Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316ZBJ1

Protein Details
Accession A0A316ZBJ1    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
377-398LDLPPPRRKRGRPRKHALLPDDBasic
507-531GASPRKAPKAKRVRKPGSSSKRKATBasic
552-610GAEPAALRPKKRSRPRRSDAEFDPNAPPKRRPGRPKGSKDKKPRRLAPPRPKKRAEGETBasic
647-666APPARKKKGAVKAAKLSSRKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
381-392PPRRKRGRPRKH
475-477PRK
510-530PRKAPKAKRVRKPGSSSKRKA
558-606LRPKKRSRPRRSDAEFDPNAPPKRRPGRPKGSKDKKPRRLAPPRPKKRA
649-666PARKKKGAVKAAKLSSRK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR018465  Scm3/HJURP  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0042393  F:histone binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10384  Scm3  
Amino Acid Sequences MEPSYGASGSRRSRGDASPSPSFRAAATAAGSSSGGGGGGGGGGGGSSSSGSSLLPPQRRRFFPTPFRIDGATPAPGASPYEPTPQPEPRRRLLFTSELGPPPAVNPDGTPNVEHLRYASTLRLKARWDDIFERFRDAHLIDQDEIDLGRPGPEDKGPRLVRDRGLLRALPQKRLDFGCFIKEEDLVFEGETLGDPSALAMGAEEAEAARSDEEESDDEEGGGRAVDKQLLSQYPEFQRGPSAPWQSVPLYEPAQLGNNDDDLRDFLDAEARRRTLRGDDSADEGDVVDFDDPQWQRDGAPPRRPRAGSQDGDAAEGALGYSSSEEMCEVIMTPAELDEFYREELIARRENVEDDFFLTRINTILPYDDVPGLAELLDLPPPRRKRGRPRKHALLPDDFSSAAKRGKKSVCGGPVMIRVDSLTGLPTPPRSGPEESCGDTSTSPAHPAVAADTSGSVSVSGQEQPAPVLQPKARPRKSVAKPRVAGPDDTLDEGAVADLDLQRELLGASPRKAPKAKRVRKPGSSSKRKATGAAQEGAGGEGDAAASTSLDGAEPAALRPKKRSRPRRSDAEFDPNAPPKRRPGRPKGSKDKKPRRLAPPRPKKRAEGETAPPAGEEAPATGDAAPSAGDAAPAADETAPPAGEDAAPPARKKKGAVKAAKLSSRKSATPAVDAASSAPAAPTTTPRNASPCGGEGGCNKTFCLKCGNTFSSPLAAMP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.51
3 0.51
4 0.53
5 0.56
6 0.57
7 0.57
8 0.54
9 0.49
10 0.4
11 0.35
12 0.29
13 0.22
14 0.21
15 0.17
16 0.16
17 0.16
18 0.16
19 0.12
20 0.11
21 0.08
22 0.06
23 0.05
24 0.05
25 0.04
26 0.04
27 0.03
28 0.03
29 0.02
30 0.02
31 0.02
32 0.02
33 0.03
34 0.03
35 0.03
36 0.04
37 0.05
38 0.05
39 0.07
40 0.15
41 0.23
42 0.32
43 0.4
44 0.49
45 0.58
46 0.62
47 0.7
48 0.7
49 0.72
50 0.74
51 0.76
52 0.75
53 0.7
54 0.68
55 0.61
56 0.54
57 0.49
58 0.41
59 0.33
60 0.25
61 0.21
62 0.19
63 0.17
64 0.19
65 0.16
66 0.17
67 0.17
68 0.24
69 0.25
70 0.29
71 0.35
72 0.42
73 0.51
74 0.56
75 0.59
76 0.61
77 0.67
78 0.66
79 0.64
80 0.61
81 0.56
82 0.49
83 0.47
84 0.45
85 0.39
86 0.38
87 0.33
88 0.27
89 0.22
90 0.23
91 0.2
92 0.15
93 0.14
94 0.18
95 0.22
96 0.23
97 0.23
98 0.22
99 0.25
100 0.25
101 0.24
102 0.2
103 0.19
104 0.19
105 0.2
106 0.23
107 0.24
108 0.29
109 0.32
110 0.35
111 0.35
112 0.37
113 0.43
114 0.4
115 0.4
116 0.4
117 0.44
118 0.47
119 0.45
120 0.47
121 0.4
122 0.37
123 0.35
124 0.3
125 0.28
126 0.26
127 0.29
128 0.24
129 0.24
130 0.23
131 0.2
132 0.19
133 0.14
134 0.11
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.11
140 0.15
141 0.19
142 0.21
143 0.31
144 0.32
145 0.36
146 0.42
147 0.44
148 0.42
149 0.45
150 0.45
151 0.4
152 0.42
153 0.37
154 0.35
155 0.4
156 0.41
157 0.4
158 0.42
159 0.39
160 0.39
161 0.41
162 0.4
163 0.35
164 0.33
165 0.33
166 0.29
167 0.29
168 0.26
169 0.24
170 0.21
171 0.18
172 0.17
173 0.12
174 0.1
175 0.09
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.04
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.08
201 0.08
202 0.1
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.08
209 0.07
210 0.06
211 0.05
212 0.06
213 0.08
214 0.07
215 0.08
216 0.12
217 0.13
218 0.17
219 0.17
220 0.22
221 0.23
222 0.29
223 0.28
224 0.25
225 0.27
226 0.24
227 0.27
228 0.28
229 0.29
230 0.24
231 0.25
232 0.28
233 0.25
234 0.25
235 0.23
236 0.19
237 0.16
238 0.17
239 0.17
240 0.14
241 0.17
242 0.16
243 0.16
244 0.14
245 0.14
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.1
250 0.1
251 0.08
252 0.08
253 0.06
254 0.12
255 0.14
256 0.16
257 0.19
258 0.2
259 0.2
260 0.2
261 0.22
262 0.21
263 0.24
264 0.25
265 0.26
266 0.26
267 0.29
268 0.29
269 0.27
270 0.22
271 0.17
272 0.12
273 0.08
274 0.08
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.13
282 0.12
283 0.13
284 0.19
285 0.29
286 0.31
287 0.4
288 0.45
289 0.48
290 0.54
291 0.54
292 0.51
293 0.5
294 0.51
295 0.42
296 0.38
297 0.4
298 0.34
299 0.33
300 0.31
301 0.21
302 0.12
303 0.11
304 0.09
305 0.03
306 0.03
307 0.02
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.03
322 0.04
323 0.04
324 0.03
325 0.04
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.09
332 0.12
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.15
337 0.16
338 0.17
339 0.15
340 0.12
341 0.11
342 0.11
343 0.1
344 0.1
345 0.09
346 0.08
347 0.07
348 0.07
349 0.05
350 0.05
351 0.06
352 0.06
353 0.07
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.07
358 0.07
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.03
363 0.04
364 0.06
365 0.06
366 0.08
367 0.15
368 0.17
369 0.23
370 0.3
371 0.38
372 0.48
373 0.59
374 0.68
375 0.73
376 0.8
377 0.84
378 0.85
379 0.84
380 0.78
381 0.73
382 0.64
383 0.55
384 0.47
385 0.37
386 0.29
387 0.23
388 0.2
389 0.17
390 0.19
391 0.18
392 0.24
393 0.26
394 0.31
395 0.34
396 0.37
397 0.37
398 0.35
399 0.35
400 0.31
401 0.33
402 0.3
403 0.26
404 0.19
405 0.15
406 0.14
407 0.13
408 0.1
409 0.06
410 0.05
411 0.06
412 0.07
413 0.08
414 0.09
415 0.09
416 0.12
417 0.15
418 0.18
419 0.19
420 0.23
421 0.25
422 0.25
423 0.26
424 0.24
425 0.21
426 0.17
427 0.17
428 0.15
429 0.12
430 0.12
431 0.11
432 0.1
433 0.1
434 0.1
435 0.1
436 0.08
437 0.08
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.05
444 0.04
445 0.05
446 0.06
447 0.07
448 0.07
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.09
453 0.1
454 0.11
455 0.14
456 0.15
457 0.23
458 0.32
459 0.43
460 0.45
461 0.47
462 0.52
463 0.58
464 0.67
465 0.7
466 0.7
467 0.69
468 0.67
469 0.68
470 0.71
471 0.62
472 0.54
473 0.45
474 0.4
475 0.31
476 0.3
477 0.26
478 0.16
479 0.14
480 0.13
481 0.1
482 0.05
483 0.04
484 0.04
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.06
492 0.07
493 0.13
494 0.15
495 0.17
496 0.24
497 0.26
498 0.32
499 0.37
500 0.39
501 0.44
502 0.53
503 0.61
504 0.64
505 0.73
506 0.77
507 0.8
508 0.84
509 0.85
510 0.85
511 0.86
512 0.83
513 0.8
514 0.79
515 0.71
516 0.65
517 0.59
518 0.57
519 0.51
520 0.46
521 0.38
522 0.31
523 0.3
524 0.28
525 0.22
526 0.12
527 0.07
528 0.05
529 0.04
530 0.03
531 0.03
532 0.03
533 0.03
534 0.03
535 0.03
536 0.03
537 0.03
538 0.04
539 0.04
540 0.05
541 0.06
542 0.06
543 0.15
544 0.18
545 0.2
546 0.29
547 0.38
548 0.48
549 0.59
550 0.69
551 0.72
552 0.8
553 0.87
554 0.89
555 0.86
556 0.83
557 0.79
558 0.78
559 0.68
560 0.61
561 0.6
562 0.57
563 0.57
564 0.53
565 0.48
566 0.48
567 0.57
568 0.63
569 0.66
570 0.69
571 0.73
572 0.81
573 0.89
574 0.9
575 0.91
576 0.92
577 0.93
578 0.94
579 0.93
580 0.92
581 0.91
582 0.91
583 0.91
584 0.92
585 0.92
586 0.92
587 0.93
588 0.92
589 0.88
590 0.84
591 0.82
592 0.8
593 0.76
594 0.73
595 0.69
596 0.68
597 0.64
598 0.57
599 0.47
600 0.39
601 0.31
602 0.23
603 0.16
604 0.08
605 0.08
606 0.09
607 0.1
608 0.09
609 0.09
610 0.08
611 0.08
612 0.07
613 0.05
614 0.06
615 0.05
616 0.05
617 0.05
618 0.06
619 0.06
620 0.06
621 0.07
622 0.06
623 0.06
624 0.07
625 0.09
626 0.09
627 0.08
628 0.09
629 0.09
630 0.09
631 0.1
632 0.13
633 0.19
634 0.23
635 0.25
636 0.31
637 0.36
638 0.38
639 0.43
640 0.47
641 0.5
642 0.57
643 0.65
644 0.68
645 0.72
646 0.77
647 0.81
648 0.75
649 0.69
650 0.67
651 0.63
652 0.55
653 0.5
654 0.5
655 0.45
656 0.44
657 0.42
658 0.35
659 0.31
660 0.29
661 0.26
662 0.2
663 0.17
664 0.13
665 0.11
666 0.09
667 0.1
668 0.11
669 0.15
670 0.2
671 0.26
672 0.29
673 0.32
674 0.36
675 0.38
676 0.4
677 0.38
678 0.34
679 0.33
680 0.3
681 0.31
682 0.3
683 0.34
684 0.35
685 0.32
686 0.3
687 0.34
688 0.35
689 0.33
690 0.39
691 0.35
692 0.38
693 0.47
694 0.52
695 0.46
696 0.49
697 0.49
698 0.43