Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316ZHF4

Protein Details
Accession A0A316ZHF4    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MLLRHTRAAARVRRRRRRCEPAELLSGGHydrophilic
353-373AASGSSKKKKTQQQQLLLEEGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-17ARVRRRRR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026699  Exosome_RNA_bind1/RRP40/RRP4  
IPR004088  KH_dom_type_1  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR041054  Rrp40_N  
IPR037319  Rrp40_S1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000178  C:exosome (RNase complex)  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0010468  P:regulation of gene expression  
Pfam View protein in Pfam  
PF15985  KH_6  
PF18311  Rrp40_N  
CDD cd22526  KH-I_Rrp40  
cd05790  S1_Rrp40  
Amino Acid Sequences MLLRHTRAAARVRRRRRRCEPAELLSGGAQTAAEQAGSAECESSGRRRGAGAAAAAISARASLDFVASTALCLSLVFRSTPLALSSHCSACLATSHPSSTGPGAPLLHARPAAPMSALVLPGDRLPLSSAAHVKLGPGLVHASASASSSSASAATVLHITRAGLLARTQAGKGAQGRWVETNARRYIPSPGDSIVGQVTHRSADGYLLSLGSGCAHSATLPALAFEGATKRQRPNLRVGALVYARIAAAERHAEPEATCVDAETGRAEGFGELKVDEEGCSMCFKTTLGLARSLLRPSHPLLPALATHFPFEAAVGHNGLIWARAGEHRHLIAFGAVLRAADEHVPSASSAAAASGSSKKKKTQQQQLLLEEGATHGMDGATLAEKRGALSEAEVRRIVAMYT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.9
3 0.91
4 0.93
5 0.9
6 0.9
7 0.88
8 0.84
9 0.82
10 0.72
11 0.62
12 0.52
13 0.44
14 0.32
15 0.23
16 0.15
17 0.08
18 0.09
19 0.07
20 0.06
21 0.05
22 0.06
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.07
27 0.07
28 0.09
29 0.12
30 0.17
31 0.23
32 0.23
33 0.23
34 0.24
35 0.26
36 0.28
37 0.29
38 0.24
39 0.19
40 0.18
41 0.17
42 0.16
43 0.13
44 0.1
45 0.06
46 0.06
47 0.04
48 0.04
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.06
53 0.08
54 0.07
55 0.08
56 0.07
57 0.07
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.07
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.11
66 0.11
67 0.13
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.15
72 0.19
73 0.18
74 0.18
75 0.17
76 0.16
77 0.15
78 0.16
79 0.15
80 0.15
81 0.16
82 0.17
83 0.17
84 0.18
85 0.19
86 0.19
87 0.18
88 0.15
89 0.15
90 0.15
91 0.15
92 0.18
93 0.18
94 0.18
95 0.16
96 0.16
97 0.16
98 0.16
99 0.15
100 0.12
101 0.11
102 0.1
103 0.11
104 0.11
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.1
110 0.07
111 0.06
112 0.07
113 0.09
114 0.1
115 0.13
116 0.15
117 0.15
118 0.16
119 0.15
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.11
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.06
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.07
152 0.08
153 0.09
154 0.1
155 0.09
156 0.1
157 0.1
158 0.12
159 0.14
160 0.14
161 0.17
162 0.17
163 0.18
164 0.18
165 0.2
166 0.21
167 0.23
168 0.28
169 0.26
170 0.27
171 0.26
172 0.26
173 0.3
174 0.28
175 0.26
176 0.21
177 0.19
178 0.19
179 0.18
180 0.18
181 0.13
182 0.1
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.07
214 0.09
215 0.13
216 0.16
217 0.18
218 0.25
219 0.31
220 0.33
221 0.4
222 0.44
223 0.42
224 0.4
225 0.39
226 0.37
227 0.31
228 0.29
229 0.2
230 0.13
231 0.11
232 0.09
233 0.09
234 0.05
235 0.06
236 0.08
237 0.08
238 0.11
239 0.11
240 0.12
241 0.11
242 0.13
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.11
274 0.16
275 0.16
276 0.18
277 0.19
278 0.22
279 0.25
280 0.26
281 0.24
282 0.2
283 0.21
284 0.21
285 0.27
286 0.25
287 0.24
288 0.23
289 0.23
290 0.23
291 0.24
292 0.25
293 0.19
294 0.18
295 0.18
296 0.17
297 0.15
298 0.14
299 0.12
300 0.1
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.09
308 0.07
309 0.06
310 0.07
311 0.11
312 0.13
313 0.16
314 0.19
315 0.2
316 0.2
317 0.2
318 0.19
319 0.16
320 0.14
321 0.12
322 0.1
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.08
336 0.07
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.05
341 0.08
342 0.15
343 0.23
344 0.29
345 0.33
346 0.39
347 0.48
348 0.58
349 0.66
350 0.7
351 0.74
352 0.78
353 0.83
354 0.81
355 0.76
356 0.66
357 0.55
358 0.44
359 0.33
360 0.24
361 0.15
362 0.1
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.12
372 0.12
373 0.13
374 0.15
375 0.15
376 0.12
377 0.15
378 0.23
379 0.25
380 0.29
381 0.29
382 0.27
383 0.27