Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CF30

Protein Details
Accession A1CF30    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
365-385GVIGGKKQTRPKPPTPPRAHVHydrophilic
436-455IGGKKKEKFKTPTPRTSRSPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
357-381PAKKPKGLGVIGGKKQTRPKPPTPP
415-486PRAPAPAEQKKPAPKSHGLGVIGGKKKEKFKTPTPRTSRSPDPAPAPAPAPAQSLPKRPGKLGMIGGKARKL
550-576RADRKREELKRQLEAKSKAPAKKKRRF
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 10.5, cyto_mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG act:ACLA_091770  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSLKWRRLHLSRQGDLPPLLFRYSIAANGYELFMTDLTNIWTERMSRRDILRRADEDATTIDPSEDVEQFKVLLEKIGEALENKPGAAASLNPRSQVDSLKLIVSVKLPTPLRPLTWTAYLTKEPASSTSRHLLLPLLKAEAAWEPRQQTLLDQLNRKDWALGKLFEKIENMGIDLSTIFPGVTGHRRAHGETLLSQAARYIKGVAPFDEAEWLGEVAKSSPESSLAANMVAELTGFDETKHVDSLDPPPDGWWEKLTAEEPATLTPPGREQAQEPTEKKHAEHDTAMETDTDTGNDDLDGDDEFERQETPPRLKKPTDQERSSPAATASTTAGTADEATHGHKATSEDEPTKHESPAKKPKGLGVIGGKKQTRPKPPTPPRAHVASEPTGPATQPKHDDDATDSDLDQSPRAAPRAPAPAEQKKPAPKSHGLGVIGGKKKEKFKTPTPRTSRSPDPAPAPAPAPAQSLPKRPGKLGMIGGKARKLRDAAPETQTRAEADAQAQARSETPPQAKSESTEDLPVRGTVKKSASSSVAPPPEPPREETEHERADRKREELKRQLEAKSKAPAKKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.56
3 0.48
4 0.41
5 0.34
6 0.31
7 0.25
8 0.21
9 0.2
10 0.2
11 0.21
12 0.19
13 0.17
14 0.17
15 0.18
16 0.18
17 0.14
18 0.13
19 0.11
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.13
29 0.16
30 0.22
31 0.25
32 0.29
33 0.32
34 0.4
35 0.49
36 0.54
37 0.59
38 0.61
39 0.6
40 0.6
41 0.58
42 0.5
43 0.42
44 0.38
45 0.32
46 0.24
47 0.22
48 0.16
49 0.13
50 0.14
51 0.16
52 0.15
53 0.15
54 0.14
55 0.14
56 0.15
57 0.16
58 0.16
59 0.13
60 0.14
61 0.13
62 0.13
63 0.13
64 0.14
65 0.14
66 0.13
67 0.14
68 0.16
69 0.16
70 0.15
71 0.14
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.15
76 0.17
77 0.25
78 0.26
79 0.28
80 0.28
81 0.31
82 0.31
83 0.31
84 0.28
85 0.24
86 0.24
87 0.23
88 0.24
89 0.22
90 0.21
91 0.19
92 0.18
93 0.15
94 0.2
95 0.21
96 0.22
97 0.27
98 0.28
99 0.28
100 0.3
101 0.32
102 0.29
103 0.33
104 0.32
105 0.28
106 0.31
107 0.3
108 0.28
109 0.26
110 0.23
111 0.2
112 0.22
113 0.23
114 0.2
115 0.24
116 0.27
117 0.27
118 0.26
119 0.26
120 0.26
121 0.26
122 0.28
123 0.24
124 0.21
125 0.19
126 0.18
127 0.19
128 0.2
129 0.21
130 0.2
131 0.22
132 0.22
133 0.23
134 0.25
135 0.23
136 0.2
137 0.24
138 0.3
139 0.32
140 0.35
141 0.37
142 0.4
143 0.41
144 0.4
145 0.34
146 0.29
147 0.29
148 0.28
149 0.29
150 0.26
151 0.3
152 0.31
153 0.3
154 0.28
155 0.23
156 0.21
157 0.19
158 0.18
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.08
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.04
168 0.05
169 0.08
170 0.13
171 0.16
172 0.17
173 0.2
174 0.22
175 0.24
176 0.26
177 0.25
178 0.21
179 0.19
180 0.22
181 0.2
182 0.18
183 0.17
184 0.16
185 0.16
186 0.15
187 0.14
188 0.13
189 0.13
190 0.17
191 0.18
192 0.17
193 0.19
194 0.18
195 0.18
196 0.17
197 0.15
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.03
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.05
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.09
232 0.15
233 0.18
234 0.17
235 0.16
236 0.16
237 0.19
238 0.2
239 0.19
240 0.15
241 0.12
242 0.12
243 0.13
244 0.13
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.09
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.1
259 0.17
260 0.2
261 0.26
262 0.26
263 0.29
264 0.33
265 0.33
266 0.32
267 0.32
268 0.31
269 0.27
270 0.27
271 0.24
272 0.22
273 0.22
274 0.22
275 0.14
276 0.11
277 0.1
278 0.09
279 0.08
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.12
296 0.14
297 0.21
298 0.28
299 0.33
300 0.38
301 0.39
302 0.45
303 0.5
304 0.57
305 0.6
306 0.56
307 0.54
308 0.55
309 0.57
310 0.51
311 0.41
312 0.31
313 0.23
314 0.19
315 0.18
316 0.13
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.06
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.07
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.1
331 0.11
332 0.13
333 0.16
334 0.18
335 0.19
336 0.2
337 0.24
338 0.28
339 0.28
340 0.27
341 0.29
342 0.3
343 0.37
344 0.47
345 0.5
346 0.47
347 0.46
348 0.49
349 0.51
350 0.47
351 0.42
352 0.39
353 0.41
354 0.41
355 0.46
356 0.43
357 0.4
358 0.47
359 0.5
360 0.52
361 0.52
362 0.57
363 0.63
364 0.73
365 0.8
366 0.8
367 0.78
368 0.72
369 0.69
370 0.62
371 0.54
372 0.49
373 0.41
374 0.34
375 0.29
376 0.27
377 0.22
378 0.2
379 0.21
380 0.17
381 0.18
382 0.21
383 0.23
384 0.26
385 0.26
386 0.27
387 0.26
388 0.29
389 0.28
390 0.24
391 0.21
392 0.19
393 0.22
394 0.21
395 0.18
396 0.14
397 0.14
398 0.15
399 0.17
400 0.17
401 0.15
402 0.2
403 0.28
404 0.29
405 0.33
406 0.38
407 0.46
408 0.49
409 0.52
410 0.54
411 0.54
412 0.57
413 0.57
414 0.56
415 0.52
416 0.51
417 0.52
418 0.52
419 0.44
420 0.4
421 0.39
422 0.4
423 0.39
424 0.38
425 0.36
426 0.34
427 0.41
428 0.44
429 0.5
430 0.49
431 0.55
432 0.64
433 0.7
434 0.77
435 0.78
436 0.8
437 0.77
438 0.76
439 0.75
440 0.7
441 0.66
442 0.6
443 0.56
444 0.54
445 0.5
446 0.45
447 0.37
448 0.33
449 0.29
450 0.25
451 0.24
452 0.21
453 0.27
454 0.3
455 0.36
456 0.39
457 0.45
458 0.45
459 0.43
460 0.48
461 0.43
462 0.44
463 0.44
464 0.45
465 0.43
466 0.46
467 0.47
468 0.46
469 0.47
470 0.42
471 0.38
472 0.34
473 0.32
474 0.38
475 0.41
476 0.42
477 0.45
478 0.5
479 0.5
480 0.49
481 0.46
482 0.37
483 0.33
484 0.29
485 0.24
486 0.2
487 0.23
488 0.22
489 0.22
490 0.21
491 0.19
492 0.19
493 0.2
494 0.21
495 0.23
496 0.26
497 0.29
498 0.32
499 0.35
500 0.35
501 0.36
502 0.38
503 0.36
504 0.33
505 0.36
506 0.33
507 0.31
508 0.31
509 0.29
510 0.26
511 0.25
512 0.25
513 0.25
514 0.28
515 0.32
516 0.33
517 0.35
518 0.37
519 0.36
520 0.39
521 0.42
522 0.44
523 0.39
524 0.41
525 0.44
526 0.48
527 0.48
528 0.47
529 0.44
530 0.45
531 0.51
532 0.54
533 0.56
534 0.56
535 0.58
536 0.62
537 0.6
538 0.62
539 0.61
540 0.59
541 0.6
542 0.61
543 0.67
544 0.7
545 0.73
546 0.74
547 0.75
548 0.77
549 0.77
550 0.73
551 0.68
552 0.68
553 0.68
554 0.66
555 0.7
556 0.73