661 0.35
662 0.36
663 0.36
664 0.35
665 0.34
666 0.33
667 0.31
668 0.32
669 0.31
670 0.31
671 0.31
672 0.3
673 0.27
674 0.26
675 0.2
676 0.14
677 0.15
678 0.12
679 0.12
680 0.14
681 0.15
682 0.15
683 0.16
684 0.19
685 0.16
686 0.16
687 0.15
688 0.16
689 0.16
690 0.16
691 0.15
692 0.11
693 0.14
694 0.14
695 0.13
696 0.1
697 0.09
698 0.1
699 0.09
700 0.09
701 0.06
702 0.06
703 0.07
704 0.06
705 0.06
706 0.06
707 0.08
708 0.1
709 0.11
710 0.12
711 0.12
712 0.12
713 0.14
714 0.17
715 0.16
716 0.14
717 0.14
718 0.16
719 0.16
720 0.16
721 0.14
722 0.09
723 0.08
724 0.08
725 0.08
726 0.06
727 0.05
728 0.05
729 0.06
730 0.07
731 0.07
732 0.1
733 0.11
734 0.13
735 0.15
736 0.24
737 0.28
738 0.29
739 0.32
740 0.31
741 0.33
742 0.31
743 0.34
744 0.26
745 0.27
746 0.27
747 0.26
748 0.24
749 0.22
750 0.23
751 0.19
752 0.22
753 0.19
754 0.17
755 0.16
756 0.15
757 0.14
758 0.13
759 0.13
760 0.1
761 0.1
762 0.12
763 0.11
764 0.15
765 0.16
766 0.16
767 0.16
768 0.15
769 0.12
770 0.13
771 0.14
772 0.11
773 0.09
774 0.11
775 0.11
776 0.12
777 0.12
778 0.11
779 0.09
780 0.09
781 0.09
782 0.08
783 0.08
784 0.08
785 0.08
786 0.08
787 0.1
788 0.09
789 0.09
790 0.09
791 0.09
792 0.09
793 0.09
794 0.1
795 0.1
796 0.11
797 0.11
798 0.11
799 0.13
800 0.12
801 0.13
802 0.17
803 0.17
804 0.17
805 0.18
806 0.19
807 0.21
808 0.23
809 0.23
810 0.21
811 0.22
812 0.25
813 0.27
814 0.31
815 0.35
816 0.35
817 0.34
818 0.38
819 0.36
820 0.37
821 0.4
822 0.35
823 0.29
824 0.29
825 0.28
826 0.26
827 0.24
828 0.24
829 0.2
830 0.2
831 0.24
832 0.24
833 0.27
834 0.3
835 0.37
836 0.37
837 0.39
838 0.44
839 0.4
840 0.42
841 0.4
842 0.33
843 0.27
844 0.25
845 0.24
846 0.2
847 0.21
848 0.17
849 0.17
850 0.2
851 0.26
852 0.28
853 0.3
854 0.37
855 0.38
856 0.39
857 0.4
858 0.42
859 0.44
860 0.45
861 0.47
862 0.44
863 0.43
864 0.43
865 0.43
866 0.39
867 0.3
868 0.28
869 0.19
870 0.17
871 0.15
872 0.14
873 0.13
874 0.12
875 0.12
876 0.11
877 0.1
878 0.09
879 0.1
880 0.13
881 0.15
882 0.18
883 0.22
884 0.27
885 0.3
886 0.33
887 0.33
888 0.32
889 0.3
890 0.28
891 0.25
892 0.21
893 0.18
894 0.14
895 0.13
896 0.11
897 0.1
898 0.11
899 0.09
900 0.09
901 0.1
902 0.11
903 0.11
904 0.12
905 0.12
906 0.1
907 0.12
908 0.14
909 0.17
910 0.16
911 0.18
912 0.19
913 0.21
914 0.22
915 0.25
916 0.26
917 0.26
918 0.27
919 0.25
920 0.27
921 0.26
922 0.26
923 0.23
924 0.24
925 0.23
926 0.26
927 0.26
928 0.25
929 0.27
930 0.24
931 0.22
932 0.23
933 0.23
934 0.21
935 0.23
936 0.24
937 0.23
938 0.29
939 0.29
940 0.25
941 0.23
942 0.23
943 0.2
944 0.18
945 0.21
946 0.16
947 0.18
948 0.19
949 0.2
950 0.21
951 0.26
952 0.26
953 0.24
954 0.27
955 0.26
956 0.29
957 0.33
958 0.37
959 0.38
960 0.45
961 0.46
962 0.46
963 0.46
964 0.43
965 0.38
966 0.36
967 0.35
968 0.35
969 0.34
970 0.34
971 0.35
972 0.35
973 0.33
974 0.3
975 0.26
976 0.2
977 0.16
978 0.14
979 0.1
980 0.1
981 0.1
982 0.09
983 0.06
984 0.06
985 0.08
986 0.1
987 0.11
988 0.14
989 0.21
990 0.24
991 0.27
992 0.29
993 0.34
994 0.38
995 0.4
996 0.39
997 0.34
998 0.32
999 0.31
1000 0.29
1001 0.22
1002 0.16
1003 0.14
1004 0.12
1005 0.1
1006 0.1
1007 0.08
1008 0.07
1009 0.07
1010 0.07
1011 0.08
1012 0.07
1013 0.07
1014 0.08
1015 0.1
1016 0.09
1017 0.11
1018 0.14
1019 0.12
1020 0.15
1021 0.16
1022 0.2
1023 0.24
1024 0.33
1025 0.39
1026 0.47
1027 0.53
1028 0.55
1029 0.59
1030 0.56
1031 0.56
1032 0.58
1033 0.55
1034 0.45
1035 0.4
1036 0.4
1037 0.38
1038 0.38
1039 0.35
1040 0.25
1041 0.19
1042 0.18
1043 0.18
1044 0.17
1045 0.16
1046 0.17
1047 0.17
1048 0.17
1049 0.18
1050 0.18
1051 0.17
1052 0.15
1053 0.12
1054 0.1
1055 0.07
1056 0.06
1057 0.05
1058 0.06
1059 0.09
1060 0.1
1061 0.09
1062 0.09
1063 0.09
1064 0.1
1065 0.1
1066 0.09
1067 0.07
1068 0.09
1069 0.14
1070 0.15
1071 0.19
1072 0.2
1073 0.19
1074 0.24
1075 0.27
1076 0.28
1077 0.26
1078 0.27
1079 0.25
1080 0.27
1081 0.27
1082 0.23
1083 0.22
1084 0.21
1085 0.22
1086 0.24
1087 0.24
1088 0.23
1089 0.24
1090 0.25
1091 0.32
1092 0.37
1093 0.42
1094 0.41
1095 0.43
1096 0.41
1097 0.43
1098 0.42
1099 0.39
1100 0.38
1101 0.31
1102 0.33
1103 0.31
1104 0.31
1105 0.27
1106 0.26
1107 0.21
1108 0.15
1109 0.11
1110 0.06
1111 0.05
1112 0.04
1113 0.04
1114 0.04
1115 0.05
1116 0.05
1117 0.06
1118 0.06
1119 0.07
1120 0.08
1121 0.11
1122 0.13
1123 0.21
1124 0.25
1125 0.26
1126 0.3
1127 0.4
1128 0.48
1129 0.54
1130 0.58
1131 0.55
1132 0.58
1133 0.58
1134 0.57
1135 0.52
1136 0.48
1137 0.4
1138 0.37
1139 0.32
1140 0.26
1141 0.25
1142 0.23
1143 0.17
1144 0.13
1145 0.14
1146 0.12
1147 0.12
1148 0.13
1149 0.13
1150 0.13
1151 0.15
1152 0.14
1153 0.16
1154 0.25
1155 0.26
1156 0.3
1157 0.31
1158 0.31
1159 0.3
1160 0.31
1161 0.3
1162 0.25
1163 0.24
1164 0.21
1165 0.27
1166 0.35
1167 0.35
1168 0.38
1169 0.38
1170 0.35
1171 0.4
1172 0.45
1173 0.44
1174 0.47
1175 0.56
1176 0.58
1177 0.61
1178 0.68
1179 0.73
1180 0.76
1181 0.79
1182 0.79
1183 0.79
1184 0.85
1185 0.84
1186 0.83
1187 0.84
1188 0.81
1189 0.76
1190 0.75
1191 0.7
1192 0.62
1193 0.58
1194 0.54
1195 0.46
1196 0.44
1197 0.4
1198 0.32
1199 0.28
1200 0.25
1201 0.26
1202 0.25
1203 0.21
1204 0.15
1205 0.16
1206 0.21
1207 0.23
1208 0.23
1209 0.21
1210 0.2
1211 0.2
1212 0.2
1213 0.19
1214 0.13
1215 0.11
1216 0.13
1217 0.14
1218 0.16
1219 0.16
1220 0.16
1221 0.18
1222 0.22
1223 0.27
1224 0.27
1225 0.29
1226 0.31
1227 0.36
1228 0.39
1229 0.43
1230 0.42
1231 0.39
1232 0.4
1233 0.36
1234 0.34
1235 0.3
1236 0.27
1237 0.21
1238 0.25
1239 0.31
1240 0.3
1241 0.32
1242 0.38
1243 0.46
1244 0.53
1245 0.62
1246 0.65
1247 0.67
1248 0.73