FuNGI

A0A316U272

Protein Details

Accession

A0A316U272

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
444-467	NESSEKKSKSQLKREQKARRNDES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
450-464	KSKSQLKREQKARRN
474-474	R

Subcellular Location(s)

cyto 10, cyto_mito 9.333, cyto_nucl 8.833, mito 7.5, nucl 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR019039 T4-Rnl1-like_N IPR015966 tRNA_lig_kin_fungi IPR015965 tRNA_lig_PDEase
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0003972 F:RNA ligase (ATP) activity GO:0006388 P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation
Pfam	View protein in Pfam PF09511 RNA_lig_T4_1 PF08302 tRNA_lig_CPD PF08303 tRNA_lig_kinase

Amino Acid Sequences

MSAAAGPSSSSAPSVDPQTSALLASLHSSAEKSDANPKPLIKSTLHRVPRQSAPGAPQAAHSASSSDDVYEVTSWKTVEFAYRKAAEVGIGKDLPTLARGLFTVKDGAQHATQEASSEASGRQGDRIVVRGYDKFFNVGEISWTKPASIERYSAPPYLLTFKENGCIIFISALSPTQLIVTSKHSLDSQQARQLQEQQNGHKQQADTVAAAEEADEIGGEQGGSSSSTKTSHAAKGEEWLERHLARVGRSKHELAEQLWSRGETAVAELCDDSFEEHVLAYPPEKSGLHLHGLNSNTVAFQTRPMEDVCAFATSWGFIPTRYISLDSMDEVKQFTDRVGTTGEWQGEAIEGFVVRTSMPKDTPQGQVEGAASPPYIPGQAWFYKVKFDEPYLMYRDWRELTKKMLTDKKKWENATHASTSSGQAGELSQLATKTEAVKLQDSSNESSEKKSKSQLKREQKARRNDESQRQAAARGAAPLPAPPKARSNRPETRLFIQWCHDRIYGSEDGKVKPNPAIFEGINVGKGIIRLRDMFLAYLKTEEGIKKIAGLGGPRGAVAAKLEGQGILTGTTSQSEQPAAEDDRSTRPYTHLLIVPIAIPGCGKTSLFLSLSHLYPQVVGHTQSDDVKSKKTAPTFLKNICNELSKHRVVLADRNNHLLKHRDEIVEAIKEWENRGGLTEEQHRAQKKANAGKSSKQAGVQNAQDSGSLEEGKASEKPRVKIVAMAWSLDMLPLNTLHRLMSDRILARGDNHQSLIADTKSATGSRSHETILWRFLQSLETLNSAEGKGEGDKGMGDANFDETITLQVESSQEEQLTKVCQELRRAAVAGIEKDLKQPSDEQVRAALAAAAGYRVSVKKVEEPAAVNVKKGQDTARAGPRYYGIAVELDLRSVMGKFLKLAAQRTSTEVLQRARDMFAFLRDSDRVVLRPHITLVHSSALRALSPEEEAQLDDSKRAERSTAKSKWDRYSALSRLNEPVDFDITLGHLVFDELVMAFSISNVHPTQPASKHLASEEFWKLQGGKGGAGEGDWRPHVTVGTRDESVRPFEANRVMREAEDDQSRRGELGLIEAGETQITLRGRLMGMS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.19
3	0.18
4	0.2
5	0.21
6	0.2
7	0.19
8	0.17
9	0.12
10	0.11
11	0.12
12	0.12
13	0.1
14	0.1
15	0.1
16	0.1
17	0.13
18	0.15
19	0.15
20	0.25
21	0.31
22	0.35
23	0.39
24	0.41
25	0.44
26	0.48
27	0.5
28	0.44
29	0.45
30	0.49
31	0.55
32	0.6
33	0.59
34	0.6
35	0.62
36	0.65
37	0.65
38	0.59
39	0.54
40	0.51
41	0.53
42	0.5
43	0.44
44	0.37
45	0.35
46	0.32
47	0.29
48	0.24
49	0.17
50	0.16
51	0.18
52	0.16
53	0.12
54	0.12
55	0.11
56	0.12
57	0.12
58	0.12
59	0.11
60	0.13
61	0.13
62	0.12
63	0.13
64	0.12
65	0.2
66	0.23
67	0.24
68	0.3
69	0.32
70	0.33
71	0.34
72	0.33
73	0.28
74	0.28
75	0.27
76	0.25
77	0.24
78	0.22
79	0.22
80	0.22
81	0.19
82	0.15
83	0.15
84	0.09
85	0.1
86	0.1
87	0.12
88	0.12
89	0.13
90	0.16
91	0.15
92	0.18
93	0.19
94	0.22
95	0.21
96	0.21
97	0.21
98	0.19
99	0.18
100	0.16
101	0.15
102	0.13
103	0.12
104	0.12
105	0.11
106	0.13
107	0.16
108	0.15
109	0.16
110	0.16
111	0.19
112	0.19
113	0.23
114	0.21
115	0.21
116	0.24
117	0.26
118	0.28
119	0.29
120	0.28
121	0.26
122	0.25
123	0.25
124	0.22
125	0.19
126	0.2
127	0.19
128	0.21
129	0.22
130	0.22
131	0.2
132	0.21
133	0.24
134	0.24
135	0.25
136	0.24
137	0.24
138	0.3
139	0.34
140	0.33
141	0.31
142	0.26
143	0.26
144	0.29
145	0.27
146	0.23
147	0.22
148	0.21
149	0.24
150	0.24
151	0.22
152	0.17
153	0.17
154	0.15
155	0.14
156	0.13
157	0.1
158	0.09
159	0.09
160	0.09
161	0.08
162	0.08
163	0.07
164	0.09
165	0.1
166	0.11
167	0.16
168	0.19
169	0.19
170	0.21
171	0.21
172	0.2
173	0.27
174	0.33
175	0.33
176	0.38
177	0.42
178	0.43
179	0.46
180	0.54
181	0.53
182	0.53
183	0.53
184	0.52
185	0.57
186	0.58
187	0.57
188	0.51
189	0.44
190	0.4
191	0.41
192	0.36
193	0.26
194	0.23
195	0.22
196	0.18
197	0.17
198	0.14
199	0.08
200	0.05
201	0.05
202	0.04
203	0.03
204	0.04
205	0.04
206	0.03
207	0.03
208	0.03
209	0.04
210	0.06
211	0.06
212	0.07
213	0.09
214	0.1
215	0.12
216	0.14
217	0.19
218	0.22
219	0.25
220	0.26
221	0.25
222	0.3
223	0.33
224	0.33
225	0.3
226	0.27
227	0.27
228	0.25
229	0.26
230	0.24
231	0.23
232	0.23
233	0.31
234	0.33
235	0.36
236	0.41
237	0.41
238	0.38
239	0.4
240	0.4
241	0.32
242	0.37
243	0.33
244	0.3
245	0.3
246	0.28
247	0.24
248	0.21
249	0.2
250	0.11
251	0.11
252	0.11
253	0.1
254	0.1
255	0.09
256	0.09
257	0.09
258	0.09
259	0.08
260	0.06
261	0.07
262	0.06
263	0.06
264	0.07
265	0.08
266	0.09
267	0.08
268	0.09
269	0.09
270	0.11
271	0.11
272	0.13
273	0.16
274	0.18
275	0.21
276	0.22
277	0.22
278	0.25
279	0.26
280	0.24
281	0.2
282	0.17
283	0.14
284	0.12
285	0.13
286	0.09
287	0.11
288	0.14
289	0.14
290	0.15
291	0.16
292	0.18
293	0.17
294	0.18
295	0.15
296	0.13
297	0.13
298	0.11
299	0.11
300	0.09
301	0.09
302	0.1
303	0.09
304	0.08
305	0.11
306	0.12
307	0.14
308	0.14
309	0.15
310	0.13
311	0.15
312	0.16
313	0.14
314	0.15
315	0.14
316	0.14
317	0.13
318	0.12
319	0.11
320	0.11
321	0.1
322	0.11
323	0.1
324	0.11
325	0.13
326	0.13
327	0.15
328	0.19
329	0.19
330	0.15
331	0.15
332	0.13
333	0.11
334	0.11
335	0.08
336	0.05
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.06
343	0.07
344	0.1
345	0.11
346	0.13
347	0.17
348	0.21
349	0.27
350	0.26
351	0.26
352	0.24
353	0.24
354	0.23
355	0.2
356	0.16
357	0.11
358	0.09
359	0.08
360	0.08
361	0.06
362	0.06
363	0.05
364	0.06
365	0.11
366	0.12
367	0.16
368	0.18
369	0.18
370	0.22
371	0.23
372	0.25
373	0.22
374	0.22
375	0.24
376	0.23
377	0.27
378	0.27
379	0.27
380	0.25
381	0.24
382	0.26
383	0.22
384	0.23
385	0.23
386	0.21
387	0.25
388	0.29
389	0.31
390	0.35
391	0.42
392	0.45
393	0.49
394	0.58
395	0.62
396	0.64
397	0.64
398	0.61
399	0.59
400	0.59
401	0.56
402	0.48
403	0.39
404	0.34
405	0.33
406	0.3
407	0.24
408	0.17
409	0.11
410	0.09
411	0.09
412	0.08
413	0.07
414	0.07
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.07
419	0.07
420	0.08
421	0.09
422	0.11
423	0.12
424	0.14
425	0.15
426	0.15
427	0.18
428	0.19
429	0.2
430	0.2
431	0.21
432	0.2
433	0.22
434	0.27
435	0.27
436	0.26
437	0.32
438	0.39
439	0.45
440	0.56
441	0.63
442	0.68
443	0.75
444	0.83
445	0.86
446	0.84
447	0.86
448	0.83
449	0.79
450	0.76
451	0.73
452	0.73
453	0.7
454	0.64
455	0.56
456	0.48
457	0.42
458	0.36
459	0.3
460	0.21
461	0.16
462	0.13
463	0.12
464	0.11
465	0.13
466	0.13
467	0.15
468	0.16
469	0.16
470	0.23
471	0.26
472	0.34
473	0.37
474	0.45
475	0.49
476	0.52
477	0.57
478	0.52
479	0.52
480	0.51
481	0.48
482	0.41
483	0.38
484	0.38
485	0.33
486	0.33
487	0.3
488	0.23
489	0.22
490	0.26
491	0.25
492	0.21
493	0.24
494	0.22
495	0.23
496	0.27
497	0.27
498	0.22
499	0.2
500	0.21
501	0.18
502	0.17
503	0.19
504	0.15
505	0.15
506	0.16
507	0.14
508	0.13
509	0.11
510	0.1
511	0.07
512	0.08
513	0.08
514	0.07
515	0.08
516	0.08
517	0.09
518	0.1
519	0.1
520	0.1
521	0.1
522	0.1
523	0.09
524	0.09
525	0.08
526	0.07
527	0.08
528	0.09
529	0.09
530	0.09
531	0.09
532	0.08
533	0.09
534	0.1
535	0.09
536	0.09
537	0.09
538	0.09
539	0.09
540	0.08
541	0.08
542	0.07
543	0.06
544	0.06
545	0.06
546	0.05
547	0.06
548	0.06
549	0.06
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.05
554	0.04
555	0.04
556	0.04
557	0.05
558	0.05
559	0.05
560	0.06
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.09
565	0.1
566	0.1
567	0.1
568	0.11
569	0.15
570	0.18
571	0.19
572	0.17
573	0.17
574	0.19
575	0.2
576	0.21
577	0.19
578	0.17
579	0.16
580	0.16
581	0.14
582	0.12
583	0.1
584	0.07
585	0.05
586	0.05
587	0.06
588	0.06
589	0.06
590	0.06
591	0.07
592	0.09
593	0.1
594	0.1
595	0.13
596	0.14
597	0.15
598	0.15
599	0.15
600	0.13
601	0.13
602	0.12
603	0.1
604	0.09
605	0.1
606	0.1
607	0.1
608	0.11
609	0.12
610	0.15
611	0.17
612	0.17
613	0.18
614	0.19
615	0.22
616	0.25
617	0.26
618	0.31
619	0.33
620	0.39
621	0.44
622	0.47
623	0.51
624	0.48
625	0.48
626	0.42
627	0.39
628	0.33
629	0.32
630	0.33
631	0.26
632	0.25
633	0.24
634	0.25
635	0.23
636	0.3
637	0.32
638	0.33
639	0.34
640	0.39
641	0.38
642	0.36
643	0.38
644	0.35
645	0.29
646	0.26
647	0.29
648	0.24
649	0.23
650	0.25
651	0.26
652	0.21
653	0.2
654	0.18
655	0.16
656	0.16
657	0.17
658	0.17
659	0.14
660	0.12
661	0.14
662	0.13
663	0.12
664	0.14
665	0.19
666	0.19
667	0.21
668	0.26
669	0.26
670	0.26
671	0.3
672	0.31
673	0.33
674	0.4
675	0.43
676	0.46
677	0.48
678	0.51
679	0.53
680	0.53
681	0.47
682	0.42
683	0.4
684	0.36
685	0.37
686	0.35
687	0.3
688	0.26
689	0.25
690	0.22
691	0.19
692	0.16
693	0.13
694	0.1
695	0.09
696	0.09
697	0.09
698	0.1
699	0.12
700	0.13
701	0.18
702	0.23
703	0.24
704	0.28
705	0.31
706	0.3
707	0.31
708	0.31
709	0.33
710	0.28
711	0.27
712	0.23
713	0.2
714	0.2
715	0.16
716	0.14
717	0.06
718	0.06
719	0.06
720	0.07
721	0.08
722	0.08
723	0.08
724	0.09
725	0.11
726	0.12
727	0.13
728	0.17
729	0.17
730	0.18
731	0.19
732	0.18
733	0.18
734	0.23
735	0.25
736	0.21
737	0.21
738	0.2
739	0.19
740	0.2
741	0.21
742	0.15
743	0.12
744	0.1
745	0.11
746	0.11
747	0.12
748	0.12
749	0.12
750	0.15
751	0.17
752	0.18
753	0.18
754	0.19
755	0.23
756	0.25
757	0.25
758	0.25
759	0.22
760	0.21
761	0.21
762	0.19
763	0.16
764	0.17
765	0.14
766	0.14
767	0.14
768	0.13
769	0.14
770	0.13
771	0.12
772	0.09
773	0.09
774	0.08
775	0.09
776	0.09
777	0.08
778	0.08
779	0.08
780	0.1
781	0.09
782	0.09
783	0.08
784	0.1
785	0.1
786	0.1
787	0.09
788	0.07
789	0.09
790	0.09
791	0.09
792	0.06
793	0.07
794	0.08
795	0.1
796	0.12
797	0.12
798	0.11
799	0.12
800	0.12
801	0.13
802	0.15
803	0.13
804	0.14
805	0.17
806	0.2
807	0.25
808	0.3
809	0.31
810	0.31
811	0.32
812	0.29
813	0.28
814	0.28
815	0.24
816	0.21
817	0.21
818	0.19
819	0.21
820	0.23
821	0.2
822	0.18
823	0.2
824	0.23
825	0.3
826	0.31
827	0.28
828	0.28
829	0.28
830	0.27
831	0.24
832	0.19
833	0.09
834	0.09
835	0.08
836	0.06
837	0.05
838	0.05
839	0.07
840	0.07
841	0.09
842	0.11
843	0.13
844	0.18
845	0.23
846	0.27
847	0.28
848	0.3
849	0.34
850	0.42
851	0.4
852	0.35
853	0.34
854	0.33
855	0.31
856	0.3
857	0.27
858	0.24
859	0.29
860	0.36
861	0.42
862	0.42
863	0.41
864	0.41
865	0.4
866	0.35
867	0.3
868	0.23
869	0.15
870	0.12
871	0.13
872	0.15
873	0.13
874	0.11
875	0.1
876	0.1
877	0.09
878	0.09
879	0.11
880	0.09
881	0.09
882	0.09
883	0.12
884	0.16
885	0.19
886	0.23
887	0.26
888	0.28
889	0.29
890	0.32
891	0.33
892	0.3
893	0.31
894	0.33
895	0.32
896	0.31
897	0.33
898	0.31
899	0.29
900	0.28
901	0.27
902	0.22
903	0.23
904	0.23
905	0.21
906	0.23
907	0.22
908	0.23
909	0.23
910	0.24
911	0.21
912	0.21
913	0.27
914	0.24
915	0.25
916	0.25
917	0.25
918	0.24
919	0.24
920	0.24
921	0.24
922	0.22
923	0.21
924	0.23
925	0.2
926	0.19
927	0.18
928	0.16
929	0.12
930	0.14
931	0.15
932	0.13
933	0.13
934	0.13
935	0.15
936	0.19
937	0.18
938	0.17
939	0.18
940	0.2
941	0.21
942	0.21
943	0.23
944	0.25
945	0.31
946	0.4
947	0.46
948	0.52
949	0.59
950	0.65
951	0.69
952	0.69
953	0.65
954	0.61
955	0.63
956	0.6
957	0.61
958	0.56
959	0.52
960	0.5
961	0.5
962	0.44
963	0.36
964	0.33
965	0.26
966	0.23
967	0.2
968	0.16
969	0.14
970	0.15
971	0.12
972	0.1
973	0.07
974	0.07
975	0.07
976	0.06
977	0.06
978	0.05
979	0.05
980	0.05
981	0.06
982	0.05
983	0.05
984	0.08
985	0.08
986	0.12
987	0.12
988	0.13
989	0.15
990	0.18
991	0.25
992	0.26
993	0.31
994	0.34
995	0.35
996	0.36
997	0.37
998	0.39
999	0.32
1000	0.36
1001	0.37
1002	0.32
1003	0.31
1004	0.31
1005	0.29
1006	0.27
1007	0.31
1008	0.26
1009	0.21
1010	0.2
1011	0.2
1012	0.18
1013	0.17
1014	0.19
1015	0.15
1016	0.17
1017	0.17
1018	0.17
1019	0.17
1020	0.18
1021	0.2
1022	0.2
1023	0.25
1024	0.27
1025	0.3
1026	0.3
1027	0.31
1028	0.34
1029	0.35
1030	0.36
1031	0.32
1032	0.29
1033	0.26
1034	0.3
1035	0.37
1036	0.39
1037	0.39
1038	0.4
1039	0.39
1040	0.37
1041	0.4
1042	0.37
1043	0.34
1044	0.38
1045	0.37
1046	0.34
1047	0.36
1048	0.36
1049	0.31
1050	0.28
1051	0.26
1052	0.17
1053	0.19
1054	0.2
1055	0.17
1056	0.17
1057	0.17
1058	0.17
1059	0.14
1060	0.13
1061	0.09
1062	0.11
1063	0.11
1064	0.12
1065	0.12
1066	0.14

A0A316U272

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer