FuNGI

A0A316ZAM5

Protein Details

Accession

A0A316ZAM5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
339-424	SDASSRSDSRKRKRKSSSKSSRKRSKSSSSSKKRHKSSSRKSSHSSRKHHSSSRKRSRSRSSSKRHGSKKKHRHKSSSRGRAVKNA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
347-421	SRKRKRKSSSKSSRKRSKSSSSSKKRHKSSSRKSSHSSRKHHSSSRKRSRSRSSSKRHGSKKKHRHKSSSRGRAV

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MPSSSKRSATAGSSRSGSGMNADEKVVWQAAMSRPNNTLTDLKDIELDIDRQLAAINGLLRKSLFTASKVGGAMHYTAVSKGEASVMGSMEGDEGIIYSLIKDSGTEGIWTKQLKTRSNLHQSVMTRCLKNLEQKQLVKVVKSVKFPTRKIYMLYGLTPSVELSGGPWYTDNELDTAFIEQLCLMLYRHIANETWPSSDAQGNSLGPLYPASHTAKLPTAPACLRWLKARKVTDIPLGVEDVQSLLDVLVFDEKIEKIPCMPGGGDGGGGKKVYDADYRPGSVDGMETQSSSSSSSGSDSGSESGSDSGSDNGSESGSDSGRSSGSASSASGSESGSGSDASSRSDSRKRKRKSSSKSSRKRSKSSSSSKKRHKSSSRKSSHSSRKHHSSSRKRSRSRSSSKRHGSKKKHRHKSSSRGRAVKNAALGAVDGDDDDVEEMSTAAAGMYVYRALKPLAVHVGWSETPCGACPVFDFCEPGGPVNAEGCAYMAQWLEVQHAGDEPEPDSESDNEDAAGSGAEAGTKSRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.34
3	0.32
4	0.25
5	0.2
6	0.22
7	0.21
8	0.2
9	0.2
10	0.19
11	0.19
12	0.22
13	0.19
14	0.14
15	0.11
16	0.15
17	0.2
18	0.29
19	0.3
20	0.3
21	0.32
22	0.36
23	0.37
24	0.35
25	0.34
26	0.27
27	0.34
28	0.32
29	0.3
30	0.28
31	0.27
32	0.26
33	0.24
34	0.22
35	0.15
36	0.15
37	0.15
38	0.13
39	0.13
40	0.11
41	0.09
42	0.09
43	0.12
44	0.13
45	0.14
46	0.15
47	0.15
48	0.15
49	0.16
50	0.2
51	0.18
52	0.18
53	0.23
54	0.23
55	0.26
56	0.26
57	0.24
58	0.2
59	0.19
60	0.18
61	0.14
62	0.14
63	0.11
64	0.11
65	0.12
66	0.12
67	0.1
68	0.09
69	0.09
70	0.09
71	0.09
72	0.1
73	0.09
74	0.09
75	0.09
76	0.09
77	0.08
78	0.07
79	0.06
80	0.04
81	0.04
82	0.04
83	0.04
84	0.04
85	0.04
86	0.05
87	0.05
88	0.06
89	0.06
90	0.07
91	0.09
92	0.09
93	0.11
94	0.12
95	0.13
96	0.18
97	0.19
98	0.2
99	0.22
100	0.29
101	0.33
102	0.36
103	0.43
104	0.49
105	0.58
106	0.59
107	0.56
108	0.55
109	0.53
110	0.53
111	0.53
112	0.48
113	0.39
114	0.36
115	0.38
116	0.36
117	0.43
118	0.45
119	0.47
120	0.49
121	0.51
122	0.53
123	0.58
124	0.56
125	0.47
126	0.44
127	0.43
128	0.39
129	0.42
130	0.44
131	0.44
132	0.5
133	0.51
134	0.54
135	0.5
136	0.47
137	0.45
138	0.44
139	0.4
140	0.34
141	0.34
142	0.29
143	0.23
144	0.22
145	0.19
146	0.15
147	0.1
148	0.08
149	0.06
150	0.05
151	0.09
152	0.08
153	0.09
154	0.09
155	0.1
156	0.11
157	0.12
158	0.11
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.08
165	0.07
166	0.07
167	0.06
168	0.06
169	0.05
170	0.06
171	0.05
172	0.06
173	0.07
174	0.08
175	0.09
176	0.1
177	0.1
178	0.1
179	0.15
180	0.16
181	0.16
182	0.16
183	0.16
184	0.16
185	0.19
186	0.18
187	0.14
188	0.15
189	0.13
190	0.13
191	0.12
192	0.11
193	0.08
194	0.09
195	0.08
196	0.07
197	0.1
198	0.13
199	0.15
200	0.15
201	0.16
202	0.18
203	0.17
204	0.19
205	0.16
206	0.17
207	0.15
208	0.16
209	0.19
210	0.19
211	0.19
212	0.25
213	0.31
214	0.32
215	0.39
216	0.4
217	0.4
218	0.42
219	0.44
220	0.41
221	0.36
222	0.32
223	0.25
224	0.23
225	0.19
226	0.15
227	0.12
228	0.08
229	0.06
230	0.05
231	0.04
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.05
240	0.06
241	0.07
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.09
249	0.07
250	0.08
251	0.08
252	0.08
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.06
258	0.05
259	0.06
260	0.07
261	0.1
262	0.11
263	0.14
264	0.16
265	0.17
266	0.17
267	0.17
268	0.15
269	0.12
270	0.11
271	0.08
272	0.09
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.06
281	0.06
282	0.07
283	0.08
284	0.08
285	0.08
286	0.08
287	0.09
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.08
308	0.08
309	0.08
310	0.09
311	0.07
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.07
327	0.07
328	0.08
329	0.1
330	0.12
331	0.16
332	0.25
333	0.34
334	0.43
335	0.53
336	0.59
337	0.67
338	0.77
339	0.83
340	0.84
341	0.87
342	0.88
343	0.89
344	0.92
345	0.93
346	0.92
347	0.9
348	0.87
349	0.84
350	0.83
351	0.82
352	0.83
353	0.83
354	0.84
355	0.86
356	0.88
357	0.89
358	0.86
359	0.87
360	0.86
361	0.87
362	0.87
363	0.88
364	0.86
365	0.83
366	0.82
367	0.82
368	0.82
369	0.81
370	0.78
371	0.75
372	0.76
373	0.77
374	0.79
375	0.8
376	0.8
377	0.82
378	0.85
379	0.86
380	0.84
381	0.86
382	0.89
383	0.89
384	0.88
385	0.87
386	0.86
387	0.87
388	0.89
389	0.9
390	0.9
391	0.89
392	0.9
393	0.9
394	0.92
395	0.92
396	0.92
397	0.92
398	0.93
399	0.93
400	0.92
401	0.92
402	0.92
403	0.9
404	0.88
405	0.81
406	0.79
407	0.74
408	0.66
409	0.58
410	0.47
411	0.38
412	0.29
413	0.27
414	0.18
415	0.13
416	0.09
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.03
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.04
434	0.07
435	0.08
436	0.08
437	0.1
438	0.1
439	0.12
440	0.13
441	0.16
442	0.21
443	0.2
444	0.2
445	0.2
446	0.24
447	0.23
448	0.23
449	0.2
450	0.15
451	0.15
452	0.15
453	0.18
454	0.13
455	0.12
456	0.13
457	0.17
458	0.19
459	0.2
460	0.22
461	0.19
462	0.26
463	0.26
464	0.26
465	0.23
466	0.21
467	0.21
468	0.19
469	0.2
470	0.13
471	0.12
472	0.11
473	0.09
474	0.08
475	0.1
476	0.09
477	0.09
478	0.1
479	0.11
480	0.13
481	0.14
482	0.14
483	0.12
484	0.14
485	0.15
486	0.15
487	0.16
488	0.14
489	0.15
490	0.16
491	0.16
492	0.18
493	0.17
494	0.19
495	0.19
496	0.18
497	0.16
498	0.15
499	0.15
500	0.12
501	0.11
502	0.07
503	0.06
504	0.06
505	0.06
506	0.06

A0A316ZAM5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer