Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316U5S1

Protein Details
Accession A0A316U5S1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
192-212MGEERRKRPTIGKDRRTRGEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
196-208RRKRPTIGKDRRT
Subcellular Location(s) nucl 8.5, cyto_nucl 8.5, cyto 7.5, mito 6, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007667  Hypoxia_induced_domain  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04588  HIG_1_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51503  HIG1  
Amino Acid Sequences MASKVVFPKEEPYRPPGWEPEEPAKSKFFRKMREQPLVPLGSLLTCGALVIASHQLRVGNRKAFNRALRWRIYFQGLTAIAAVGGVYYYGLAKPAIPPETPLLGPDGQPLDPTAAAAAAAASSPYSNVATIPGRPPTNLQVNKQGDREAQSRREWEERMREAQKREAEAEDQRRLEAALLKGTGVAPQNGEMGEERRKRPTIGKDRRTRGEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.52
3 0.5
4 0.48
5 0.46
6 0.49
7 0.52
8 0.55
9 0.54
10 0.52
11 0.51
12 0.47
13 0.49
14 0.52
15 0.49
16 0.5
17 0.58
18 0.66
19 0.7
20 0.77
21 0.72
22 0.68
23 0.69
24 0.62
25 0.52
26 0.41
27 0.32
28 0.22
29 0.2
30 0.15
31 0.07
32 0.05
33 0.05
34 0.05
35 0.04
36 0.04
37 0.05
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.12
42 0.15
43 0.16
44 0.22
45 0.26
46 0.27
47 0.32
48 0.35
49 0.4
50 0.45
51 0.48
52 0.52
53 0.54
54 0.53
55 0.54
56 0.54
57 0.51
58 0.47
59 0.46
60 0.37
61 0.29
62 0.29
63 0.24
64 0.2
65 0.17
66 0.15
67 0.1
68 0.1
69 0.09
70 0.03
71 0.03
72 0.02
73 0.02
74 0.02
75 0.02
76 0.03
77 0.03
78 0.04
79 0.04
80 0.05
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.12
85 0.13
86 0.15
87 0.15
88 0.14
89 0.13
90 0.12
91 0.12
92 0.12
93 0.11
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.03
105 0.02
106 0.02
107 0.02
108 0.02
109 0.02
110 0.03
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.07
116 0.08
117 0.1
118 0.12
119 0.16
120 0.16
121 0.16
122 0.19
123 0.21
124 0.3
125 0.33
126 0.33
127 0.39
128 0.44
129 0.46
130 0.45
131 0.43
132 0.35
133 0.35
134 0.37
135 0.33
136 0.33
137 0.34
138 0.36
139 0.38
140 0.41
141 0.39
142 0.41
143 0.44
144 0.43
145 0.48
146 0.51
147 0.52
148 0.52
149 0.57
150 0.55
151 0.49
152 0.47
153 0.41
154 0.39
155 0.42
156 0.46
157 0.45
158 0.41
159 0.38
160 0.35
161 0.33
162 0.31
163 0.27
164 0.22
165 0.19
166 0.18
167 0.18
168 0.19
169 0.18
170 0.2
171 0.16
172 0.15
173 0.12
174 0.13
175 0.15
176 0.14
177 0.15
178 0.14
179 0.16
180 0.24
181 0.3
182 0.33
183 0.39
184 0.41
185 0.43
186 0.5
187 0.57
188 0.59
189 0.64
190 0.71
191 0.74
192 0.81