Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316ZEA3

Protein Details
Accession A0A316ZEA3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
120-140EASGSKPKPPKASKKGVSFDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
125-134KPKPPKASKK
183-197RKVRKAERAARRAAK
Subcellular Location(s) mito 11.5, cyto_mito 10.333, cyto 8, cyto_nucl 7.833, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034482  Mrd1_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12565  RRM1_MRD1  
cd12568  RRM3_MRD1  
Amino Acid Sequences MSRLIVKQLPAYLSEARLREHFAARGGAVTDVRLLRRPDGTSRGFAFVGFHSDADALEAQRYFDRTYIDTSKIAVEVARKIDDESLPDRRNKRSAPGADLPPSKRHAGESGVVASTPGAEASGSKPKPPKASKKGVSFDEFMSVMAPKAKRKTWQNEEGGEQAQLAAGDFAHGAAVADAAADRKVRKAERAARRAAKAEAAAAAAAAEEEQRIERDEPQPADAALNDEGMTDLDYMHRRMKRKLGGEEEKPALEDDDDAPKAFEQSGSEAGDDDVASSSDESDEDDDDAAAKREAERKRLEAEAAKEQESIDTIMTSGRLFVRNLPFGASEDELSEYFRRWGSVSQAHIPLDKKSKKAKGLAFVKFEEPANALAAFRAADGATFQGRLLHVMPAVDARPVPADAKAKTLKEQKKETLKADATKDFNWSMLYMSADAVASSVAERLGVDKSQILDANDDSGVSPAVKLALAETRVIQETKAFLSKEGLDLDVVQSGKRVARSDTTILVKNIPHGTTTEALRELFAKHGDVERVVMPPAGTLAIVEMPVAGEARVAFRSLAYKRIGNGVLYLEKAPVGLLKPKEEVELAAPSASTGAAAPPSKTEQMHGASAADNDDAEPGATLFVKNLSFATTDETLANFFAALPELAFARVQTRSDASKPGVRLSMGYGFAGFRSAAAAKAARQALDGHDLDGHSVSLAFAKRGQDEDKSKGKGAAAQTSSTKIVVKNLPFEANKKEVRALFAAYNVKSVRVPRKPAGGATAGARGFAFVEVATRRDAEAAMEALAHTHLLGRHLVLRYDKEDAQGVEGVRARTQRALPTGEETVARKAKLHLGEDDIRDAVARERAAADAADDDDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.31
3 0.3
4 0.3
5 0.33
6 0.33
7 0.34
8 0.33
9 0.3
10 0.31
11 0.29
12 0.29
13 0.25
14 0.23
15 0.19
16 0.17
17 0.19
18 0.19
19 0.21
20 0.25
21 0.27
22 0.28
23 0.32
24 0.36
25 0.38
26 0.43
27 0.45
28 0.45
29 0.45
30 0.45
31 0.41
32 0.37
33 0.33
34 0.25
35 0.27
36 0.22
37 0.19
38 0.16
39 0.17
40 0.16
41 0.17
42 0.18
43 0.12
44 0.14
45 0.14
46 0.15
47 0.17
48 0.2
49 0.18
50 0.18
51 0.21
52 0.2
53 0.27
54 0.3
55 0.31
56 0.29
57 0.29
58 0.29
59 0.26
60 0.24
61 0.19
62 0.18
63 0.19
64 0.22
65 0.23
66 0.22
67 0.23
68 0.26
69 0.26
70 0.27
71 0.28
72 0.34
73 0.37
74 0.44
75 0.48
76 0.5
77 0.57
78 0.55
79 0.57
80 0.57
81 0.58
82 0.59
83 0.62
84 0.62
85 0.62
86 0.66
87 0.62
88 0.57
89 0.55
90 0.49
91 0.42
92 0.38
93 0.34
94 0.31
95 0.3
96 0.29
97 0.28
98 0.26
99 0.24
100 0.22
101 0.18
102 0.14
103 0.11
104 0.07
105 0.05
106 0.04
107 0.06
108 0.1
109 0.2
110 0.2
111 0.26
112 0.32
113 0.37
114 0.48
115 0.57
116 0.64
117 0.63
118 0.74
119 0.77
120 0.8
121 0.82
122 0.78
123 0.73
124 0.64
125 0.55
126 0.47
127 0.39
128 0.29
129 0.23
130 0.18
131 0.14
132 0.17
133 0.19
134 0.21
135 0.27
136 0.31
137 0.38
138 0.48
139 0.58
140 0.61
141 0.69
142 0.69
143 0.67
144 0.66
145 0.62
146 0.53
147 0.43
148 0.33
149 0.23
150 0.17
151 0.13
152 0.1
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.04
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.11
171 0.18
172 0.2
173 0.26
174 0.35
175 0.44
176 0.53
177 0.6
178 0.66
179 0.67
180 0.68
181 0.66
182 0.57
183 0.5
184 0.4
185 0.33
186 0.25
187 0.19
188 0.15
189 0.11
190 0.09
191 0.06
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.03
196 0.04
197 0.05
198 0.06
199 0.09
200 0.11
201 0.15
202 0.19
203 0.25
204 0.26
205 0.26
206 0.27
207 0.24
208 0.23
209 0.19
210 0.18
211 0.12
212 0.12
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.09
218 0.06
219 0.06
220 0.08
221 0.11
222 0.13
223 0.2
224 0.24
225 0.27
226 0.32
227 0.4
228 0.45
229 0.5
230 0.56
231 0.59
232 0.62
233 0.63
234 0.64
235 0.57
236 0.5
237 0.43
238 0.35
239 0.26
240 0.18
241 0.15
242 0.11
243 0.15
244 0.15
245 0.15
246 0.15
247 0.14
248 0.15
249 0.14
250 0.13
251 0.08
252 0.1
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.13
258 0.12
259 0.11
260 0.09
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.06
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.09
280 0.17
281 0.2
282 0.25
283 0.28
284 0.3
285 0.33
286 0.34
287 0.35
288 0.32
289 0.33
290 0.35
291 0.34
292 0.32
293 0.29
294 0.27
295 0.25
296 0.21
297 0.18
298 0.09
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.09
307 0.1
308 0.15
309 0.19
310 0.21
311 0.21
312 0.21
313 0.2
314 0.19
315 0.21
316 0.17
317 0.12
318 0.11
319 0.12
320 0.11
321 0.12
322 0.11
323 0.1
324 0.11
325 0.1
326 0.11
327 0.1
328 0.12
329 0.15
330 0.2
331 0.22
332 0.25
333 0.28
334 0.27
335 0.3
336 0.29
337 0.27
338 0.32
339 0.32
340 0.34
341 0.39
342 0.45
343 0.48
344 0.54
345 0.54
346 0.54
347 0.6
348 0.6
349 0.55
350 0.5
351 0.46
352 0.4
353 0.36
354 0.27
355 0.19
356 0.14
357 0.11
358 0.1
359 0.09
360 0.08
361 0.08
362 0.07
363 0.06
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.07
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.08
388 0.09
389 0.13
390 0.13
391 0.18
392 0.21
393 0.21
394 0.26
395 0.35
396 0.38
397 0.41
398 0.46
399 0.48
400 0.54
401 0.58
402 0.55
403 0.53
404 0.5
405 0.48
406 0.46
407 0.43
408 0.36
409 0.32
410 0.33
411 0.25
412 0.23
413 0.19
414 0.15
415 0.11
416 0.09
417 0.09
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.05
423 0.05
424 0.04
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.04
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.07
437 0.09
438 0.1
439 0.09
440 0.1
441 0.1
442 0.11
443 0.09
444 0.09
445 0.08
446 0.07
447 0.06
448 0.05
449 0.05
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.06
456 0.07
457 0.08
458 0.08
459 0.09
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.08
464 0.09
465 0.1
466 0.13
467 0.12
468 0.11
469 0.13
470 0.13
471 0.14
472 0.14
473 0.13
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.09
479 0.08
480 0.07
481 0.08
482 0.09
483 0.11
484 0.12
485 0.11
486 0.13
487 0.17
488 0.18
489 0.21
490 0.23
491 0.24
492 0.24
493 0.24
494 0.22
495 0.22
496 0.23
497 0.19
498 0.16
499 0.14
500 0.16
501 0.16
502 0.17
503 0.15
504 0.13
505 0.13
506 0.13
507 0.13
508 0.12
509 0.11
510 0.11
511 0.1
512 0.1
513 0.12
514 0.12
515 0.12
516 0.12
517 0.12
518 0.12
519 0.11
520 0.11
521 0.09
522 0.08
523 0.08
524 0.07
525 0.05
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.03
533 0.04
534 0.04
535 0.03
536 0.03
537 0.04
538 0.05
539 0.06
540 0.07
541 0.06
542 0.07
543 0.13
544 0.13
545 0.19
546 0.19
547 0.2
548 0.2
549 0.25
550 0.26
551 0.2
552 0.21
553 0.18
554 0.17
555 0.17
556 0.16
557 0.12
558 0.11
559 0.1
560 0.09
561 0.08
562 0.08
563 0.13
564 0.14
565 0.17
566 0.18
567 0.19
568 0.2
569 0.19
570 0.18
571 0.15
572 0.15
573 0.13
574 0.12
575 0.11
576 0.1
577 0.1
578 0.08
579 0.06
580 0.04
581 0.04
582 0.07
583 0.08
584 0.09
585 0.11
586 0.14
587 0.16
588 0.16
589 0.17
590 0.19
591 0.21
592 0.22
593 0.2
594 0.18
595 0.16
596 0.16
597 0.16
598 0.11
599 0.08
600 0.07
601 0.07
602 0.06
603 0.05
604 0.05
605 0.04
606 0.05
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.07
611 0.07
612 0.08
613 0.08
614 0.09
615 0.09
616 0.1
617 0.14
618 0.13
619 0.14
620 0.14
621 0.14
622 0.13
623 0.12
624 0.12
625 0.07
626 0.06
627 0.05
628 0.06
629 0.05
630 0.05
631 0.05
632 0.06
633 0.06
634 0.06
635 0.06
636 0.08
637 0.1
638 0.11
639 0.13
640 0.15
641 0.18
642 0.2
643 0.25
644 0.25
645 0.29
646 0.29
647 0.3
648 0.3
649 0.26
650 0.25
651 0.24
652 0.25
653 0.21
654 0.2
655 0.17
656 0.15
657 0.15
658 0.15
659 0.11
660 0.07
661 0.08
662 0.08
663 0.08
664 0.11
665 0.12
666 0.12
667 0.18
668 0.19
669 0.17
670 0.18
671 0.18
672 0.19
673 0.24
674 0.23
675 0.18
676 0.18
677 0.18
678 0.18
679 0.17
680 0.14
681 0.08
682 0.08
683 0.07
684 0.09
685 0.1
686 0.1
687 0.13
688 0.15
689 0.17
690 0.2
691 0.23
692 0.27
693 0.32
694 0.38
695 0.43
696 0.44
697 0.44
698 0.44
699 0.42
700 0.39
701 0.38
702 0.39
703 0.33
704 0.32
705 0.33
706 0.33
707 0.33
708 0.29
709 0.27
710 0.2
711 0.24
712 0.28
713 0.29
714 0.32
715 0.34
716 0.39
717 0.39
718 0.41
719 0.41
720 0.42
721 0.42
722 0.39
723 0.42
724 0.37
725 0.39
726 0.37
727 0.34
728 0.28
729 0.31
730 0.35
731 0.29
732 0.33
733 0.29
734 0.29
735 0.28
736 0.34
737 0.38
738 0.4
739 0.47
740 0.47
741 0.55
742 0.56
743 0.55
744 0.53
745 0.45
746 0.39
747 0.34
748 0.36
749 0.27
750 0.25
751 0.22
752 0.18
753 0.15
754 0.14
755 0.12
756 0.06
757 0.1
758 0.11
759 0.13
760 0.14
761 0.14
762 0.14
763 0.15
764 0.15
765 0.12
766 0.13
767 0.13
768 0.11
769 0.11
770 0.1
771 0.1
772 0.1
773 0.09
774 0.06
775 0.08
776 0.09
777 0.1
778 0.11
779 0.12
780 0.18
781 0.2
782 0.24
783 0.26
784 0.29
785 0.3
786 0.35
787 0.34
788 0.31
789 0.33
790 0.3
791 0.29
792 0.28
793 0.25
794 0.25
795 0.28
796 0.27
797 0.26
798 0.28
799 0.27
800 0.29
801 0.32
802 0.33
803 0.35
804 0.37
805 0.36
806 0.39
807 0.39
808 0.35
809 0.35
810 0.31
811 0.34
812 0.35
813 0.34
814 0.3
815 0.31
816 0.37
817 0.4
818 0.41
819 0.36
820 0.39
821 0.45
822 0.45
823 0.45
824 0.38
825 0.31
826 0.28
827 0.25
828 0.22
829 0.2
830 0.18
831 0.17
832 0.18
833 0.18
834 0.19
835 0.18
836 0.15
837 0.12
838 0.13