Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316ZJ25

Protein Details
Accession A0A316ZJ25    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
157-179EVPLAQSVRRRRRRRSASMDDDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-58PAKAPKAKSAKSRASAEGAAVKVPKAAKAARVAKSKPKAKA
165-171RRRRRRR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.833, cyto_mito 6.833, mito 6.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
Amino Acid Sequences MSGLLAQLDALSAAAAAPAKAPKAKSAKSRASAEGAAVKVPKAAKAARVAKSKPKAKASAPEEQADEATLLALQAQVRAFGLRPAAGVAALRSQLAACQAALREREAEAAASASAAGDTSMHSTWSAPGDVDEPGDVTMQLAREADTDAEREPSSDEVPLAQSVRRRRRRRSASMDDDAAVDDDTSSGADEPAEAAPGAVERTLDEALQRAVRGDAQLRRRILQLEPVAFDEVLSVATRAGVRFKKKDSVRDWLDAGICFYSAELTGARSRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.05
4 0.07
5 0.09
6 0.12
7 0.16
8 0.17
9 0.24
10 0.33
11 0.39
12 0.47
13 0.55
14 0.61
15 0.65
16 0.69
17 0.64
18 0.6
19 0.55
20 0.48
21 0.43
22 0.35
23 0.3
24 0.26
25 0.22
26 0.2
27 0.2
28 0.2
29 0.18
30 0.2
31 0.22
32 0.31
33 0.39
34 0.43
35 0.5
36 0.53
37 0.58
38 0.66
39 0.69
40 0.67
41 0.66
42 0.65
43 0.61
44 0.67
45 0.62
46 0.62
47 0.58
48 0.53
49 0.47
50 0.42
51 0.37
52 0.28
53 0.22
54 0.12
55 0.09
56 0.07
57 0.05
58 0.04
59 0.05
60 0.05
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.1
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.06
81 0.07
82 0.08
83 0.08
84 0.06
85 0.07
86 0.08
87 0.11
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.11
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.06
99 0.05
100 0.04
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.02
105 0.03
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.06
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.07
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.07
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.14
150 0.23
151 0.34
152 0.43
153 0.51
154 0.59
155 0.69
156 0.77
157 0.83
158 0.83
159 0.83
160 0.81
161 0.78
162 0.7
163 0.59
164 0.5
165 0.4
166 0.3
167 0.2
168 0.11
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.09
194 0.11
195 0.12
196 0.12
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.13
201 0.18
202 0.23
203 0.29
204 0.36
205 0.37
206 0.38
207 0.39
208 0.4
209 0.35
210 0.37
211 0.36
212 0.32
213 0.32
214 0.32
215 0.32
216 0.29
217 0.28
218 0.19
219 0.13
220 0.11
221 0.1
222 0.08
223 0.06
224 0.07
225 0.09
226 0.09
227 0.17
228 0.22
229 0.3
230 0.36
231 0.41
232 0.49
233 0.54
234 0.64
235 0.62
236 0.65
237 0.64
238 0.62
239 0.59
240 0.53
241 0.49
242 0.4
243 0.36
244 0.26
245 0.2
246 0.15
247 0.14
248 0.11
249 0.09
250 0.1
251 0.08
252 0.11