FuNGI

A0A316Z141

Protein Details

Accession

A0A316Z141

Localization Confidence

Low

Confidence Score

5.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-36	SPLARVRPCSHHRCRPAPALA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 17, extr 4, cyto 3, nucl 1, pero 1, E.R. 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019321 Nucleoporin_Nup88 IPR037700 NUP88/NUP82
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF10168 Nup88

Amino Acid Sequences

MAPTQHSYSALAPSSSPLARVRPCSHHRCRPAPALAPTMAYPAAAMPGRSAFPHSPDPFAPDVAWLDGLAQHPIFHAGDTPPAPAAGRSSVRARSTLALRGTDLVAAVGSELRIASLAEAKHAAATGASPAERPHRVLAHALPPFPIASIAVNPANRLLAVVGSHQVAVLVLPRSAGSKAQADAAHSRGAARSVTCHAARVGAYYHDEHIGPHARVAKVLWHPWGKDGTSLLILTADGTLREYNVSGDLDEPAQTLALTPPPPPAVGRSDSRAAGPSRFGVGSGAAPGREWDPAVGLALGLSASGAGNSGDWSALTIYGLTRAGDVYGITPFLPAQAQVPAQYLSALSTYTAETSAAASSTSRTSSLRYLSSLLQQRESTAANARDATPAYLRGVTPASGMSLDAGLLAQEPGDDDDGDAEDGEIRVLISTPSGQMPARQGPFLLAPAPHELSEVREAKASDMTVLRVPASPVEDGDTAFAVLAIVSDDGRVDLGVLPSIFPRWGGGARTKARKMGRYGLTDDEDDESFDEDEEGELPAVLIYETIDLGLLADLTSSGLGDASSDPERLERLLGAHAPAFVPDLLYSDTVYVHHSLGAHALCIGTWARDLLDAMNTAADATPGRGLGADGEPQVEDRQGAVARVLHRAEPTQVVWAVKTPGFDAREQRHTPICGLCIISDVYLSYALLAVAAPCTPVALELNMRVPEELEAVAQDHAEHATRGLGDAGPAQGYVSLLGDGPPFAVPSLFRSGSTLPNAPRVIARGGEVEITPDTLRELGTTAERLRDQMRSVVSAGNVVQGRLDLQLREMSRQLERLADVRRRCRGSRADGGESLEARLARVHARQHALVARTDRVLQRLMDAHQPSLSMYERKWFDELAGLAEEIGLKGEADEQPTGLSAQADKLDYQLSHLRPSLMALQAKGHPSSGEGPPGALGSSQLQAMERMLAQEAALLLEARTKARALSAHVAQAAGH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.23
3	0.23
4	0.21
5	0.27
6	0.32
7	0.39
8	0.44
9	0.49
10	0.58
11	0.65
12	0.72
13	0.75
14	0.8
15	0.8
16	0.81
17	0.8
18	0.79
19	0.77
20	0.72
21	0.67
22	0.59
23	0.53
24	0.45
25	0.39
26	0.31
27	0.22
28	0.17
29	0.11
30	0.15
31	0.14
32	0.13
33	0.12
34	0.14
35	0.16
36	0.16
37	0.22
38	0.2
39	0.24
40	0.34
41	0.34
42	0.37
43	0.36
44	0.41
45	0.37
46	0.37
47	0.31
48	0.24
49	0.24
50	0.2
51	0.2
52	0.14
53	0.13
54	0.14
55	0.15
56	0.15
57	0.14
58	0.13
59	0.13
60	0.16
61	0.16
62	0.13
63	0.15
64	0.13
65	0.19
66	0.19
67	0.2
68	0.17
69	0.17
70	0.18
71	0.15
72	0.17
73	0.18
74	0.19
75	0.21
76	0.26
77	0.32
78	0.34
79	0.35
80	0.34
81	0.33
82	0.35
83	0.38
84	0.36
85	0.31
86	0.31
87	0.31
88	0.29
89	0.24
90	0.2
91	0.13
92	0.1
93	0.08
94	0.07
95	0.06
96	0.05
97	0.05
98	0.05
99	0.05
100	0.05
101	0.05
102	0.06
103	0.1
104	0.1
105	0.12
106	0.13
107	0.13
108	0.13
109	0.13
110	0.12
111	0.08
112	0.08
113	0.09
114	0.1
115	0.1
116	0.1
117	0.12
118	0.19
119	0.21
120	0.23
121	0.26
122	0.27
123	0.28
124	0.32
125	0.34
126	0.37
127	0.38
128	0.36
129	0.32
130	0.3
131	0.28
132	0.24
133	0.2
134	0.12
135	0.1
136	0.11
137	0.14
138	0.17
139	0.17
140	0.17
141	0.17
142	0.17
143	0.15
144	0.14
145	0.11
146	0.08
147	0.08
148	0.09
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.08
155	0.07
156	0.1
157	0.09
158	0.08
159	0.09
160	0.09
161	0.11
162	0.12
163	0.13
164	0.13
165	0.15
166	0.15
167	0.2
168	0.21
169	0.22
170	0.25
171	0.25
172	0.24
173	0.21
174	0.21
175	0.17
176	0.18
177	0.16
178	0.13
179	0.14
180	0.16
181	0.22
182	0.21
183	0.22
184	0.21
185	0.22
186	0.21
187	0.2
188	0.18
189	0.15
190	0.17
191	0.17
192	0.18
193	0.17
194	0.17
195	0.15
196	0.19
197	0.23
198	0.2
199	0.22
200	0.27
201	0.25
202	0.26
203	0.26
204	0.28
205	0.27
206	0.3
207	0.34
208	0.32
209	0.33
210	0.35
211	0.39
212	0.32
213	0.29
214	0.26
215	0.21
216	0.19
217	0.18
218	0.15
219	0.11
220	0.11
221	0.09
222	0.08
223	0.07
224	0.05
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.08
229	0.08
230	0.08
231	0.09
232	0.1
233	0.09
234	0.09
235	0.1
236	0.1
237	0.1
238	0.09
239	0.07
240	0.07
241	0.06
242	0.06
243	0.07
244	0.1
245	0.1
246	0.11
247	0.13
248	0.14
249	0.15
250	0.15
251	0.17
252	0.18
253	0.2
254	0.22
255	0.24
256	0.26
257	0.26
258	0.26
259	0.28
260	0.25
261	0.23
262	0.22
263	0.19
264	0.18
265	0.17
266	0.17
267	0.13
268	0.12
269	0.11
270	0.12
271	0.11
272	0.09
273	0.09
274	0.1
275	0.1
276	0.1
277	0.09
278	0.07
279	0.07
280	0.08
281	0.08
282	0.07
283	0.06
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.03
288	0.03
289	0.02
290	0.02
291	0.02
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.06
306	0.07
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.05
322	0.06
323	0.08
324	0.09
325	0.09
326	0.11
327	0.11
328	0.11
329	0.11
330	0.1
331	0.08
332	0.08
333	0.07
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.07
339	0.06
340	0.06
341	0.07
342	0.07
343	0.06
344	0.06
345	0.05
346	0.06
347	0.07
348	0.08
349	0.08
350	0.09
351	0.11
352	0.14
353	0.17
354	0.17
355	0.17
356	0.18
357	0.18
358	0.25
359	0.29
360	0.27
361	0.27
362	0.26
363	0.25
364	0.25
365	0.25
366	0.2
367	0.19
368	0.19
369	0.17
370	0.18
371	0.18
372	0.18
373	0.17
374	0.17
375	0.12
376	0.12
377	0.12
378	0.12
379	0.11
380	0.11
381	0.12
382	0.11
383	0.1
384	0.09
385	0.08
386	0.07
387	0.07
388	0.06
389	0.05
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.04
400	0.05
401	0.05
402	0.04
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.03
412	0.03
413	0.03
414	0.03
415	0.03
416	0.03
417	0.04
418	0.05
419	0.05
420	0.07
421	0.07
422	0.08
423	0.12
424	0.17
425	0.17
426	0.17
427	0.16
428	0.16
429	0.16
430	0.15
431	0.13
432	0.08
433	0.09
434	0.11
435	0.12
436	0.11
437	0.11
438	0.1
439	0.11
440	0.17
441	0.17
442	0.15
443	0.16
444	0.17
445	0.17
446	0.18
447	0.16
448	0.11
449	0.1
450	0.11
451	0.1
452	0.1
453	0.1
454	0.09
455	0.09
456	0.08
457	0.1
458	0.08
459	0.08
460	0.1
461	0.09
462	0.09
463	0.09
464	0.08
465	0.06
466	0.06
467	0.06
468	0.03
469	0.03
470	0.03
471	0.03
472	0.03
473	0.03
474	0.03
475	0.03
476	0.03
477	0.03
478	0.03
479	0.03
480	0.04
481	0.04
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.06
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.07
492	0.08
493	0.12
494	0.19
495	0.24
496	0.3
497	0.31
498	0.36
499	0.38
500	0.41
501	0.41
502	0.42
503	0.43
504	0.4
505	0.42
506	0.39
507	0.37
508	0.33
509	0.29
510	0.22
511	0.17
512	0.14
513	0.11
514	0.09
515	0.07
516	0.07
517	0.06
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.03
526	0.03
527	0.03
528	0.03
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.03
535	0.03
536	0.03
537	0.03
538	0.02
539	0.02
540	0.02
541	0.03
542	0.03
543	0.02
544	0.02
545	0.02
546	0.02
547	0.03
548	0.04
549	0.06
550	0.07
551	0.08
552	0.08
553	0.08
554	0.09
555	0.09
556	0.09
557	0.07
558	0.07
559	0.08
560	0.09
561	0.09
562	0.09
563	0.09
564	0.09
565	0.08
566	0.08
567	0.06
568	0.06
569	0.05
570	0.07
571	0.07
572	0.08
573	0.08
574	0.07
575	0.08
576	0.08
577	0.09
578	0.09
579	0.08
580	0.09
581	0.09
582	0.08
583	0.11
584	0.1
585	0.09
586	0.08
587	0.08
588	0.06
589	0.08
590	0.08
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.05
595	0.06
596	0.06
597	0.06
598	0.07
599	0.07
600	0.07
601	0.06
602	0.06
603	0.06
604	0.06
605	0.05
606	0.04
607	0.05
608	0.05
609	0.05
610	0.05
611	0.05
612	0.05
613	0.07
614	0.08
615	0.08
616	0.08
617	0.09
618	0.08
619	0.09
620	0.1
621	0.08
622	0.07
623	0.06
624	0.08
625	0.08
626	0.09
627	0.09
628	0.11
629	0.13
630	0.16
631	0.17
632	0.16
633	0.16
634	0.17
635	0.18
636	0.17
637	0.16
638	0.15
639	0.17
640	0.16
641	0.15
642	0.16
643	0.17
644	0.15
645	0.15
646	0.13
647	0.16
648	0.18
649	0.2
650	0.26
651	0.29
652	0.37
653	0.38
654	0.4
655	0.39
656	0.38
657	0.38
658	0.32
659	0.28
660	0.21
661	0.2
662	0.17
663	0.14
664	0.13
665	0.11
666	0.09
667	0.08
668	0.07
669	0.07
670	0.06
671	0.05
672	0.05
673	0.04
674	0.04
675	0.04
676	0.04
677	0.04
678	0.04
679	0.04
680	0.04
681	0.04
682	0.04
683	0.05
684	0.05
685	0.06
686	0.08
687	0.09
688	0.13
689	0.14
690	0.15
691	0.14
692	0.13
693	0.13
694	0.13
695	0.12
696	0.08
697	0.07
698	0.08
699	0.08
700	0.07
701	0.07
702	0.06
703	0.07
704	0.07
705	0.07
706	0.06
707	0.07
708	0.07
709	0.08
710	0.08
711	0.07
712	0.07
713	0.08
714	0.09
715	0.08
716	0.07
717	0.07
718	0.06
719	0.06
720	0.06
721	0.06
722	0.05
723	0.05
724	0.06
725	0.06
726	0.06
727	0.07
728	0.06
729	0.06
730	0.06
731	0.06
732	0.06
733	0.1
734	0.17
735	0.16
736	0.16
737	0.19
738	0.21
739	0.25
740	0.29
741	0.3
742	0.25
743	0.31
744	0.32
745	0.29
746	0.28
747	0.26
748	0.24
749	0.2
750	0.2
751	0.15
752	0.15
753	0.15
754	0.14
755	0.13
756	0.12
757	0.13
758	0.11
759	0.1
760	0.1
761	0.09
762	0.09
763	0.08
764	0.08
765	0.08
766	0.1
767	0.13
768	0.13
769	0.17
770	0.17
771	0.19
772	0.21
773	0.22
774	0.22
775	0.24
776	0.24
777	0.23
778	0.24
779	0.24
780	0.21
781	0.2
782	0.19
783	0.19
784	0.18
785	0.16
786	0.14
787	0.12
788	0.13
789	0.14
790	0.15
791	0.1
792	0.11
793	0.17
794	0.18
795	0.2
796	0.22
797	0.22
798	0.23
799	0.26
800	0.25
801	0.22
802	0.23
803	0.25
804	0.31
805	0.35
806	0.41
807	0.46
808	0.53
809	0.57
810	0.57
811	0.6
812	0.61
813	0.61
814	0.64
815	0.63
816	0.6
817	0.56
818	0.57
819	0.52
820	0.44
821	0.37
822	0.29
823	0.22
824	0.17
825	0.16
826	0.15
827	0.15
828	0.19
829	0.24
830	0.28
831	0.32
832	0.32
833	0.36
834	0.4
835	0.38
836	0.38
837	0.37
838	0.33
839	0.3
840	0.34
841	0.31
842	0.29
843	0.29
844	0.25
845	0.25
846	0.26
847	0.27
848	0.31
849	0.31
850	0.29
851	0.27
852	0.27
853	0.23
854	0.23
855	0.25
856	0.2
857	0.18
858	0.25
859	0.27
860	0.29
861	0.31
862	0.27
863	0.24
864	0.27
865	0.27
866	0.22
867	0.21
868	0.18
869	0.16
870	0.16
871	0.15
872	0.09
873	0.09
874	0.06
875	0.05
876	0.05
877	0.09
878	0.11
879	0.14
880	0.14
881	0.13
882	0.14
883	0.14
884	0.15
885	0.12
886	0.11
887	0.09
888	0.11
889	0.14
890	0.15
891	0.15
892	0.16
893	0.18
894	0.17
895	0.21
896	0.26
897	0.25
898	0.29
899	0.3
900	0.3
901	0.27
902	0.3
903	0.31
904	0.3
905	0.3
906	0.26
907	0.29
908	0.32
909	0.35
910	0.33
911	0.28
912	0.22
913	0.23
914	0.26
915	0.26
916	0.27
917	0.23
918	0.23
919	0.23
920	0.23
921	0.2
922	0.15
923	0.14
924	0.1
925	0.11
926	0.12
927	0.12
928	0.12
929	0.13
930	0.13
931	0.14
932	0.12
933	0.12
934	0.13
935	0.12
936	0.11
937	0.12
938	0.11
939	0.1
940	0.1
941	0.09
942	0.07
943	0.12
944	0.13
945	0.13
946	0.15
947	0.15
948	0.15
949	0.18
950	0.21
951	0.24
952	0.3
953	0.32
954	0.35
955	0.36

A0A316Z141

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer